Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA042941

[Submit comment/correction]

Sequence
AA042941
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042941
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTTCGTGCCGCGATTGCTCACATCACACCACGGTTGCTTCCCTTCTTCC
CCCCTCCGGACTCGCGTACCCTACAGAGCAATTTCGGGTACCATCCAGGG
GCGGGACGGTCATTTTATCTGCCCCCATTAATTAAGTCCACACGAGTCGA
AGCCTCACACCCCACGCTGCCTTCGCTAGCGGACGACCCTATTTTCCCCA
TACTGCCCCTCTCGCCGTCGCCTCCAAAACCACCTCCGCCTTCCTCCTCA
CTCAGAGACCTCTGCTCAGCCCCCGCCCCAATGGCCGATTCGACGAACCC
TAGCTCTGGGGACCTCCCCGCTGGCTCCGGGAGCTCGCCTGAGATGCCGT
ACCCGGCGGATCGACGCGTCGCGGCGCTCGCCGGTGCCGGAGCGAGGTAC
AAGGCCATGTCCCCCGCGCGGCTGCCGATCTCGCGCGAGCCCTGCCTCAC
CATCCCCGCTGGCTTCAGCCCTTCCGCCCTCCTCGACTCCCCTGTACTCC
TCACCAACTTCAAGGTGATTGCTGCCTCGCTGTACCTATCGACCGCCTCT
CTCCACCTCTTATTACCTGTTACCGCGGGATCTGCGAGTTGTACGGCGTC
CATGTCATGCTGAGCTTCATTTGAGCTGGGAAAAAGGCGGGATTTCGATG
CGCATTAGCTTCGCGCTCTAGTTTATGTGACAATTGCACCGGGGAATTGG
GTCGTGGCCTCGGAATAATGCGCTTTTCCTGTGCGCTTTCGCATTTCCGG
CGGTGCTATGGGGCTTCTGGAACTTCCCTTTTGGCGGGGTTCTTTGTGAT
ATGGTTGTTTTTGCCTCCGTTTCTTCTTTTGGAGCGTCCCCGCGCCGTCT
ACTTGCTGTGGAGTGAGGTGGGAGCTGTTGCTTGTGCGCTCTGCGGGGAA
TTATTCTGTTATGCACACACTTGGTGGCTGCGAGAGCATATCATCATTTG
GCATTCCTACCTTTTATGGGGGCTTTGTAGGGCCTTATTTAAGGAAACGC
CCCCCTCGGCTTTGGCTGGTATAGCACTTGTGGTGTGCTCAGAGATGGTT
GCTCGTCCACGCGGAAATCACCAAGTAATTGGGGGCGGGATTTTTTGCAG
GCTCGTGTTCGGGTTGACCATTTTCTTGTTATTCTTTCTCGGGATTGTGT
GTAGATTTGGTAGGAGTTTCCCTGGTTCCTCTCTCTGGCAGCTTGCAAAA
CTGAAATAGCCTTGCTTGCTGGGCGTAGTGACTTGCTTGGTGCATCACTG
CTACCTTCTTTGTCTTCGTTTGCTGTTCTTGTTGGCTCTCTTCGTTATGT
TTCTCTTTCAAGCGTAGGATAGGATGCTTGACAGACAGGTTCTTTTTAAA
GGAAACATTATGAAGATGACATTCGTTTGGCAAGTGTTTCTAAAGTATTT
ATTTCAGAGGGCTTACAAACTTGCATTCGAACTGTAGAATTACTTTCTAT
GGATAATTTGCTGGCTGTAATGTTGTTGTGCATATTTCAGCGTTCACAAG
TATTTAGAAGGCTTAAGCCAGGTAGACCTGAGATAGTTAACAAAATTTTC
TGTTCAGGTTGAACCCTCACCGACGACTGGTTCTCTGGGCATGGCTGCAA
TTATGCACAAGATTGCTCATCCAGACATACCGCCTTCACCACGGGACAAA
TCTGTTCGTAGTGCCCATGCAGATGGGGGTTCTAGGGAGTTTGAATTCAA
GCCTCATCTCAATTCGTCTTCTCAATCACTGGTACATCACCTTCCATTTT
CTTTGCTGTATGTGTCAATAGAAATAAATGAACTTTATCTTGTAGAACAT
CAAAATTATCTTTAAGCATTTTGTTTCTATATGATCCCACAAATTCAGTT
TGGCCTTTATTTTGCATGTTCAACAAATAAACTTCATTCGGCAGTGTTGT
TAAATCTTTGCATAATTGTTAACCTCTCTTCTCTTTGCCTCTGTTTGTAA
ATGTGTGAAGTTACCTATTTTATTTGATATTTTTTGGAGAATAGGAAGGT
TTCATTGTCCCAGATGCATGGCAAATCTCACCATGGATCCCATTAACTAT
TTTTGGGTGTTGTCAAATGTTGTTAGTAGTCCATGGTCCAGTCATTTGAA
AGGTAATGCCAGAACTGGATTATATGGCTAGATATTAATGTTTGAGCGTC
AAGGAAAAGGAACAAAAAATTCAAGTCCAAATAAGTGTATCAGGTTTATT
GAACGTTTAACTACACCCAGAATTCACAGATTGAAAAAGAGAGCTGTTTG
TGGAAATGAAGAGACGGTATCCTTGTGACAAGAATTTGGTATAACTATCG
CATTGCGCACAAGGACAGTGACAAAACGTTGTCTTGATAGATATGATCTG
AGAGGATGGTACTGCAATTATGAATTCACGATGAATTTGTTAAACAATAA
TATGGAAGAAGAATCTAAAGGATTACTGTTTGTGTTTTCTGTGCTTTAGA
ATGACTAACAAATGGCATGATACTTAATTCTGACATAAACATAAAAGGAA
GTTCATATCATATTGTGTTCTCTGGAGTTACACTATTAAGTGTTAAGCTG
CTTAGTCTACACCATATATATCACAGTCTCTTTCACAAGTAGTGGAGAAA
AAGTTTCTTGTATAAACGATGAGTTTGAAAAGGCACCTAAAATAATAGTT
TGGAGAAAAACTAGAGTGCATATGTAGTTTGGTCTATCTATACTTGCTAA
ATTAGTGTCGCCTTAATTCTGTCGACTTGTTGTACATCTTTAGTTTTGCA
TTGTGTAACTTTTCTAATGCTCACATTTTGTACTGCAGCCTCCTGCTACG
AGTGACTCAAAAAACCATGAGCATTCTATGCAAAATCAAAGCATGAATCC
TAGCTCATCATCTAGCAATATGGTGACTGAAAACAGACCTCCCTGTTCAC
GTGAGTCAACTCTTACAGTGAATGTTTCAAGTGCTCAGAACCAACCTGTT
GGAATGGTTGGTCTGACTGACAGTATACCTGCTGAAGTTGGTACGTCTGA
GTTGCAACAAATGAATGGCTCTGAGAATGCCATGCAAGAACCACAGTCTG
AAAATGTGGCTGAAAAATCGGCAGAGGATGGCTACAACTGGCGCAAATAT
GGACAGAAGCATGTCAAGGGAAGTGAAAACCCTAGAAGTTATTACAAGTG
CACACATCCTAATTGTGAAGTAAAAAAGCTACTTGAGCGTGCGGTTGATG
GTCCCATCACCGAAGTTGTTTATAAGGGGCGTCATAATCATCCTAAACCC
CAGCCTAGTAGGAGGTTAGCTGGTGGTGCAGTGCCTTCGAACCAGGGTGA
TGACCGATATGATGGTGCAGGAACTGCTGATGGTGAGATGTTTATTATGA
TTTCTTTGAAAAATTGTTACTGGTACTATAATTTGGCAGCTTGGTAATAT
GCATTGTTCTATCTTGTTTTGGAAATAAAAGTACATTGACATTTAACATT
GAGCTTTAGCATTCCCTTGCTGCTTTTGTGTCTCTCGAGTAGCATCCTTT
TTTTTATGAACGTCTTATAGTAAGTAGTAACAACTGAACAGTTCAAAATT
GAACATTCTTGGAAAATAATTCCATGAAGTTACAAAACTTAATTTTACAT
ATTTCCCTGAGTTGTACTTGGACGTTACAACAGATATATTGGTCAGTCCA
TATACCAAAGTAAAACTTTTGGTAAAGATGTTTTTAAATATATTGCTATC
ACTCTTTTGTCGGTATCTCAGTTTTTTCTGCTAATTTGCAGATAAATCTT
CAAATGCTCTTAGCAACCTTGCTAATCAAGTAGAGTCGCCTGGTATGATT
GTGCCTGTTCCAGCTTCAGTTAGTGATGATGAGATCGATGCTGGAGGTGG
AAGACCCTACCCTGGGGATGATGCTACCGAGGAAGAGGATTTAGAGTCGA
AACGCAGGTACGCTTGGTTTGGACTTGGTACACTCTACAGAATCATTCCT
GTGAATGTTAAGCCTTATCTTGTTGTCTACTATCAACTATGGAAACAGGA
AAATGGAGTCTGCTGGTATTGATGCTGCTCTGATGGGTAAACCTAACCGT
GAACCTCGTGTTGTTGTTCAAACTGTGAGTGAGGTTGACATTTTGGATGA
TGGGTATCGTTGGCGCAAATATGGACAGAAAGTTGTCAAAGGAAATCCCA
ATCCACGGTAAGTACTTACTTTGTCCATAATTACCCTCTCTCCTGTTGCC
TTGCATGTGAAGTTATGTTAACAGAATGGTAATATATCTACTCTAGTTAC
ATTTTATGAGTTACTGAGTAACTTAAAGCACTCTACGCATAACTCGTCAG
TCATGAGTCATGTATGTGTAGAGTTATGTCTCTTCCCCAAGAGAGCCCAT
GATCATGGTGTTGGTTAAATATAAATATCTTAAAACATACTCATTGAGAG
GACTGATCGAAACAAAATTAAATGGCCTTTTGGATCAGAATTATATTTCG
CATCTATGCGCATTGTTTAGGATGAACACATGAAGTGGACATAGCTGCGA
ACATATGTGGTAGATGAAGATGAAATATCTTCTACTTCACCTTTATCACT
GTTGGTGATAAATTACGGAGTTGAAGAACTTCCATTCCGTATTATAATCA
GCCTATACGGAGATGAAATATCTGCTACTTCGCGTTACATTATACTGTCT
AAAATGTTATTCCTGAGTGTACAAAGTGAAGACAATTGATTGGTTGGTAC
GTGTCTGTTTCCAGAAGGGTGGCTTTTGGCTCAAAGCCTGTAACAGCTTG
TTTTCTGGGGATGTAATCAGTAGGGGAGGATTAGATCAGGAGCAACGAGA
GAGCTCTTGGGAGCTGTAGAAGGGCAGATGTAGCTAGGTGCAGATACTGT
GTGCGACAGCATAAAAGGCTGAGGAAGAGATAGGAGTATCTTATAATTCT
TTGCGTGATTCAGTCTCATGGTTGCTACCTCATTATATAGATGATCTTCC
TTACAAACTGACTCTGACTCCATACGTAATAAGATATGTCCTCTGATTTA
TTCAATAAGGACCCGCCTGCTCTCCGATTGCAGTAGCTATTCCCTTCCAT
CAATGGGAATCCTACTTGTTGATACTTCCCCCTAATGTTGATGGCTACCA
GGTGCTGGTCCATTTTGTATTTTGCTGCTCTCTTCTAGGTTGCGGTGGCA
CTAAACGGTTGCCATGACACTTCTATGTCTGCCCTCCACATAACAAGGCC
CCATGGTGCACAGCATTTTATCATACATTTTGCCAGTTTATTTACTCATA
TGGGGTGCAGTGCTTTAGAATAATCCCGTGCTTTTGAGTTGCTACCTCGG
CAAGACGCCCTTTCTATAAATATTTGGTTCGAAACCAACGGTTGCTAATG
TTGACACTGTCTTTGGCACACATCCACTTTGCTGTCTGAACTGTTAGGTT
TTTTCTTTTGCCAAATATTCATGGGCATGGCCAACATTGTGACAAACATT
AGCAGTGCATACTTCGACGCAACCAAACAGCCTATATTTGATGTACTTGC
ATGTATTTGTATGGCATGCCCTTCCATTACTTCAGTTTGTACTCCCTCCA
TTTCAAATTATAAGATGTTTTAGCTTTTTTCTGAAGCACATGTATCTAGA
AGTTTTTTAGTGTGTAGGTTCGGAGCAAAATGAGTGAACCTACACACTAA
CAGGCGTCTAGATACATGTGTTTCAGAAAAAGTCTAAAACATCTTATATT
TTGAAACGGGGGGAGTAAATAATTCAAAAGCAATCTCGCAGTCACATCAC
ACCATATGAAATGCTATTCCTATGCACACAAAAGGGAGGCAATTAATTGG
TTTGATAGCTCTTTGTTTTAAATCACATGAGCATGCATTTTATAATCGAT
ATTTTTGTTGGAACAATAACTCTGAGAGTCAGGCTTTGAAGGGCTTGAGG
ATTCTGGCCCTCTGTCTAGTACTTTAATGTTTCCCGACGAGCTTGGTTCA
AGATAATCTCATACTCCATATGTATACTAGCATAGGTCATCTTTGTACTT
CTCAGATTCCAGCACGAAACTTCATCTAAGACAAATCTAGACAACTAATT
TGAGACAGAGTGGGTACTTAGAATAACAAAGTACATATTATGATATTTTT
TTAAACAGATCCTGTGACATTATTTCCGGATCTCCAGTCTATATAGCATA
CTTTTACATATGTTACTGGTTGAAGCTTCCAAAAGGTCAACCACATGGAT
CACATGGCGACCTACATTTCTTGATAGAGTTGTGTTACACATTTAGCCAA
GGGGGAACTAATTAAATATGGAGTGGCACATGTGAGGCAGTTCGCTCATA
TATTCATTTTTGTTCTTGACTGCAGGAGTTACTACAAATGCACAAGCACA
GGATGCCCTGTTAGGAAGCATGTTGAGAGAGCATCGCATGATCCTAAATC
AGTGATAACAACATATGAAGGAAAACATAACCACGAAGTCCCTGCTGCCA
GGAATGCAACCCATGAGATGGCCACACCTCCCATGAAGAATCCCATGCAT
CAGATTAACGGCAATATGCCCAGCATTGGTGGCATGATGAGAGCATGTGA
ACCCAGGAACTTCACCAACCACTATTCTCAAGCGGCTGAAACCGACACCG
TGAGTCTTGACCTTGGTGTTGGAATTAGCCCGAACCACAGTGACGCCACA
AACCAAATGCAGTCTTCGGTTCCCAATCAGATGCAATATCAAATGCAACC
CATGGCTTCGATGTACGGTAACATGAGGCACCCATCAATGTCAATGCCAA
CGGTACAAGGAAATGCGGCTGGCCGGATATATGGTTCCAGAGAAGAAAAA
GCTAATGAAGGATTTACTTTCAAAGCCACACCGATGGACCATTCAGCTAA
CTTATGCTACAGCAGTGCTGGGAATTTAGTCATGGGTCCTTGAGAGTGTC
TACAAATGCTTATAGCTCCAAGAATCATATATTACCAACAAAGCTTTTGT
AATGACAATCTCCTGAGCAAGATTCTCAATTGTGTTTCATTTACAAATCA
GTTCAGCCAGAGGCAAGTAAGCTATACCTGGGGGCGCACTGCAGCAAATA
CACACGGGTCACTCAGTGCGGAGAAGACCTCTGTTGTATGTAGCCTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.