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GrainGenes Sequence Report: AA027951

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Sequence
AA027951
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027951
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCGCTCGCACCGGCAGCCCAGCATTGACTCGCAACACATAAATATCCTC
GTCGTCTCCCACCTCTCGCCTTCGTCCCCTTCCCCAATTTGTCCTCCTTC
TTCCTGCAGAAGAAAAAAAAATTCTGTTACGCCGTGCGCACTGCGTGTTC
CTCGACTCGACCGGCGGGCCATGGCGGACGCGCCGGTGGAGCTGCCTGGC
CGGCTCGCCATACTGCCCTTCCGCAACAAGGTGCTCCTCCCCGGCGCCAT
CGTGCGGATCCGCTGCACCAACCCCAGCAGGTCAGTCTGATGGGCGGGCG
ATTCCAGGGGAGCCGATTAGGCTACCTCTTAGAGCTGGGGGTTCAGGGTT
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GTTTTCTCCGCCGGAGCCGATCAATCGCTTGGCCCGCACCTTCCGATTCA
GTGTCGTCTTAGCAAGCTAGCCGAAATCGAGAGGCCTTTTTTTTTCCTTC
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TTGGGGGTGATTCAGGTGAAGGAGGCAGCAAGTCACCTGGTGGTTCTGGG
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TTTGGCATGGATTAGGCTGTTGGCAGATATAACAATGCTCCTCAATATTT
CATTCTATGAACCATATGAAAAATAGATTTAAGCAAACGACTTCGCATTT
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AGCTTATGGATAATTCTCCTTTAGTTGATTGTTGTTCTGTTGGTGCTTCA
CATGTCTGTCATGTAATAATCTACTTATTCTCCAACTATTAACTGTTTGA
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CTACTATGTTCTACAGATGGTTGCTGTGCCATGGGCTTTCTTGTCTACAG
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AGTATAATTTCTTCTTGACATACTTTATTAGCTCATAAAGAATTCAAAAG
ATTCTGTTTCCTGTACGAACTACTTGGTTATGTAGCTTCCTTTTTCTTTT
CAAAATCACATGATATATCAAATTTTGACTCTCACATCACTATTGTATCT
TTGGTTCAGAGTTGGAGCAGGCAGAGCAAGACCCTGATCTAATTGCTCTT
TCTAGGCAATTTAAAGCAACTGCCATGGAACTCATTTCCGTCCTAGAGCA
GGTAAATAACTCAATGAGATCTTGATGTCCTCTTTTTACCACTAGATTTC
AAGAGCCTGTAGTTGGCAGGGTAATAGGAAGATTCGGTCCAGAACTGAAT
ATTGATTAATGTTGAAGATCAGTGGTAGATCCATGCAAGATTGTGAAAAT
GAGCTGAATCTATTTATGATCCATGATGTTCTTTTTTGCTGTTGTAGAAA
TTACTAGCCGGGTTTTGGTTTCTGCAGAGGCAGAAGACTTACTGCTGCTT
ATGATACTTATGTGAGTTTTTTCTTACTATTGCTCTGTTCTTTCTGCAGA
AGCAGAAGACGGTTGGTAGGACCAAGTTGCTGCTCGAGACAGTTCCTGTA
TACAGGCTAGCTGATATTTTTGTTGCTAGCTTTGAAATAAGCTTTGAGGA
GCAGCTCTCTATGTTGGATTCAGTTGACTTGAAAGTCAGGCTTTCCAAGG
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ATCTGTGAATTAATGATAAATTGTGTTAAGGTTCCTTGTGATTTAATAAG
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AGTCAATTCTCGTAGCTGAGAAAATAACACAAAAGGTTGAGGGGCAGCTG
TCGAAGTCACAAAAAGAATTTCTGTTGCGCCAGCAGGTTTGTTTTTTAAA
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TTATATTTCCAGTATGATAATAACCCTGCTAATTCTGCAGATGAGGGCTA
TCAAAGATGAACTTGGTGATAATGACGATGATGAAGATGATGTAGCTGCA
TTGGAAAGGAAGATGCAGAATGCAGGAATGCCTACTAATATTTGGAAGCA
CGCCCAAAGGGAGTTGAGGTAACTTATCCTATCTATATCCTTTTCTATGT
GCTTACATGTAGTATTGGAGGTTCGTTCATCCTGCTAGTCTTTGTGCAGG
CGCTTGAGAAAGATGCAACCTCAGCAACCTGGATATAGTAGCTCGCGAGC
TTATTTGGAACTTCTTGGCGACCTTCCTTGGCAGAAAGTCAGTGAAGAGA
GGGAACTTGATCTTAGAGCTGCAAAGGAGAGTCTTGATCGTGATCATTAT
GGGCTGACCAAAGTTAAGCAGCGGATTATAGAGTATTTGGCTGTCCGTAA
GGTTGGTACCTTGACGTGTGTATGCTAATTCTTATGTGCCTGTCCTGATT
GTTCTATCTCATGTTGATGAATTAATTTTCTTGCAGCTCAAACCTGATGC
CAGAGGTCCTGTGCTGTGTTTTGTGGGACCACCTGGTGTTGGAAAGACAT
CATTGGCCTCTTCCATAGCAAAGGCCCTGAATAGGAAGTTCATAAGAATC
TCTCTCGGAGGTGTAAAGGACGAGGCTGATATTAGGGGCCATCGAAGAAC
ATACATTGGAAGCATGCCAGGGCGCCTTATCGATGGACTGAAGGTAACTC
GGATCTCTTTCCAGTTTCAGGATTAACTTGTTTTTCCTGCCAATATTATG
TGGAGGATCAATTGTGCTTAACATATTAATGCACCTTTTCTTCACTATAA
ACTATTACTCCTTCTAGTGTACTTAGTCTTGTGTCATAGCTTGACAGCCA
TTACAAGATCTTTTTGTGTGCACAACGGATACTTTCTTCATTCCTAGTTG
CTTCCCATTGAACAAATCTGAGTACCATTTACTCTTGGTATAATTACTTG
TAGATATGATTTTGAATTCCCCTGGCAACAGCACACTGATTAAATTTAGC
TTTCTGTGAATCTGGGTCTAACATCCTTTTGTCGTATATTTCCGAACCAA
GAGTTAAATAAAGTCATTCTTACATGCTGTTCTAAAAAAATGCAGAGAGT
ATCTGTCAGCAACCCAGTGATGCTTCTTGATGAAATTGACAAGACTGGTT
CAGATGTACGCGGCGATCCAGCATCAGCCTTACTAGAAGTTCTTGATCCT
GAGCAGAATAAAACGTTCAATGATCAGTATCCTTTCATTTTATGTGCGTA
ACAAGTGCATCTTATTATTAGCTTGTTGGCTCCTTTGTGAAATCGTGCCC
TTTCCTAAAAGATGTTTGTTATGCATGTATTGGTTAGTTAGGCTTATCAC
TTCTGGGTACCCTTTTACTCTCATCTCCGAGGATTGCAATTTTTCTAGGC
CCATACTCTTTCTAAGAGGATATGTTCTTGGGTTACTTAAAACTCTGATG
CACACCATACAGTACCTGTGGAAGAGATTATGCTATTTGATCTGCTATCT
GTATTTTACATGTTAAAATTCCTTAACACAATTTTACCAGCTATTTAAAT
GTTCCATTTGACCTGTCAAAGGTCGTGTTTGTTGCAACTGCCAACAGGAT
GCAACCTATCCCTCCTGCTTTGTTAGATAGGATGGAAGTCATTGAGCTAC
CAGGCTACACCCCTGAAGAGAAGCTAAAAATAGCGATGAAACATCTCCTA
CCTAGGGTATTGGAACAGCATGGCTTGAGCTCTGCATATCTTCAGATTCC
TGAGGTATGAAACAAGCACTATCTTCTGCTGGTGTAAACTATTTTATTTG
ACATCCCATGATCAAAAAAGGTTTGAGTTTGCTTTACCTCCTTGGGAACA
AACTGAAGTTTAAAATGGAAAATATAAAGGCATTTAAATTTAGTTTTTAT
AGCGTGAAGTACAGTGTACTGTGCTTTAGAGGGGCGCTATTTTATTTGTG
CTATAGCACATGTAGTTGATTTTGGGTTGTCACTCCATTATTTTAACAAG
GAGAAGACATGATGTCAGTATGGTTAGTTGGGTTTACTCATAGATTTACT
CCGTGAAGTAGAGACGAATTTTCTTGTAAATGTTTCCTTAGAGAGAGAAC
TTCTTTCTTATGGTCTTCTCTGTAGGGATAGAATGTATCTGCTATTGATC
AAGCCTGAACAATGAAGTAATTTCCTCTTAAAAAGTTCTCGCATTCTAGT
CTATAGTCTATCTACCCTTTTAGTATTCTAACCCCCCTTGAAGCCATCTC
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TTACCATCGCCCTTTTTTTTGCAGTCGAACTGCTTATAATTCACTAAGTA
ATACTCCCTCCGATCCAAAATAAATCAGCGAGACTTATTTTGGATCGGAG
GGAAAACTATTGAGTTCATTATCTGTCCTGAAACAGTTCTTAGAATGGTT
CTCTTACACCTTCTCCGTTTATTTTGCATATTTTCTTCCATTAGAACTCA
TTAGTTAATCTCTGTTTTCCTTGTACCTTTCATCTGTCCAGGCTGTAGTG
AAACTTATTATTGAGAGGTACACACGAGAAGCAGGTGTTCGTAATCTTGA
ACGAAACCTAGCTGCATTGGCCCGTGCAGCTGCTGTTAAGGTTGCAGAGC
TAGACAGTACACTGAGACTTGGCAAGGAATTACAGCCAATAACCACAACT
CTACTGGACTCGAGGCTTGCCGATGGTGGTGAAGTTGAAATGGAAGTTAT
TCCTATGGGCCAGGACATATCAAATTCGTATGAAAATCCATCACCCATGG
TTGTTGATGAGGCTATGCTAGAAAAAGTTCTTGGGGTATGCCATTGCCTC
TAAGTTTGATTTCATGATAAGCTAGATTAGTATGTTATGTTTGTTTGTTG
TATCTTACCATGTTACATTACATTGTGCTACAGCCTCCTAGATTTGACGA
TAGAGAAGCTGCGGATCGTGTGGCATCCCCAGGAGTGTCTGTTGGGCTTG
TCTGGACTTCTTTTGGTGGGGAAGTTCAATTTGTAGAGGCTACAGCCATG
GTGGGTAAGGGTGACTTGCATCTGACGGGACAACTTGGTGATGTAATCAA
GGAGTCAGCACAGTTAGCTCTGACGTGGGTAAGCATCTTACTTTCTTCTC
ACCAATCTCCCTCACATGGTGTGACCTTTTATTTATTCTTATTCAGTTGG
CAGGACCTGCCGTTGCCATGTGAAGTTGTTTTCTAGCAGCATGGTGCATG
GTTAAAATACTGTTTAAATTAAGCATCATCTACTCCACTATGCTTAATTC
TCAGTATCAGAACATATCAAGTTCAATAACGTTCTGTTCCTCTTTAACTT
GGATTTTGCTTGTTCTTGCAGGTGAGAGCAAGAGCTGCTGACCTCAATCT
GTCACCTAATTCGGATATTAACTTGCTGGAGAGCCGTGATATTCACATAC
ATTTTCCTGCTGGTGCTGTGCCAAAGGATGGTCCTTCTGCAGGAGTAACA
TTGGTAACATCTCTGGTGTCGTTGTTTAGTAACCGAAAAGTCAGAGCAGA
CACCGCGATGACGGGAGAGATGACCCTTAGGGGCCTTGTGTTGCCAGTTG
GTGGTGTGAAGGACAAGGTAGAACCATATATGTTCCTGATATTTTCTCTG
TTTCTTGCCTGCATGCAAACCATGGAAGGCCGAACCACTTCCCTGATGGT
GCTCTTCTATGTTTCTAGCTACTATATGTCTATATTTAACTTCAACATTT
CGCTGGAATTCAGGTGCTTGCTGCACATCGATATGGCATCAAGAGAGTAA
TATTGCCAGAAAGAAACTTCAAGGACTTGGCTGAGATTCCAGCGCCCATC
CTCTCTGGCATAGAGGTATGTGATTGCTTATTGTTAGTTGTAGTCAAGAT
CTGCCCTGAACTGCTACATTATGTAGCTTGGTTGTTAAGGATATGCTCTG
ACCTACCAGAAGTCTAGCACTAACTTGATTCTGCATTTATACCTGCTCCT
AATATGTATGATGCGCGAATTATTGAGCACACATTTTTCATAGAACACCT
CTAGAAGTTTTTGCTATCATGCTGAGCTAAAGCATCCAGAAACCAGAAAT
AGCAATCTGATGGAAATTTATGTCGCAATTGTGTCTCTCCTCTGCATACG
ATGTTTGTTGCTGACTTGTGTTTGCTTATGCTGCTGGTAGATTCTGCTCG
TGAAGCGCATAGAGGAAGTACTTGGCCATGCTTTCGAGAACGGATTCCCT
TTAAGACTACAGTCCAGTCTCTAGCACGGACAATACCAACTGGAACCTGT
TGTGGTGTTTTCACACTGGTTATGTAACTGTTCCGAAGATTGACTGATCA
CTTGTTCTTGGCTGATGTATCTGCAACGAGCAGTCGAGAGCTATCGAGCA
ATTGTTCCATCAGAGCGAATCTAATGATGCAGTCCTTGCGTGCCAAACTC
GGTTAAAGCTAATATTCGGAATGTATATATGGATATCCATGAAAGCGGCA
AGGAGATATGCTCCGACCCTTTGTGCTTATATTTATAGAGATGCTGATCT
ATACTCAGTTTGGTATTGGAGCAAGGAGGTCCACTTGTTGTTTTGCGCTG
CTGTCGGGTTTGGGTGTATATGTAACCTATTACAGGGAAAATTCAGTGTT
GCAATGTAATAAGATGGGTCCTTACAAAGAATAATCGTATAAGATTATTT
GCCAATACAAGTTACTTTCCCCTTACAACTATTGAGCACCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.