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GrainGenes Sequence Report: AA043514

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Sequence
AA043514
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043514
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGATTGTTCCCCTAACCCTGTTTCGTTATATGGTAGCTGCTATAAATATA
ATTAGCTCTTGTTATGCACTTGACAGTAAGCTTTTGTCTCTCATAGGACC
AACTGTTGTTGCATGGGTGAAGCCTGGAGATGATGTTGACTACGTAGTGC
AGAAAAAACGGAGCTTCATGCTTCTCTAGCACATCGTCGGTAAGCTCATG
TTTCTCCTGTTCGTCCCCATGTCACCCTCCCTGAATTTATGAGATTCTAG
GGATCTTGGTCCACGGTGGATTCAAGGTGTCTTGGTTCTAGTTAGAAGAT
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TCCCTGCTGAGGCACGATAGGATGCTCCCTTGGTGGGGCTCCCAGTTCTT
GGCTGGTCAACAGTAGAAGCAGCCGACTCAGCTGACTTCACATGGAACGT
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CAGGTGCACACGCTCCTCTCTTCCTCTTGATTCTGCTCCTCCTCCTCCCC
TTTACTCCTTTGTTTTAATCCCTGCAACATATATAATCTGTTTGTGTGCA
GATTCGTTTTTTTCTATGCCTACAAGGTGTTTGATGAAAGTTCAACCATG
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TTGATTCCCCTATTGGTTGTTGTGCCCTATCTAGCATTTTGTATTAGACT
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AAATTTCAAAATAATGGTATGTGCTGATATTTCTTGCTGTGCTCATGCTA
CCATAGACGCTGCAGGTGTCATGTGGGCTTTGCCAACACCTTCATCAGTG
GTTGTCGATAGCGAGTCCAAACTTGATGCAGGAACGGTTAAACCTATGTG
GAAAAGGTAATGCTACACAAGATCTTGGTGATCTGAAAGCCAAGAATTAG
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TACTCGGTATTCGTCTTCTCTTCCTTCTATTAACATGTTAATCTTATATT
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CATGTAAACTTAAAATGCTTTTCCTCTAATATTGTTTTTTTACAGTTTGG
TAGGTTACTGCCAGGTTCAGATCCTCCGCTCACTAAATTTGCTCCTTTCA
TGCAGTACATCATGTACTGAAAATAAGAATCAAGAATTACTTCTGTGATG
GTACAATGCTTTTCTATCATATACTCAACAGTCAGAACAACAAATGGGAG
AATCGTGTTTCCATTTTTCTTTGCATCCCATTACTTTTACAGATTATTGA
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TGGACATATTATTCTTAGTGAGACAAAGTTATTTTTTTTTTGCAGATCAA
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GTCCATTTCCCTTGTGTTGATTTCCAGACTACGAATTGATGCATTCTCAA
GCAACTGTGCAGGTTATGGAATTCAAGGTTCTTGCTGTTTTCCTCCAAAG
AAAGGGTTCTGATTGGTTTTATTATCTTTCTCAGATGAAATGTTAGTTGT
ATTGGGCAATCCATTTACTTTTTTATTCATGATACATGGATAGGCTAATA
GCCTTGGTTTTAGGATTGAATTATACCCCATTGAGATAAGAGACTATCGT
ATGTCTTCCTACTTTTTTTATAACGTAGCATCTACAAGGAAATAAGACGG
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CTGGACATTTTATATATTTGTAGGTGTACCTTCGAAAGATAGGGAATGCT
GAGAAGTACTCTCTTACAATCAAATATATCTTGGTAGTTGTTGATATGTG
ATGCATTGCAAGACCTAGGCCTTTTCTGTTTTGAGTTATCTTGATATCTT
CCCATGAACTTATGTGCCTCATAAAACTACTACTTCCTTTTATCTTTAAT
GATAAATTAAGAATAATATTATATATGATCACTATACAATTATTGTGATA
CCCCGGGATTAGGGCTAAATAAATCCCAGACCTCTGTCTGGCATAAGCTT
AACCTTGATCTCGAGGATGTCCAGTGAAGAATCGGTAACACAAGAGTGAC
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AATATTACAAGCAGAGGTCAGTGACCTCAAACGCCAAACAATGGAAGACA
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CTTATCTGCCAAAATCGTTTATACTTTTAAATTGATATTGAAACTACTAG
TTAAGAAGTTTGAACGAATTTTGAAGATGAGATTCTGGGAGAAGCTGGTC
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GTAGCTGATGGAGTATTTTGCATAAAGCCATCTTTGTTTGTAAAACAAGA
GAGAAGAAGCTTGTCTAATCATAACATTTTAAAATGGGATAAGAGAGCGA
CATCTCTGAAATATTGATCATCATCTTTTGGTATCCACCGAGTCAACATC
ATCGAACCTTAACTAGGATCATCCCCTCGTACCCATGAGGAAGCATCCTT
AAGCACACGTTGATCTGCCAAGTTTTATGATTAGGTTAAAGTTCTCTATA
ATCTTAGAATCTGGTCACCAAGCGTTCATAACCGTGAACACGACTTTTTA
AAAAGATTTAACCCTGTAGGGGTGTACAACTTTACCCGCACGTACCAACC
GACTCTTAATGCCAGATCATTAGCCCTTTTTCTTGGAAGGTCGAAAGAGG
GTGGTTGACCATGATCTTTACCTTGCTTTCGCCGAGACCATGAGTCACGC
CCTAAGGATGGTTCCGCCATAACGGGTCAAATCCCGAAGCCGGTCCCTAG
AGATGTGAGGCGAGGTTGGTTTACCAGGGGCCCCATCAACCCTAAGCAAC
TTGGCCCACGCTTCCCTACCTGTTATGAATGCACCTCCTTCACCGTCTTC
GAGAAGATCTAGAATGCATGTCGAATGGAACGCCTGAACTATGTGACTCA
TGGAATCTACTAGGCAAGTTAGTCAATCGAGGAGTTCTCAAGCCCCGTGT
GGTTGTACGCTCATCTCGGTTCCAGAGGCAAGAACTCGGGTCCTATTGGT
GGCGAGCATGGGACTATAAAAACCACATCCCACCGTGGCCTCCCACACAA
GTCTTAGCATGTTTAATCTCATATCACCTCTGATCTTATCTCATCATGTT
CTCCTGTCATACTAGATTCTCTGCACCTGATACATCATCTGGTTGAACCA
GACTTAAACGCTAAGCATGGCTAAGCAAGACACAGATATAAGCTCTAGTA
GTACACACAAGCCAAACCTAGTTATGCTAGGAGCAGTGGATCAGGTAATA
TAAGCTCAAAGAGAGTAATGCAACAAATAGGATACTCTATCTATCGATAA
AAGACCATAGTAGAATCGTATGCATCATGGCAAGAATTGAAATGCTTTCG
AAATCATAGGATTATATCATGGTGGGGCTATGCTTGCCTTTGCCCGTTGA
TAACCAATAAGCAGATTTTCGGACATTCGGTACCTGACTTCGTTACAGTT
GGTCAAGTATTGTTCGTCGATCTTCGATGGTCTTGATCTCGGTCTTCGAT
CTCGATCTCGATATCGCATTCTACCGGAAAGAACGAAACACCGGAAAGAA
AGGGAGACAATCAACACATGTCATCGATGCAATGCGCAAGCAAGGATAAT
GATATGGCAAGTTAAATTGTATTGAAATAAACCCTTAAAGCATGCTTGTC
AATTTAAGCGGCGTCCGAGGGGTGCAAACCCTAATACAGGAGGGACCCCG
GAATCACCTGCGAGGGTTCACTTTGTTCTCTAATTGAACTTGTCTTAAAA
GTTGTTGAACAATGCATGATGTTGATGCTATGGGATAGATCTCATTTTTC
TGAACATTTTGATATATTATTTGTATTTTTTTGACTTATGAATAATTAAC
TATTGAATTTATACAAGTTTTATTCATCTTCTGAAATTATCTAAACCATT
TTTAATTGAATTACTGCGTCAGCATGACATAGGGCTGATGTCATCATAGG
GTCAGGGCATTTCTTACTGGGTCTGTATCTAGCCCCAGTCACTGACTGCT
GGGCCCTGGGGCCAGGTCACCTTGCCATGCTGGCGAAGGTTGCTGGTGCC
ACGCGGCCACACATCAGCGCCACGCGGAGCCACATCGACACCACGTGGAC
ACCACGTTGGCACGCCAGCGAGCTCTGCAGACGACAGCGGCTGGCGGCGC
TAGAGCGGGGGCGCGTGGAAGGGCGGGTTTGAACGAGCGCAGCACGACAG
ACCTAACTACGGCGGCGCCACCGGTTTTTGGTCACCGGAGCGAGAGGAGC
GGCGGTGACTGGCGACGGTATGCGGTGGCGCGCGACGCGAGCAAGCAACA
GAGCGAGAGGAAGGAGTGGAGAGGTCCATGATGACCAGAAGCTCACCAGG
AAGGGAACGGAGGCGACAGCGAGGCGCGAGGAGGCCGGAATCGACGAGGA
CGACGACGGAGGTCTTCAGAGACCGAGGTATGGATTGGGACAAAACGGAC
CATGCCAACTTTCTCTGCTAGGGGCAAACGAACGAGGCGAGCAAGGCGGT
CACCGTGGAACACTTAGCGGGGCTCGAGGTGCTCCAGAACGACAACGCCC
AAAGCTCCAACGAGCTAGGGTTGCAGTGGATAAGGGGGAAGGAGGGAGAA
GGAGAAATGGGGCTCATTTCTGCGGTTACGGGGTCCTTATAGGCAGCAAG
AGCGGTGGCCGCACGTATCTTGGCGAGGAGGTCATCGCGGCGACGGTGGA
CGGCTCCGGCGGCGACACGCAGCAGCTGCTCGACGACATCCTTCTGGCGC
GAGGTAGAAGAAAAGGGAAAGGGGGCAAAGCGGTACAGGCCACGCTTGGG
CTGTTGCTGGGCCGCTGGCTTGCGCTCGGGCGGCAGGAAGAAGAGGGAAG
GAAGCTGGGCTGGGCCTGGTACGGCTGCTGCTCTGTTTTATTTCCTGAAA
TTGTTTTTCCAATTTATGTTTTGCCTTTTGTGTTTGTAATTCCAAATTCA
TTTCTATTTTGAGTTGTTTGAAAATACCAGAGGCTTTATAAAATATATGA
AATACTTATAAGCCCTTGTATTCAATTTGGGCTCCACTATTTTTGGTAGT
TTTCAAAATATTCAAAACCATTTGAATGCATTTCGGAGAGGAGAGGGAAA
AGATAGGGTTAGGGTTTTTCATTAATTTTCTTTGCATGCATTTTTAAGAG
ATAATGCTCATGAATGCATAAACAAACCCTAATTGCTGTTTAGTTAAAAC
TAGGTTGTTACAGCTCTATCCCCTTTACGAGAATCTCGACCCGAGATTCC
TAAGGTAAGAAGAGAGACAGAGAGAGGAAACAAGGTTACACAAAGGCTAA
GAGGAAAACACACTAAACAACACAAAGTATCTCATGGTCAACTCATGGAT
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AAGGGAACAAGAGGACAAGGTTTCAAGTTGTTAGATAGATAGTCTTCATA
AGAATTGAGACCATGGAGCTCATAGAAGAGTTTAAGATTCTAAGAAGGGA
AGCTTCCAACAGAGGGAACATAACTATAGACTTCGATAGGAAACCTCTAC
TAAACGGCTTAAGTAGAGATACCAGGTTGTAGAGATATGGATCAACAAAA
GCAAGCTGTTGAACTACTTTTGAAGCAGAAGGGTCACTCTTTCATCCAAC
AGAAGGTCAAGACATAAAGGTGTTTTGGTGGAGAGGACTCATAAGAGTCA
CAAAGAACATGTTATAAGAGAAACTATTGATTACCAAAATCATAGTCACT
CTTAAAACATGGCTGAGAACACGAAGAAAACTCTTTATTCATCTAGGTTT
ATCGAATATCCTGACAAATGATCAGCCGGCAGATATCCTGACAAAGCCAC
TGCCGAAGCTGAAATTTCATGAGATGAGGGAGAAGATAGGAATGTGCCAA
GTCAAGTAAGTGTAACTAGCCTAAGGAGGTGAGTGTCAGTGTTAGCTCTA
GTTACCCAAGCTCAGGAGGAAGCTTTTCAGCTCTGTTCGTGGCCCTCGCC
AGAGCGCGCGCCTTCGGAAGCTGCGGCACTCCTTCAACACGTCCCGCCGT
GCCCAAGCTTCCATCTGCATGCAGCTCAGGCTCATCGACAAAGAAGAGGA
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TCATGCCGGCGAGGATCGCCAAATTGGTGGAGATTTCGGGGGTCTCCTCG
CCATCGCACCTTCGGCTCCCAGACTCAGCGCTGCAGGCGCTGCTTGATGA
GCTCCCGGTGGGGGGTTCTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.