Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005518

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005518
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005518
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAAGCAGCTGCCGGTGGAGTTGATGACATGACAAAGCTCTCCTACCT CCATGAGCCAGGAGTTTTACAGAATTTGGCCATCAGATATGAACTTAATG AAATATATGTATGTTTTCTTTCTTACTGGGAACTTGCAGCAGTCTACACA TATTCCGTTATGTCAGCTGTACTGTCTGGTTTAAAGTTTGAAACTCACGT AATGTTTCACATGGCTGATATCTCTTCATTTGGGCAGACATACACTGGAA ATATTCTCATTGCTGTCAATCCTTTCCAAAATTTGAAGCATTTATATGAC CTGCATATGATGCAACAGTATAAGGGCGCACCATTTGGAGAGTTAAGTCC ACATGTTTTTGCTGTCGCAGATGTTGCATACAGGTAAGTAAACATAACCA AAATCGGTTTGGTATTGCTAAAGAAGACGGGTTGATCTCATTGTTCTATT TCACATGGAATAGGGCTATGATTCATGAAGGAAGGAGCAACTCTATTCTT GTGAGTGGTGAGAGTGGTGCTGGTAAAACAGAAACAACAAAAATGCTTAT GAGGTATCTTGCTTATCTGGGTGGCCGTGCTGCAACAGAAGGAAGAACAG TAGAGCAACAAGTTCTTGAAGTAAGACAAACAGTTACTTAGCCAGGCAAG AAAAAATTACTGTTAAGTTATTTATATTTCAATCGAACTTCTATTTTGCA TTATTATATCTGCAGTCAAATCCAGTTCTTGAAGCTTTTGGCAATGCCAA GACCGTAAGAAATAACAATTCGAGGTAAGAGATAGAAAAAACTACAGATC TCAAAGATTACTTGCATTATTGAAATCATGGAGGTGTATGTATAAGTTTG AATCTCATTATTTTCATGATGCTTGGTGCAGTCGATTTGGTAAGTTTGTT GAGATTCAGTTTGATAAGCAAGGAAGAATCTCGGGTGCTGCGGTCAGAAC TTACTTGCTAGAAAGGTCCCGTGTATGCCAAATTTCTGATCCTGAACGTA ACTACCACTGCTTTTATCTTCTTTGTGCGGCCCCACAGGAGGTAATGATC TATATTCTCCTTTGGCACTTCTTATGCGCCTTGATGGACTCCTAATACAC ATAATCTGCTTTGGTGCATTGCATTTTCAGGATGTTGAAAAGTACAAATT AGGAAATCCTAAGAATTTTAATTATCTTAATAAATCAAATTGCTATGATT TGGTTGGGGTTAGCGATGCTCATGAGTATTTGGCTACCAGAAGAGCAATG GATATTGTTGGCATCAGTACTCAGGAACAGGTAGCTCAAACTATTTCCAT ATGTACTTTGATATGATCAATGTGCAGTTTAGCTGTTTTTTCTTCTCACC TATTTGCACTTAAACTTGTTTCCAGGATGCTATTTTCAGGGTTGTTGCAG CTATCCTTCATATTGGCAACATTGAATTTGCCAAGGGGAAAGAAGCTGAT TCCTCAGCTTTGAAAGATGACAAATCTAAGTTCCATCTTGACACAGCTGC TGAACTTCTCATGTAACTACCTTTATTTGGTTTGTGTTACCTAATTGCTG GTATTGCATGTGCTTGCTCCAATGACTGTTGACATGTATTTTATGTCAGG TGTGATCCTGGAGCCTTGACAGATGCTCTTTGTAAGCGTGTCATGGTAAC ACCAGAGGAGGTTATAAAAAGGAGTCTTGATCCTTACAGTGCAACTATCA GCAGGGATGGTCTAGCAAAGACGATATACTCTCGTTTGTTTGATTGGTAA ATTTATATTGCCTGTTGTACTTCATTATGTATATCCTTCGTGCCCAAATT CTGATGCAATGCAACCTGTCATTATCTTGCAGGCTTGTTGATAAAATTAA CAGTTCCATTGGGCAAGATGCTAACTCTAAATGTCTTATTGGTGTCCTCG ACATCTATGGTTTTGAGAGCTTCAAGTCAAACAGGTCATATTTACTGTAG TCCAGTCTTGTATTTAGAACTCACTAGGTTGTTTCCACAAATTGAAAAAT AATGTTTTCTGCAGTTTTGAACAATTTTGTATTAATTATACAAATGAGAA ATTGCAACAACACTTCAATCAGGTAATACTTGTTCACAAATAATGGTTCA TGTACACCAAACCCCCATAGACATTTGGTAAACAGAGGGCATATATTTAT GTGAAAGGTGCTTCGGTGATCTTTTTCAGCATGTTTTCAAGATGGAGCAA GAGGAGTACACCAAAGAACAAATTGATTGGAGCTATATTGCGTTCGTTGA TAATCAAGATGTTCTTGACCTTATTGAGAAGGTATGTGTAAAGTTTTAAT CAATTTAGTTTCATCTAGTGCTTGATGGTAAAATCTGTAGTGCAGTAATC GGGCATGTTTATGAGTTTATCGGGTTTTTCTTGTTTTGTCATTATTTTTT TTTTTTTTGGGAAAACGCAATGACATTGCGTTTCTTTTCACTGCACCGAA GAGTTTCACTTTTACAGGATTACAAGCCTATGCCACACATGCATAGAACA GGCCACCGAGAAGGCGGGGAACAAAGTTTTGCATACAAAAAAATAATTCT TTTCATTAATTGTTTTTTAGAAAACGCAAAAGACTTTTGTGTTTCATTAT ATTGAAAAGGCAGAGTTTGTTACAATCTTAATGTTGCCGATATGGTCGTA TTACTGTAGAATGCAATCAAATAATTTCTCAGTTAGTGCCTACTTGGCCA AGTTAAGCCTCACCTTATGGACCACATGCTTAAAACAAGGCGAAATATTG ATTCAACATGTATTTATATTTCTTTAAAAGGATCACATAGCCAGAGAAGT CCCTATGTCTGCAAGGAATTACACTGCATTCTTTTTCTTTTACTTGCTTT AGAACAATGAACATCTTTTTCAATCAGTTCTGCAATGGATTCTCACTCAT TAATGTTCCATGTATTACTGAACTGTCACTTTGCAGAAACCTGGTGGTGT TATTGCACTTCTTGATGAGGCGTGGTATGTTTACCATATCTTTTCTTTGA TCACGTCATTTAATCATTCTGTTTTACTGTGTGAATGAATGTCTTAGTTA ATGATCATGGACTAAACAATGTGATAATTGTATTCTGTTTACTGTTCTCT ATTCAGTATGTTTCCGAAGTCAACACATGAGACCTTTTCCCAGAAGCTGT ACCAGACTTTTGCAAAGAATAAACGGTTTGTCAAGCCCAAGCTATCTCGC ACAGATTTTGCAATCTCCCACTACGCTGGAGAGGTTAGGTTTTATTCATC AAATTCAATGGCTCTAGATACTGTAGAGTTTTAACTAATGTTAAAGTATT TATGCTTGTGGTATGCAGGTGATGTATCAGTCTGACCAATTTCTTGACAA AAATAAAGACTATGTTGTGGCAGAGCACCAGGAGTTACTGAGTGCTTCTA GATGCTCCTTCATTGCTGGATTATTTCCTCCTCCAGCAGAGGAAACATCA AAAACCTCAAAGTTTGCTTCCATTGGAGCACGCTTCAAGGTCTCCCCTCT TTTGCTTCTGCATTTATTATTCAGACTTTGCTGCCACTTCGATATCCACC TGGCCCATCATTTATGTCCAGTGTACTATTAAGCATGATTAATCTTACTG ATTTCTGACTCTTTTTCTGTGGCAGCTACAACTTACATCTCTTATGGAAA CATTGAACTCTACTGAACCTCATTATATTAGATGTGTTAAACCAAATAAT GTGCTGAAACCGGCAATTTTCGAGAATGTCAATGTCATGCAACAGTTGCG TTGTGGTGTAAGTGCCTCTGAATTATCATCTACTGTGCCTCAGACTTAAC TGCAGTGAATGTAGGCTTTGAGTTACTCGATCTATGTTACAAAGTTGTTC CAGTAAATTGCATCCCATCTATCATCAGGGTGTACTCGAGGCAATCAGGA TCAGTTGTGCTGGATATCCCACACGTCGCACATTTTACGAGTTTCTGCAT CGTTTTGGAATGCTTGCACCAGATGCCCTTGAAGGGAAGTAAGTTCTTAT TTGAACTTATCCAGATTTGTAGCTTAATATCTCAGACCCATTAGAATTTT CCGGTGCATCTAAAAGTGATTATCACTAATATTTTTTCTTTCCTCACTTC TCATTAGTTGTGAAGAAAAGGTTGCATGCAAGAGGATTCTGGAAAAGAAG GGTCTTGTAGGCTATCAGGTAACTAGCCATAACTCTAGTCAGTCTCTGCC TTGTCACGTGGTTTGTTTATTCAAAGTTCGATCTTCTATGAATACCTAGC CTTTGGGCACATATTAATGATCCGATAAAGGAAATATTGCCGATAAACTG ATGTAATTGCTTAATTTGTAGGCTTGTAGGTCTAAAGTATCAGACTGTTG CATGCAGGGTGCTCTTACAGTATTAGCATAAAAAATGCAGGATCATGAGA AATTATTTCCTTTCTCTTACTCTAACAATTGTTTGCATTTGTCAGATAGG GAAAACAAAAGTTTTTCTGAGAGCCGGCCAGATGGCCGAATTAGATGCTA GAAGAACTGAAGTTCTCAGTGTTGCTGCAAGAACAATTCAAGGGAAAATG AGAACACATATAATGAGGAAGAAGTTTGTTTCTTTGAAGAAGGCATCTGT ATGCTTTCAGGCAGTATGGAGAGGTCTGTTTGCTTGCACTTAACTGCAGA CCAGGTGATTTTCATTTTACTAATAATGTTAATACTAACGCTTTGGGTTT TAGGAACATTGGCTTGTAAACTCTATGATCGGATGCGAAAGCAATCAGCT TCCGTCAAAATTCAGAAAAATCAACGTATGCATCAGGCAAGGAGGTCTTA CAAACTCCTACATGCTTCAGTTCTTGTAGTGCAAACGGCATTGCGTGCGA TGGCAGCAAGGAATGATTTTAGACATAAGAAGCGATTTAAAGCAGCAGTT ACAATTCAGGTGGTATTCAGTTCCTCCTAAATAATATGACAACTCAATGC ATCTCGTATTTATTTGGGTTTGATGAAACCACAGGAGCTCTGCTATGCAG CTCATTACTGGCTCAACTCATGATATATTCCTAATGTCCTGATTTTCTAC TACAGGCTCGTTATAGGTGCCATGTATCTTATTCATACCACAATAAGTTA AAGGGTGCAGCAATTGTTGCACAGTGCAGATGGAGGGGAAGGATTGCGAG GAAAGAACTCAAGCAACTTAAAATGGTATGTTTATTATCACAGTAAATGC ACTATTTCTATGTCTCATATGCTAGTCACGGAACAACACGGATGGCTGGT CTTATTTGTTGTGTCCACCTGGGGTGGGGGTTGTAACTTCTACATTTGGT TACTTCAATGGATTGGTCGAGCTCCTATATCAGTTTTGTAATGCTGTAGT ATACTTTTATGGCTACAAGATTATACCATTCTAGTATTAGGCAACTTATG CTAATGCTATGTGATTACCATTGTAGAACACTCACGCAACTGCCTTATGT TTTGGCATCAAATGAAAATAAAAAATTCCCTGGAAATATTCTTTTGTCAC AAAAACAGCCAGAACCAGAAGGTGAAATACGAGGTCCCTGAAGGATTCTA AAAATCCCTCGAAGGACATAATATCATAGCACCATCAGAGAGCACAAAAC CATTTCTAATGCATTATTATTAACTTCTTCAGGAAGCAAGAGTTATCTAC TGCTAAGTTCATGAAATCGTTAATAAGGTAGTACCATCAGGGAGCACAAA ATTATAATTTTCTAATGTGTTACTATTATCACCTCTCCAGGAAGCAAGAC AAACAGGTGCGCTTAAGGAAGCAAAGGATAAACTTGAAAAGACAGTGGAA GAGCTTACATGGCGTGTGCAGTTAGAGAAGAGAATGAGGGTAAAATTGTT GAACTTATTGCACTGTTTATACATCTGTTGCTTCATAAAAACTTCTGAGT AAAATGTGTTAAATCATGGCTTGATTTTATATAATTTTAATATGCTGCAT CACAAAAATACTTATTATGATATGTGTATTTCAATCCTTTTCACACAAAT CAACACATGTACAGACAGATTTGGAGGAATCAAAAACGCAGGAGTTGTCA AAACTGCAGAGCTCAATGGATGCCCTGCAAGCTAAATTGGATGAGACAAA TGCAGTGCTTGTAAAGGAACGAGAAGCTGCTAAAAAGGCTAGTCAGGATG CACCTCCTGTAGTACAGGAAACTGAGGTTCTAGTCCAAGACACTGAAAAG GTTGCTTCCTTGGAAGCAGAGGTAGATGAACTTAAGGTACGCAATCTACC ACACTAACACTATTGGTGTTGTTGACCAGAATTTCCCAATGTTTTGTACA TCCAATAGTTTTGCACAAAGATATACTATCAGATAACTAAACACTTCCAT ATTATGATTTAACACTTTCACTAATTTTGTGATGCACAACCTTATTTGCC TGTAGACCTCACTTCAATCAGAAAAACAAAGAGCAGATGAATTAGAAAAG AAACACTCTGAAGAAGCACAAGCAAATGAAGAAAAGCAAAAGAAGCTAGA AGAGACAGAAGTAAAAATACGTCAATTTCAGGATTATCTGAGAAGGTTAA GCTTTTCACATGTTTCTTGTTATGATTTTTTCACCTTTGTTCCGTTGTTT TCTACTTGTGCATGATGCATGTGCAAATGCTCACTTGATTTCAGTTTTCA GACTACACCCATGTAGTGAACACATTCTATTAATATGCTCTATCATCTCC CCGCACACGTCTAGAAATTGTTAAAAAAACGTCTAGAAACAGCGCGCTTC TGTCATTTTTCTTTGGGAGTGATAAAAATTGAATACAAACATACATGTTG CCACTCCTCTCCTTGTCTCTCTGTAGTGAACTTCTGAATTATGGCCACGT TGATATCTGAATGCATTGGTCATCATGTTACACAACATTGAATCTTCATC TTACAATGCCTGTGATCTGCATTTTATCCTTTAGGCTAGAGGAGAAGCTA TCTAATGTAGAATCTGAAAATAAAGTCCTTCGCCAGCAAGCTGTTTCAAT GGCTCCAAGTAAAATTTTGTCAGGACGTTCCAAGTCGAATTTACAGGTGA ACCAGTTTGTGCAGTTATTTTTTTACACTTTGTTTTATCTTGGAGAATGC TTTTTATCATTTATATTGATTGTTTATTTCACAGAGGAATACTGAGAGTG GCCATGTATCAGTCAGCGATTCAAAAACAACTCCTGTTACCGTGAGTTAC ACAATATTTAGTTACTACGTATATACTTGACAATCATCAATATGACATCC ATCTTCTGTATCTTTTGGTGTTTCAGGACTCCGCTACCGTGGCCTCTCCT AGAAAGGAATATGACATCGATGACAAGCCACAGAAATCTCTAAACGAAAA GCAACAGGTGTAGTCTGCTATCTAACTCATGTTTTTTGGGACCACTCTAT AGGTACTTCAGATCTATCTGGTTCTCTGAAATTGATACGTTAGTGTCTTG GCAGGAAAATCAAGATCTACTAATTAGGTGCATAGCACAGCATTTGGGCT TTGGTGGGAATCGGCCAGTTGCTGCTTGTATTATATACAAGTGCCTTCTT CATTGGAGATCATTTGAAGTAGAGCGCACAAGTGTTTTTGATCGCATTAT TCAGACCATTGGACATGCAATTGAGGTTATAACCTTCAAATTTCAGCTTT ATTATCATTATCTACAGTGATGCTGAATTATCATTTTTTGTGTTCTATAG ACACAGGACAATAATGAAGTTTTAGCATATTGGCTCTCAAATGCTTCAAC ACTGTTGCTTTTGCTCCAACGTACTCTGAAAGCGAGTGGGTCAACAGGAA TGGCTCCACAGCGTCGACGATCGTCTTCTGCTACTCTTTTTGGAAGGATG ACCCAGGTACACAATTTTATCTTCTTTAGCAGAAGCTTCACAATAGGTAC TGAGTGATTATGTTATTCATTTTGTATTTCCAGAGCTTCAGAGGGACTCC ACAAGGTGTTAATCTTGCTCTAATGAATGGAAGCATGGTTAGTGGAGTAG AGACACTAAGACAAGTCGAAGCCAAGTATCCTGCTTTGCTATTTAAACAG CAACTTACGGCATATGTGGAGAAGATATATGGAATGATCCGGGATAATTT GAAGAAAGAGATCTCTCCTTTGCTCGGACTGTGCATTCAGGTGGCTATGC TTTATAAGTTTAAAGAATGAGTGTCATTTATTAGCTTGGCTTTTATTTGG GAATATAAATTTGGTACATTATTTGTCTAATTGGTGTCATATTCGCAAAT CTTACCATCAATTCAGGCCCCAAGAACATCAAGAGCAAGCATGATGAAAG GATCTTCTCGTTCAAACACAAATACAGCTGCACAACAAGCTTTAATTGCT CACTGGCAAGGGATTGTGAAAAGCCTTGGAAATTTCTTGAACATCCTTAA AGTGAACAATGTTAGTTTGTTCGAACACACTTTCCTTTTGTTCACGTAAC AATTAAGACAATTTCTTCAGCATTGTAACGTGTAACATGTAATACCATCA CATGTCATTATGTGTATGGTTATTTAACACGGTTGATGTATCTAACAAAA TCCTGCTTATCTTTGTCACTGCTCCAGGTTCCTCCATTCTTGGTGCGGAA AGTATTCACTCAGATATTCTCATTCATCAACGTACAGCTATTTAACAGGT AAAATATACCATGAGATGAAATACAACTATCTGATTGCCTGCAAACACGA GAAATGCTTGACCGGGTTTCATTTGATTATTTTCAATTTTCAGTCTTCTA TTGAGAAGGGAGTGCTGTTCATTCAGTAATGGTGAGTACGTAAAAGCAGG ATTAGCTGAACTCGAACACTGGTGCTATAGAGCTACTGATGAGGTAAATA TAGCTATTTCCGTCACATCGAAAATTCTGATTGATGAGGGCAGTAGACCT ATAGTAGCAACCTATTTTTTCTTGAAGGGGATCTAGTAGCATTCTTGTTT GATGCTTAGCTCATACAAATTAATTTGTTCTAGACCATATGGCTGTGCCT ATAACCTGTCATTTACAGTGATCAATAGCAAAAGGAAGAACAGATAATAT TTGTTTTTGTCATGTTCATTATGGAAGCAGTTTCCGAATTGCTTAATGTT GTAATAAAGCTATATGCATGGTTGTATGCATCAGATATTGGTTTCTCATC TAGTGTTCTCTACTTGCAGTATGCAGGTTCAGCCTGGGATGAGCTTAAAC ATATTAGACAAGCTATTGGTTTCCTGGTATTTTTTCTTGCATTCACTTTA AGAAAATAACTTGCACACAATTTTTGTTTACTAGGTTATCGCTGCTAAGA GGAACTGAGCATTGAAATATGAGATGATTACAACATGACTCCAGTTTGGT CTAGATCACATATTTAACTATTAGTTTTCCTTTAGAAGTTTATCTACTGA AAATATCCACATATCAGACTTCTACTTCGGGGACATGCTCCCGGTCTTAA CACTTGAGATACAAGAATCTATATGAGCTGTAGATTTTAGTACTCCCTCC GACCCATATTAGTTGACTCAAATTTGTCTAGATACGGATGTATCTTGCAC TAAAACTTGACTAGATAGATTCATATTTAGATGAATCTAAATCAACTAAT ATGGGTCGGAGGGAGTACTGAACATCGACAAGTTAAATGCACAGGTCTCA CATATATTATTTTTCCAGGTGATTCATCAAAAGCCAAAGAAAACGTTGGA TGAAATAAGTCATGACCTCTGTCCAGTAAGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAGAGAGACAAAGTCCTCATCATGCCCTTTTGCTTTGAAAATTTACATTA CCTTGGAATTTTAAAACAATCCCGAAACACCCTGTGCAGGTACTTAGCAT ACAACAGCTATACAGGATCAGTACTATGTACTGGGATGACAAGTATGGAA CACATAGCGTGTCCCCGGAGGTACGTTTTCACACACTGTTCCATAGCTGC ATTTCATTTAACCTGATGAGAAGTGATTGCATATGATACTTTTTTTTCGA TAAAGAAAAAAATAAGTGATTGCATATGGTACTTAAAATCAGGTTATATC AAATATGAGAGTACTAATGACAGAGGACTCCAACAATCCTGTAAGCAATT CATTTCTTCTGGATGATGACTCGAGGTGGTTATCCCTATTCTCCCATCAA TCGCATACACTGTAAGAACTAATCTCAAGTGCTTCGTAATTAACCATCTG CAAAACTTTGGAATGCAGCATACCGTTCTCCGTGGACGACATATCAAAAT CAATGCAGCAGATTGACATCTCCGACATCGAACCACCCCCTCTCATCCGG GAGAACTCTGGCTTTGTATTCTTGTTGCCGCCACCTGAATAAAGTGCGTA GTGCCCTGAACAAGAATTGGGCATGGAATGGCACTGGCCCGGGCAGACAA TTGGGCGGTATATGCAGATTGAGTAATTTCCCCTCAGTGGCCAATGAAGT GCAGCGCACAGCTTCATTTGTCTGTTTTTCCGTGGTAGGAAGTAGGAAGC AGGAAGTCATGGATCCCGACCCCATGGCTTATGTGCATTTTGCCTGGGCT CACCTCAAAAGTAGTTTCGCCTCAGTGCTACTTACCTCTTTTTTTTTTTT ATCTACTCAAGTTCTTTTGTTTATTCTTTTTAAGCTCGGAGGTGGTCACA CTAGTTTAATTCAGCTAGACAGAAAGTTTTAGCAGAATCAGCTGAGATTC ATTCTTCATTGCGTAGACTTTTTTGTGTGTGTAGTTTTAGAGCACTTTTG AGGTGAGTTTGCAAGAGCGGTGTAATAGGAAACATATACCCTTGCTATTC AGTCACATGGATTTTGTGGCATGTGTATACCAATTGATCTGCCGATAGTG ATTCTTCGCCGCATGAATTTTTCGAGCTTGTCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.