Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA000275

[Submit comment/correction]

Sequence	AA000275
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA000275
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAACTGAGAAAGAAGACAAAGAAGAGGAAGCGGAACGCGCGGCAAATAAA TGAAGAAAACGGCCTATTTGGCCCAAGGCGTAATGGCGGGTTGTGGGCCG ACGTCGGCCCGCGTGATATACAGCGATCACCCACACAGAGAAACCTAGCG CCGCCGCCCCGCAGAGCCGACCCCTTTCATTCTCGTGCGCTGCGAGCTCC TCTTCGAACTCTCCAGAGCTGCTGCCTCCTCAGCCCACTCCTCGCCGTCG CCGTCGCCGTCACCATGCCGATCACCGCCCAGATGCCCGACATCATGGGC GAGCGCCAGTCCGGCCAGGACGTCCGCACACAGAACGGTAACGCCCTCCT CCTACTGCTGCTGCTTCTCACGCCAGATTCCGTGGTGTTCCGTGAGATCT AGGGGTTCGCTTGGATCCGTGTCACCTAGCTAAGCGAGGCTCGCAGTCCC GCCCAGGAAAGCAACGCTAGTCATTTGGTTAGCTAGCGGCCCGTGAGACG CTTGAAGCACGACCTGCGCCCCTGCCCGTGCGGCTCCTATGGCGAAGGGT TTTGGTTGCAATTTGAGCAATAATATTTACTGTTTAGCAAGACTAGAGTT CTTAAGTGCCACCGAATGAATGACCCAAGCAAAGCTGGGATCTCCCTAGC TTGAGTTCCAACCATGCCCTAGTTACCCATGTAGCCCTTCGTGCGCGCCC TGGTTTAATTTGCGTTCAATCTCCTCTGATTGCAGTGGTGGCGTGCCAGG CGGTGTCCAACATCGTCAAGTCGTCGCTAGGGCCTGTCGGGCTTGACAAG GTACGCTCCTTCCACTTCCCTTGTCAGTGAACCAGATAGGTTCTCTGGAT CCTCAGTAGTTTCGAAGACGAAAAAGAAACACCTTGTTAGGATTTACTGA CTTAGCACATGTGCGACTGACAGATGCTGGTGGACGATATCGGTGACGTT ACCATCACGAACGACGGAGCAACCATTTTGAGGATGTTGGAAGTCGAGCA TCCAGCAGCCAAGGTAATCATACCTGGCTGGCAGTCAGAGCGGGCCTTTT TTGATTTACTCGTTGCTCTGTCCTTACTTCTTTTGTTGTGGTTCCATTGT TTGCAGGTTCTTGTGGAGTTGGCCGAGCTCCAGGACCGGGAGGTTGGAGA TGGAACAACTTCTGTTGTGATCATAGCCGCAGAGTTGCTCAAGGTAATGA ACAGAGCTTTAATGCCAGGTTTTTCCTGCATACAGATTTCCGATTCTGCT ATTCATACACATGATGTTCCTTTTCTTACCAGAGAGCCAATGATCTTGTG AGGAATAAAATCCATCCAACATCTATTATCAGTGGCTACAGGGTGAGCTT ATAATTTATATTTGTTTATTGCTGTAGCTCTTTCATTCTGAATGAACAAT TTGAAGAAACCACCTAATGGCTTTCTATACTTAATTTTTCACCTTCGTGT TCTACCAGCTTGCTATGCGTGAAGCTTGCAAGTATGTTGAAGAAAAGCTG TCTGTCAAGGTAAATAAAAAAATATTCTATCCGGAACTAATGGCAGTAGC GCTCTGTTCTATTCTGTGCTTATTGTCACGCTGACATGAATATCCATCCA ACTTTCTTAGGTTGATAAACTTGGAAAAGATTCCCTTATAAACTGTGCAA AAACTAGCATGTCTTCGAAACTGATCCACACCGACAGCGATTTCTTTGCA AATCTGGTAAGTTCCTGTGGTCAGATGTGTACTTTTGGTTTCTTAATCAT GCCTTGTTTTTACAGCGTGTGCACAGTGAAGGTCTTAAATTAGATGGTAT AGTTGTCATGTACTTGATTTGGTCGCATCTGTTAACCCCGTAATTAATTA TTTAGGCTATGCATGTATTTGAGGTAGCTGATCTATTATTTTGATAATAC TGCCATGTTATGGTGTTTATCCGATAAGTTTCTTATCTCTGGGACCAAAA GTTAGATATTCCATTGTAGTCTTGTTGCCTTGGTTGAAGAAATGCGATAG TCAGTTGACTTGGCATTGGTTTCTTAGGTTGTAGATGCAGTTCAAGCTGT GAAGACTACGAACTCCAAGGGAGAAGTAAAGTATCCAATCAAGGTAAATA AAGTGCATTAAAGCATTACTTCGTTAAATCAATTTTTTCTATTCGTATTT GATATATCAAGTTATGTGCAATTGTAATATTGCACTCTTTTTTCTGTTAC TGTGCCCCTTCTTTTTTAATGTAGATTTTTAGTTGTATAACCTTGTATAG ACACTTCAGACACATGTATTCTACCAGTTTGTTATGTTGTGCCATTTGTT TTTTTGTTTGGTCATGTGTTTAACGTCTTGATATTTCATGTGCTAGTGTA AGGTAAGGTAATCTAATGTCTTTCTTAATATCGTGCTCTCTTTTTTCTTG ATATTCATATCAGCAATCTTGCTGCCACTTAAACTATTCTCATAATAATT TGGTGATGTGCTTTTATGTATTGGACATGATGTTTGGTTCATTTAACGCA AGGATGGGAATTTGTTGTTTCTGCCTCTTAAGTTTTTGCTTGTAAATGAT TGCTTTGTTTGTTCTGCAGAGTATTAATATTTTGAAAGCTCATGGTAAAA GTAGCAAGGAAAGTTACCTGCTGAATGGTTATGCACTGAATTCTGGCCGT GCAGCTCAAGGAATGCCTACTAGAGTAACCCCTGCTAGAATTGCTTGTCT TGATTTTAACCTTCAGAAGACAAAAATGCAAATGGGTGTTCAAGTCCTTG TATCTGATCCAAGGGAATTGGAGAAGATCCGTCAGAGGTATGTTAATCTT TCTCTTTCGCAGTTCATCATTATACCTACTGCTGTTATCTCCCCAATGAA TCTGCAATGAGTGTGCTCCATTATCCTGTTTGTTTCTCATTTCTTCTGAT AGATCTTCATGCCTTTTTCCTTTACAATCAATTTATTTTCCATTTAATGA TCTCTTGCAGTATACCTAATACCCTTTTTCCTTAGAGAATCTGACATAAC GAAGGAGCGAATTGAGAAAGTTCTCAAGGCTGGTGCTAATGTTGTATTTA CCACCAAGGGTATTGATGATATGTCATTGAAGGTACTTTCTCATCAACTA GCACAGAAACGTTTGCTGTTCATGTTCTTGATATGATTTTGTGCATGGTT ACCCAGCAACTGCAGCACAAACTATTTATGTATTTAGTTGAACTGGTCCA TGCTAGTACTGAATGACATTCTGCTTAGCTGCTGGTACTTTTGGTTGGGT GGTGCACACATAACCTGTTGTACTACACTTAGCATAATATGTTTCATAAT CTAGACTTTTCGGTAGAATTTAATGGATATCACTGCCATCGTACATTCCC TTCCAACAATACTCGATCTGAAATTTATGTCCTCGGAAGTTTCTGTTTCA TAATTGATTTGATTTTTATGATTTGATGAAAATATGTACTTGGTTATTGT GTTGTATATGGATATCACTTCCTGATGACTGTAACTGAATGTGCTTTATC GTTGTGTGACAAAACATCATTTCAGTACTTTGTTGAGGCTGGGGCAATTG CGGTTAGACGTGTGCGTAAGGAGGATTTGCGCCATGTTGCCAAGGCAACA GGTGCAACAATGGTATGCTTTATTTCTTCCTATTGTTCATTGCATGGTTA TGTTCAAGCTGTTTTTTTCATAGTTTATACTCTTTAATCTCATTCATGAC TAGTTGTTTCTCCTATGAACTTGCTTTTCTTTGAAATCCTAGTAAAGTTG CTTCAACTGTGTGCTCAGATTCTAAGGGAATATGCAATGCATCATCTGAA CTCAATGCCCTTGTAATATTGGAATTCGTTTATTTGATTAATTCCTGTTT CTGAATATCTTATTCGAGCATGGCAGCTTTGAAGGTGCTATAAATTGACT AAAGTATAACTTTATTAGTAAAACAACTTCTACCCTTGACGATCCCAAGT AACAAGGCAAATAATCACCTTTTCAAGCCCAAGTGAACGGTTTGTCAATA TCTGCAGGTGACTACTTTTGCTGACATGGAGGGTGAAGAAACATTTGATT CGTCATTCCTTGGACATGCCGATGAGGTTGTTGAGGAACGGATTTCTGAT GATGAAATAATTCTGGTGAAAGGCACAAAGAACACAAGTGCGGTTAGTCT TTTTATGCCAATCTTGACTCTTGAGTTAGCTTTACTACGAATGACAGCAA CCTTTGTTTTGAAGCTAGAGTCATCACACTTTGCGTATCTTTTATGCAGG TTTCCATTATTCTAAGAGGAGCAAATGACTTCATGCTAGATGAGGTTGAA CGGTCTTTGCACGATGCGCTGTGCATTGTGAAGAGAACTTTGGAATCCAA TATGGTAGAACCTTCTGCTGCTGTTCGTTTACTTGTTATGTGTTGTTTGT TCCCTGTTGAATACAACATGTTTCAGTTGTCATGATTTATGTGGAACATG AGGAAACATTAATGTGTTTTTCTTTAGCATTTTACTTGCTACTAAGTGAG CCTTGCAGTTAAAAGTTTAGCTGGTGCATCCTGGTTGTCATATTAATATT TTCGCAAGATTCTTCCTTATACCGTGCTCGTTGTTGGCTTCCACAATTTT TTATTTAGACCTTGTTGTCTATAGCTGCATGTCCATTTATCATGAACTGT TTTCATGAATAGGAACAGTTAAAATGTCGTCACTTGAATGAGCCACTTAA TTCTTTAGTATCTGCATTTTTTCATCTGTCATCGCACAAAGTAGTTCTAG CATTAAATCCTCTTTTGTGGTTGGTGAATGCAGATCTGTAAGTGTAGGTG TCATTTTATTTTAACTAACTAGAACATATCGCAGCAGCGTATCTCCCCTC CCAATGCACCCAAATGTGCACACACACACACAAACACTGTCTTTAGAAAC TAATTTTCTTTAGTAGTGTATTTAACATGTATGCGGCTCATGCAGGTAGT TGCTGGTGGTGGCGCTGTAGAAGCTGCATTGTCTGTGTACTTGGAGAATC TAGCTACAACTCTTGGATCTAGGGAACAGCTGGCAATTGCTGAATTCGCA GAATCTTTGTTAATCATACCGAAGGTTTGATCAATTATATTTGATATATG TATGATACTTGCATACTGAACCACATAATATACTAATGGGAATATGGATG TGTGATGACAGGTCCTCTCTGTTAATGCTGCCAAAGATGCAACTGAGCTT GTTGCAAAGCTTAGGGCATATCATCATACTGCCCAAACAAAGGCTGATAA GCAACACTATTCAAGGTAATTACAGAATTTATAATCCCGTTACATATCCA AATGGATTACTGTTCCTCTAATTTACATTTGCAAAGTCATGGGCCTTTCC AGATTAATTTAACCACCCTCTAAACGAAAGTAATTAAGCACTCTGGGATG TGCTTATTAAGCAATTGTATATACCAGACAATATCCCCTATTTTTTGTTT ACACAGTACACTGCAAGATTCATTGCAGTCGAAGCTTTCTTTACGTGAAG TGTTATTGCCAGAATACCTATTATTTAAATTTTGGACTTAGTCGTTGGGA AAGTGCACCTAGATGCATAATTTGGTAAAAATAACTGCTTACAGTTTTTT AAGTTTTCCGTCACTGTTTGTTCTGTTACTGCACATCTCCGTTTTTTTCC TTCCACTGCACATGTTGAATTTGTTCCATTTTGCCACAGCATGGGTCTTG ACCTGTCGAAAGGTATCATCCGCAACAACCTGGAATATGGCGTGATCGAG CCAGCCATGAGCAAAGTGAAGATCATCCAGGTCTGTACCCAGGCTTAACC TGTTAGCTTTCTAGTCACCCGCCGTATTTGGGATCCGTCGCGTGTGTCTT ATACATTTCCTTCCTTGTACAGTTCGCCACAGAAGCGGCCATTACCATTG TGAGGATCGACGACATGATCAAGCTTGACAAGGAGGAGTCTGGGCAAGAA GAGTGACCTTGCTGTTTTACGATCTCTGGCCACTGTTTGTCATGTGATGC CTGCCTGGTTGCCGCTAGACTTAGATTTGTCTGGTTTGGTTTTTCTTTTC TTCCTTTCGCACAATGTTATTGGACATTGCTGTAGAATGGAATGTTGTAC GTGAGGTGTGTATCGGTGTGCGTTACTGTATGCAGGTAGTAGAACGACAC TTGAATGGAAGCAAATTTTTGCGTAGAGCACCAGAGCCTGGGATCATAGA CTGTATCTGAATTGTCTGTTCTCTTGGATTTCTATCTAATGGACCTTCCG GTTGCTCATCTTAAAAAATTAAAGTAAATGGTATTGGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.