Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA008729

[Submit comment/correction]

Sequence
AA008729
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008729
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TACACTCGAGAGACAAGCTTCACTTCCCATGGCAATACAAAGATAGATGT
CGTCTACACCAACAAGGAGGATACACTTGTGCGAGTCCTAAGGATGTACG
AGGAATGGATTGAGAAAGATGAGGACAAGTTTGTCGGATTGGACCCCGAG
TACACCAAGGAGGAGCAAGAGTATGAAAACGATGTCGCCGTCATTCAACT
AGCAATGAGGCAACACGTCCTCGTCTATCACTACTCATGTTTTGTAGATC
TGATCTCTTTAGTTTACCAATTTCATGGTTTTCTTACTTTTAGTGGCCAC
TTGTATGATTTTAATCAGTTGATCTTGTCTTTACTAAACAGTCTTAGTCC
TAAATTTTGCTCAAATATTGTTCTCGCAAGTACTGCAATCTTTCTGTCAC
ATCCCAAAATTTTCCAAACTTTGAAATGTAAAAAAAATTAAAAGAAATTG
AGAGGGAACAAAAACTTTTTGACTATTTAATATAACTCCCTCAAAACAAA
AGTTAAATAAAACAATTTTGTTTGTGAAGTTGTATGCATGTTTTCAAAAC
CTCAAAATCATGAAGCATGCATGGTTGCATTTTAAAACTAAGAGAAATAA
CTTTCTTCTCAAAGTTGAATTGGCCACTTAACAACATGAGGCTTTGGGTA
TATTCTTTATTTAAAATATACAAAAGAATTCCTAAGTGAGCTAAAAGATA
AAAGGCAAAATTATAAAACCATAGAAATTAGTTTGACTCTACTTGAAGCT
CCAGATAAATTTATAAAATGTAGAAAGAAAAATAAAGTCAAGTTAAGGAA
ATGACTAAAAACGAAATAAAAGTATTCTTAAATTAGTTATTATGATAAAG
AATAAAATTATAAAGTTAAGGAAATTGGTTTGAACATTTTTGGAGCTCTA
AATCAAAAAAATACGAAATAAACAAGAATTGAGAAAATATACTGTATAGG
CCTACGTGCCATGCTTAATTTTTTTAAATGAATTATACTTTATTAAAAAA
TATTCCAAATACTCTAATTGAAATAAACTATCAACTTATATTTTATATAA
AATTTTCTAAAATTTTTTGATACAAATTTGAATCAAATTGAAGAGATAAA
TTGAAAACTAGAAATAAAACAGAAAAAAGAAACGTTGAAGGAAAAAAAAT
AAAAAGCCCACAAGCAATCCAGCCCACCGTGACCCTCCTCTCCCCTCTAT
TTTTTTCTGTCCTCCTTATTTCTTTTGGGTCGTACTTCCCTGGCCCATTT
GAGTAAATCGACTCTTCTTCTCTTCCTAGTGTTCAAAGTACATAACTTCA
CATAAAATAGACGTTGTCATGGCAGTATACCTCTTCTCCTCCTCCCTCCA
TCAATTCCGTTGACCGTTTCTTCTTGAGTTAAACACAAAAGTTATTGGAA
ATACAATATAGAATCCATTCAGGGAAGAAATTTTGCATTTAGGTGAATAA
TTACATCAAACCGAACCGGTGCTCTGAACGTCATCCATCGGCATACGTCT
CCCAATCTCTCTCTACAGAGCATATCAAGACGAACCGAGAGAAACAACGC
GTACCTCTAGTCCTCATCCTTTACTTTCGTTACTAAACTTTCTCGAGAGG
AGCTCCATAAAAACACACGAACCATGCCAATATCTGCCTAATCTAGGAGT
TCATCGTCAGATCTTGTCGTCCTTCATGAGTCCCTTGTCAATTCCATCTA
CCATAAGACTATTCTTGATATTGCCTACCTCCAGGACATAATTGTTCATC
ATATTATTGTAGTTGGTTGTGCCTCCGATGTCGCACGTTGCTTCAGCCAT
GGATTACCGTCACCATTGGAGACGAACAAGCTATAAATCACGTCCAGTAG
CACCACCTCGACGTCCTCTACGTTGTCCACATCTTCTTCAACTCCGGGTA
CGTGCCTAGCGACGAGAACGGTAACGCCAAGATCGTGCCCGCAAATCCTG
CGAACTTCTCCGGCGAGTTTTTCTGGTGAGCCATCTTGGACCATTAGATC
TTCGTCTAAAGGTCATCGTAGATCACTTAAATGAAGGGGTATCCTCCAAT
TAGAATCTTCCAAGTGTCATATTTATTCCTATTTTCGGATTTTTAGACAT
AAGAACATAGAAACTTATAAAAATTATATCTTTAGTTATGTATATTTAAA
TTTAGCAAATAATATGTCTATAGATTCACAAAAACGAGTAGAACAGTGGA
GCCATAATTAGATATTTTTGGATCTGTTAAAATCACGTTTTATACAGAAC
CATTTGTGGAGTATTTTGAGTATAAAATTGTTGTGTAAATTATTTTTAAG
TGAATCCTTTTGCAAATGGTTGTAAATTCAACCCTCTGTCCAGTAAGACA
AAAATATAATTTTATTATAGTATAAATAAGAACGTGGCAATTATTTAGTG
AGAACTGCCTTTCCAAGTGTTATAAAATATTGCTAATTGCTACAATTACA
CAAATGGTTGCATTTGTAATCTTGAAAATATAAAATGTTCATAAATCACT
TAGTAATGTTCAGAACCTTGTTATAACAATTTGTAAAATAAAAATTGCCA
TCTTGCATGTTTGCATACTTTGCATGATTTTTATGTTGCCATTAGAGTTG
ATCTTATGATTGTTTTGTCTTGGTTGTTTTGCTTGATAGATTGTGTTGAT
TGTCAAGTGTGTTATTGCGAAGAGTGTACCAACACCACAAACTACTAAGT
CAAGTGGAACTATCATCCATGTCCTACTATTTTCGTTACACTTAGTGAAA
TTTTTGCAGTATGCATGATAGGGCTACTATGTTACTATGTTATGATATGT
CATATTAGGATATCCTTTATATCTTCCTTAGTGGAAACATCATAGTTGTA
GTATGCTTAGCCTTGCTATAGATTCAGGGTGGAATATCATCCTATGATTA
TATGAAGTGTTGGAAAATATATGTTTTATATAATAAAACAATTACTCAAT
GAATCACCTGGGTGGAATGTGGATACTCAGTTGTGAATAAGGTGGCAACG
AAGGGAACCATATCTATGACTATCTCTTTCATGTGTGCACTAGAAGAATA
CCACCCAGGGACTTAGAGATTGAACATATTTCTCGTACAGTGGCTTTCGT
GTACAACCACATGCTAAATGGGCTCTAGCTTAGTCAATTACATAGTGGAA
GACCCTTGCATTGGTACCTATTCAGGTTAACTAGAATTATGTATTGGAAG
TATATCCTTACATTGGTGCCTGGTAGATGTGTTAGCATTATGTATTGGGA
GGACTTCTGTGTAAAGACTTTGTCAAATTCTCGATATGTCGGTACTCCAC
TTGGTGTGTACTTATCCAGCTGCCACTGGTGGCGTCAAGACGAGATTGTG
TCATGTGGGTAAAGTGTAGAACTTTTGCAGAAGATCAAATTCTAAGTATT
TAGTCGTGTCCCCGGTTACGGACAACTCTGAGCAACTAAGGCCTGAAGCT
ATGTAAGATCTCGACATTCCAATTTCTCAAAGTAAAACTTGATGGTGTCA
AAAAGGGATTAGAAGCACTTGGAGTTTGCCAAGAAGTTCAGAAAGATTGT
TAAAAGATCAAAACTATTTTAAAAAGATGGGATAAAACCATATTGCTTTC
TGCAAATGAGCCTAAACTCTACTTAGCCAGATATGCATGTATTGATAGAC
TCCAACTTATTTACACATAGTAGTGACACTTGCCAATACAATTCAAATAT
ATTGAACCTTGTGGCTATAACTTATCATGTTGCAGGATTACTTCATGATA
GTGATATCTTCTATATCTAAATAGTAATCCCCCACTATCTTATTTCTCTC
AACATGCAAGCTATCCACATCAGTATACACGTCAGCTCACCCGTTTCATT
TCTGTTCAACGTTCTAACCAAACCAGCTGGTGCAGGGCGTGCAGCCCATT
TGAGATCTCATGTAGCCCATAACTCTAGCCTATTTGATGCTCATTTGATT
GGAGAACGGGTCCATCATTCTTTTCTTTCCCGGCCCATTGCCATATGCAG
CCACCAAACATCAGGCTAACAAAAAAAAGGCAACAGCCTCGACGCACACT
CTTCGGATCTCCTTGACGGCGCTCTCTCTTTCTTTCCCATAATTATCGTG
AGAAAATACCGCAGATGAAACTGATGTATGCATACAAGAAGCCTGCACAG
ATCCCTCCTTAAATTTCGAGCTCCGCTTCAACCCATACATTATGTTTGCA
TTCCCCTTAATTTCTGATCTACCGGAGCACCGCGCCGCCTGCCACCGCCG
CCGCTTCATTTTTTTCACCATTCACCTGATCGGCACCAGCCCTTCGTCCT
CGCGGACCAGACCCTGATTGACCTGCTTCATAGCCACCCACCTCATCCAT
CCTTCGTCCATCGGTTAGGATGTGTCACCGCGCTGCAGCCGTGGCTCAAA
CGAAGGTCAATCCAGAGGCAATGGCTTGGATGCCTGGGTGGGGTGAATAC
ATCTCCTATGAGTTATGTGTTTTGCCTTTTTTGTTAGGGAAAAGGATCAT
GTAGAGTTTGATCTGCCGGCTGTTGTGTAGGCTATCGTCAAACTACTTTT
CTGAATATATTTCTCTTCTTATAGGGACAATTGATGATTATATAATTTCA
TTTTTGCTTGGTTAATAGTTTTGTACGATTTCTTTCTAAGAAACTTATTC
CATATATGTAATTCTATTTTGTTCAATATGTAGGCTGTTGGAAGGCTTGG
GAGATACTCGATGGAATGACTCAACCAAGTAGGTACGCAAGGAATTATTG
GAGGTATTTTATTGAAGACACAAGTTCTTGCATATTGATTTGGTTGGCCA
TAAACTTTGCGGTACATGCACTGTGCACTGTCTAGCATAGAGCCAACACA
CTGCTAATATATGGCCTCAGGAGTCCTTTAATCTATTATTTTCCTATACA
TGTTGTCCTACTTTAGATCAGCAAATGAGAATATGCCGTTTTTCCTCTAA
TACCGCTGAAAACCTTATCCGGATTCTGCTCAAATCATAAGCGAGGTTAT
CTTCATTTCTTCCTGTTTAGTACGTGTTGCTACTGTCACCTGCCGTTTTA
CGAAATTCAAAGCATATAACCTGGAATTCCAAACGAAATTTTCCGGTGCT
AAATCTACTAAACACACTACCAACACCGCCAGGTACCAGCAGCCTGCCAG
GTATGTCCTCCCAATTTTATTGCTGTAATCTATGGTTGTATTATTTTTCT
ACCTGTAATAAGGCCATCTGGCTTTTGTGTCAGTTATTGTATATCTCCTT
TATGGTAACGTAGGTGATGCTGAAGCTGTTGGAAACACCGATTGTGACAT
CGGATACCACAACTGTAGTTTGAATAGGACCTGACTAGGTGAGTGCCATC
GTCTTCCCTTTCTCTTCATGTATCCCTAGGGATCTTAAAACGTCAACATG
TATGAAAACCACTAGGTTCACATGTTGCCGAACAGTCCCCTCTCCCAATT
TCCTTCTCTCTTTGTACAACTTCAGTACACACATGCATAAATGCATCTAG
AAAATACTCATACAGAAGAGTTACAATATTATTATTACTTTTTTGTGTTT
TTTACTCCTATAGTTGTATATAGAGATAAAGTTGCATCTGGATATGTGTT
GGATATAGTGAGGACACTATCTGGACATGCTATTAATAACGGATGTTTGT
TTATTCTTTTTTTTGTCGAGTTGACCCCTTGATTTCACAAGTTCTATATG
TGGAGATCTATTTGGTTCTCTTTTAAAAGATATCAAGCTTTAATAAATCT
GTCTTCGTTTTAGATCCAACAAGTCAATAATTAAGGAAATTGCAAAAATA
ATATTCTTTATTGCTGGTTGTACTAAAGTTCAATGAATCTTTTGTATGCT
GGAACACTCGTATCCTTCAGAAATACATTTATCAATGTTTTCGTTTGATG
TTATTTCCCTTTGGGATTTGCACACTTGATTAAATTATATACCTTCGATC
CAAATTAATTGACTCGGATTTATCTAGATTTCCCTTCGTTTGTTAAGGTT
ACTATTAAAATAAGAAAATACATTATAATTGAACAATTGGAGCAATCGAG
AATGATCATTTCTGCCACTTACCATTTATACAATTTGCAACTATCTAGAG
AGTTGAGTGTGCGCATTAACGTTTATTCTTATCTTTTGATCATATAATAC
AACTCATGTTTCTTTTTAAAAATGCACATTTGTTGCGGGGCATCATCTAG
TTTGATGAGTAGGGGTTACGAGTCTGCACCCAACATGTTTGCTTGTGGCA
CATGAAGAAGAAGGACTCCATGCTTTACTTTTATTCCGCTACTTTGTAAT
AAGATAGCCTATGGCTATGAGATAGTAATAAAGTATTTATATTCTGGATC
ATGCGATGTAATATGACCTTTGTATCTTGGTATTACATCTTAAAATGTGG
GTGCTAGCTATTCGATTCAGGGACTAGCACTGTAATCACGGGGATTTCAA
ACCAAGCCGGGTTCGGGTCCGCTATAGATGGCATCAGAGCACTGTGTTTC
CTATAGGTTCGTAATCCTAGGATTTGGACAAAGACCCTTGTTAGGAATGA
ACTTATAATTTTTTACTTACTAAATTTTCTCGTATACACTGATCATTCTT
TACTGAATCTTTTCTCCTTCAAACATGTAGAAAATCAGCCTTTTGATTTC
TCTAAGGACCTTGAAGATGGATCGTGTCAACAAGCAGTTCAAGATACAAG
TTGCGACAAGTCATCGAGCTTGCAAAATATGTGGATAAGTAGGCCACACC
TCTAAGGAACATCCAGATCAATGTCCCTTTTGTGATGACAACCATCTAGT
TGAAGAATGCCCCGTATCTCAAGTTACTTGTTTCCTATGTGAAGGAACCA
ACCACATTCCTGCCAAGTGCCATCTCGACTTCATAGTGCAACAAATGAAA
GAACAAGTCAAGGATGGAATGTATCAAGCTCTCAAGAAGATAGAAGAAAA
CCTTAGTTGTATCACTTGCTCCAAATGCAAGAAAAAAGGACACAATATTA
ATGAATGTCTAGAGAAGGAACTTCAAGACAACCACAACAACACTTCAAGG
AAAAGGACCAGAGACATTACAAAAGTGTTTTGCTATCGCTGTCGGAAGAC
ATGACACTTCACTGATGATTTCCCAACTCAAAAGAGAGCTCCCACTGATG
TTATCATTGTGTGACCTAAGAGACATTAGATTGCCTACCAATTATTTAAG
ACTTTCGTATCGTGTTAGTGTATGGATCATACTGACCAATGTGGTATGAC
TTTACTAGGTTGATTGTTCCAGCAAAACTTGTTGTTTTCTTCGACTCGTG
AGTTAAACTCATAAGTTGTTAAGTGATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.