Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA028658

[Submit comment/correction]

Sequence
AA028658
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028658
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTCGCCAAGACTGCGGCGCGAAGAGTTACCTCTGATCCAAGACGTCT
TCCACCTGTTGTTAATGTCATTGCTTTGCTAGGGCTTGTACCAACTTTTA
TTTTGAAGGGTCGACAAGCTACAATGGAATATCTATATGCCAAGTTTGGT
AGTGTATTCACTGTAAGTCTATTTGGACTCAATGTAACCTTCTTGATTGG
ACCGGAGGTTGTAGCTCATTTTTTTCAAGGGTCGGACTCGGAGGTTAGCT
ATGGTAATCTCTATGAGTTCACGGTGCCAATGTTTGGCCAAGCAGTTGGC
TATGGTGTAGATATCACCACTCAGAATGAGCAGATGCGGTTCTCTAGTGA
TTCAATGGCGCCATTGAATTTGAGGAGAAAAGTTGAACCAATGCTTCAAG
AAGTCAAGGTATGTCGCCAAGTGATTAGGCATATATTTGTTTCCTCTTCT
TTTATTCCTTTCTCATTGGGCAAGCATTCGACACATAGTTACTTTTATTT
TAAGTACTCTATAGCACATTTTAACAAAATTTATGACCAAATATCACACT
AGAGACGGTATCAAGAACAAGTATTAATGGATGTAGGGAGTACTATATTA
TTAGCCACGGGAAATAGAGTATACCAAAATAGGTCTATTTTTCTAGCAAG
TGCAACTCACGCTAAATAACATTCCAGATGGAAGAGCTTATCTTAGAGCA
CCTCTTCAAAAGACTTATACATACTATATTTGGGCTATATGTATACCAAG
TCAAATCAGAAGGGGACACTTAGGAATGAGCTCACGTCATAATAATGGGT
GACTGAATTATGGTTTCGGTTGGAGAGTATGGGACACATACACATGGTTT
GCTATTATATATCAAATATACATGTTAATGTTTAATTAGGATGTGGATAT
CATTTATGGAAGAAAATACCATGTCCTATCAGCCCATTTTTGTTGTTCCA
AGGGAGGCCTTAGGGTAGTGCAAAGTCGGGTGAACAAGAATACTATACCC
CGCCTTTACTTGTAAGTTGGGGTCCTATCTGTCAAACCATGGGATGTTTT
TAATAGTTATGTGTCAAAAGTAGTGGTAATTATCTTGTTGCTCACATATT
GTTTATATGATGTCCAAACATTTTGTAATAAGATTATGATTCAAACTCAT
GCTTTGTTCATGTATTTATGTTTTTAGGATTACTTTGCAAACTGGGGACA
AGAGGGTATGGTTGATTTGAAACATGAACTCAAGCACTTGCTCATGCTGA
TCTCAAGCCGTGTCCTGCTAGGAAAGGAGGTCCGTGAGGGAGTGTTCACA
GAATTCTGCCAACTATTTTCTGATATACAAGGAAGCGCAAACATGATAAA
CTTATTATTTCCATATGTCCCAATTCCAACAAACCGTCAACGCGACAAAG
CACGCATCAAGCTCATAGATATACTCACTGAAATTGTGAGGTCTCGTAAG
ATGTCCGGCCGAGTGGAGGAGTGTGATATGCTACAGAAATATAATGATTC
CAGGTATAGAGATGGCCGCTCTACCACCGAAGAAGAAGTCGCGGGGCTTT
GCCTTGCTATTTTCTTTGCTGCAAATCATACTTGCTCTCACGCTATTGCA
TGGACCGCAGCTTACCTTCTCAGCCATGAAGAATGTTTAACAGCTGTCAT
TGAAGAGCAAAATAATATCACTAGGCAAAACAAGGACCACATAGACTATA
ACATATTGTCAGATATGCAGTATCTGCATAGGTGTATCAAAGAGGCACTA
CGGATGCACCCTCCAGTACCAGTATTTCTTCGTAAGGCACACAAGTCCTT
CACTGTACGGACGAAGCAAGGTGACGAATATGACATCCCAAAAGATCACA
TCCTCGCAAGCCCTACCATACTCAACCATAATATGTCTTACATTTATAAA
AACCCTCGGGAGTATGATCCTGACCGGTTTAGCCTGGAACGGAAGGAGGA
CAAATGTGGCAAGTTTTCATACACATCATTTGGTGCGGGAAGGCATGCTT
GCTTTGGTGAGGCCTATGCTTATATGAAGTTTAAGATGATATGGAGCTAC
ATGTTAAGAAACTTTGAGGTAGAACTAGTATCTCCGTTCCCTGTAGAAGA
CTCTCGGAAGTTTGTCCCAGAGCCTCAAGGGAAAATTATGGTTAGGTATA
AGAGGCTTCCTACTTTCTAGAACCTAGTTTGTGGTGGGTAACATGTACTT
AAACCAAGTGAAGCCGTATGTTTGGCTCTGTGTACATGTGTATGTATACA
TGTTTTGACCATGTCGTCCATCTATGTAACATCCATATATTTTTTTGCAA
ATTTTTTACCGATATATTAATAATCATCAACAACAGTATAAAAAGCACCA
AAAGTAATAAAAATTACAATTAGTTCATTGGACCACATAGTGATAACGTA
ACTACATGCACTGGCGCGAGCCAAAGGTCTTAGAATAGCTATTAGAATAG
CCTCATCAAGCAATGGAAGAGGAGCAAGGTGTAGATGATGACAATTAGTG
GAGACTAGGAAAAAATGTTTTTTTTGCTAAATTCCACCGATCTATTAATA
ATTATCAACATTAGTACAAAAAGTCTTAAAAATAGTAAAAAATACAAATA
GGTCATTGGACCACTAGCAGATTGTTATAGTAGACATATGGGAAGTTGTC
ATGATTCACCCTTTTGGAAAGGACTAATGGAAGTAAAAGATGAGTTCTTC
GCCCGTGGTACTTTCAAAATCGGAGATGGAAGAGACATCCGATTCCGGGA
CGATATTTGGCTAGGAGAGGCGTCTCTCACACAACAATATCCTACTCTTT
ACAACATCGTTCATAGAAAAAATGTTTTGGTGCACAATGTTTTATCCCAC
AATCCTTGGAATATTGGTTTTAGACGAAGCTTAAATGGAAATAAATGGGA
AGCATGGATACACTTATGTGAGAGGTTAATGGGAATACTTTTGGCTAATG
AATGGGACACTTTTGTATGGAATTTAACGTTGAATGGGGTTTTTTCTGTT
AAATCTATGTATAAGGATCTCATGAATGAACATCCGCGTTTTCCCACAAG
ATATTTATGGAAGATAAAAATATCAATGAAAATAAAAAAAATATGTGTTT
TCTTAACAAGAAAGTACTATTAACTAAAGATAATTTAGATCGAAGAAACT
GGAATGGATGTAAGAGGTGTTGCGTTTGTGACGAAGACGAAACAATTGAA
CATTTATTCATTTCCTCTCCTCTCACAAAAATAATTTGGTGCATGGTTTT
TTTCACTTATAATCTTCCTCCTCCAACCAATGTCACTAATATGTTTGGGA
ATTGGCTTAACGGAGTAGATAAAGTGAATACAGGGAGAACTCGTATTGGC
ATTTCGGCCTTATGTTGGTCCATTTGGAAATGTCGTAACAACTGTATTTT
TAACAAGACCAGAGTTCCTTCCTTTTTGCAGGTTATCCTTATGGCGATGC
ATTGGATTCAGTTATGTACTTTCCTCCTTCCAAAGCATCAGCGACAACCA
ATGGTTTCTGGTTGGACCCGTCTTGCGGCGGTTACTTCAGATTTCTCCAG
CCAGGCTTCATGGTGGCATTCTAGTAATTGACTGACGCCTAGCTGTTATT
TCAACTCTCTTGTGAGACCCCTTGTTTTATCACATGGTTGATCTGCGCAT
CTTCCTATCTGATTTATGCTCTATAATACTATTTTGGTACTACTTTGAAT
TTTAATAAAGGGTTGTGTGCATCCCAGGATGCAGAGGCCAGGATTTCACC
CCCATTTTGAAAAAAATAACCAATGCACCAGAGAAGCAACCATCACTAAA
GATGACTAACGTAGATCAGAAGAGACTGACATCAAAACACACCAACAAAT
ACGAAAAACGACTAGATCCCAAGGGATCCATCAGACACACGACTCCACAC
GTCCTCCGCTAATGCTACACACACCATCAGAGTGAGGATAGAACAAGAAT
GACCTTATTCTAACTTCAGTATGTAGCCTCGTACCTCTGAGCCTCTGCCT
ACTCTCCTGACCTAGCCACAACATCTCCGCCTCCTCCATAGATCGGTTCC
CCCTCCTCCAGCCGGTCTCGTCGCTGTCGGGAGGGGTGGGGAACCCGATT
TATGGGTGGAGTTTTTAATAAAAGTAGTGTTTTCAAAGATTATATTAGTG
TTTTCAAATATTATATTAGTGTTTTGGTTGTAATCTTATTGATCTATGTG
TTAATGGAGATGTCACCGTCTATAATAAGTGATATTTGACCTTTCGTTTG
ACGAAGATGTCTCTTTCCCGACGTCAATGGTGGTGTTAAAAGATTAAGAT
TCTATAGGTACAATGTTTCAGATCTTCCTTGTCCATTGATTTTAGACTTT
TTCTCATGGTCGCGAGAAGGATTATCCTCGCAATATTTGTCCTGACTGCT
ACGTACTCGACAATGATGATTCATACTTTCGGTTCGCTAGCGACGTCGAT
CAGGCTGTTCGGTTAATTTTCCCTGAAATACTTGTGTTGGATCTCTTGCC
GATGTTGATTGATTATTCTAATAGTTGCACGCGTGCACGTAGCCTTGATA
CTGCGACTCAAAAAATTATCGGAGAACCTTCGTTAGTATTTACAGGTTAT
GGTTTAATGTCTTCCATTGTTCGGCTACCTTGAGAAAAGTGCAAGATTAT
GTCTTAAAAGAAGAAAGAGATTGAAGACCTCAAAAATTTGCTACGTTTCT
TTAGACTTTATTTTGTAATCGATAAAGTCAGTTTATGTATCTCTACCATG
TACTATTTGCTACTATAAATATAACTGGTATTGACTGTCGAAAAAAACTC
CGCCTAAACATCCCGAAGAAGACACTAAAAATAGTATAAACAAAACACTG
AGATCTCCTGCCGTCTGCCACGCCTCCAAGGCCCTAATGCCATCCACCAC
GCCTCCAAGGCCCTAATACCGCCGAAGGCGGGACGGACCGATGGCATCGC
CGACAGAGGAAAGGAATCGGGTTTTTCTGCCATCTCTTGGAGACTCTCTC
TCTTCGTACCGGTTTGATGAAAATTTAGAAAAAAAACAAGTATTTAGGAA
TAAATAAATACCTAAATTTCGTCTGTCTATTTGAACCTAGGTGTTGGATT
TCTAATACAACTATCGTTATAATCACATACTCCATCGGATTTCAATTTAT
TATTTTATGGGAAATGATACTACTCCCTCGGGGGATCGATCCCCCGGGTA
GGTAGCTCTCGTACGCTTCGGTCCTAGAAAAAAAAGACTTATCTCTTCAA
CTATATATCCGAGCGTCTCGCGCATGGCCTACTTCTCCTCCCTGGAGCGC
CGCTGTGCCGCCGCGCCGGAGCCCCTGCTCCTCCTCCGCACCGCCACGCC
GGAGCCCATGCTCCTCCTCCCCTCCGTGTCGCGCCGCCGCGCTGGAGTCC
CTGCTCCTCCTCCCCCTCCGTATCGTGCCGCCACGCCGGGAGCCCCTGAT
CCTCCCCCCTCCCCGCGCCGCCGTGCTAGAGCGCAGCCGCGTCGTCCCCC
GGCGATGCACTGCCTCTCCACCAACGATGTGCCACCGCGCCGCCTCTCTG
CTCTATCTCCATTGGTCTCCTCCTCCCCATGCCCTCCTTCTCCTACCCAG
CTTCCATGGCCATGGGGACGTGATTTTTTGCTACATACAGCAGGCGAAGC
TAACCCAGAAGACGTCCATCCTTGCTCCGTGTTTAGATCGCCGGTGCTCC
CTGCGGTGGCATCAGAATGTATGATTTCCAATAAATATGTCGCCCGTTCC
ATTGAATCGGAAAACGGCATTCTAGTCATCTTGCCCATAAGGCATGGCTC
ACATGTATCAAATGATTCATAATCAAGTGATTCCAAAAGTCCATCCGAAT
GGAGCTTCTTCATGCGTTTAACGCCAATATGACCTAGACGGCAGTGCCAC
ATATATGCGGATATATCATCATTTAGTTTAATCCTTTTAGCATCAACATT
ATGAATATGTGTAACATTATTATCGAGATCCAAAAGAAATAAACCATTCA
TCATCGGTGCATGACCATAAAAGATTTCATTCATATAAATGGAACAACCA
TTGTTCTCGGATTTAAATGAATAACCACTTCGCATCAAACACGATCCAGA
TACAATGTTCATGCTCAGTGCAGGCACCAGATAACAATTATTCAAGTTTA
TAAATAATTCCGACGGCAAGTGGAGAGGCAGCGTTCCAACGGCGATCACA
TCAACGCTTGATCCATTGCCGACACGCATCTTGACCTCACCCCTTGCTAG
CGGTCGCTTGTTCCGCAGCCCCTGATTCGAGTTACAAATATTAGCAACTG
AACCGGTATCAAATACCAAGGTGCTACTGCGAGCACTAGTCAAGTACACA
TCAATAACATGTATATCATAGATACCTTTGTTTGCCTTGCCGGCTTTCTT
GTCTGCCAAATACTTGGGGCAGTTGCGCTTCCAGTGGCCAGTCCCCTTAC
AATAGTAACACTCGGTATCAGACTTAGGTCCAACTCGGGGTTTCTTTCCA
GGCACGGCAACAGGCTTGCCGCCCTTACTTCCCTTTCGTTTTCCCTTCTT
GTCTTTCTTGAAACCAGTGTTCCTATTGATCATCAACACTTGATGTTCCT
TTTTGATCTCCACTTCTGCAGTTTTAAGCATTGACAGAAGCTCGGGGAGA
GACTTCTTCATGCCTTGCATATTATAGTTCATCATGAAGCTCTTATAGCT
AGGTGGCAGAGACTGCAGAACACGATGGATGCCTAAGTCAATGGGAATCG
ATATTCCCAAGGACACAAGCTTATCGGCGTAACCCGACATCTTGAGTACA
TGCTCACTAACGGAGTTGTGCTCTTCCATCATGCAGCTAAAGAACTTTTC
TGAAGCGTTGTAGCTCTCTACAGCAGCATGTGTGTCGAAAATCATTTTCA
ACTCACCCATTGTATCAAAAGCATTGCCATTTTCGAAATGCTTTCGAAGT
TCCGGCTCTAGCCCATACAATATGCCGCAATGAACTAAGTTGTGGTCCTC
CTGACGAGTCTGATAGACATTCTTCTCCTCGTCAGGGGCATCATCTAAAG
GTGGGGGGACTAACGACGCTTCTAGCACATATTGCTTTTGTGCAGCAGAG
AGGAGAATCCTCAAATTCATGGCCCATTCAGTAAAGTTGCTACCGTTCGT
TGCAAGTTTCTCTTTCTCCATGAACACATTGAAATTAAAAGCAGGTGGTG
CCATCTACAACATAATTTGTAAAGTTTAGACTAAGTGTATGATAGATTGA
GTTCAACTAATCCATATTACGAATGAACTCCCACTCAAAAACGACATCCC
TCGTGCCTTTTTGGTGATTACATGAACCAAATCCACTACACCAAGTCCGA
TCATCACGTGAGTCGGTGTAGCCTTAAAGGCGAGCATCAAATGGGCATCA
TATCAACTATATGACTCATGCTTAACCTTTCGGTCCGTGTTCCGAGGCCA
TGTCTGTACATGCTAGGCTCGCCAAGTTAGAACCTTAGTATTCGCGTGTG
TAACTGTTTTACACCCGAAATATGGTCGTGGATCCAAGAACACCCGATCA
TCACGTGATGTCTTGGAGCGACGAAAACATAATCGGTGCATACTAAAGGA
AGAACACATTCTTATCTTGATATTTAAATGAGGGATCATCTTATTATGCT
AACAATGCGCTAAACAAGCAATATAAGATGCTATCAAACATCACATGTTT
ATTAGTGAAATGATATGGTTCCCGCATATGATCTCTATCATGTGCACCGT
GGTATGATTACTATCATACCTATATGTGTAAGTCCAAGGTCTATGGAGAT
TACACGCTATGTGTGTTGTAAGAGTGTCATCTCATACTTCTACTTACAAC
ACTACCATATCATAACACTAGACTAGCAACAATCTAAACTAGACGCCTCT
AATTTATTCATTGCAAGTTTTACGTGGCTTAGGGCTTTCGAGATAGAACC
GTTCTTACCTACGAACATGAACCACAACGAGGATAAACAAATTGTTAACA
ATTCGTTGCAAAATAGATATTGACTATAGTAGGAGAGACAGACACCCGCT
AGCCACTTATGCAAACTAGTTGCATGTCAAGCGTGGAACATGTCTCATGT
GCGAGGACATGTAAAGTTTGTTCGGGCCGCTTCATCCCACTATGCCACCA
ATATCCAAAATTACAACAAAGGAGCAACAACATGATCATCATCGCCCACA
TACTCATATGTGTACTACCAGTGTAAAGTATCTACGCATAGATCCGACTC
TGATACCACTGTAGGGTTCGCAGCATAGAAAACAAAAAATTTCCTATGAT
GGGAACTATGTACCAAGATCTATCTACTAGATACAAACAACGGGCGGATG
TATATCCGTAGAGAACATACCCTTGAAGACCGACAAAGCTTAACGAGTTC
AACTCGTGGTTGATTTACACGATCTCTTGCCGATCTCAAGATCGAGAGGA
AGTCCTAGCGCCGCAAAGCAGCAGCGCATCCGTGCTCGCACACACGTACA
AGACACCGGGCAACCTCCGCCTCCTCGCTCCAGCGATGCAGCGGAAGCAC
AATCCTTTCTTGCCGAATAGCCACCGGAAACATGTATCTCGCTAGTCCGA
TACCATGGGGGATAAATTCTAGAAGGGGAGAGAGATCCTTCACGAGGAGG
TGTAAGAGACAAGTGAGAGGAGGGGCTCCTTTTATAGGAGGAGGAGTGCA
CCCAAGGGGGTGGCCGCCGGCCATGGGGGCTGCCCCCTCCCCTCCTTCAT
TCATGTGGGTGGACACTCCACTCACAAAATGTCCCTTCAATTTTCTCCAC
TCAAAAGTCCAATCAAATTCCCATTAAATTTCCACCAAATTTAATGCAAA
CTCTCATTAAATAAAACTCTTTTATTTAATTCAGAATTTTGTCAATTACT
TTAATTACAAACATTCACAAATAACCCCTTGCTAGAATTCCATTTCACAT
GCATAACCTCTTTATGCAATTTCACCCAAAAACCTGTTTCGGTATCTAGT
GAAATAAATTCCTGCGCTTGTTTATTCTTTCGGCATGAAACATTTGCTCC
AACATTTGCTACATTATTTGACAAACTACAACAACATGGAGTTAACAAGT
AGTGCTGGTTGGTTTGCCGCGGTAGCTCTTTTGTCCCTCGGTGCCATAAT
GTTCGCCAAGACTGCGGCGCGAAGAGTTACCTCTGATCCAAGACGTCTTC
CACCTGTTGTTAATGTCATTGCTTTGCTAGGGCTTGTACCAACTTTTATT
TTGAAGGGTCGACAAGCTACAATGGAATATCTATATGCCAAGTTTGGTAG
TGTATTCACTGTAAGTCTATTTGGACTAAATGTAACCTTCTTGATTGGAC
CGGAGGTTGTAGCTCATTTTTTTCAAGGGTCGGACTCGGAGGTTAGCTAT
GGTAATCTCTATGAGTTCACGGTGCCAATGTTTGGCCAAGCAGTTGGCTA
TGGTGTAGATATCACCACTCAGAATGAGCAGATGCGGTTCTCTAGTGATT
CAATGGCGCCATTGAATTTGAGGAGAAAAGTTGAACCAATGCTTCAAGAA
GTCAAGGTATGTCGCCAAGTGATTAGGCATATATTTGTTTCCTCTTCTTT
TTTTCCTTTCTCATTAGGCAAGCATTGGACACATAGTTACTTTTATTTTA
AGTACTCTATAGCACATTTTAACAAAATTTATGACCAAATATCACACTAG
AGACGGTATCAAGAACAAGTATTAATGGATGTAGGGAGTACTATATTATT
AGCCACGGGAAATAGAGTATACCAAAATAGGTCTATTTTTCTAGCAAGTG
CAACTCACGCTAAATAACATTCCAGATGGAAGAGCTTATCTTAGAGCACC
TCTTCAAAAGACTTATACATACTATATTTGGGCTATATGTATACCAAGTC
AAATCAGAAGGGGACACTTAGGAATGAGCTCACGTCATAATAATGGGTGA
CTGAATTATGGTTTCGGTTGGAGAGTATGGGACACATACACATGGTTTGC
TATTATATATCAAATATACATGTTAATGTTTAATTAGGATGTGGATATCA
TTTATGGAAGAAAATACCATGTCCTATCAGCCCATTTTTGTTGTTCCAAG
GGAGGCCTTAGGGTAGTGCAAAGTCGGGTGAACAAGAATACTATACCCCG
CCTTTACTTGTAAGTTGGGGTCCTATCTGTCAAACCATGGGATGTTTTTA
ATAGTTATGTGTCAAAAGTAGTGGTAATTATCTTGTTGCTCACATATTGT
TTATATGATGTCCAAACATTTTGTAATAAGATTATGATTCAAACTCATGC
TTTGTTCATGTATTTATGTTTTTAGGATTACTTTGCAAACTGGGGACAAG
AGGGTATGGTTGATTTGAAACATGAACTCAAGCACTTGCTCATGCTGATC
TCAAGCCGTGTCCTGCTAGGAAAGGAGGTCCGTGAGGGAGTGTTCACATA
A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.