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GrainGenes Sequence Report: AA024485

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Sequence
AA024485
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA024485
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCGCCTAGAGGTAGAGGCAGAGGAGAAAAAGAAGGAAAGAAGAAGGAAA
GAAGAAGGAAAGAAGGAGGAATGGCCTTCAAGTTTGTTCAGGCGTGTACC
GCCGGGCAATGCCACCTCTTGCCGTTGCTCCTGCTGCATCTCGTTCCCGC
CATTTTCCTCCTTCTGCTGCTCTCACGCTCGGCGTCGGCATCGACGGTGG
TCACACACCTGCCAGGATTCGAGGGCCCTCTGCCATTCTACCTCGAGACC
GGGTAAGTATTTTTGCACCAGCCTGTAGGATCTTGAGATGAGACTGATGG
GCGGCTGGAGTGGCCGTGCTATGCAGGTACGTGGGTGTGGAGGAGGAGAC
CGGGACGGAGCTCTTCTACTACTTTGTCGAGTCGGAGCGGAGCCCCAGCG
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TGTGCAGTATGCATCTATCGATCTAAACAACTTGTAGCATGTTTTCTTTT
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TGGACACATTTTGTACAAAAAATGTGTTCTCGCTGCGCCAAAACCGTTTG
GCGATGCTTCACCAAGAAAGTTTCTGCTGGAAGAATCTACCCATATAAAT
GCACCACCTAGTCGACCTGATTTGGATTGTTTTGTCAGTGTTTCTTCTTC
ACTTGACTGTCAATTCCAATAATGAAGAATTTTGCTGAACGTGAAAATGT
CACATGGCACTCTATTATCATATCATGAATTTGTTCGTGTCTCATTTCTA
AACTGCAGACATACGGTTACTACCTTTCATACTTTTGGATGAACAACAAC
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CACAACCAAGGAATACATAATACATATATGCCTAATTTGCTCGTATTGTT
TGACATTCATAATTATCTTTGGCTTGCATGAGCATATGCTCCTGAGCCAA
GTTGTATTTCCGCAAAATAACACACTTTTGAAGTTTTTGGTAACTTCAAT
ATTTTTTTGCACTGATGCGACATCCTCGTGAGACATGTTTTGGTTGTCGT
ATGAATATGCGACATCCTCGTGAGACATGTTTTGGTTGTTGTATGAATAT
GGTGTGCAAAAATAGTTTCTCTAATACTGCAATGTCAGGGGTGATTATAA
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CCTGTAGATGTGCGCTCTTTTTATCCGTGTAAAGGACTCATAGAGATACA
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GTACGTTGGTGGAAGAAGTGGAGTTAGCGGCGGAGGTAGAAAATAAGTTT
GAGGGGGGGGGGGCAATCAAATATTTTGGTTCTTGCAAATTGTTGGGGAG
TGCCGAAATACAAAATTTCAGAAAATTTAGGATGTTTTAGGTAAGAAAAC
AATATTAACAAAATTCTGCATGTTAGGGAGGGCTAGGCCCCTGCTGGTCC
CCGCTGGTCCCCCTGTCTCCGCCACTAAGTTCTACCTTCATGCAGCTAGG
AACCCCCTAGGTGCCTTCCTCTCCACTGGATAAGGAGGGAAAGGTCTCTT
GCAAGAGAATATGCCTTTATAAAATGGTACCCAGATAATGATACACAATA
TAAATATCGCTGAGACTATATTTGAGCTTCTAAGTGAGATTACCCTCTTT
GTAATCGTGCCATATTAATAGAAAGTCACTATAGGAGTTGTCTTGTCACC
CACAAGGAGGTATCATAGGCACAAAACGCTGAATGTTGTTGAATCTCCTT
AAGTGCACAACCACAATGGTTCACTATTTACGGTTTTGAAGTTTCCGGAC
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ATCTTAAATTTGGAATAACATTGACTATAAATAATTTCTACAATAGGGAA
CAATTGGTGAGTGGATAAGGTGCGTCAAAGGGCTCCCCTACGCATTTGAC
ATGCCAAGCAGCATACCATACCATCTCAACCTTACCATGAGAGGTTACCG
TGCACTCGTGTATAGGTGATCACAAGTCATCAATGCAAGTTCTCCTAATC
ATTTTAACTCAAATATTCGTACACATCTTCTAACAAGAACCATGTGTGAG
CGCAGCGGAGACCATGATCTCATAGTGCCATTGCTCGGCACACAAGCGTG
GATCAGATCTTTGAACTTCTCCATTGTTGATGACTGGAGAGCATGGCATC
TAGATGGCCAAGCTGCAGGGTTAAGACACCTAAGCCATTTTTCAGACACT
TATGAATATGAAAAACAATTATGCCACATTGATTGTGTGTGTGTTTTTCT
ATTTTTATTTCTTATGAATGCATCCTTTATTTTGCGCAGATTTACGATAG
CATACACAAACAACTTGACATTTGCGACAATAAAGGTGGTCACATTTTCC
TTTTCAGATTATTTGTCCTATCTAGGGATTGGGAGAACCATATGAGCTTG
CCCTGATAGCTTCTGATGATTTGTTTGTTTGTGTAGGGTGGTGGTCATAC
TGCTCCAGAGTACCAGCCCGAAGAATGCTTTGCGATGGCCCGACGGTGGT
TGGACAATGAGCCTCTTTGACACATATACTTTCATCGCATAAAGGTTCAG
ATATCACAATAATTTTCGAAGCACGTCAAATAGTTAACAGGTTGTCGATC
CAATCAAGCATAAGCCATATCTTGTTATAATTGTAAAAAAGGGGCATATA
TGGTAAATAGTACTGCATAATCATTTGTATCTAAAATATGGAAGATTCAT
TGGTGCAAATTATTCTATAATACAAATGCTTGTAAATAGTTGCGGAAAAA
TGTAACACTTGCGTGTTGTAGAAAGAACAAGATGTGATCGGACAATGCAT
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GTAAATGGTGTCCACTTTTACTTTGATTCTACTTTTGTGCACCTAACATT
CTCTGGTACTTGATTGATGTATTTGTTTGTACCGCACCTTTGACATTGGG
TACATTGTACCAGAACTGTATACAACATCATATGGGCCACCTCTTTTGAA
TTGCAACTTTTATACCACGTCTTTTCTACATCTTTATATTGTACTTTCTT
GTACCAGATCTTCAAACTACTCTCTCCGTGCGGAAAGAAGTGACTTAAAT
TTATCTAATTTTACATGTATCTACACTAAAATGCATCTAGATATATGTGA
ATCTAGATAAATTTAAGTCACTTATTTTTGGACAAATGTGTAGTTTTTGT
TGTGTTTTTCTATTATATCTTTCAACTACTGGTATAAAAAAGAAACATCT
AGTAACATGCGACCAACACCCCCCTCCACACACACAATCTATTCCATGCT
CGTGCTCACAGAGGAGATGAGTGGATATAAAGTTGTGAAATGTTAAAGTA
TCTATGATTTTCTTTGAAAATTTAAGTGCACATTTTCCTGATATCTACCA
ATTTCTATTATTGTTTTGGAACAAACCTATAAAAATATTAATGAAATTCT
AACCTCTATTTAGATCTCTTTTTGGTATTTTCGTGAAATGAAAAATAAAC
CCAAAATATAGCAAAGACTTTGCACCACAAACATGAAACCTCGACAAAGA
GCATCTTGGGGGAGGGCCCAGGGGCCGACACACGTGGGTGACACATCACC
TACATGTGTGGAACGTTGATATGTCAAAAATGTATCCAAGAACATTGTAG
TTTATTATGTGATATTCCAAGATATTTGCATCATATTATAGTTTGCATCA
TATATTTCAATTTTTGCGATTTTACACGAATTTTCCCTTCTTTGGGTTTT
AACGCTGGAGAACCGAAAAACTTTGTTTTGGGCATTTTTTTTATTTCAAG
GACCTTCCCAAACTCAAAACAATATGAACTTTTTGCCACGTAAGTTTTTA
TCCAGAATGAAGACCAAGAAACTTTGGTTGGGACAATGGGCGGCCTAAAG
GGCTATCCACCCCACCATGCGGCCAGGGAGGCTAGAAATGTGGGGTGGAG
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TGGCACCTGGACTGTCAATTCGGGACTAGAGGCCCTATCTCTAGTCCCAG
TTTGCTATGAACTGGGACTAGAGGCCATCACGTGGCAGCGGGAATGCGAC
GGGGTCTGGAGGACCTCTAGTCCCAGGCCTTAACACTACCCGGAACTAAA
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TTTGTGTTTTCCTTTTCATTTTTTTTTTCATTTCGTTCCTTTTTTAATTT
GTGTTTCATTATAATTTTAAACATATTTCCATACACTTATTCTACGCTAC
TATATATACAATACACGTTGATGCATATATAATTAATATTTGATCCCTTG
TGAGCATATATATACAATATTCGATCATATCAAAACGAAGGAACTATTTT
GAAATTACATGGTCATTGATGATATATCATATTAATTACATGGAGATCAC
TAATTTATATTGAGTTCCCGGTCCTCCACATAATGTTCTCCCCTTTCATC
AAGGACCTCCTTCATCAGAAATCCCGTCAATTTCTCTTGAATTACTCATA
CGCGTTGTTCTGGCTCGAGATTCTCCCGCAAACTTTGAATATAACATGAA
TCAACTCTCTGCTCACTGGTCAACTCGCGAATGTACTCATAGACGTAGAA
TTCACATAAATAAGTCCCCAACGGTTGCTGTAAACCCTTCACCATTTTAT
AAGTTAGGTCATCTTTGAATGGACCTTCTATTTTCTTTTTGAACCGTGTC
CAACACCTTCTCGGCAAAGAAAATAAACAAAAGAATTATTAATTACTTGA
TATCAGGAAATGAACGAAAGAGGCCGATATGCGATAATGATTAAAATTAC
TTATGGAACATTGCTTTCATGTCGCTCCACTTCTCTTGGTCCCAACTTAA
TGAGTCGTGGACTTCAACTAGGGACTTATCAACTTGAATGTTTAGCAGGA
TCTAATAAAACATGCAGACGTTTATATAAACAGACATGCATAACGCATCA
AATACATTTAACATCGAGTAAGCAAAAAAAGAATGTGTACAAGACAAAAA
CACTCACTTGAAGTTGTAAGGAGATAGTATTTCCTTAACGTAATTATGCT
TGATTAAAAACCTACACAGGTCTTCCTCTTTGTCCTTGGGGTAATTGTGT
AACGTATATTCATTAATGATATCTGGGTCGATGAACCCAAAGTCATATTT
ATTAAGCCTTTTGGATTCAAGCATCTTCATTCTGCATATATACAACAAAA
GAATATATAATCATGCAATGAACGAGCTAAGCTAGAGATTTAGTTACAAA
AATAAATCACTTATAGACAATAGCAATCGAGGATAGATTTGTCGAGGGCA
CGCTGATTGTATAACTAAAACAGTTTGGTCATTTGAATCTGTATCGAGTA
ATCTTTGAAGTGATGCTCCTTTCTAACGTCCACCAAAAACCATTCTTTCA
GGTGCTTTTTCCTTGTTTGCACATTGTACCATTCATGCAAATTTCGCATG
TCTTGATAGATGCGTGAGCTCCTCGTGACTCACTAGAGGCTCCTCTTTGA
CATACTTCCGTGCTATCTGACGCATTAATGTATCTTCATAGTCTAAATAT
TGACAAAGACACATACCTGATACAGTAGCATTTGCTTTGGCATGTGCTAC
AGTGATGCCAACTAGTCTGGCAACAATCCTGACTCTGGGGTCCAATAATT
CCATGTCCTTATCTATATCGGCTCTGAAGGCCTTGTCCATATCTGAAATC
ACTATAAGCGGGGAACCGATTGAATCTTTTGTTGTCCTAGCTGGGCAATT
TGGTTTCTGCTGTTTGCACTTGTTTTTTGTTCTGCTTTGCTTGCTTCATA
ATTTCTCAGTTATAGTCTGATGGACGATTCATCAATATTTGGGATGGTTG
CTCAAGAAAGGACTTAACCTAGTTTTTGCTTTTTTCATCAAATACCGGCT
TTGTCTCTGGCTTTTTGCGTGCAAAAAAAAGCCTTAGTGTAGACAGCCAC
ATCCGCGACGTTTTCCTCATCAGTCTTGTCATAAGGTCTCTTGGAAAGAG
TCGGCGGGATGTCCACTATATTCGCCGTACTACCTTTCTTCTGAGTGGGG
CGCGGGGGAGCGATGACCTTCCATTTTTTCGGCGATGGCGGAGGCAGAGA
TCGAGTATTGCGCGGAGGCGGAGGCAGAGGCAGAGTTGATGTACTCGCGC
TGCGGCGATCGACATCCCTCCCGTTGAGGGGTGGACTTGGAGGTTGACGT
TCATCGGGGTGGCGTGGACTTGTATTCCTCGGAGTCGGTGGCATTGGTGC
CGAGCCTGAAAACTTGATGCACTTCTTCCATAGAATGATGTGGCATTTGA
CATCTCCCAGCTTCCTAAGGCCTTCAAGCGATGTCAATCTCTAAGTCCGC
AAAATCCTCCACTAGGTCATCCACCGAGACACGAGCATAGCCAGGTGGAA
TCGGAAGTGAACAATGGAGTGCTCTAGGTAGACAAGGTAAAACAGTGTCG
ATCACCACCTTGAAGGACATGTTGTTCATTAGCTGATGTAGCTCATATTG
TGCATCGTGCCAACGACGGTTTTGGTGGTGGCCGGCGGCTGGGAGGGCAG
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GGCAGACGAGCGCTGCAAGAGGGAGTAAAATTATACAAATCGGGCCCCTC
GGCTCCTATATTTGCGAGTCGAAACGGCCGATTTCTAAAAAAATTGCTCC
TTTAACACCGATGCGGGATCGGTTAGAGACGGTTTTAGCCGTTAGAGGAC
TATTTTTGCTTCTCTAAAGTCTTTTTTAGGATGTGTTAGAGATGCTTTAA
GCTCAGCGGTTAAAAAAAATCACGCTAAAATGGATGGCGTGAAGTTACCG
CGCGCGCGAAGTGATATCTGGCGCGAAACCAAAGTGGTCCCGGTAAAAAA
GTTATGATGGCAAGTAGCAGGGTTGATGTGCAGTACATTTTTTTTTGCTG
CCAAGTGCACAGGTTCTTCGTTGGAGAACCACAGCTATGAGCTATATAGG
CCTGTCTTTCGTACCATCTATAGCTGCGGATTTTGGCTATATCTGCTAAA
CAGGTTTCTGCATTATCTTCTTGGAGAAAATCGTGCGACACGGATGAGTA
ATAACAGAGTCTATTTGAGTTTATATTAGAGTTTTGCTACTGCATGATTG
TGATGTGACGTATATAGATTTTTCCTACTCAGCTAATGTGATTATTTGAC
CAACAGAGTTGACAATGAAGGCAAATTTGGATTATGTTGAGCACGCGGGG
CACGGATGAATAAGAATTAGCAGAATTAGCTGCTTGCACGTTATCTGTCA
ACCGAATCCCCAACCATTTGTATTACTAGTCTGTTTCGAGGTACATGTAA
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AGCTCATAAGCTACACCTGATCTTAGCAACGTGGTCTCTTAGTAAGTTGG
GTTAACTCGATCCGTAAATAAAACTCAAAACTCTACGTTTTATCTTTCTC
TTCTCGAAACAACAACGCTAGATGACTGTCAATTGTTTCTTGTGATCAAT
AAAGTGAGTAGGTGATCTGTCATTTGTCAATCACTATTCTCCGTATGAAA
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GACGAGAAAAGGAAGGAAAGAAGGAAGAATGGCCTTCAAGCTTGTCCAGG
CGCGTACCGCCGGCGGGCAATGCCACCTCTTGCCGTTGCTCCTCCTGCTG
GATCTCGTTCCCGCCATCCTCCTCCTTCTGCTGCTCTCACGCTCGGCGTC
GGCATCGACATCGGCATCGACGTCGACATCGACGGTGGTCACCCACCTGC
CAGGATTCGACGGCCCTCTGCCGTTCTACCTCGAGACCGGGTAAGCATTC
ATGCCAGGATTCGACCGTGATTTTGACATGAGACTGATGGGCTGCTGGAG
TGGCCGTGCGGTGCAGGTACGTGGGCGTGGAGGAGGAGACCGGGACGGAG
CTCTTCTACTACTTCGTCGAGTCGGAGCGGAGCCCCGGCACGGACCCCGT
GCTCCTGTGGCTCACCGGCGGACCCCGCTGCTCGGGCTTCACCGGCTTCG
CTTTTGAAGTTGGTTAGTGCACACCGAAATAATCGCTCCCGGCATGATTT
CTACCGCAAAATTTTCTGAGCTGACATCCATCGACCAGGTCCCATAAAGT
ATGTGTTGGCGCCTTACAGTGGTGGCTTGCCGTTGCCGCAGATAGAATAT
AACCCGTTGTCATGGACGAAAGTAAGAATATAACCATCCACAATTAGATG
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TCTCGTATGCGCATGATCCCAAAGGTAACGACGTCGGCGACTACTCGTCC
TCTCTGCAAGTCCAAACATTCCTGAATAAGGTGAGATTGACAGTTACCAT
TGCTGATGTTCCAATGTCTCCTGCTGTTTGGCTGGAGAATTTTTGTGTGT
TGATTACCTACTTACCGCTCTATGGATGCAGTGGTTCACTGATCACCCGC
AGTACCTGTCGAATCCGTTCTACCTCGGAGGAGATTCATATGCTGGGATG
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CAAATGCTAAGTGTGTGCAAGATGCTTTAGCTTGTTCTTTTTGTCGTGTT
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ATCTGATCAGATATATGAGGTAACTCTGCATTCATCCGCTTTGAAAAGTC
TGTAAAATGTGTAAGTATGCATCTGTCGATCTAAACAATTTGTACCATGT
TTTCTTTTCTTTTTCCCAAATTAAGGCTGCAATGAAGAGCTGTAAAGGAA
ATTTTGTAAACCCGGCGAATCAACTGTGTGCTGGGCTGCTGCGTAAAATC
GAAAATGTGAACATAATATACTTACCTATTGTTCTTCTCTGAACTTCTTG
TATTACTGCCAACATCAGCTAATGCACTGCCTTGTATCACAGCTCATTTC
TGAAATTCCAGATGCACACGTTTTGTACAAAAAATGTGTTGTTGCTGCGC
CAAAACAGTTTGATGACGCTTCACGAAGGAAGTCTCTGCTAGAAGAATCT
ACCCAAATAAACGCACCACCTGGTCGACCTGATTTGGATTGTTTTGTCAG
TGTTTCTTCTTCACTTGAGTGTCAATTCCAATACGGAAGAATTTTGCTGA
ACGTGACAATGTCACAGGGCACTCATTATCCCTCAAAAAAAAAAACAGGG
CACTCATTATCATATCATGAATTTGTTGTCTCATTTCTAAACTGCAGACA
TATGGTTACTACCTTTCATACTTTTGGATGAACAACAACTTGACTAGAAA
TGCTCTTGGGATCAAGGAGGTAAACTTGCATTATGTTTTCAAAGTTTTTT
TTTTCAGAAAGTACTCAACTAGTATTCTAGTATCATGAAGGTAGCAGTAG
CTTCTTTGTCTCTATAATTAGACCTAGTGGGTAAAAAATTGTGGCCGGAA
AGTAGAAGTATATTAGTATGAACAAAACAACCCAAGCGTGGAGTTTTGTC
TCCCAGGAGCGTATGCTCCAGGGACAGTAAAATAAAAATTGAAGAAAATA
AATTTGAAAAATCTGTTTTTAATACTTATTTATGCTCTGTGTTCTTACAA
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TCCAACGCTCTAAACAAGCAAGAAAATCAGGCACTCAACTTTCTTTTTAA
CACAGATTGCAATATGTTTTCTCCGTACAAATTTATAGACAACCAAGGAA
TATAGAATAAATATATGCCTAGTTTTCTCGTATTGTTTGACATTCATAAT
TTATCTTTGGCTTGCAGGAGCATATGCTCCTGAGATCCAATTTGTATTCC
GCAAAACAACACAGTTTTGAAGCTTTCTGTAACTTCAAATTTTTTTTGCA
CCGATGCGACATCCAGTGAGGCCCGTTTCGCTGACATGGTTATTGAGCAG
AAGCAGTTTTTTTTTCTTATTTGGGTAAACCGGCTCTAGGTGCCATCGAC
AATCCTCAAGTTTGTAGTAGTGGCCGTTGTATGAATATGGTGTGGAAAAA
TAATTTCTCTGACACTACGATGCCAAGGGTGACTATAAATAGTACAAAAC
CACTATATAACGTAACATGATGCACAAGGTATACATCTAGATGTAAGCCT
CATAGAGATACATATGTTACTCATGGGAAACATTGTGTCTAGTCTAGCAA
GAAAATCACTCGTACATTGGTGGAAGAATTGGATTCTACCTACATGCGGC
TAGGAACCGATCCCTAGATGCCTCCCCTCCACTATATAAGGAGCGAGAGG
CCTCTTGTGAGAGAATATGCCATCATGAAACGAGCAAGTGTCTACCCAGA
TAAAGATACACAATATAGGTCTTGCCAAGTCTAGATTTGAGATACTAAGT
GAGATTACCCTCTTTGTAATCATGTCATATTAATAGAAAGCCACTATAGT
AAGTCTTATTACCCACGAGGCGGCATGACCATGTATAAATTTTCATCTCA
TTTGCTTTTGTCTACTAGACGAGTACATTAGAACATCCTCGACTACTCCC
ACTAGCGCCCCTACCCACCTTTTATTATGTGTAAACCTATGTTCGGAAGA
AATCGTAACAGAATGAAAAACTATGTGCGAGAGAGAGGGAGAGAGACACA
CAGAGAGAGATCTAGTTTAACACACAGGTGCAAGCTTCTTTAAATTTTGT
TCAGTTGCCTAGACTTAGATATGGCATATATTGACTTGTTGGACCCCATG
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TGATGGAAATATGAGGATCAAATACTTGACATTATTCTAATCTAAAATTT
GGAATATTATTGACTATAAATAATTTTGACAACAGGGAACAATTGGTGAG
TGGGCGAGGTGCATCAAAGGGCTTCCCTATGCTTTTGAGATGCCAAGCAG
CATACCATACCATCTCAAACTTACCACGAGAGGTTACCGTGCACTCGTGT
ATAGGTGATTTCAAGTCATCAATGCAAGTTCTCATAATCAGTTTAACTCA
AATCATACACATCTTCTAACTAGAACCATGCGTGAGCGCAGCGGAGACCA
TGATCTCGAGGTGCCATTGCTTGGCACACAGGCGTGGATCAGATCTTTGA
ACTTCTCCATTGTTGATGACTGGAGAGCATGGCATCTGGATGGCCAAGCT
GCAGGGTTACGTCACCTAACCCATTTTTCAAACACTTCTGAATATGATTT
TTTTATGCCACATTGATTGTTTATGTTTTTCTATGTTTATTTCTTCTAAT
GCATCCTTTATTTTGTGCAGATTTACGATAGCATACACGAACAACTTGAC
ATTTGCGACAATAAAGGTAGCCATATTTTCCTTTTTGGATGGAAGATCCA
CATGATCTAACCCTGATAGAGCTTCTGATGGTTTATTTGTTTGTGTAGGG
TGGTGGTCATACTGCTCCAGAGTACCAGCCTGAAGAATGCTTTGCGATGG
CCAGACGGTGGTTGGACAATGAGCCTCTTTGACACATCTACTTTGATCGC
ATCAAGGTTCAGATTTCATAGCAAATTTTCAAGAACATCGAATAACTAAC
AAGTTGATGATCCGATCAAGCATAAGCCATATCTTGTATCATATGGTACA
TAGTACTGTAAAATCATTTGTTTCTAAAATTATGGAAAATTCATTGGTGC
AAATTATTCCACAATACACACGCTTGTAAATAGTTGCGCAAAAATGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.