Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA019657

[Submit comment/correction]

Sequence	AA019657
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA019657
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTGTCCGCTGATACCCCCGATCGGACGGCTGGGCTCGCGGGCGGAGCTC GTGCTTATCATTCCGCCGTCTCCTTCCTCGGGCTCCGTTCCTGACTGTGC TGCTGCTTTACTGTGTCTCTGCGCTCCCCCCCCCCATCCCCTTCTCGCCG CGAAGCCTTCGGTGCCGCCCCCAAATGGCGAAATCGCCGGCCGATCGGAA CCCAATCTGAGTCCGGTCACTCCGCAATAGCGCCTTGCTGGCCCGATCTC CCAAATCCCCCAAAGCGGCCGAGTTGAAAATGGCCACCACTGTCCCGATC GGGCTCGCGACGCGCGATTCGGTGGTGCTCTGGCCTGGGGGGTCTCGGGG GCTGCAGGTTTTGTGAAGACCGAGCCGTGGTTGCTCTGGCTGCCTGGTGC GGGCGTGGGTGTCCTCCCGAGAGAGCAGCGTCTTTTCTTCACGACCAAGG GTAATCGACGGTGCGCCTCTTTTTTGTTCGAGCTTTCCATTTCGGTTATG GTGGGTTAATTTGGCGTGATTTGGTGGTTTGTGCTCTAGGGTTGGTGGAA TGCTCAGCGAGAGCCCTGTGGCGATGCGTGAGGAGATGGGCGGCGTGGGA GAGGTTGACGAGCTTGAGGCGCTGCTCCGTGCCGGTGGCGGCGGAGTTCG TCGGCGAGGCGACGAGGCTGGCGAGAGAGAGCGGGGCCCCAGCATATTCC GAAGTGGGTCGGCGCCGCCGACCATAGAGGGTTCGCTGAACGCCATCAGC GGCCTCCTCCGCGGCGGTGGCGAGGCGACCCGGACTACCCCCGCCGTTCC TGATGCTGAGGAATTGAACGGACATGGTGGACTCCTATCGGAGGAGGAGC TCCGGGCTGACCCAGCCTACCTGTCCTACTACTATTCGCATGGCAACCTT AACCCAAGGCTGCCACCGCCGGTCCTAACAAAGGAGGACTGGCGGTCAAC ACAGCGGCTGAAGGCAGGGGTGGTCGGTGGGATCGGGGACCGGAGGAAGG TAGTGCAACAAGAGGCTGGACAGGGGATGTCTCTGTTCCCTCAGAATCCT GGTTTTGATCGGGAAGACGATGCGAGGAAGGGCGCGGGCGGTGCTGGAGA GTGGGTGGATAGAGGAGGTGATGGGCTCATTGGGTTATCACTAGGGCGGC AACGCAGCTTTGCTGATATGCTTCAGGTTAGTCACAGTTGGCCATGCTAA GGTTGCTATTTGTTGTCATAGTAGATTCGTAGTTGAGGTTTATCTGGTGG TTTACCATATCCAGTTACTAGTTTTTGCTGTATGTTACTTGCTTACTGTA TATAGTATACTTCTGGGATTTAGACCCCCCCTCACTTTGTTTCAATAGGC AAGCCCTAGCCATTCCCAGCCTATCCAGTTACAAGCTGGATTGTCTAGAT AAAGTTGTGATAAATTCAGTGTCTGGCAAGGAGTTTGAGGTCCTTTCCTG CCCAAGTTTGGACACCTGTGAGGTCATGTGTTGGGTGGACAAGCTAGGTC GTACAAATCCTATAGCAGAAAGTGGTTTGGGTTTGTGGTTTGCACAATCC TGTGGGTTTATGTGCTGAAGTATATGTCTTAAAAGTTATTAACAACTGTC TTCCTGGAATCCTGTACCGATAGAGCATTATCTTTGAGATGAATGCACTT GTAACTAATGTCATTTCTCTGCGAATCAACTGTCAAGAAAGTTTCCTACC TGGTATCGATCTAATTCCTTTTTTGCATCACTAGCGAGGATGTATGGGCG TTTGGTTCGCCGTTATGCTTTGCTTGAACTTTAACAACTTGTCACTGTTC CTAATACTGTCAGCCTTTACCCCAAATTTTGGTTCGAAATAATGCATTTC CTTGGAAGAGAGCATGCCCTGACTAAGTTTTAAGAGTTGCAACTTCAAGA AAACTGCGACCCATTTCTTATTTCTGCTGTGAGCGGGATCTTATTCCTGC TTTGTGGTTGATACTCCAGCAGTGTAATTTATCCTTGTAACATCAATTCC CCCATATTTTTAGTACCTTAATTTACGATTTTCTGTGCTCTTTGTTTCCC TGGATAGCTGATTTAGTCTACTCTGCGCTATTTCAGGATAACCTTGGTCG CAGAACACCTACCTCAGAGCATCCCTCTCGTGCAACCAGTCGCAACTCTT TTCTTGACAACCAGGAGGCACTTAATTATTCTGAGAACCAATACTCTATA CATAATGAAACTCTGGATGCACGTCACTCTGCTGGAAATGCGCAAAGTGT CCGAGGTCTTTCCAATATTAATGCATCCGCATCTCAAACTTTTGCTTCTG TTCTGGGTTCATCGGCTTCAAGGAATGCTACACCAGATCCTCATTACGTC CCTAGGGTTCCTAGCCCTGGTCTTCCACCTGTTGGCGTTAGGGTTGGTTC TAATGAGAAGAGACTGAATAGCTCGTCATCATCATTCAATGCAATTTCCT CAAAAGCATTTGAGTCTGATGATATTTTAACTGCATTATCTGACATGAAC TTATCTAAAAGTGGTACTTCAAATGACAATAACAACATTAGTCAGTCAAC ATATCAGAGAGGGATAAGCGACCACCATAATTTGTCTCTTGCACCGCAAG TTAACAATAGGCAGCATTCTGTGATGTTGGAAGCAGGTGATGAATATTTG GGTGTACCATCAATGTCACAACCATCGAATTCTTCATTTGATGATACCAC TAATCTAGCAAATTTAAGAAATCCCACTGACATGCGGTTCGATGGACATG GGGAGATGCAGAGGTCTTCTACTCTTTCTGCTCATTCATATCAGAAGTCG CCACCATCTTCTAATGCAAGCCCAGGTGGTTCTCCTGCTCAACATCAGAA TTTTGATGGAATAAATCCAGCATTTTTGAACTATGGGCTTGGTGGATATC CACTCAATCCGGGTTTCAACTCTGCGATGATGAATTATACAGGTTCAGGT AGCATGTCTCCTTTGTTTGAAAGTGCTGCTGCCGCATCTGCTATAGGCTC GGTTGGGTCAGATTCAAGAAACTTTGGCAACAATATTTTATCACCACCTA CCTTAAGTCTATCTGATCTGCATCACCTTGGTAGATCCATTAATCAAACT GCCACTGGTCTTCAGTCGCCTCTCTCTGATCCGTCTTATGTTCAGTACTT GAAGGCAGCTCAATATACAGCGCAGGGAGCAGCCAACTACAGCGATCCTT CATTGGAAAGAGGTTTCATGGGTAGTTCATATGCTGATCTAACACCAGTT CAGAAAGCCTATGTTGAAGCTTTGCTTCAGCAGAAGCAATATGGAATGCC AGTTCTTGGTAAATCAGCAGCCTCAAATCATGGCTATTATGGCAATTTGG CTTTTGGCATGGGCATGACATACCCTGGAAGCCCTTTGGGAAGTCCTGTT GCTGCTTCCCCATCAGGTCCTGGTAGTCCATTTAGGCTTGGTGAGCGGAA TCTGAGGTTTCCTACTAATATTAGAAGCTTGAGTGGTTGGAACGCTGATC CAAGTGGCTACATGAATGAAAACTTTCCATCTTCACTTTTGGATGAATTC AAAAGCAATAAGGCCAGAAGTTTTGACCTTGCTGAGATTGCTGGGAATGT GGTAGAGTTCAGGTATACTTGGTCATTTCATACTTTTGCAATACATATGT TTGCTTTAATCGATAACTAATACTCCATCTGTCCCAAAATAAGTCACTTG GGTTTGTCTATATTCGCATGTATCTACATACTAAAATACGTCTAGATACA TATGAAACTAGACAAACCCAAGTCACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTAGG TATGATCCATTATATGTCCATCTGTAAAATATCACTCCATAAATTATCCC ATCCCATCCTATACCACTATTTGCCACTTGGTTTCTTTTGCCAATTTATA TCTTGCCCTCTTAAAAAAATCCCAGTGTTTTTTTACCTCTAATCTCAGAC CTTGCCACATGGCAGCATGGTTCTGCCTCTCCTCCCATTGTTCTTAACTT TCTCCTTCCTCCTCTAACCTCGTATCCTCACCCTTGACCATGGAGAGTGA CCACAGATGGTTTGCTGTGCGCTCACACTTGCTCCCCATGACGTGGCTCC ACCTCTGCCACACCGAGCACCCATAGTAAGGATGAACCTCATCTCAGGAT GTTGTGTCTAGACTCGGTTACTGGTTGCTAGATGCAGCTAAGGCACTTGG GCACCTCCGGCATGGATCCTTTGGTCCAAATGCGGGGGAGAGGGAATCGC TTGGTGGTATCGGCATGGACCGGACCTCACCATCTTCATGAGATCATTCC AGGAAGGAGCTGCTGGTATTGGTGAAGGGTATCGTAGGTTGGGGGAGGTT GGGGTGAATATATGCCAGTCTGGTGTCATCTCTCTTTGTTGTCACCTCTG AGCTCTCAAATTATTTGGAAGACAGTAAAAAACTACAGTAGCACTGCAAA TAGATCTTCGAATCGTGAATTACAAATGCAAGGAGTGTAGTTCCTCTAGT GACATTCTGTAGAGGGGCTTTAATCGATAGTCCCTAAGCAGCCTGGCACC TTATTCTCTGCACAAGTTGATATTTTATGGAAAAAGACTGAATGCGAAGA GCGTCACTGCACCTTTTATGTGTCCACAATTTGGTATTCAATTGTAATGC ACTGAACTCTTCATGCGAGTTCATAATTCATCTAACATCTTGTTCGTGCC TCACAGTAACGATGATACTTCTCTTACTAATACTTTAGTTAGTAACACCT GCTTACTAATATTTTAGTTAGTAACACATTCTAAATTCTCATGTGATGTC TGATTTGATTATGCAGTGCTGATCAATATGGAAGTCGTTTCATACAGCAA AAACTTGAAACAGCGACAGTTGAGGAAAAGAACATGGTTTTTGAGGAAAT CATGCCTCATGCTCTCTCATTGATGACTGATGTCTTTGGGAACTATGTAG TGCAGAAGGTATTCATTACTGAGACCCTATTGCTGCTCACTTGAGATCCG GGACACTAAATTATTTCTTCAATTTGTAGCATCTTCAAATTTTTAATTCT GACGATGCCACGACTAACTTCCATATTTTTAATCCAGTTTTTTGAGCATG GGAGCCCGGTACAGCGCAGGGAGTTAGCTGATCAACTATTTGGACATGTA CTAGCTCTCAGCCTTCAGATGTATGGCTGTCGAGTTATCCAAAAGGTAAT ACATAGTTCATATTTTTTTCACTTTCCATAAATTCTTTTATTTCAAAAAA TATTTCTTTTAGGATTGCTGACTCAGGCTTATGTGTATGCACATCACTGA AGGCAATAGAGGTGGTTGACCTGGACCAGAAGACAAAAATGGTTACTGAG CTTGATGGTCATATCATGAGATGCGTGCGTGATCAAAATGGAAACCATGT TATCCAGAAATGCATTGAATGTATACCGGAAGATTCAGTTCAGTTTATTA TCTCGACATTCTACGGTCAAGTTGTTCCACTGTCCACTCACCCCTATGGC TGTAGAGTCATACAGGTTGATCTTTGAATTCTCAACTATGCAATTCTTCT ACCCTTAATTTTATCTGGAAAAATTACCTCAGTACCATTGGAAAGAGGTG TGAAAGGACACATTGGGGTGTGTGGTGTGTGTGGGTGGGGTGGGGTGGGG GGGCACATGTTACTGATGCATTGAGTTGTATGTTCAAACACATTGATCTC TGCCATGGTACTGATCAATATCGCTGTTTTATATTAGTTAAACTCATGAT TTCTTTCTTTACGCAGAGAGTGCTGGAGCATTGCACTGATCCAAAAACAC AGCAAGTTGTTATGGATGAAATATTGCAATCTGTATGCATGTTGGCACAA GACCAATATGGAAATTATGTTGTCCAGGTTTGTTACATCTTATAATTTTT CGGACTGATATTGGGCTTGACGTGGCATTCTGATAATTTTTTCAGCAGCT TTGTACATTGACCTTGTATAGATTTTGATCTATCTATAATCAGTTCTGCG ATATTCCACTGTTGTTTAGCTCTGAACCATACATAAGATGCTATGTAGTA TGATTTGATGCCAGAATGTGGAAACTCAACCGTTGACTATCTTGGATTGA AGACAATGAAATGCAAAGTACAGTCAACTATGCCATTAAAGAATGTTCCA TCTAATATTGCCCAAATTGACTTGTAAAATTATCAATCATACTTGTATGC TGTCCAAAAAAGTAATTCTTGGCTGTAACAAAAGCAATTCTTGTGTGTAA TAAAATTGTACATCTTAGCTCTTGCGTATCCTGCGAATTTTTACTGGTTA TCTGACGGAACGCCTATTTACCACCTTTCTCGTGAAGCATGATCTTGGTC TAGTCTTGCATGTAGAACCATACGTGTGATACAACTGTTTGTGCTGGACC ACCATGTCTCCGAGTTCATATTTGTGCCTGATCTGCTGATCATGTTACGG GGATGTCCTGAATGATTATGTAAGTGGACTTTTTGTGATATTTTATATCA CGACTAGCGAAGTGCTGATATTCAGGATGTCATGTAATGAGGGAAAAACA CATGCACTAATCCACCCTGTTGGACTGAGATATGATGATATCTCACTTAT TTGGGAAGAACAAAATTCACCCACTGTTTCTGTTGGTGTTGCAAGTAAAG CACATAAAATGTTATGTGTTGAATTCGATTAGAAACTACTACCTCCATTC TAGAAAAGAAGGCGTATAAATTATCTGAAAAGTCAAATGGTGTCAAGTTT GACCAAGTTTATACAAAAAATACCAATTCTTATAATACTATACTGATACA GTGTGAAAATATATTTCATAATGTATCTAATGATATAGATTTGACATCGT AAATATTAGTACCTTTTTCAGTAACCTTGGTCAAACTAAGCACTATTTGA CTTCTCAGGAAATTTATACGCCTTGTTTTTCGGAGCGGAGGTACTATAGT GAATGACTTAGTATGATAAAACTCTACCGAGTAATTCATTAATCATGAAT TCATGATGTCTCTTCTGGGTCAATCAACTGATATACACTGAAAATATGAT GTTCATGTCCAGCCTAAGAGCTTACTTGAGTTTATGATGGATCATCGACC TCACGGTAGACTAGTTCGGTACTATATTCTTTTTTCCCTTTGCTGTTCTT TTAACAAAGATGGTATGTGTTATTCTTGTGCAGCATGTTATGCAACATGG GAAACCTCATGAGCGATCTTTCATTATTGAAAAACTAGCTGGACAGATCA TTCAGATGAGCCAACAGAAATTTGCCTCAAATGTTATTGAGAAGTGCTTA ACTTTTGGAGGCCCTTCGGAGCGGGAAGTTATCATAAACGAAATGCTTGG AACTACTGATGAAAATGAGCCTCTCCAGGTTTTACTTATGATCTTTTTGT TCGATCAGTGTTCAATAGCTTTATGGATTTGTTTCATCCAATTCTATGTA GTGTACCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATTGTGTACCCTGTTTAAAT AGGAGCAATAAGGGAAATCAATGTACAGTGATGTGATTAGCATAGCAGCT CACCTGGTCTTTCATAGTCTGAATATATTTTTGCCATCAGTTTCTAAGAT TTTATCTGAGCAGTTACCACGAATATCCAGATTTTTCAAGGAATCCATGA CATATTGGTTTTGAACCTGTGAAGCTTATGAAAGTGATACAAAGAAATTG TGAAATAGAAGTACAATTAGGATTAAACAATGTGATTTCTCTATTCTACT AATGATTCTACAGCATCACCCCAAGTTAAAAAATCAGTCATACTATAGTT TTTTGAGTTTTTGAGGAATACCATGGTTTGTTCAAAATATTGTAATACTC CATTAAAATCTGTGAGATTACAATTGTGGAATTTAAAAGATCTGCTCAGT AGCCCTTTTTTTAATCAAACCTGGTGACTTGCACTTTTAGAGAGGTGTGC TTGCAACGGACTTTGATATTGCTTAGAAAGAAAACACATTGTAATTTAAT TATAGACATGCTTGTGAGTTTAGGATGTATACAGATTTGTAGCAATTTAT CTTGAACTTTGGTTTACCTCTGAGAAAAACTATGGACTTCCTTGATATTA TTTAGTTACTTCTTTGTGTTAAATGGTATAGTGGTTTTGCCTAGACATAG GTAATATCGTACATGCATTTTGACCTATTATATGTATAGGTTTTGTATAT TTCTGTGTTTGCTACATGCAAGAGCCTGTCTCGTATTTTTCTATTGAAGA GCGTCATTACTTTACTTAATAACTAATGGTTATTTAATCTAATAGCTAGA TTTAAAGGAGAAAACACTGAAATGTCAAACATTGTCATAGTTTTACTTGG TATACTGCAAAATACAGTTGTTTAATCAACTGAATTGTTTCATGCCCAGC ACCTTGAAAACTGTGGGTTTGAAATAGTTTAATGGAAAAAAATGGAAGGT AGTTGCATTTTACTACAAGCTTCGAAAATTCCAAAAATTCTCACATGTAT ATACGATAATACACTATGAATCTGCAAATTTCATGAGAAAATGCTTTCAT TTGTGGGCTGCATAAAGATAAGTTGTGATATAACGAATATGAGTATGATG CAGTTCTATTAACTCATAGGGTATTACAGTTTTTATTGTGCATGCACATT TTGGGTTTTGCAAAATTTATACTCCCTCTGACCCATATTGGTCAGAGGGA GTATTTTATTCCCTAAATTGTGTTATCGTAAAGTGCTGTTCAACTATCTA AGACCTCTACTGCGAACCTGTGCAGGCTATGATGAAGGATCAGTTTGGTA ACTATGTTGTACAGAAAGTACTAGAGACTTGTGATGATCAGCAGAGAGAG TTGATTCTTTCGCGAATAAAGGTTCACCTAAATGCCCTGAAGAAATATAC ATATGGGAAGCACATTGTTGCTCGAGTTGAAAAACTTGTCGCTGCTGGTG GTAAGCTTCAATGCTCAACTTTTGCTTCATCAGTTAAATACATCAGTTCC TTGCATTCCCACCCCCTAATCCATTTTCTGCTGTACCTTTTAACGTGTTT TATTTATGTATACTTGAAATTCAGAGAGGAGGATTGGACTGCAGTCACAG TATCTTTCATAATGTCAGTAGAAATGACCATGTACAGCTAACCATGGCTC CAAGATCTACCTTCTGCTGCTTGCTCTGGGCTGCTGCAAGCCTAAGTTGA AGAAAATAAACATGTTGTACTCAGAACTTTGTACATTTTGTAGTTTGAGC TTATAGTCGAGTCACGGTTTGGCTCAGAGGGTTTATTTACCTGGTGCCGC TGCAGAGAAGATAGGTGTCCTGTACAAGTTGTTTAGGTGTAAAAAAAGTT GAGGAGGAAAGACTATTTTGCGAGACTGTACAAATCTGCGTTCCTGAGAA ATCTACCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.