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GrainGenes Sequence Report: AA018480

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Sequence
AA018480
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018480
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTTAGTCCCTACATTTTTAGTGCGTGATACTGAACCATGCACACGGT
CAATTTCATGGTCTCGGCCAGGATTTGCACCTAATTCTGGGTATATAGAA
TTTTAGTGGTATTCAAAGCTATTTTTTCCTTCATTTAAAGTTTATAGCCT
AATTTTTTCTTGTTTATATTGACACAATATTTCAGGTGTTTGCTTGCTGT
TTGCACTGCTGATGGTCATGTGAATCTTTACGGCCCACCAATTGGGGAAT
TTTGTGATGAATGGGTTGAGGTAAGCCTATTCTGTCAATATTTATGTATA
ATCGTAATATGCATGAAGCTTTCATGTTAAAACAACTATAAAGTTAGATG
GAATGCCCACCAAATTTCTTTTTGTGACACACACGTGATCTGTAAATATT
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TGATTTGTCTATTCAAAAAAATCTTTATTGTTCTTTCTATCGAATTCCTT
ACAGGTTTGTTACTGGCAGATTCTTTTTCATACTTTTGTTTATCTGGAGA
TGGTCCAGGTCTCATATACTGATACACCCATGAACTTCTATTCTGTTGCT
CTAGGTCGCGGATGTATCTAAATTGCTGTTCAACTATTACAAAAGTATAA
ACTTCGGAGAGGATTATAGTCCTGATTCAGTTCCTCAGGTATGCTCCCTT
CCACTCGAGCACTGCACTGTTCCTTTACTCGATTATCTCAGAGTTTTATT
GTTAAACGTTTTCTTTCATATATTAGGAGAAGGTAAATAGTAAGCAAGCA
GAGGAGTTAGGATGTACTGCTCAACTGCAAGAACCCCTTTCCTGCAGCGA
TCTTCGACAGAGAAAAAGGAAACCAGCAAGGTGAATGATGTTTTCCTTTT
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GCATCTAGTTCTGGAATAATAAGATTGTCCAAAGTTGATTGTTCAATCAA
GGGAAAGTAAATTGTGTTTCTTTTCTTGCAAACACACTTCTACATCACAT
CGACAGTCTCTCCAAAGAAAATTTTCTCTTCAGCAGTTTGCTCTGATTTG
GATGCGATCATGCGAGAGATTTTATATATATTGAGGATGTTCCCTGATGA
AAAGTTATTAGTAAAATAGCAGTAACAGTAACACCATATGCTAGTTTGTT
TTTCCTTTTCTTTACATCTCATTGAATTAGACTGGCAGAGATCTAAGAGT
TCTTGCAAATGTGGTAGAATTGAGAAGGCTAATTTTAAGTTTACCCCTAC
TGGAATTAGCCATAAATGTGACTTCAGTGTGATTAACATAAACAAACATC
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ATAACACCTGGTTAATCAGCTTTCATTATCGTTTTCACTAATTCCTTTTG
TTGCCAAAGTTTGTCCAAAACCTGGGCCAAGAAATTGAAATACAAATATA
CTGCCAATATTGTCAAACATTAGTAGGGTTTGATATTTGTGTATGGCATG
AACCTAGCAGCCCCTTCTATTTTCTCCTTCTGCTCCTCTTAGGCTTATTT
CTTTTATTCCCTTTCACGAGCCAGCATTGTTATATTGTACCTGAATGTAC
TTAAGTAGATCTTGTTTGTTTGTAGATTTACGAGCTATGTTTATGATGAG
GATGAAGGTTATTTAGATGCTTCAAATGATGCAGATTTCTCGCTCAATCC
AGGCACCATGTCAAAGAAGATATCTATGAAAAAGGTACAGACTCTGCATG
TTCACATGAACAGATTGACTCTGGGTGTTCACAGTAGGCTGAAGTTCTGG
TTTAAGTCAAACAAAAATTGAGGTCATCAAAGGCAAATAATCGTGTTTAT
CAGTAGTTAGCAAATGAAACAACTAATTATCCTGTTAAATCCAAACTGTT
TCAGAGCCTATATGTTTGGCTTTCCTTTGTGGAGTTCTACTTATTTATCC
ACTGTGTTCCCAGATTGTCAAACCTGGACATAAAATCCTCCTGAATGGGC
TAGGTGGCTCACAAGATAACAAAGCAGCACTCCCTTGCAACGTAGAGAAC
ACATATCTTCCTCTTATCACTGCAAAACAGTATGCACGTCGAAATGCAAT
TTTGTCTTCTCTCGTAGTTGCATGGTCTCCAGTTCTTCCATCAGGAGACG
CCACTTCGTGTTTGTTGAGAAATTGGTGCATTCTTGCTGTTGGTTCCAAG
TCCGGGGATGTTTCATTTTGGAAAATATGGGAGCCCAAGTATTACACAAT
AGATGTTTGCATCGTTAACAGAGATGCTATACTCATCGGGGTTCTGAAAG
CTCATAATTCATGGGTTAGTGCTATCAGTTGGGAAGTTTGCTTTGCAGAC
TCTTCAAAGTCCTCGCTACTTTTAGCAACTGGGTGTTCAGACGGAAGGTG
AACACAATCACACTAATTTGTTTCCACTCTTTGCCCCTACTCCCTTATTA
CGGCTTGACATGTTTTTTGACTTAGCTCCTTGTAATTCATTAAACGGTAA
AAAGATAGTTGTGTTTAATCAACCATGAAGTTTTGAACATGGCGTTTGAG
CTAGTAAATAGTACTCCATCCGTTCCTTTCTATATTGCCTATAGTTTTTT
AGGCAAAAATTCCAAAATATAAGAGTGTAGTTTGATTTTTTAGCAAATAC
ACCCCTCCACCGATCAGCCTTAAAAAGGAAACTATCATATGGGTGATCTC
CTGCATGCATACATAACAGCAGATCCCAACGATTGCTTTCTCGCCCTCCT
CGCCCAAAAAAAATCGCTTGGTTTTATGAACTAATGATACGGAGTATTTT
TTTCGAGTTATTTGGATAAAACTATCACAATTAGGGGCTGTCGGGACGAC
TCAGTACCACTTTCGGTAATTTTGCGAGTCAGTACCAACTTTTGGGTCAG
AGCGTTGCAAATCGGACTAAATTTCGTCTAACAGCAATTTAACACGATTT
CTGACGGCTCGGGCCCAGCTGTAAGTGCTGAGTTGGCGGCACGTGTCTAG
AAGAAGCTGAGGTGGAAGTGGGGCCCACCTGTCAGACATATCTTATGTTA
TTTTTTATTTTTCTCTCCTATTTTATTTTTTACTGCCAGTGGGTCCCACC
CGTCAGCCTACCTATTTTTTCCCCATTCACCTTCTTCCTCCCATCTCAGG
CGGCGCGTTGGGGAACTGTAGGCGTGAGCGAAGCAGGCGGCCGGGTGGCC
GAGCTCCGGAGGGAGCAGAGCATCCTCCGCAGCCTAAGCTCGCCGTACGT
CGTGTGGTGCCTGGACTCGGGCTCCTGGTGGCATGCGGTGTGGCGGCGGT
GGCCACGGTCGGCGCATTCCAGGCGCACACGCCCGAGCTGTGGGGCGTGC
CGGGGATGCCCGCCGCCTCCGTGTTCCTCAACGTCTTTCTGCTCGGCTCC
CTGGGCCGGCCTTCATACGTCCGGTTCGGCTTCTTCTTGGCGGCCGCGGT
GCTCGTCTACACGCTCTACAGCGTGCACTCCAGCTACGATGCCAAGGAGA
GCGCCGTGCTAGAAGGCGCTAAGGTGCAGGACGAAGCTTGCAAGGTGTAG
CTAGCTAGGGTTGAGAGATCGAGACAGCTAATTAACTGCTGCTCTAGGTT
TTCTTCTTGGTGGTCTTAGATTCTTAGTTGTTGGCAGGAGGGAGCTAACA
AGGTGTTCAAAATTGAGAAATGATTGGGGGGAAAACACACTTTACCTGAA
ACTTGCATATGCGATGTACAAGTTCATTCAAACTGTACATGTTCTAATTC
CATGGAAGAAACTTTTTACACGGCTGGATCACGGTCCATTCCGGCACCAG
CCTCGCCGCCGCCGACAAATTAGAAGGTGGATGGGGAAAAAATATGGAGG
CTGACGGGTGGGACCACTGACAGTAAATAGTAAATAGAAATAAAAAATAA
CATAGGATATGTCTGACAGGTAGGCCCCACTTCCACCTCAGCTTCTTCTA
GACATGTGTCGCCGACTCGGCACTTACAGCTGGGTCCAAGCCGTCAAAAA
TCGTGTTAAATTGCTATTAGACGAAATTTAGTCCGATTTGCAACGCTCTG
ACCCAAAAGTTGGTACTGACTCGCAAAAATTACCGAAAGTGGTACTGAGT
CGTCCCGACAGCCCCAATTGTGGTAGTTTTATCCAATTAACTCATTTTTT
CTTAACAAACCTATATAGGCTGCACTCGTAGGATCGCTGTCATATTCTCC
GCCGTGTTTCTTGACGATCTCTCTCACGCCAGCTCTCTTTTCCGCCATCT
AGTGCTCTTCCATGGCCAAGGAGATCGGAAACCCAGCCATCCTCCTTCCC
ATGGTCGAGGAGGACGCGCAGGCGGTGACTTCTCTTCTGATGGTCAAGGA
CACGATGCTGCCGACCTATCTTCCCAAGGTCAAGGAGGTGATGAAGCCGG
CGAACTCTCTTCCCATGGTGAAAGAGGATATGCCATGCCCATTGTGTCTT
AAATTGCTCGGCACAATAGTCGATTTCTCAGATTGAGTGAAAGAAGTGGC
AAAATAAGAGTGTTCCGGGTGTGGCGAGATGCACGACCTATAGGCGTTAA
TCGATTTTTCTTTATCATGAATCATGATAAAAAAATGATCAACGCCTATG
TGTACTTTTCCAGGTCGCTCCCATGGTCTTCTTCATCGCTACATATGTAG
CTGTTCGTTGAAGATCTATCTGAGCTTTGTGGGAATAGGTTGCACATCTC
GCTGCATCCGAAACACTCGTATTTTGCCACTTCTTTCACCCAATCTGAGA
AATCAACTATTGTGCCGGGCAATTTAAGACATAGTGGGCATGACATATCC
TCCTTCACCAAAGGAAGAGAGTTCGACGACTTCATCTCCTCCTTGACTTT
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CCGCCTGCGCGTCCTCCTCGACCGTGGGAAGGGGGGTGGCTGGGTTTCCG
ATCTCCTTGGCCATGGAAGAGCACTAGATGGCGGGAGAGAGAGCCGGCGT
GAGCGAGATCGTCAATAAACACACGGGGGAATATGCCAGCGATCCTATGC
GTGCATCCTATATAGGTTTGTTAAGGAAAAAATACTCCGTATCATTAGTT
CCTAAAACTGAGCGATCCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGGGTGGGGGGTGGG
GGAGAAAGCGATCGTTGGGATCTGCTGTTAGGTATGCCTGCAGGAGATCA
CCCATATGACCGTTTTCTTTTTTAAGGCTGATCGGTGGAGGGGTGTATTT
GCTAAAAAATCAAACTACACCCTTATATTTTAGAACTTTTGCCAAAAAAC
TATAGGCTTTATAGAAATGAACGGAGGGAGTATTTTAGACTAGTCTCAAA
TCGATTGGCCAGAGTGTTTTGTGTTAAAAAATCACCCTACGCTAATTTCC
GTTCCAAAAAACTATAGGAACTATAGAAAGGAACATAGGGAGTAATAGTT
CTTTAGAACAAGTTCCCAGGTCAGCATGAGACATGCCTTTTCATGCTTCT
GCCTTAAATGAAGTTTTGTTTATTAAACAACATCATCAGAAAGTTAAATT
CACTACTCTACCATGTGAAATTGAAGCATTGATGAAAATGATCTCCCCAT
ATGCAAAATGATTTTCCTGTTCATTTCAGCACCAGCTATTAAATTTTACT
ACCTCTGTTGGTAAATAGATGACATCATAGAATGTTTTGCAGCAGTACTT
CCGTAACTTTGACTCATATTGCATGAAAACTTATTTAGTTTCTTCATAAG
AAACAAATATTATTAAGCGTGATCTATTTACGAATAATGGGAATATTTTC
TGATTATTCTTGTCACTTCTTAAATCAATAATAGTTCACTGAAACCTTTA
GTATCTCATTGGGGACAACTATATCTTTTCAGTGTGAAGATATGGTCAGG
TAATACGGAAGGATTGAATCAATGTACATATGTAAAAGAATTGCCATTTT
CATTATTGGCCGAGGTATAATACTCAGTGTTGCCTTGTGTTATGTTCTTT
ATATTTCTATCTTTGCACATAGTTGATATTTGACACCAGCTATTGGTGAA
ACATCCAATGAGTATGGGCAAGCAAGTCTTTTGACTATCATGTTATCCAT
TCAAGTCCAAATGTTCTGCTGGTCAGGTCACCACTAACTCGTCAGCTCCA
GTCTCGTCAATTTCATTATATGTGCCAGCTCAGCCTCAACATGGGATTAA
TCTTAATTTGGCAATCGGAAGAGTGTCTGGGTCATTGGAAACATGGTTGT
GGGATCCATGTAGAAACAAAATTGAGCATACCAGTGCATGTCATGCTCAT
GATCAAGTGGTAAAGTTTCATTGCATTCTTTCTTTTTCAATAAAATAAAA
ATAAATGTCTTGCATTGCCTCAGGTGACAGGATTATCGTGGGGCTGGGAT
GGCCAATGTTTATACAGCTGCAGCCAGGTCAGTTGACTTGCCACAGCACT
ATTTAGGCTACAGATTTATCATGGACTATTTTTTTATTAGCTTGTCTACA
AGCAAAATATATTTGTTCTCTGAAGTTAATGTGCTCATACTGTGTAGCTT
TCCATTTTGACTAGTTGCTGTTTACATACTGGAAAGAGCTACACAAAATG
AATTTATTTTATCTAGAGAGTTCTTCATATATTATAGACTTATAGTAGTA
CTATTCTAGTGGAGATTGTGTGTTTGCATAGCCTCACTAGTTGACTGCTG
GTAACAGCAGAAATGGGTGATTCTCCTGTCAGATCTTATGTGTTCTGTCT
ATATTTTTCATAAAGACCACAAATTCTTAACTGCTTCAATCAGATTCTAC
ATAGTTGCACACAGTTCAATTTAATCCAAAGGGCAAGTTTTAAGTTTCTA
TCAGCTTATTTGATAGATACCCTAATGTGATGCGTTAAATGCTAGAATTA
ACAAACACTTGCTACTAATATTGCGAGATGGGCATCAATTTCTAATGAAC
ATCCGTTGTCCATAACACTAACAACACAACACATATTTCTCTTTCCTTAA
AATTCAAAAGAAATTGGTGTCCTGGTTGGAACTCATTAGATGGGGGCATG
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GGGTCCTATGGTGAGAATCTCTAAATCTGGAAAACTAGTCAACGACTTGA
CCTACTTATGGAAAAGGCCAATGTGCTGGGGATGACCTTTTGATACCATC
AATCTAAGCTTTCTTGTGTAATTGCTGAAACTTTATGAGTCTACTTTCGA
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ACCTTATTTTCATGGCGATGCTTAATATTTTCTTCTTTATCAGGATAATT
CTGCACACTGTTGGATTTTCCGGGAAAAACAACTTGAAGAGATTCCTGTG
CACACAAATTTTCAGGAGCTAAAAGTGTCGACAGATGTAAAAAAATCAGC
CTCTTCGAATTCCCGTTTTCGCTAAATGTCTGTGTTTTTGTTCTTTCTAA
TTGCATATCCATTGTACATGCAGCTATCAGAAGTATCAGATCAATGCTTC
GGACTTTCAATTGCACCTGGACAACTGATGATTGCTATGGTGTGCCATAG
ACTTTTTCGTGTATACATTTGTTGCTCAACTGCACAGTTTTTTCTTCTTC
TAATTTATGAACATTGTCTCCTTCAGGTTCGCAGCTTGGATCCAAATCAG
TTAGATCAGATGTATCAAGCCAGGTAATTTTATTTACGGGCTCACTGAAA
AGTTCAGGGGTCCTACATAGGAATCTTGATATAATGATTGCATTGGGGGA
TAACATTAGAGAATGCTTGTCATTGTATGTTTGTAACAATTTGTTAATAA
AACAACAGGACACACAAAGCAGTGGTTGAGTTCATTTGGATTGGTGGTCA
GTTCCTTGGTCTTCCATTAGTCAAGGGCATTAATATCTGCACCGAACAAT
CTGCCACTAACTTCCTATGGTGGGGATCCAACATTTTTTGGTCATTGAAG
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AATATCCTGTATCATTCAAGAAAGGACATGATGTCGAAGGCTAGCTTGAG
GAAGTTACACTTGCTGAACATCATTATTAGGAAAGTAATGCTGAGCGATA
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AGGGTGCCCCTAACGAGGACAGGTGGTTTCCTGTTGGAATTGCCCAGATG
GATGCTTGGGTATCTAGGAATAGTGGAGAAGTGCATGATCAGCTTAACTC
TCTAAGATCGAGGATCAAAGACATTGGAAGGAGGTATATCCATTGTGCTT
AATTCATTGATCGTAGTCAATTTCACTCCTGAAAGGAAATGAAACATGTG
TTTGTTCCCTTCCAAGTTTAGTGAAACAAGCACAGTACTGTATTTGGGTA
TTGTATGCCTTCTCAATTGTTTTGATTTTGCAGGATTGACTCGGTGTGTG
AATATTTGGTAGAAGAAACCTGCCCCTACTGCTCTGCACCAGTGCACTTC
GAGTCACCTGATGTAGCCTTGTGCGGAGGCGGGGATCCTGCTACTGCCCC
AGATGCAAGGCACAAGCTGTTGAGATGCAGAGCGTCGATGCGGCTGTGCT
CTGTTCTGGACCCTACCTGGTACTGCGTATGCTGCGAAGGAATGGTCGAC
AAGCTGGTACCCGAGACCTTCTTCACATCCACGGCAGCTTCCCCTTTGGA
TGCCGACTGTGACGAGGAATCACTTTGTTTATCAGCGCCTGCTGTTCCAC
TCTGCCCCTTGTGCGGCATACTGCTGCAGAGGCAGACGCCGGAGTTCCTC
CTTTCCGTCTCCCCGGTGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.