Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006393

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006393
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006393
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACCGATCAATCCATCCCCCACAACCCTCTCCATGGCGCCGACCTCACCG
TTAGCGGACGCGCCTGCGCCGCGGGCCTCTTCGTCCCGCAAGCGCAATCC
TCCGAAGAGGTTTGCCGACGAGCCGCTCGCCGTCGTGACCAAGCGCCCGC
GCCGCAAGGGGCCGTCAGCCTCCGGGATCAAGTCCAAGCCGAATGTGGCG
AAGAGAACCGCCGGGGCCCCAAGGAGGAAGCAGCAGCCGTCCGAGGAGGA
GCCCGACGACGAGTGCGCCGCGGAGCCTGACCAGGACGCGCTGGCGGACG
CGGAAGCCCAGGAGATCGCGGCCGACGACGGTGACCATCCGACTGATGCG
AGGACCAGGCGAGTGGCCGCCGCCAAGGCCATCACCACCAGGGAGGAGGG
CGACCTGGAGTTCGTCGGCGACCCCGTCCCCGCCGACGAGGCGCGCGCAA
CGTGGCCCAAGCGCTACCAGCGCGTCCCCGCCAAGAGGTAAATCCTATTC
CCGGATCGATCAATCTGGCTCCCCGCAACTGTCTTCTGTGCTGAATGTTG
TTTCTGCTGCAACTGTGTTTGGGCAGAAATGCCGAGGATGAGGAGGAGTT
GAAGGCGAGCTGCCACTACCGTGCGGCCAAGGTGGAAGATGACGTCTACA
GCCTGGGGGATGATGTGTACGTTATGGTAATATTCTCTGCCTCCACGATC
TACTTCTGATCATCGATGGATCATCTCGACGCTCTAGTTCTCTGTACAAA
ACGAAATTACCACACTCTGTTTGCGTTGATTAATGGCACTTCTGTTCTGA
ATATGACTATGATTGATCCTATCAAATCCTGTTAGATTCTTGCATAACCT
TGCTGTTGTGAAATGGATGGTTCGCTCATCTCGTTAATTATTCTGCATTA
AAGTTCTGTGTACAAAATAAATTTCCACCCCTGTTTGCATTCTATGGTTC
ATGTGATTGCAACTATGCTAGCTGTTGTAAAACATCTTTTATCCTCGTAA
TTTAATTGTGCCATAAGCACGGATGTGCTACTTCTCTCTATAAAATCACT
CCCCACCACTGTTTGCTTAACATATTGAATAAAAAAACTCTCTCTACACC
TCACGCAACTGCAGTTATGCTTGCTGCTTTGAAATCCTTGCTCCTCTGAC
TTCAATTGTGCCATAAGCATAGATAGATGATTAGCTGCTTCTCTGTATAA
AATAAATTTCTACATGGCATTTCTCGCACCCTACTTGCATTCATGTGGAA
CCCCCTGCCGTGCCCTCGCTATCTGTTAGATTTTGTTTGTTTGTAATGGG
AATGCTCTGTTTCACACTATCCACACCTCTGGTTATGAACATGCTTGCTG
CTGTAAAATTATGAAACTATCGTTGTGTTAGTCGTGCCACATATCTGGTT
ATGGTAATGTTCTGCCTCCTGACCCCATGTGTTTGCAATTATTATGGTCG
CTGCTTGAAAGTACCTGCTCCTTTTATTATTGATTAGGATGTCTCGGTAA
TGCCTTTCTCTACACCGTCTCATTCTGATTATACTTTTTCTGTGAAACTG
GCGATTCTCTGATTGCCATGCTAATTCTCCATTTCTACAACTCATGTCAT
AGCAAATATGCACGCTGATGAGAAATAGATAATCCTTTGATTGTCAGTTG
CGCATAAAACGTACCTACTCCAGTTCTCTGTATAAAATGAATACCTACCA
CTGTTTGTGTTGCTTACGGCGTTTCAGCTACCAAACTGCATCCATTTGAC
ACCCCTCCTTGTGAATTCAGTTATATTTTTGCATAACATGGCAACCAGCC
ACACATTCATAGAATTTACTTGATTCCATTTTGTCATTCAGGCTGGGGAA
AAAGAGCCGCATTTCATTGGCAGAATTACTGAACTTTTCAAGGGAGCCGA
CCATGGCCAATACTTTGCGTGCCGCTGGTTCTACCGACCAGAGGACACGG
TGATCTCAACCGCAAAATTAGTTGATGATCATACTCATCATCCCAAGCGG
GTCTTCCTCTCCGACGAGAGGAATGATAACCCCCTCGACTGCATTGTGTC
AAAGGTCAAGATTGTACAAATTGATCCCAAGGTCAGTAGTCTTGTTCAGA
ATTGTGTGATTATCTTATTTATGTAATGTTTCTAAATATTTTTCCTGTCA
TTTCAGCTTGATCCTAAGGTAAAAGCCTCACTAGCGGCTGATACCGACCT
CTACTATGACATGTCTTACACTACGGCTTACTCGACGTTTGCAAACATCA
CAGATGGTAATTTCTATTGTGACCTCATAACTTTGTTCAGTTGTGCAAAT
TAATTGTTGACCTATTTAATGCTTTGAATATTTCCAATACAATTGCTAAA
TCTTCATGTAATTCTTTTAGTTGGTTGTTTGAATTAACTCATGATATTTG
AAGATCTTAGAGAATATATGTGAAATAATATTCCCATCTGTCCATGATTA
TCATAACCTGATTTAAGTTAAAATCAAATAAGATTATTTTATATCCACTC
CTTTCCATTCAAAATAATAATTCTGCTGATTGGTTCAGTAGAAATTAGGA
TGACATTATTTTTCTGTACATGTAACTTGTGTTTATTCAAACAGTCAAGG
ATATTTTTGGTAGAGAGAGATAGAATTGGCTTAGGGGTAGCGAGGGCACA
GGAACATTTGTCTATAATCTTTTCTTATTGCTTAGGGCATAAGTGCATGT
AACACATGATCTCTCGGTGTGTAGGTAATTTTGAATGATCTGTTGAATAT
ACTTTCTAGTTCAGGAATATAACTAATTTTTTGCTTGTAGATATTAACGG
AAGTTCGGGGATTTCATCTGACGCTGATTTGGAGGCTAACGCCTCTATGC
CAACAGCCGCGTTGCTTGATCTTTATTCTGGGTGCGGTGGCATGTCCACA
GGATTATGCTTGGGCGCAGCACTAGCTGGCCTGAAACTTGAGACGGTATT
ATTCTGCCTTATATGTTTTTTGAAGAATAACTTGTTGATCACCCTCTTTT
CCTTTTCTATATCAGAAATGGGCAGTTGACTTTAACAGCCACGCATGTCA
AAGCTTGAAATCTAACCATCCAGAAACCAAGGTTGAGTCATGAATCTGTA
GTTCTCTTTCAGTGGTACTAATCCTCCTGTTTTAGCTTAGCGAAATGTTC
TTGTGATTTCTGAATATAGGTTCGGAATGAGAAAGCGGATGATTTTCTCT
GTCTGCTCAAGGGATGGGCTCTTCTATGTGACAAATATGTCCATGGTAAT
GATGCTGACGCAGCTCCTCCCGTGGAGGATGAGGACCAAGACGGTAAACT
CGAAAAGGATGAGTTTGTTGTAGACAAGCTCACTGAAATCTGCTATGGTG
GCGCTGATAGGAAAAGTTGCATTCTGATAGTCCGAGTCCGCTAAGTGCGG
ACTAATGATGCTTACCTATTCTGTTACATTTGAAAGGGTGATGTAGATGT
CTTATGTGGAGGCCCTCCTTGTCAAGGGATAAGCGGGTTTAATCGGTATA
GAAACCGCGATGACCCACTAAAAGATGAAAAGAACAGGCAAATTGCCATT
TTTATGGAGATCGTTTCTTATTTGCGGCCGAAATACGTTTTGATGGAAAA
CGTTGTTGATATCCTAAAATTTGCTAAAGGATATCTAGGTAGGTATGTAC
TGAGTCGCTTGGTGGCTATGAACTACGAGTCTCGGCTGGGCATTATGGTA
GCTGGCTGTTACGGGCTTCCGCAATTCCGCATGTGTGTCTTCCTATGGGG
TGCCCTCTCTACAATGGTTTGTTTATATCCCTTGTCAACACCAGAATTTG
CTAATAATAATTTATTTCTGAGGTGATTGACATGGTTAATTTTGCTATGC
AGGTGCTCCCGAACTATCCTCTACCCACGCATCATGTGGTTGTGCGAGGT
GGGGCGCCAACTGCATTTGCTGTAAGTAAAATGGTATTGAAATTAAGATC
ATCGTGTAATCCACTTAGAAGTGTAAATATGTTGACCAACTTGCTTTTTG
TTACAGCAAAGCATTGTTGCATATGATGAAACTCAAACGCCAATCTTGAA
ACAGGCGTTGGTTCTTGACGATGCAATCTCAGATTTGCCGGAGGCATGTA
TTTACTTGACTTCTGTATGTGATATTTTCTACATTTAGTCTTACATCTGT
TATGCAGGTTGGTAACGATCAAACTGATGACGTAATTGAGTACCTTGCGA
ACCCAAAGAAGGAATTTCAGCGATATATCCGTCTTAGTCGTAAAGGTATT
TATATACTCCCTCCGTCTCAAAATAAGTGACATGAATTTGTCTAAATTCG
CAGAATCTAGACGCGTTTTAGTATATAGATACATGTGAATCTATACTAAT
CTAAGTCACTTATTTTGAGACGGAGGGAGTAGCTCTTTTAATAAGAAGAA
TATATGCTCATCTATTTGTTTGTGAAAAGTCCTTTCCTTGTGCATTTCAC
ATTTCAATTCAGTTTTATGCCTTTAAAGTAATTTTTCTAATGCTGCTCCA
ACGTTGTAGAAATGCTTGACTACTCGTTCGGTGATGGAACTGGTACCGGA
GAAGGAAAATGTTTGGATCACCGTCCTCTAAAGTTGAATAAAGATGACTT
TGAGCGCGTCAAACGAATACCATTTGAGAAGGTAGGTGGCTGAATTTTTC
CATCCTTTTTTGTGTGACCACTCTTTTCTCTTTGTGAAAATTTTGAATTC
TCTCTGTTAGGGAGCCAACTTCCGTGACCTGGAAGGTGTAATAGTAGGGC
CAAGCAACGTCGCTGAATTTGACCCTGAGATTCCACGAGTTTACCTTGAG
TCCGGCAAACCATTAGTACGTACTGGTAAATGGCTTTTAGATGGTTTTCT
CATCTAGTGTCAATTGCTGAAGAGTGTACATGTCTGTTTGTCTAGGTTCC
TGATTATGCGATGAAGTTTGTGAAGGGCAGATCTGTCAAGTGAGTGCCTT
ATATCCACTGCTTTTCTTCTGTAATCATACTGGGCTGTTGTTGTTCTTGT
TCTTCAAAATACACGTTATGATGGTTTCGTAGGCCATTTGGGCGACTGTG
GATGGACGAGACAGTTCCGACAGTAGTGACCAGAGCAGAGCCACATAACC
AGGTTAGCATCGTCGCAAGCTGCCACCTGTTCTGACCAGATTTCTGTTTG
GTTTCTTAATTTTGTTTCGTGTTGCTTCCGTCAGGCTATACTGCACCCAA
ACCAGCCCCGTGTCCTGACTGTTCGTGAGAATGCAAGGCTGCAGGGGTTT
CCGGACTACTACCGTATGTGCGGACCCATCAAGCAGCGGTATGTCCACCA
ACTGTTTCTAATAACTTTCTGAAGCTCAAATGAAGATCTGCTCTTGCTGA
AACTGAACATGTCCTTGTGCTGAATTGTTTTTGCTGGCAGGTACATGCAA
GTCGGCAACGCAGTGGCGGTCCCTGTGGCACGAGCGTTGGGCTTCTCCCT
GGGCCAGGCGTACCTGCGCAAGCACGATGGCAGCGACGACCCGCTGTTCG
TGCTGCCCGCCAACTTCTTCAGCCCGGCGCAGACTGAGGTCGTCGCGAGG
GCTTCGTCGGTTGGGTTCCCTGTAGGCGAGGTTGCAGAGGACACATAGAG
CTTCCTTTGCTGCTGGTCTTCTTGAATTTGAGTTCGCTGAATTTTTTCTT
GTTTGTTCGCTTGATACAACTTCATGGATTTTGGGTGATATAAGCTGCTG
AGAGATTTACTTGTGAACAACCTGATTTGTTGTCTCCTCTCATTTTAGTG
GTTGATAGATTTATGTATTAAGTTTTTATCTCCTTTAGAATATTTTATTA
TAATTATAATCAAATAAACTTAGATTGACTGTTAGCTATGAACCCTGTGC
TCAGTTAGTTCTCTTCAGGTTCAGTTTATTCAGTTTCGTCAGATAGGACT
TGAGTCGTTTTTCTGTCAGTTTTCAGTTAGCAGGTCGTAGCAGTTTCGTT
CCAGACTACAAGTTCAAATCAGTTTCGTCAATCTAAGTTTATGGGATGGC
ACGAAAATTACAGATCATGGATAATGTTTTCCACTTGCTGTAATCTGGAC
AAAAGGAGAGAGACGAGATCACAAAAGCTGTGCCTTTTTGCTGTAACCTC
TACTAGAAGTTCCTTTGCGCTCTGATTATCTACCTTCCTTGTTTTGCTTC
TCTCGAGAGAAATACATGGATTTTGGACGATGTATAAGCTGCTCCCATCC
ATGTGGCAGCTCACTGTTGATGGATTTATGTGGCACTGATGGTGATTCTT
CCACGTTTGTGTTTTGTCTTGTTCAGTCTAGATGTTACCGTAATCAAATT
AAATTAATCAGTGTGCTTCATTCAAGGAGGATTTGCATTACAAACCATAT
GATTCCCATCTGAATTTGGACTCTAATGATGTAAGCATAAAAAGATGATG
CTGATAATTGTGCGTGTATCGTCGAAAACTTTGCATCGGCCATTGAAATG
ATCCAGTGCGGTAACAAGAACAGGAAGCCAATCATCGCCCTGAAGCTAGA
CTTTCAGAAGGCGTTCGACACCGTCTGCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.