Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA003570

[Submit comment/correction]

Sequence	AA003570
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA003570
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGTTGCCGGCGTGCGTGGCCTACAATTTTTGGCGACGCTTGGAGGAGGC CTTCCTCGCTGTCATCGAGGACGGTGGAGGAGGAAGAAGGAGAGGTCGTG GACTGTGTGGATCTGGGACACCCATCGACGGTGGTGGCCATGGCAAGGAC GGATCCAGCGCGGACTGCTGCAGCAGCCATCGCTCAGTCTCGCCGTCGGA TTTCTGCCCTAGGTGAGTGCACGCCTCTGTGGAGGAAAAAATTGGTGAAC GCGGGTTCCATCGCCGACAAGGCACGTGTGAAGGCCGTGCAGGCCGTCGT CGACTGGCGCTACATCCTGGTGGCATGAGACCCTGCTCCACATCGCCGTC CGCCTCTGCGATGTTGTGGCAGCCCAGATGCTCAGGGCGACCGTGGTCAT CTTTTATTCCCGAGTCGGCTGGCCGCGTGGAGGTGGACTTGGCAGGAACG AACAGCAGCCTCTGTCTCCGATGGTAGATCAGCAAAAGACGACACCCGTG AGACATACTAGGACGAGTGAGTTCAACTGATTCCTTGATTTCTTTCATTG CCTCTTTCACCGCAGCATTGTCATCCTCAACTTATAATTTCTTCTTTTTT TAAGGTCTTCTCGAGATCCAGAGGAGGAAGATGAGGGTACGCATGCCTCC ATCAGCCCCGAGGCTACCAACTTGGTGTGCATGTGTTACTTGAAGTGGCT TTGGTGTGATTTTTAGCCAAATTTGATCAGTGCGATGCAGGTGCATTACT AGAACTTAATTCTCCCTTCGCGCTTCAGTTTAGGGCATTTAGCCCAACAA CCAGGAGACCAATTGTTACTTCAAGTTCAGAAGTGCTGCGTATATACTAC AGAAAGCATATGAACGCTGCTTATTCTGTGGCTGGTTCTTAAAATAATCA ATAGGTTTCTTAGGGAATTTTAAATTATCGTCATTTCAGATTGATTGATG AAGTACAATATGTTGTCCTTGTGTCTCTTGCTTTACTGCATAACTTAAGA AAATAGAAAAGCCACATGTAGCTGACATTTGTGTTGCTTTGTTCAAGAAA GAAGGCCTTCATTTAATAGAGATAGCACGTTTAGAATGCAACAAGCTGGC ATTTGAACTTTGTTTGTGTGGTTTGTATCAATAATTTTGACTAATTTTGA ATCGAGGTAAATATTCCCTCCCAGGGCATTCTCTACTTTAGTTTCACGTA GCAATTATCGGGAAGTAGTAATGTAGTATACTAATTTTTATTTTGAATGA TTGCAAACAGTTTGTATTTTGTTGGCTTCGAACGTTTTATATTCATATAG AGCCTCAGAGGGTGGTTACTTTGTTCAGGTTAAGTTACACTAATTGTTGC AGCTCATTCAGGTTAAGTTACAGTAACTGTTGCAGCTCATTCAGGTTAAG TTACACTAACTGTTGCAACTTAGGTTATCTGCAAATAGTATATTCATGGT AGAGGCCGAAATTCCTTTATGGTCAAAAACAAACTTCTCCAATTCAGTTT CTCCCTGAAAGTAGTATATTCGTGGTAGAGGCCGAAATTCCTTTATGGTC ATAAACAAACTTCTCCAATTTAGTTTCTTCCCGCAAGTAGTATATTCATC TAACTTTTTTACAAGCAAACAAGGGAGTTTAGCCTGTAAATTGATGTGAT TAGAGTTTTTTTGTGTTTTTTTATGGACATTGTCTTCTCAATTTATGACT TCTTGATGATGTAGAAGGATAACTTATTGCCGGTAGACTGGATTGGCCAT TTCTAGTGAATCCAATCTAGACAGTATTTCCTGGGATGGATGGAGATAAC TATTCTCTGAGTTATTCATTTTCTCCTCAGTCATGTACGAAACAACCTTA TAATCCTGAATGCGACGAAATAATGGGTGCCCGATTTTATTCCCATCGAG TAGATATTTTATCACAAGTATGAATCCATGAAGGTTGATGAATATATAGA AGGGATCGGAGATTCCAACATTTTGAGCTATCAACGCTCAGGTTCTCGAT TTCAAAATTTTCATTATGTTTATTTCGTAACCGGCTTACCATCCTGATTG TTATTACGCGTGTAATGCATTCAAATTGAGTGAATTCTGTAAATATGTTG GTTTTTGGTTCTTCAATTGAGATGTATCCCTTCTCTTTATTTTCTAGATT TCTTTCTAGCTATCATCCTGGTTGCTACTGTTGTCCATATATATTTATTA TATCTATCTTTGAACTTCTTCTTTTTTCAATTTGTATACCAGTTCTATAC GTATGTTGGCTGTTGATTCTTCCTAATTGATATGTAAACATGTTCAGATC AATCTTTGAATCTGTTTGGCCTCCAGCAAGGCAGCAAGCTTTTGCTTCTA CATCCCTACATAGTGAGGTGGATCTTGCGAAATGGAGGTGAAGGCCTTCT TCTAGCAGCTACTTTTTATTTGTTTGTACATTTTCTATGCAATAGTTCTT ACAGAAATGTTCACATGTTAATATATTAATTGGCATTTATATCATAGGAC ATATGCATACAGTCATGGTCGTATTTTTTATTAGATTAACATTTTCAATA TAAAGCCCAGAGTTTCTTTTGGTGATTCCAGAGTTGCTTCTCCACTATGT TTATAATTGCATCTTATCTCTTGTGCCAATCCAGAGTTGCTTCGTCGCCA TCGCTCTTTCCCCTGCGTGTAAACGTGGTTTTCATACATGATATGTGTAG ATCATATGAGTTGCGGCAACAGAGAATTTCATCTTCTATCCACTAGGTAT GATTTTAAGGAGTGAGCATTTACTTACAGGAAATGTTTCCACAGAAACTT GATTATTAGCTAGATGGGTTGAAATGGGCTTGGTGAATTACAGGGATCGA CAGCGGTAAGGACATAGGTAGGGCACCAGAGCTGCACCTGGAGCCATGAT GTCCTTCCACGTCTGGCAGGAACAAACTAGAACACCTCCAGTTCTCTGTG GCGCAATGCTGCACACGTTGCTTTGACCCCCCCTTGACAGGCAGGAAGAA GGATCTCACAAGATGAGAACTCTTGGCTTAAAATTCAGGTCTGACTGCTC CTCTTAGCCTTAGTTAGTAGAAATTAACTACTACTGCATTTATAATTTTT TGTCATTTCTCCATATAAATCAGTTCGCCTTGGCTTATCTATTTGTGTTT ATCTTTAAGGCTTCTAGCTCACTTCTTCTGATCTATCCCTATGTGGGATG GCGTCTCAATTGGTGTGATTATCTAACATCTGGCTGAATAAACATGCTTT GGCTAATGTTTTAGGTACAAATAATCTGCAAGAATCCGGTATGATGGTAC TTGCAGAACAAAGTGCAGAGAAACGCAACTAACGCAGAATATTCTAAAGT TATGAACATGCCAATGGTAATTGATACCGTGCTTCCGCCCATCTTTTTAT GTGCTTACTAGAGAAATTGTACCACTAGCGAGCCATGAATATTTTTTAGG TAATGAGTGACATGGTTTAATATTATGTACTAATTCTAGTTATAGTTCAT GTCGAAGTTGAAATTTGAGATGCATTATTATATATGTTAGACGTAATTAT GTACATATAAAAATATTCGCCACGGGCGCGGCATATGTTGCCGCGCCACC TTCCCTAGTATTTACTAATTGGAGGCATTGTAGGAGGCACCAGGTTAATC CCCACGAAAAAACAAACGGTTTCCGTCCGATATTCGTTTGATGCATTAAA AACCATTGGATCAAGTAGCCCTATACAGATCTAGGCCTCCACGCCCGTTA TTGTCTCTACCTCCCTAGCGCTCAAAGCATAAAAAGAAATCTCCCTCGCG TCCTCTTATCAGCTGACGTCGCCGGCCGCCTGCTGCCTATTGAGCCTGGC GACCACCAAAAATAGCAGTCTTGCAGGCTCTGTTGCGCCCCTTATTCGCT GCCGCCTCCTGCCGTTGATTTTTAACAGCTAGCTGGACACTGAGGAACAA CGATCTAGTAATTGAAACTGATACTACTTGATCGATCCTGCCTCTTGTGT TTGTCTACCATCAAAGTGCATCAGGATCAACATCATGTGCTAGATGGGAG AGCAAGGACATGCTCAGATTGTATCGTCCTCTAATGGATCGTCCTCTAAT CATGTGAGTTTCTTGAAGTTCATGGAGGTTGCTGAATTAAAGATATTGAA TGAGTGAAGAAGATGGTGGCTTCCCAGCTTACCCACAGCACAGCGTCGCC GTCGATGTGCATACATATACCTCTCAGGTACGCTCGACACGTTGGCCGCC AATTAGAATCCAACCTTTTGTTTCTTATGCGGTCTCATCGTATGCACGCC TGTCTAGGTGATTTCTGTAAGATTTAATTTATTGTCCCAGCTTTAAGCTG ATGGTGTATATGAGTTACTTCATTAAACCTTTCACTGCCTCGGACAAAGA TATAGGTAGAATAAAATCATAGAAATCCTTAGTCGCCCTAAGATTTATTT TCTCGCACACCTTGCGATGAACTTTGGAGACGAATTTGTGGCCAGCAGAA AACATGTCGTAGTATTGTGTCTGCAGTGTGTGAGCACTCAAGAGTTGTGT ATGGCCTCAGGTTGATAAGTTCTGATTGAGAGATTCTAGATATTGTTCAA CTAACTCATGGATTCTGAATTTCTTATTTTGCCATATGTCATATCATCCG TATGGATATCAGTAAGCACTTCCAGTCTACTGTTCATATTGGATTATCTT TGTATTCAATTTTAATGCATATCTATGTTTCCTATATATGATGAGGTGTG CTTCGGTCCCCCCCTTCCAAACTTAAGTTTGAATGGGCCAGCTTTATTTT GACCAGCCGAAACTCATATCTAGGTTATGTATACCTTCGTAGAGGTGTAC TTTGTCGAGGTGGGTATTCCGGTTGATCCCACCTCTTGTTATCGTGATCT ATGTCTTTGCATGCCATATTTTAAAATTTTGTTGCTTCTGCTATATAACT TTCGATTTCCGCCTCCCGTAGACGCATAAGTATACATATACGGTGAGTAT ACGTCTAAGAGGATCATACCGCCTTCATATGGGTTCGTACGGTCTTTGAA ACGAATCGGTATCAAAATTTTGTTGTCATAGTTTGGGGGGGGGGGGGGGG GGGGGGGGACCGAAGCAAAAGTGATATATGATAATTATAAGCTATACCAG GTCTGTTGATCTATGTCGTAGGTGTCTCTAACCGTGGGTATCCTTGCCAG TAATGCACATTCTATATAATTCATAGCCTTAGTGGATTTTTTTAAATTTC TCAGTACCATATAACTGAATAACTGTCTAAGTAATGCTGCTGTTTTAGCT TTGTACGCTGGGTTGCATCTACCAGTTTAATTATATCAGGGATGTGTTCG ATGGTGACGTTCAGTTCTGCGTGAAGATGTGTTGTATGCGGGATAATGGA TCTAGCATGTATACTGTAATTCTCAAGCATGAAATAAAAACACGGTAAGC ATCTTAATTTTTTTTAGAAAATACTTATAAATCTATTCTTCTTTCTATAA ATGTATCCGGAAGTGCACAGAAGTAGCGTATCTACAAGACCCCATTGGAT TATATAGATTTGCTCCCATGTAGTGTGTATTTAGATATATATGAATTTGT TTTATTAGATTTTTGGTTCTTTCCTCACCTCTAGATTAATTATGATGACT TAGTTTGTCAAACCAGAACTAGGACGTATCTCGGGACGTATCTCGGGACA GTTTGACCATTTGGCACACTCCCAGGAAGCATATTCCCAAAGCTAGCAAT GTTTTTCGGAGGATCGGAGGCTGAATGAAGCATATTCACAAGATACTCGG CAGGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.