Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028522

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028522
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028522
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCACACAACTTGAGAAAAATCTTACCGTGGGCTGCAGTGGCAGCGGC AGCGCTGCTTCTGCTTATATCGTCGGCTGGAGCAGCTGGACCGGCGCCGC CGGTGATAGGGATGCCGGGCTGCGACACCAGGTGCGGCAACATGAGCGTG CCGTTCCCGTTCGGCATGGGCCCGTCCCACTGCTACCACTCGCCGGGGTT CAACCTCACCTGCCACCACGGACGTCTTCTACTCGGCAACGGCACGCTCC AAGTCACCCAGGAAATCTCCCCCGGCTATCCATACTTAACCGTTGTCCAT GCCGGCGACGTACAGACCGACGGCGGCGGCCAGGGCACGTTTGGCGCTGG CGCCGGGCTTGGAGACAACGGTCCCTACGCGCTGTCGCGCGGGAACCAGC TCGTCCTCGTCGGCTGCAACGTGCGGGCGACGCTGAGGAATGGCAACATC ACCATGGGCGGCTGCACATCCCTTTGCGAGGACTGGAGCGGCGGGTCCTA CATGCCGTCGACGCTGGCGAGCAGCATGCTCTGCTCCGGCATAGGCTGCT GCCAGGCGCCCATCGTGGTGAACCGCGAGGTCCTCGCCGGGTCAGGCCAG CTCGTCCCCATCACGTCCTACGACGTGGAGCTCGAGCCTTTCGGCTGGAA CCGTAGCGAGGCCCGGCAGTGGCCGGCGCACGTCTTCATCGCCAGGGAAG GCTGGTTCGCACCATTGGGCATCTCGCACCAACTGACGTCATCGCCACGG AAGAAGAACCAACCGGCGGCGGTCGTGTCGATGGCGGTTCCCGTCTCGCT AGAGTGGGAGCTCAGCGTCGGTGACAAACACAGCTCGTCGCCGGGCTCCA ACTGTTCTAACGAGGCGGCTCATGATCAACGTGTCTGCAAGAGCAACCAC ACGGACTGCGCTATTGGTACCCGAGGCGGCTACACATGCTCCTGCAGGGA TGGTTACGACGGCAATCCCTACATCGCCAACGGATGCCAAGGTAATTTGG TCGTTTCCCCAAAACCTTATTTTTTTTGTTAATTTCTGTAAAAACGATGC ATATACGAGGTCATGAAACTGTTACATTTTGTAATTTCTAATATTCTAAC CAAGAATTTCTAAGCCCCGGCCCGTATGAACATCTATATAATAAATTGGC GAAAGGGAAAAAGATGAAACAATCATAATCTAGTGGATTATTCAGGTATA ATAAATTGCTCGTATGGCATCTTCTTTAGCTGTAGATATTAAGATGTGAA ATATTCTAAAATAATTTTATCACTCTATAAATTAATTTTGTGCATTTAAA AATAAAATGATTTTATAGTCACTATAAACTTTATGTTAAGTACAATATAA CTTGTGCATAAAACGTATTTAGTTTGTGGGCAAATAACAAAAAGGTTAGG ATAGCCAGAGTAAATCCACAATAATTGATCCCTTCACCAAAAAGTACATA TTATTGTTCTAGACGAAGAAAAGATCGCTCAAGAATTCAATCAAATTATG TTAAGAGATATTACAATCAACACAATTTTCTCTCTATCTCTCTAGCAACC TAAAGCATGACAAATGCAGCCACGAATGCTCAAACAAAGCTACCTTATAA ATAATACTCCATATTCACTAATATAGAACATTTTGCCAAACCAAATTAGC TTGCCAAAACTTTTTATATTAGTGAACAAAACGGTTATAAAATTTTATTA TTTTTTCATGCATGAACTGCTACATATTTATGCGTCAATACATGTAAAGT ACATGTAGTTATATCTTAATACATCTAGCACCCAACATCATAGTAGGATG ATTCTCCAATCGCCTCTTTTATCTCTCAGAATATGTAATACATCCGGTTC TTTAGCATGAACCGTGTCTAATTAAACTCCACTCTAAGCACTTAATGAAG TTAAAATATTTCTATAAATCTTATAGAACTCTATAACTGTAGGCATGAAC CGTGTATAATTAAACTCCACTCTAATCACTTAACTGAGTTAAAACATTTC TATATATCTTATAGAACTCTATAACTGTAAACCCCATGTTACGAACATGC TATTTATTTTGATTCTTGGTTTAAGAATAAATTTCATGTTCACATTTTCA TCAAAAGTTACAAACTCAGAGCCACAAATAATTGTTCTTTTCATATACGT AAACTAGCTACATCTGAGACCATACCTGGACACGAGCTGACTCGGTCCAG CTCGTGGCCGAGCCACAAAAATCTCCGTCCGGACATGGCGAGCCCGAGCC AGCTCGCCGCCGCCAGCGAGCCGCATTAGTGAGCTTGGCTCGAGCTTACC CCAAACTCAGTCCAGCTCGGTCCGGCTCGCGAGCCTGGCATGATTGTGTC ACTGACAAGTGGCCCTCTTCAACGGCGGCGGTGGCGCGGCGGTGCGGCGA AGCCTGCAGACGGCTGCGGTCCAGGCGGCGCGTGCGTAGTTGGCTGTGCA GCGTTGCAGAGGTGGGTACGATGTCGAAGAGGAGCGTGGCGGCGCGGCGG AGCCTACAGGCAGCAGCGGCGCGGGCGGTTGTGCGGGCGGCGCGACGGTG CGGCCGGCCGGCAACATGGTCTGGGCGGCGGCAGCTAGGAACGAACAGGA ACTCCCCTGGAACCAACGTGACCTAGCAGGCCTAATTTTTCAGCCCAACT GATTATCCCCTTGCTCAATTCGGCCCTTTTTATAATTTGGAAAAAAAGAC GAGCTGACGAGCCAGACCGGGCCGAGCCCGAGCCAGCCCGACACTGCCGC GGTCCAGCACCAGAGCTCGGCTCGGTCCAGCCACACCAGCGGGCCGAGCC TAGCTCGCCCCGAGCTGGCAAAACTCGGGCCGAGCCCATTGGACCGAGTT TGAGGTCGAGGTATATCTGAGACAGACACATCCTCAATAGGGTCACATGT CCCATGTACAGAAGGAAAAGATTAATCAAAGTCATAAATGAGGAAAAAAT TAATGAAAGTCATAAATACTTCCTTCGACAGGTTTTATTAGGCCAACACA TAGTTCAAGAATAAATTTTGTCCATAAATTTGGTGAGCAAAATATGAATT ATATGTCATAAAAATTAAATCATTGGATTCATATATACAAAAGAAATTTC CAATGTTATATCTTTTTATGACAAATAATTCATATTTTGTTGGCCAGATT TATAGTTAATTTTTCTTCTTAAACTACGTATTGGCATAATAAACCCGGAC GGAGAGACAATCTAGAGATCCACTGATATGCACCCGACCAAGGAAAAATA TTGATGGACCAATCAACAGAAAGCGCAATATACCATTGTTAAGACTCTTC ACAGTGTATGTGCACCATTTTTCCTCTTTGCTCACGCCGTGAAGTTGCAT GCAGTTCTGTTCAGAAGCTGCATTCACTTCTGTTCATGAGTGCCCTGCAG CGTGCAGCGGATGGAGTGTTGATGGTTGATTTGGGTCATTGCCTGCAAGT AATGGACTTGGATAACTGCTCGTGTAGGCAAAAAAAAAGGAATTTTATGG AACACAGCTAGAGTCCTTTGGACATACTATATGTACGTCTTTTACTTACA TCGTGCACGGGAGTTTGATTTTATCTTTGATACATCCCGGATCGTGTCAA GCCCTACCATATAGTACATAACTTTTAGCATAACAGTTAAACTCTTATTA AATCTTAGACATAGATTTTAGATCTAACAACTTAAAATAATTAGTATGAT GTGGATCAACCTGGTGCCTCGAAAAGCAACCTTATATTGCTTTTAGTATA TAATAGAATAGATTTGAGAATTACTATTTGTAGGACAACTATGCAATGGT GATACAATTATTTTTTCTAGGAAGACTATATATGCAATGGTGATACCCTA ACCATAATAAGTATGGCATTTGTCAAAAGTGATTATTGTATTTCAGTAGT CATAGCTAATAGTTCAAGCAATTTTGGGATAGAAATAGGCTCCTTTACAT TCAATGATTTCGATATATATTCAAATTCAAGGATTATGAAATTTCATAAT TGCTTTTAATAGATCCTGGTTAGCCGAGAACTAGTTTAGTGGTACATCGG TCGATGGTGAATATTTTATTTTATTCTAACGAGAAAAATTAGCGTTGATG ATGGTCGGCTTTTGTATTTCGGCAATTAGCCCTCTTTACTCCTTTCATTT GTTGAAGATGCTTTCACGTTTTTTTCCCATTTTTGTAGGCACAACTTTGT TTAGATATTATCTACATCATAAAATGCGTCTAGATATGTGCTTATCTAGA AAAAACACCACATGTGTTAATTTGGAATGGTGTACTCCACCCGATCCATG TTAATTGACACAACTTTGTCTAGACATGTATGTATATCGACACTAAAACA CATATACATACATATATAGACAAAGATGAGCCAACCAATTTAGATAGGGG GAATTTTATATTTTTTCATCTCTTTGTTATAATTTTTTCTTGTGTGCAAT TGCATATATATATATTTGTAATTAGAATCTATGTTTCTTACACGCGATTG CACATATGTGCGCAATTGAAAACCCTCGCCACTTTTATGTGCCTTTGCAC ATATATGTGTAATTGCTTGTATGTGTGCAAGTACATATAAGTGTGTAATT TGAATGTATATTCACATATATGTGTGATTCTACACCCTGAAATCTATAAT TTTTTTGCTCACGGACACAAAATTACACATGGTTAGATAAATGCATATAA TTGTGTATTTTTATTGTTTTGTTCAATTTCGTTTTTCATGCTTTATGATT GCCAAATAGTAGGCATTTTCCTTGTAAAAAGCCTAGTTGAAAATTTTCAT ACAAGACTAAAAGGTGGATTTACAAAAAATAATCACCAATTTAGCTCTCG ATCAACCTAGTTCTAGCCATGTCATTTCTTAATATATTTAGTTGGTGCAC ACAATTTTAAATTGAGGGTTTCCTAGATCTCCTCTACAAGTAATTGGAAT TGTGTTGTGATTCGTGCACATGGTCAACTAGTTTTTCTTAGTAATTGCCG GGCGGCACAATTTAAATTTAATTTGTTCAAGGGAAATATTTAAGTCCTTG ACTTAAGAGTTTAGACTTTAAGACACGCTTTGCAATTGATGGCTTACTAT TGCATATATGCGCATGCAGACATCGACGAGTGCAAATATTCAGAAGCCAA TGTGTGAATACCGATGGATCTTTTCAGTGCAAGTGTCCACCAGGTACCCG TGGTGATCCAAACAAGCCCGGTGGCTGTTTCAATATCCTCAAAAGTAAGC AACTTCAAAACTCAATTTGTCAGGATAGTACTTATTTTTCTCCGCTTCCT ATCGAGATGTGAATGAGTTAATTCCACAAGTTCAACAACCTAAGTATGTC CAAATACATGGTTTATAAATCCAAGATTCTTGGCCAACTATAGTTATGTT TAATTATAACTTCTGATATTATAAGTTTTCTCTCCTAATGGATTGCTTGG GCGTAGATAATAAATATTTATATGGTATATAAATAATAATTTTTGACATA AGTTTCGTAAAATATTTCTAAGGAATGGAAGGTGTGGTCACAATCTTGAT AAACAAAATCTGTACACGCTGGATAAATCACCCAACCAGATTCACAGTTT GGTAATTATGTTGCACAACCCTGAAATACGAAATAATAGAAGTCATTGGA AAAACCTGTAATTGATAGTCATAACCTTCTTTCAGATCATTGAACCGAGT CTGTAAAAAACTGTAAAAAACAGAATATCTCTATTCTTCTCTGCAATCTC GAAGTGCATGTAGAGTAAAACTAGAAGAACAAAATAAAACATACGCTACT AGGTCTCCAGAATAATTGCCGGAACATGATATGCATTTGGTCAAGGATTT GATCAAATTTCAGTTTCAATGCCAAAACTTCGAGTATTATGTTCTAGTTA ACAAGAAATATATGCTGCTCCATGGCGAGCATAGGGATGTTGCACGTCCC GTGTAATGACACCGTGTAGATTTTAGCTATGGCTCTAAACTTCTTGAATT TTTGCATAATATTTACACTTGAATTTTAATTACGTTGTTGTACTCTAAGT GTTAGAGTTGATAACTTATAACCTTGTCCTAATTTAAAAGCAAAGGGAGT AACTGTGTAGGCAATAAACAGAAAGGTTAGACACGACATTACAAAGAGGA TGGTCTGGTGCCTGAGGCACATATGATCAGACCGGAATGACATGGCCATA GTGATTTGTCTATTGGCCTCGACACTTTCCACCAGTTCTATTAGGTTGAT GATTAGTACACGAGAGGATCACCCGTTAAGCATGGCGTTGATATCTAAAG CTCTAGAATGGAACAACACATGCCTCCGGTCTACTTTTTTCTATAATGAT CTAATTGTCTATAATGCTACTCCCTCCGGTCTATATTAATTAGTGGCCTC GACTTTATCTAGATTCGTATATTTCTAGTTAAGTATTTAGACTAGATGCA CTCGTATATATTTAGACTAATTGTCGTATAATGCTGCAGGTGAATGCATC ACGTTATGCGGCAACCTGAGTGTGCCATACCCGTTCGGCATTGGTCCGCC CAATTGCTACATGAAAGGTTTTAACCTTAGCTGCGATAACAGCTACAACC CCTCGCGACTGATGCTCGGCTACTACCAAGTTGTAGATATCTTCCTCAAC AATAATACAATGCGCGTCATCAGCACCGACTCAATGCTCGATATCTCCGG TGGCATAGGTGCATTTGTAATGGAATTCGAGAGCACGGGGCATGGAGACA CGGTGCCCTACACAATATCAACCACCAACGAGCTCGTACTCATTGGATGT GGTGTGCAGGCGATTGTGACAGGTGATGGAAACCCGACCATCCTCAGTGG CTGCTCCTCCTTTTGCCCCACAAACAAGAACGGCACCTACTTTGACGCCG CTCTGGCAGCAGCTGCTGCCTCCGCTAACGAAGAAGACGACCAGCACTGC TACGGCATGGGCTGCTGCCAGTCACACATCTCCATGTCCAGGTATGGCAT GCCCAGCCAATTCTCGATCAACTGGATGGACCCCAACACTGCCTGGGACG AGGCATTGCCCCACTCATATGCGTTCATCGCAGAGGAAGGGTGGTTCCGT AAGCACAAGGTCTCTTCCCAGCTTCTGCAGCAGCGTCTCTCAAAAACACG TCTAGAATCTTCCCAGATGATGGCTATTCCAATTGTTCTAGTATGGGAGA TATTGCAATTTCAACAGGCAGCTGGATCACCGCCCACGGCCAACGGGGGA GCGAGCTCTCAACCAAAATATGTCAAGTGTCCTGGCATCTGCAGGAGTAG TCACAGTTTCTGCAAACCAAGAAACAGAGGATATTCGTGCCATTGCTCCC AGGGTTACGACGGCAACCCCTACATCGTTGACGGATGCCAAGGTAAGCAT AAAAGCACGCAAGAACCTTAACTACATGCGTACTTATTTATTATGTGCCA TTGGTTCTTGTCATTTGTTTCTCTAGCACTACTACTATGTATAAATTATT AAGTTAGTGTTTTTTCTTTGGTCTTCAGGTGGCCCCAAATACTTTAAAGG TGGGAAATAATGCAACTACTTCCATTTTTCGTGACTATGGAAGCAGGACT CGCTACTCACCAATGCTCTGAATTAACACTCATACTTGGTTCCTCCTCAT TTCGATTGTTTGTCTAATTTCAGGTATGAGCATTGTTATAGGATTTTCCA GTGGAGTTGCCATTGTACTTTTAATTTCCACAACGTTCTTAATTTCCAAC AAACTGAAACACCGGAGAGAACAAATGATGAAGAGGAAGTTCTTTGAGCA AAATCGTGGGCAATTGCTACAACAATTGGTATCCCAGAAAGCTGATATTG CGGAAAGAATGATCATATCCTTGGAGGAGTTGAATAAGGCAACCAACAAT TTTGATAAAGCTCGTGAGCTTGGTGGTGGAGGACATGGTACAGTGTACAA AGGTATTTTGTCGGATCTCCATGTGGTAGCCATCAAGAAACCAAAGAAGG TGATTCAAAAGGAGATTGATGAGTTTATCAATGAGGTCGCCATTCTATCA CAAATCAACCATAGAAATGTGGTAAAACTCTATGGTTGCTGCCTTGAAAC AGAAGTGCCGTTGTTGGTTTATGAGTTCATCTCCAATGGAACCCTTCATG GTCATCTTCATGTACAAGGACCAAAGTCACTATCATGGGACAATAGGTTA CGTATAGCAATTGAAACATCCAAATCCATAGCATATCTTCACTCAACAGC TTCCATACCTATCATACATCGGGATATCAAGTCAGTTAACGTTCTTTTGG ATGACACTCTAACAGCGAAGGTAGCAGATTTTGGAGCCTCCAGATATGTT CCCGTGGATAAATCAGGTGTGACAACAGTGGTGCAAGGTACAATAGGATA TATGGACCCTATGTACTTCTACACAGGGAGACTTACTGAGAAAAGTGATG TTTATGGCTTCGGTGTCCTGCTCGTTGAACTGCTGACTAGACTAAAGCCA TTTTTGTATATGTCTACTGAAGGGGATGGTCTTGTTGCACATTTTTCATC CTTGTTTGCTGAAGGAAAATTATCAGAGATATTAGACCCACAAGTTACAG AAGAGGGGGGCAACGAGGTCGATAAAGTCGCCGCAATTGCGGTAGCATGC ATAAAAATAACAGGAGAGGGTCGTCCAACTATGAGGCAGGTGGAGTTGGC ACTGGAAAGTGTTCAATCACCAAAGCATCCAGGAAATGAGGTCGTAGGTG TTGGCACATCAAAAGATTGTTCTTCGATTAAAGATGGAACAAGTCACCAG GAGTCAACAAGACAATATAGTATGGAGCATGCATTCCAGATTTCAGCAAC ATACCCAAGATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.