Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA030676

[Submit comment/correction]

Sequence
AA030676
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030676
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCAGGGCCCATACCACACTGGCCGAGCTCCCCTCTCCTCCCTCGCCGCC
GTCAACACCCTCGTCCTCGCGACGAACCATCCCCATCGAGCCTCGCCAAC
GAATCCTCTCCCATTCCGCACTGGTTCCCCCGGCTCTCTACTGTCTCCGC
ACAGCGGGAAGGCGCTCTCCACCTATGGCCGTGGCAGACGGCGCCACGGC
GGTGGCGGAGGCGCGTGTGGCGATCCGCCCCACATTGTCCGGCACGTCCA
GTCCCCGCGTGATTCGCCGGAGACTCACGGCGGTAAGGTTTTCTTGCTCC
ACACCTGAACTGCTATATCTCTTTTGCTTCCGAGCACAGCATTTCGTGAT
TAATGTGGCTTTTCACGCCGATGAGGTCTCCAGCGAGTAATGACTTTGGG
TACATCAGCAACTAGAGAGAAATTTTCCCATCAGCGAGATTCCACATTCA
TGCTTGTCCAATCTGTGGATGACTGGTGTGGTGCCGCATTTGTTTCCCAC
CGAAAGAAAACGTAGCTACATGTCTGCATCTAGAGAGACAGAGAGAACAC
CACTACATCAGTATGACACATTCTATAGATAATTTGTGCTTTCTAGCTAC
TACTGATCGGTGGATATTACAGTATTTCTCTGGTAAAATCTGCATAGCCT
AGACGGACTAACTAACTCAAATTCATTAAGATCCATTGGTCTCTACGAAC
TAACCTATCACCTACGCATCTCACTATATGTAGGCCTGTGGCTAGTTAGT
TTCCTGATCTGTTGCCGGCTAATCCGTCAGCACTGCTCCGTTTTCTGTTG
GCATATCTCCTTGCCCAGAAAGCATAGTTGATCAGTGCCACCAGCTCGAA
GGCTGCCAGTACCAAAAAGAAACGATCAAGTCGTGTCCTGTTGAAGTTTG
TTCCGTCCAACCAACCTCTTCCACTGTCTCCATGCCTTGTTGCTCTGTTC
ACTAGATGTAGGAAGGCGCATGCCAGCAAGGCTGCTATTCCAGCAATAAT
GGATTGCATGTCTGGCGCTAACAGCTTCATTTCCGGAGATGACTCACTCT
TTATGAACTCAATCAGTCCACTGAAGGATGCTGCATCTGCGATGCTTAGC
AGGAAGAATTGCATCACCAGCCAGAACACGGACATGGGGACACCTACTCC
TGTTGATGTTAGTCCATGCTGTTCTGCGATTGTCAGTCTTCTTGTTTCCA
CTAATGTGGCAAGGCATGCTGCTGCTATCCCGCATGCGGAGCCAGAACCA
ATACGCTGCAGTGGGGTGATTCCGTGCGTGTGGCCCGTGAATCTTATTAG
GCACGGTGTCAATCTCTGCCTGTAGCATGGTTCCATAAACATGTGAATTG
CTGTTGGGATTGCGATGAGAGAGGCAGAGGATATCTGGATCATGCCTATC
CCCCTGTCCATTGTGCTGCCGACTTGTATGGTTAGTGTCCTTAGCAGCGT
GAATGGCAGGTAGATCAGCAAGCAGCTGATGAAGATTGGAAGCATTCGGA
TGATGGCCTTTGTTAACTCCTCGTCTCGAGTGGTGCTGCAGAATTAACAT
GGATTGTTTTCTCCATCAGATGTATTCTAGATTTGTCCAAGAATATGCTA
GAAAGATTATACTGCTTAAGATAGTATAGTATCAAGATATAGCTATGTCC
AACCCACAGCGGTTTGATTCTTTATATTTTCCATATCCTAGAGATGCAAC
TCTCATATGTTATTTCAGAAATGTACGTTATTTCAGAAATGAACATACAG
TAACAATCTGCTAAAAAAGTAGGGTTTCAGGAATATTTTATCACTATAAG
GAAGTAAGGAACTTACCCAGTGATCTCAATGTCAGATTTTCCCTCCACAT
CAACACACTCTGCTCTGCCAATCTCTTGCAGCTCGATAACATCTACGGTG
GCAGCCTGCCTCTTCTTTGATAAAGGGACAAGAACCTGGAGAGGATAGCT
TGAAAGTTGAGAACCATTTGCTTGTTCAGTTTTCTATGTTGATAGATGTA
CGTCCAAATTTAGTTTTTGTTGATACCTTTATTGTTTGATGATGATTAAT
TAATATGCTAGTTGGGGATATGACTTGGCGGCCTTTCAGGATAAAAAGAA
TGAAAGATTGAGTAATACAGTGCATTGTGATTAAGCAAAACTTTATTCGA
CCCTGTAAATCTTTGCCTAGTCTATAATTGTGTTCCACCAAGTTCACTTG
GAGTATGAAAGGTGAAACTGGACTAACTGCTTTCTAGGACCTTTATAATT
AACATGCATACTGATACTGGCAAATGCGTGTGCTGTGTGAACTTTTACCT
GCAATATTCTCGTTAAAGGACTTCTGTTAGGCTTCTTTGTTATATAGAAA
GGCAGTCCACTGGCTGCGACAAACAGCCCTACAAGTACAATAACTGCAGA
TATCATAAAGCCAATGGTCCATCCCAAATTGTTCTCGATCCAGACTAAGA
ATATCAATCCCACGAGCGCTCCAAGGGAGTTTGCAAACTTGAGCCAGCTC
AAGAACGTACCCTTGAGTTGTGTTTCATTTGTTTCATCATTGCTGAACTG
ATCTCCACCGAGGAATGGTATGCATGCGAGCATGCAGCCTTCTCCAATGG
CAAAGAGTAATAAGCACAAGAAGAGTAGTGTTACGTTCCAACCTTGAGCT
GCCTCACAATTGTTTGGTTCCTTGTTTATCTCACAATCCAGCGGATGTAG
TGAAGGCAAATATGCCTGCAATCCTAGCAACATATAACCCTGTGTTGTTG
AACAAAAAAATGTTTATAATTAGAATATTGTCATCTACTTTTTCAACCTC
AAAAATATAATAATTGAAACACAGTTACTATCATGTATACTCCCTCCGTT
TCAAAATATAAGCTTTTTCTGAAACACATGTATCTAGACAACCTACACAC
AAAAAGTGTCTAGATACATGTGCTTTAAAAAATGGCTAAAACATCTTATA
TTTTAGAACCGAGGGAGTATATGGGGACATGATCATACACTGATACGCAT
GGCGGAAGTTATCCTAGTTGTCAGTGCATTGGTTAATCAAGGAAAATTTG
GCCAGTCACTGAAGCAAAAGACTATAATTCCGTTGGTGCTTGCTCTTGTG
TTTATTGTTAGAATAGATTACTAAATCATATCCTGTCTTATACAATAACT
GCTGTAGTCGGTTGCCAAAAGAAGGAACTTAATTCTAGATGCTATGCTTC
ACTATAACAGCTCTACCTTAACCTAACATCCAAAACAGAAACATGACAAG
CCTGAGACAGACTTAAAATTTCATGATGTATTTGGTAGCACTAAAATAGT
TAAGATATTTTAAAAACTGTGACTCCAGCTATAGGTTTATTGGCTTCAGG
AATTTAAGGGCGAAGAAGAATTACCAGGACCGTGAAGGGACTGAATACAA
ATATAGTTGTGGTTCGCTGGATATATGCACAAGAGATGTAGTTCATCAGG
ACAGTAAAGAATGACACGGCGCCGACCAGATAGGTGATCAAAGTTGACGA
TGTCACAATATCCAGATGCAGTGTCCCATGGAAATAAGCCACAAGACTTA
AGTTTGCGCTGCTAGGGCAGCTTCGCAGCATTACTAAAACTGCAAATTAA
CATAAAATTCAGTTCCAACAGTTTGTTCGGTTCTGGTTCAAAATGTAGGC
AACACTATGGATCAGGAAGAGAGCAACAAATGAATTTGAAAGGTTCGTCC
AAACCATATATGAGGTTCACCCAGTTTACCAAGCTGAGAACATTGCGGTG
CAAAAGAGTTATTGTTCAGAAACAGTAGCTTACTTTATCCAATCGAGCCC
AGACTTAGCTTGTCCAGAAATTGAGTTGCTAGTAAAACCATCTTGAGTTT
GTTTTTCTCGCAAATGTCTTATCAACAAGATATGTGTCTAGAGTAATTTT
CCTCATGCAACACACACCTTGTTCAAGCAAAGAGTTATTATTCATGTGGC
GCCGAGTCAAAATTAAAGCGTCAAACTTGTACCTCTACAGCTCTACCAGA
AGCCAACGTACGTAGAAGGTTGTTGCACTTGAACGGATGATATGTACCCA
ATACTTTGAGAGATGTGGCGTGTTTTGGTTTTATTTCAATATTTGTCATA
AGAAAGTAGTATGTGCCTTCTGCTGTTGCATTCCACTAAGTATAAAATCT
TTTCCTTTTCTTCTTTTTATTTTTTGGGAATCACATTTTCTCTTGGTCAT
GATGAACTAGCATTTGGCTGGCTCTAAAACTTTGTCCATATTTCTTCTTT
AAGACTTGAGTCATGAATTATTTGTCCCTTGTGAGATTTTATTTGATATT
CTATTATGTTTTGGCAGTTGTCTCTTTTATTGGCTGTAGACCTCCCGATT
TATATATTTTACCTGTCACTCTCATTATCTGGGTCTATGAGGTGACATTT
CTAGCTAGCATACTATACTATACCAATTAAAAGACATACAATTTATTCGT
TATGTTTCCATAGTATTTCGGCATAAAAACTGACTTTCTTATTTTGAATT
GAGCAATAGGGGCACATTGTCTTTCACTAATATAAGCTACAGCTGTTTGT
TTATTGGATGCATGCGGGGAATCTTCTGTGTAGTTAGAATTATTCTATTT
GGCGAGCTTGCTTTTGATTATGTATTATCATCTGAATCATCTGTGTAGTT
AGAAATATTCTATTGTGGGAGCTTGCTTCTGATGATGTATTATCAATTTC
TTTATGATGAAGTAGCAGAGGAGAATCAAGTCAGTTATTATGTACAGTAG
GTGTAAAGATCAATAGAAGATTTTGAATGAATTTAATATCGTTTGCATTG
AGTTTAATATCCTGACCTAGAGTGCTGTCATTTTGCATGTCTTAAAGTTC
CGAGTGCAATCGAACAGCTACATACAATGTTTATTTATGTTTGAAGATCT
ACCATTTGTAAGTAAAAACACTTTGTGCTTCATGACAAACTGAATGGTTA
CAATTCAAAAGGACAATCACGCGGCCATAAACCTTGTATAATTTTACCGA
AAAATATTGCAATGCATACCTTCGTTCTGAGAAATATAGTTTTTGCACCG
ACTTTTTGTAATCTTCATGATTTCATCAAACACAAGTACCTCTTTGTAGG
TACTTAACTAGATTGCTGAACTATGTGTAGTAGATATTAGCTGGATACCG
TGCATTGCAGCGGAAAGAAAAAGTTATTGAGCATGTTGCTTCAGAAAACA
AGAGATGCTTAGAGACATTTCAGACATATGTATGTAGCTAGCCTACCTGG
AGAATTAATCGATATTTCTAACTACACAGATGATTCTAGCAATACTTCTT
ATATTCTAGCTACACAGATGGTTGTGTTATCACGTATGGAACTACATAAT
CGATATTTCTTTTTTTTTTGAAGGGATAATCGATATTTCTAACTACACAG
ATGGTTGTGTTATCACGTATGGAACTTAGCAATAACTACACAGAACTTGA
AGTATTGCAGTTTGTTTGCTAGAAAACAACCTTCCCTTTTTATACGTGTT
TCCAAAACTTTGCTGGTTACTTCTTTCTTTTGTAAATAGAAATGAATCAC
AACTTCACTTTGTAATCTTAGTCAATACTAGTTTCTTTTCTTTCTTTACT
ACCTTCCTTTTCTGTGGTGAGATGGGAGAGACTGTATAGTTCACAGATAG
AGAAGTATGTACTCCGCAACCACTCTCACCATACCTGGCCTTGAACACTG
TACGTTCTGTTTCCAACATGTAACCACGTGGAGGTGATCAAGTACGGTCA
AGACAAGAAAGAGAGACAACACACAACAAGAAGCATAAAAAAATATTCCA
AGAACAAGTTAATTGGATGCTTATTCCAGAACGAGAAGAACCGAATGCGC
ATACGTGCCTGATAAGTGATAACACAACCATATCTCTAGCAATACTTCTT
ATATGGAACATCATGTACAATCAAGCTAAGTTCCATACGTGATAAAAAGA
AATAATAAACCCTTCAAGTTTCATATGTGGTATATGCAAACAAAGGTATA
GTGTTAGGTGCTCACCGTAGAGAAAGAGTGTGGCCTTCATGCCACCATGC
TTCCTTGCATCCACAGCATTCCCTCTCCAATCTACAACTCCAGCTTCAAT
TTCCATATGTAACTAAGAAGTATATGGTCCTCAATATTAGCCCAGGCTAA
TTAATCCAGCTGAAACTAGTTCTAATCCTCTCTCACTCTTTCAGGCACTC
CATCCATGGATGCTAGCTAGCTCATATATATATATATATGAAGTTACAAA
CACATGATCGAGTAGTGCTCCTTAGAGAGGCACGCAAACAGAAGGAAAGC
AGCCTGCATCTCCAGAAGTCAAGTGACCGGGCGCCTGATTAATGAAGCTT
GCTAAACTCACGCGGTCGTGTATGCACGTTTTCTCCAGGTGACGCCGCGT
ATAGACCCCGCACGCGTGGGGCAAGGTGATTACTTAGTTTTGTGGATCGC
CTGCTGTCATTTTGTGATTTCGGGGAGATCTTGTACCTAGACATTGTGAT
CACCCACATCGATCAGTGCATCAGTAATGCAAGTAATCAAATATTGAGAA
CTGACAACTGTGTAGGCACCATCGATGATAGATGGGTTACGACATGGTTC
AGTTTTTTTTAGAGCCAACTTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.