Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA033402

[Submit comment/correction]

Sequence	AA033402
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA033402
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGGGCGCCGCAACCCCCGCAAAACACCAAGGAAAGCTCCCTTTCTCTTC TTCCCTTTCGTCCTCCTCCTTTCTCACCGAGGATCAGCAGCTGCATCAGC ACCGAAAAATCCTCCCCATGAGGCCGGGACCCCTCCCGCCGCTCTCCCTC CTCGTGCTCCTCCTCTCCGTCGCCCTCCAGTCCGACGCGAATGCGCTCGC CGCCCCAACAGGTGAATTCACCCACCCCTTGCTCCTTCTTAAAATGGCAG GATTCGATCTTGCCTTCTCCCTTCCCCTCTACTCACCTCCCTCGTGGTTT TGCTTGTCGCAGATAGCATCGTGAAGCAGCTCTCGGCGGCGGTGAAATGG CCGCGCGGTTCTTCCCCCAGCTCGCCCAAGCACTCCTCGCACTCCCAGTA TGGTGAGTATAGGCACTAGCTAGTTGCTGTTTCGAGGGTTTGCTTAGTCT GTTCATTGACGATGAGCGATTACTGCGAATTCGGGAGATCGTTAGAGAGC AGTTACTCGATTTGGTTTCCTGCGCTGTCGTGTTTCTTGCTGTTAGCCCA GGAGTTTCATGTATTCTTGTACTAATTCCTAGTAGTCCGTTCTGTACTAA ATTGACGTAATTCCTGGTAGTGCATTCTGTACTAAATTGACTGAAAGTAA GAAATAACTGTGGTCTGTGGAGAGAGAACCCAACATTTCTCTAGATCTTG GTATCATTTTTCTTTGACCATGCAGGCCTTTGCATCAACACTGTTACTAA TTTGTCGCGGCAAAGTTCATGGCTATTTCTGAACTAATTCGGAACTTGAG TCTTCATTTCTATAATGACTGAGCTGAGTTCAGCTCCAGTAGAGTTAATC ATATTCGGTCTTAAATCATTTGCATTACCAGCTAGTTAATATGAGTTATA ATGGTTAATGATTTTAGTGTCCTGGCTTGACCTTGATCTAATGGTTATGG CTTTTCTTGATGTGGCAGATGGGAACGTGGCACTGCAATTTGAGAGTGGC TACTTTGTAGAGACGCTTGTTGAAGGAGACAAGCTTGGTGTCACGCCACA CACCATTAGGGTATCCCCAATTGAAGGAGGAGAGCTCCTTGCAGTGGACT CGGCACATAGCAACATTGTGCGAATAACCCCGCCACTGTCGGAATGTATG TTACCACTTTGCTGTCCCCAGTACATTGTTTATTGGGTATCCTTTAAGTA ATTCCCGTACATGTTTTGTGGGAATCTGGTATGGTAATCAGTGGATATTT CTAAAGTATGGCCACATGTATCCTCAATCATGGCATAATTTTAAAGAAAA TTACCAAAAGCAATTTTTATAGCTGATTTGTTGAACATATCACTGGATTA TCCAAAATACTATCAAGAAGTATCCAAATATGTTCTGACGCTTTCCTCTA AGTAGAATGGTTTGGATTACTGGTTCAAAAGAGTCCTTGTTGCAACTGAA TTTAATAACAATTACATTTTGGTTGTTGGCATTAATAAAAGCATGCATAC GCCCTTAAGATACATAATCTAAACATTGTAATCATGGATCTGATAGTGTT GCTACCGGGATTGATATTAGAATCTCTGCAGATAGCAGGGGAAGACTGGT TGCTGGTTCTTTCCAAGGACATGCAGGTCATATAGATGGTAAACCGATTG ATGCAAGATTCAAGCGCCCCACAGGAGTTGCTGTGGATGATACAGGAAAT GTCTATATTGCTGATACAGCAAATTTGGCAATCCGAAAGATTGGGGAGTC AGGTAAGCTTTAATTTACTAGTAAGAATTCATGCATCAGTTTTGTCTTAG CAATTGTTGGGTGAAATTTCTGTGCAGGAGTGACCACTATTGCTGGGGGA AAATCCAATATCCCAGGGTATAGGGATGGTCCCAGTGAAGATGCAAAGTT CTCAACTGATTTTGACGTTGTATATGTGAAGAAAATGTGCTCTTTATTGG TTATTGATCGTGGAAATGCCGCCCTTCGCAAAATTGCCCTTCCACAAGAA GATTGTACTTACCAGGATGCTGCACTACTATCTTCAGGTTCACTATCTTA TTTACTTATTATGAAAGGTCATGTAGATGAAATCCCATTCAAAAGGTTAT TGGGATACTTAAATATGTTGTTTATGTTGGGAAGATGGTTGCTGGACAGG TGAAAACATATCTTTTTTTAACATAGCCAGAGCTTGTATTAAGATTGAAC AAGTTTACAACACAGCTCAAACCACATACTCGTGCTCTGAAGATCAGAGC CTAATCATCTAGTGCCTAGAAGCAGACATAGAAGACAAGCTTCTCAAGGA AAAAAAAGATAAGTTTCTGAAAATCCACACTGTCGCCCATCTACCAGGCC CGCGGCCATCCAAGATGCTGCCAACGGCTGTGCGCCAGCTCAGCCCTTAA GATGGTGTCCCTTGGCCTAGTACTGCCTAGCCTATACACAATTCAGTGCT TTTTATAGTAGCACTCAAATTTTTGTATTAAAATAATACATTACTCAATT ACAATTTAGTGACCACTTACATTAGGATAAAGGCAACACATAATTGCAAT TCACAAGTTCTGAACAAAGTACATTGAGATGGCACTAAATCTCAACAATG CACAAGGCAAAAGATCATAACAGACGGACTCTACATAGACAAACTATTCA ACTTCAGAAGACCATCCTACAACTATGGCTTGCCTAGTGAGTCCATCGTC ATAGCGACTCCGTTTAAACCATTCATAAGTTTTGATTTTCTTTTTCGCAC TAGCTCCTCTTTTCCAATATCACCACATCTTTTTAACCTTTTCTGCCTTC TGCTCCTATGATTTTCCTCTAATTTTCATAATTATTGTGTGAATCCCACC GTACCGGTTGCCAGAATCTCTAACGTCCCCAGTGTTAACAAATTTCAAAA TAATATTCGTGAATTTACAATATGTTCACGGATTTGAAAAATATTGATTA ATTAAAGAATGTTCGTGAATTTAAGAAAATACTCATGAATTTGAGAAAAA AAATTCATGAATTTGAAGATATTCGTGGATTTGAAAATATGTTCGTGGCT TTAGAATGTGTTCACAAAGTTGACAGTGTTAAAAAAAATTTAAAAATGCT TGTGAGCTTAAAAAAGAGATGAAGACTAAATGGCGAAAACAAACAGAAAT GGATTAGAAAGAACCGAAATAGAAAACCAGTATCCAAAAAAAAGTGAGGA ATAGAGGCTTAGTGGGTTGGCCCACTTATTGAACTAACGTGCTGAAGGGG TACACGTTGCGCAACAGGGGGTCAAATAGGAATTGCCTTCATAGCTGCAT TTTTCTTCCTAGTCAGCTTGGCGATGCAGTAGGCCACTAAAAAATCTCCA CTTTGATACGATAACACCTTTTTTTGGCAAATCGTCATCAACTTAGTTTG TGAATGTATGACTGCAAGGGGGTATCGTCATCATGTACGAGTTCTATTTG TCAAGCTCAACTATGGATTTTATCTACAAATAATTATTTAAAGTTAGGTT CACTACATGAACAAGATTACATGATGGTAAATTGTGTTACTAACCGCTAA GAAAGATAACACTGCCGACTCTGAATGGTGTCTGCTGGATGGTAGAGTGT ATGGCTCGCCAGGTTTAGGAACAAATTGGTGACACTGGATCACATTTGTT TCTATCAGATATTAGTTCATGTATATGCATCCCGTGTCTGAGGGTCGTAC AGTGTGTTGTTGGGCCACACACCGATTTGGATATCATTAGGAATGTGTTG CCCAGTGACATACCATATGGTCCTCGGACACGCGATGCGTATGTATATTG GTATCTGACAAAAACAAATATGATCATATGTCACCAGTTTGTTCCTAAGC CTGGTGAATCAAACACTACCATTCATCAGGCACCATTTAGAGTTGGCAGT GTTAATTTTTCTTAGCGGTAAGTGACATAATGTAGCAATCTTGTTCATGT AGTAGACCTAACTTCAAGTAATCATTTGTAAAGAAAACCCATACTTGAGC TTGATGAGTCTGATTCGTACATGATTACATTACTTGCTCATGGTCATATA TTCACAATGACCAAGCTAATGATGATTTGTCATAAAAAAAATCTTGTTGA TATCGATGTGGGAAATTTTCTAGTGTGCTACTGCACTGTCAAAATACCTC GAGTGCCGGTGAATTCTGGAAGTGACATCCATGGAGCAGAAAGAGTAGGA AGGATAAGACGTATTCTAACTCAAACATGCACAATGGTGAACATGAGCAG GCATAGTCTGATGACGATTTACAAAATGAGATCTCAACAGTCAACAGTTG ATGAGGAGATTGTTGATGGTAGTGACAACCACGGAGTGGAAAGAGTTGTG CATGATTATAGTTCGAATATCGGTGATAGTGTTGCTTCCTAGGCGGGCAT TCATGAGCAGACGCCGGAGGAAGCTGCACATGAGCATGGTTCAGACATCA GGATAATTTTGCTCACATGGAACATGAGCGGGGACATTTTCATGACGACC TATAGAATGTAATCCCAGCAGCAAGTGATGTTGTAATTTTTATGCTCGAG TTGCCGGTCAATGGTGTTGTCATTGATTTTCGGGATGTGAATGACATCCC AGCAGGTGATGCCAGCAGCCTAGAGCTGCCAGTCAATGTTGTTGCCATGG TTTTTAGGATTCTAATGCAACGCCAAAGTTCCCCAAGATGCCGCTGAATT CTAGGGATGATAATGTGGATTTTGTGCATATGGTTCATCCAGTGGTAAAG TGTGCTACTGCACCGTCACTGGACACCTCATCTGTGAGTGTGAACCTCCA AAATGATAATGTTATCTCACCTGGGAGACCGAATGATGATGCCATGGACA CCTCAGCCGAGAGAGAGCACTGGGTGTCTGGGTGGAACCAATGTTGAATA TCGTCGTGAGTGTTTCAAAAAGTTATCTACACTAGAAGACCAAAAATAAG GTGTCCCAAGATCTAGATTTTTCATGTGCAGAAATCCCTGATGTTTCAGG GGCGGCTTCAGGACCTAAAAAGAGAAATAGATGGACTATTGGTGGGAGGA CGCTAGAGATTTTGGCACTGAGTATGTTAGTCGGTTCGGTGGGATACAAG GAAAGCATGCATTAGAACCAGAATCTTGGTTTTCACACAATAAGTAGGGA AATACGAGGAAAAATAGTGGAGCAAACTGTAGAAAAGAAGGTTAAAAAGT TTCCCTGGTGTTATTGGGAAGAGAAGATCTTCAAGCGAAGAGAAAGATCA AAACATATCAACAGTTTAAACAACGTCGGTATGACAACCCAGTCAAGTTG GACAAGCCATAGTTGTAGAATAATCTTCAGAAATTGAATAGCTAGTCTAT GTAGAGTCTGTAAGTTATCATCTTTGTGCCTTGTGCATTGCTGAGGTTTA ATGCCAACTCAATGTGCTTCGTTTTGAACTTGAACTCATTTTGTTGTTGT GTACTTGAATGAATTGCGATTATGTGCCCAGGACTGAAACCATGTCACTG CATGCAAGAATAATAAACGTTGGTCTGTCAAAAACCACTGGTTTATTGTT GTCCGAATTTCCAGAACATAATAAAATAGGGAAGACTAATTTTTTGCTCT TCTAACTTAGATATATATCCTTTTTCGGAGACATTTGTACCTATTAGGTC AATCGGCCAGTGTATGTTAGCGACACAGGGGACAAAGGTGAAGGAAAAAC AATATTGTGACTTCGATTCTAAGTTGGCATAAGTGTTAGATTAGATGTAT GACAATTGCACTGGACGTTAGAAAATTCCGTGCTGATGTATGAACATATC TGTCTAATTGGATACTCAGCACCATGTGGTACATATTACAAATGTAGATG GCTAGATGCGTGTGCATGTCATCCTTCATAAAGAGAACAACTTACAGGAA CTCTCGAGATTACTGATGATGTAGATCTTCGTACCTCTTTATAATGAGCC GTGGAGCCATGCTCCCATGCATTTGCTATCCTTGAGATAAGCAAAGCAGC CATAGACACATATTACTGCGCCTGATTATTTTTATATTTGATTTCTTTGT AAACTATCTCGAAGTTTGGATCTACGATGATAGGAGTTACAGGATAAGTT GGCCCAGAATTAACCTAAGAAGATGACTAGTTTTTTCTGTGTTCACAGTT GACATGTTTCTCTAGAATTAATATGATTTATTAGTGGCTATCTCCTATAT GGTTGCTGGAATCATTTGTACTGCCTTAAGTATGATTATCAGAATGATTG AATTGATGGTTAGTTTAATACTGATTGTATCTGACAAACCTGCCTTTGAT TATTTAAGGTATTATTATGGTATTTCAGGCAGTTCTGTAAAAAAAAAAGC AGTTCAATGGACTTGGATCATTGATATCACTTTGTTGATTTTCACAGATA TCATATTGGTCATTGGTGCTGTTGTGGCTGGATATCTCTTTTCTGTGGTA CAACATGGATTTGGTCCGTCAAGTTCTGACAAGGTATCTGATGTTCTATA ATAGGTTTGAGTTTACCGAATTCAATAGAAATTTCCATCAGAAATGGTTT CTTAAAGTTTTTCTTTGAAGTATTTCCAACTCACTGTCAAATAGTATCCC CGTTGTTGTGTCAGTTATAGGAGAGTGAAACAGCAAACCTTTGATACTGT TTGTTTCTTGAAATGAAACCTGTGCTTACATAGTAAATCTCTGATTCCAA TCTAGATAGAAGAACCTGAAGACGAGAAACAAGAGAGCGGCACCGCAGGA AAGCCAGCATTGGTCGTGGAGAGCCTTAAAGAGGAACCGAGCGCAGGATG GCCGTCTTTCGGGACACTCGTTGCTGACCTACTGAAACTCGCCGTTGAAG GAGTGGGGAACCTAGTCCTCAACATCGTGCCGACACGCCTGCAAAACATG AGGAGAAAAACAGGCCTCACACCTCTCAAAGACAGGCTTGTGATGCCCGA GGACAGAGAGCAGGAGGCAGCAACCGTCCAGAAGCTAAGCAGCACCCCGA TGAGGAGCGAGACCCTCCATGCTCCTAACGCTGACAATGAGACCGCGCCG AAGGGCCAGAAGAGCGTGAAACCATCCAAGTTCAGGGATTCTACGCTGTC GAGCAAGCACAGGTCCACCAAGAGGCAGGAGTATGCTGAGTTCTACGGTT CCGCGGAGACGCCTCAGGCGAGCGCCAAGGTCCCGAAAGACCGTCTCCGC CACCGCAGCAGCCATCGGGAGAAGAGCGGGGAGGTGGCCTATGGGGCTGG GCGTCCAGAGCCCAGGCCGTCCGCTGAGACAATGAAACCGGCGGAGTATA GCAGCGAACCGAAGTTTGATCAGTACAACATGAGGAGCAAGTATGGCGCT GACAGTGGATTCAGGTACTGACTGATGCAAGGGCTGTTGCCATCGTTAAT GCCTACAGGGTCCTCGGCCATTGTGTCTACCCCTAGTAGTTTAGTAGAAG CACAAGGGGATGCTGCTTTTATGGGTCACTGTCTCACCCTTCTTTCCGCC CGCAAGATGTGGCAGGTAAAACCAGTGTAGCTGTTTAGGTGAGGTGGAAA CCTACATCATCGGTTGGCATCCTGTAGTATCTCCTGTGCGATTTCAGCGA GCCGGATGTAATTTTCGCAGAGAGCGACATGTAGCCTAGTAACTTTCTTG ATCTGATGTTTGCTCAGCAACACCTGTCGGTTGCTCGAGTGGACGAGCTG CAACGCTTAAACAGGCGTGTGGCTGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.