Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020229

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020229
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020229
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCGCCTGTTTCAAATGGTATGTTCTGAACTTTATTCCCTTGGTTTATGG AACCACTGACGTTACGTGTGTTCAGATTGTAACAAAAAACTATTAGTTGT ACCTGGTCTGTTATTTGTCGTTGATCAAATCTATTGAGGCCAAATTATAA ATCCGTGTTGTACGTTTTGCTTTACGTGTGACCGAGTAATAAAATTGACT ATTCCTTTATTTTCCCTATAAGAATATGTTCTCTCTCACCCACACTTCAG ATAACACATACACAAGCAAGCTAGACATGCATCAATTTGATTCAGATTCT TGATTCCTCAAGTGCAAGGTATTGCCTGACTGGTTGGGGATTTGGGGATT CCTCGAAGTGGTCTGCGATGTACTTTGGTCTCCTACGCAATTTCTCAGCG GCGTCATCATGGAGAGCGGGTGCCGATGGTCTCGGCATTCTCCAGTGATG ATGAATACAGGTGTGACTCCTGGTATTCGATGTCCAACCTGACCGGACTC TGGTTGCCGCTTGCCGCCGATTGATGTCCATGGACCTCGAACTTGAGCAG TCGTTCTCCTCCAGGTATTCTCTCCATTTCCCGGTTTCCCCTCCTTGTTC TCTGGTATCAGGTCTCAGGAGCTCACTTGACTCATATATAGTCACATTGT TAGCAGAACTGCAGGTCTTTGGGATTGACGTTCTGATGAGAAAGTAGCAT ATGAATGGATGAGCAGACACTAGCCAGTGCAGCGCTTCTGTTATATTTCC ACACTAAAGCTTAATCAAATAGTTGTAGGTAATTAGATCAGCGACTATTA CTGCTCCGTTTTAGTTGCACAGATAGTCCATCTGTAATTGGACCACTCTT TCCTTCATTGACATATTTGTGTAATAAATTTCTTTCACTTTCAGGAGTCT CAACCTTGGTGTCTTTGTCATTTCTGGGCCATGACTTGGCTGGGTGGTCG AGGTATATATAGATGTCAATCTGTTGACAGGGCTGACTCTCTTAGTTGTT GAATATTAGGCATTTTTGATGTTTCACATGTTTGGCAAAATACCACCGAT ATGTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGTCTCAGATTTGTCAAAATT TGGATGAATCTATATACTAAATAGTCTCTAGATTCATCTAAATTTTAGCA AATCCGAGACATCTATTTTGGGACGGAGGGAGTATTTCATATTTAGAGGT AAGAAAGTCAAATTGATTTTAATTTTGGTTTTGGTGGTAATCCACTATAC ACATCTTCTGGTAGAAGTGAAAAAGAATAAGCAAGAATAATGTGTTGTGC CTCCATCATCTTCTCTCAAGGTGAGTCTATATCCATTCATTTGTACATTG TTTTATAGATGGTTCATTAATTTATTTACTTGGTCCTCCTGGTGCTGCCA GATGTGGTTGATAGTACTTTGGTATATATATTTTGTTGGAAAAATATTAC ATAGATGGTTGCATGCCTCACTGCATCTTGAAACAATATCGGTTGTCATA TTATAGCTGTCTCATACTTACTAGAGTTTCTTTTTTTGCTATTTTTATGA GAAGGTAAGTGCCATCAAATCAGTGATGCACCTTCCATTAAAGTATACTT GAGTTAGCTTCTCCCGCTAGCACCTTTTTTGCCATGGCCTCATACATGCT CGGTTGTGGAGTCAGCTATGCTTTTTTGTTTATTTTAGGGGGTGTTGCTG TTGCAGACTGTCACCGTGTTCATCTATCTGTCATTTTTACCTCAGTCTGC AAAAGCTGATGTAAATCTTGCTCTTTTGCTGTTAGATTGCTTGGAAACTT TTAGCTGAAATGTATTCGTCAGTACCTCTTATTGATTGTACATGAGCAGC CCATTCTCCTCTCACCAAGACCACTGGCTTCGCTTCCTTGATATGCAGAT GTAACTGGCAGCATCTGGACGGTCTCTGATGTTGTTGTGTTCACTGTCCT AGAAGATTATCTGATGTTGATGTGTTCACTGTCCCAGAAAGTTATCTGAT GTGTTCGCATGCCCTTTTGTGTTACTTCTTAGTACATTTTTCACAATCTT TTTTATTTTGATGATATCTGTGTCTATAGATTATTAGTCACACTTCTCTG CTGATGGTTAGAATTGTTGGGTATGATCTGTTTGTGCCATTAGATAATGG AAAACTTTATTTGATTGTCCATTTCTTTATTTCCCTTTGGAATGACAAAG TGGTCTTCTATTTTGCAGCTAGCTGAAATTCTTAATCAGAGAAGTTAGCT TTTTTTTCCCGATAAAGGGCTTTTTTCAGAGAAATTATTGTTATTCTTTC TTCTGTAAACAGCCCATGTTTCTTTGGCTTGGAAATATCTGGATCTACCG GCGATCGTTACCCATTCCCCCTTATAATCTTCTGTTTCTCGGTACCCTAG ATCGTTACCCATTCCCCCTTTTACCATTGACTTCTCACTGCTCGGTGACT TCACCAGCGATGTCCCTCTGAGAGAATTGAGCGCAACAAAATAGCTAATA CTCCGTTAGATCTTCTTAAAATTTACCAACGCTCCTCTTTCAGACACTCA GAAAGGTACGGGGTTAAGAAACTAGCAGTCCAGTTCAATAATTTTGTCCA ATAAAGGATTATTATGCAACCAGGAGACGTCAGGTCTAAGCGTGCTTGAT CAATGACAAGAGCTGTCGCCCCAGGTAAGTTCGGTTCTATATACACGCAT TTCTCTATTGCTGCGTTGCACGTTCATGACAACTCCTTATAATCTGCTAA TCTAACATAATTCAGTTCATCAGCTCTCTGCTCTTCTCCTTATAATTCTA CTCTTTACATGGTGTCATTAATTTTATTGTTTTCAGAAATTGATTGTGTT AGCAACAACCACACTTATTATTTCGACTTTATGTGTCCTAATATGTTTGT TTCATCAATTTGTAGATACATGGGGTACATAAGACCATATTAGTGTTAGT TTACCGACATAGATTCCAACAAACATAGCGAAATTTATAATTCATTGTCT TCAGCATGACTAGTTATACTGCCCAGCTCCACGGGTGGTAAAGATCCCTT GCAAGATGATATTAGATCTTATTCTAGAAGAACTTGCCCTTCCAAAGGAA AGGTATGATTTTCATACAGATGGCCATGGTCAAGTTTCTGTCGTTGTCGT GTTCTATTCTATATGTTTGCACGTATGCCTGGGAACTTACTCAGCCCTGT CAAAATGGGTGTTGTTGAAGCTGCTGATTCTGAGACAGCAGAAGAACCAG CTGCTAAGGAGGCCATCAGGATCGTGGAAACATTGGAGAACATGGAAATC AAAGAACTACATTGAAGTGAACTGAAGTATGTAGAAGAAGTCAGAGAAGA TCTTTACAAGAAATTAGAAGCGGTGCAAAAATATAAAAAGAACTTGCACA ATGGTTTGTGTCTTGCAGCCTCAAGGATTGTTGGATTTTCTAACTGCATC CACAACATCATGTGCAATAACCGTTCTTTGGCTAAGGCGATGCAACTGAA GCTATAAATGAAACAATACATCTGTTTGAAGGGGTAGCTGCTGATCTGGG CCATGCAGGATGACATTTGCGGAAGGATTTGAAGAAGTTCAAAAAATTCC TATAAATGAAAAAGAGTGCAAGATCAGTTTGATTGTCGACGATAGTTTGT GCTAAGTATTAGCTGGTTCCTTAGGCATAGGCAACTTACTTTTACTGTCC AGTCAATCCCAGGGTCTAGCCCTCTACCCCTCTCTTTTGTTCTTTTGGTA ATGTAAAGTAATCACCTTGATCATACTATGTGCTATAAGTGTTAAGACAA TATGTATTGCTTTCGAAAACAGTATGTGTATGTTACAGCCATGCTTTTAT ATTTAACTGAAATTTAGAGAATAAGCTTCTCTTGAATTGGCTGAGTGGTG GAGAAACCAAATAATTGGATTGAATTCATCAATCATGGACCATTCGTTCA ATGGCAGTCTTTAACTTGGTACATGTACATGTACATCACTACTTTAAATC TCTTCTGAAAGGTAAGCAAGTCTGCAGCAATCCTTTTTCTAAGATTACAG TAAATTGATAATTGGTTACTTTACAATTCATGCTAATTCTTTTTTCTCAG GTTGTAACAAAAGGTGTCTATATTTGCCAAGAGGATTTTTTTTTTTGCGG GACAAGAGGCAAGAGGATGTTCTTCAACAAGCTTTGAAAATCCTATCTAT GAAGATACACGAATCCAAGGCATGTGTTGTTGGTAACAATCAGATACTTG GCTCTGAATCCAATGCATGTGCTGTTGGTAAAAATTGTGGGGTATAAACT GTTCAACATGAGCCCATCAACACAGTTATAAGTTCTACACTTCGCTGTGC CTAATTTCTGCTCAAAGTAGATCCGTCAAATGTACTCCTCATGCTTTTGC TTACAGGTTTCTGCTCAACATGAGCCCATCAACATAGCTATAAGTTCTAC ACTACACTGTGCCTAATTTCACTCAAAGTAGATCTGTCAAATGTACCCCT CCTTCCACCAGCCTCATGGTTCCTTGGGGAAACCTGTAAAATCGGCTTTC ACTTAGTTTGGTTCTGCACTGCAAAGATAATGAAAAAGAAAGTTTACTTG CGTTCAAAAATCAGGAAAGGCAACACTGCTTGCTAAAACATGGCCAATTT TTACAGTTATTCACATCAGCAACAAAGGTTGATTATGAGAAAGGAAAAAA CAGTACCTTGTTCATGATTCACTTTGATAGCCTGATCGTCAAACATACTT TTGCCACCAATCAGTAGGGAGAGTATGGCAGAAGTAGCTGTGTCGAGCCA TGTCGCCAGAAGGGGCTTTGACCATGCAGCCAGACTTGCCACAGAAAACA GCCTTCTCTTCATGATAGATGTTGCAATGCCTAATCATCTATGAAACAGA TTCAAAATGAGCTCAAATTCAAAGGGAGAAATATGCTGAACTAAAATGAT GCAGAAATGGATGCCTTACGTTATTGGTAGGCACGACACCGTTCTTGGAT CTTGGCTTATAAAAAATGCACAAATGGCATTTTGTTGAATTTGCTGGGCA CACTTTAGCTGCTTTGCAATAGTTGGCGTATTCTATGACTTCTTCATCCG GCACTACCTCCCCATCAACAGTCTGTGAAAAATGAAATGCAGTCATAATC AACATATATACTCAAATACCAATCAGTCATAATGGGTGTGCGTGTCTAAG TTGGATGAGAAATGTAATAAAATTCTTGCTGGAATGAAACGAATAATTGC ATACAAGTTCTTTACATGTTCTGCATAGTGGCTGATAGTAGGTTGAAAAA TAAGTAGTTCCCAAGGTATTTTGATCTTCTGTATGCATATGCTTAGATTG TCTAGAATTCAGTAACTGGATTGACAAGTGTTTGTGGTTTCAGGTTGAGT TGACCTTTTTTGGTACCACAGATGAACAACTGTCATTATTATACTAAAGC TTGAAAAGAAGAAGAATAATTTATCAGTGCAGAGAATTATACACCAGCAA GATGGATAGCCAACAACAGCTAATATACAACAATAAACCTACCTGCTAGG AGGAGAAGCAAGTCATATTATATTATGTCCAAAAGCAAAGACCAAACGAA GAAATAGATCACTAAGAGTAGACTTCTTACATGTGCATGTACAAAGAAAG CCTTGCAGAGTAATACCCACATTAAAGATCACCACAATGCAAAAAATAAA TCTCAGGTATCTAACTACCTAATGGGAGATGGATACTTAATAGTTAAGCA CAAAGGGACAATACAGAACAGCCTTCTTGTCTGAACATGCAACACTTAAG GGCCACATAACACCATAAAGTAACAACTAAACCATATAACTGTCTTGCTC ACAATCTCAACAAATTTTTAACAATGGCATGCAAGTCAGGTAGTTCTGAT TTTCAGTAAAAGATGGAATCAAACAACATAACACTGAAAGTCAAAATTTA CTACATTACTGCTTTCAGGTAACCGAACAGAAGAGGGTACTGTAAACTAA AACAGGAAAGATAAATAAGCTATGTAAGAAGCCAAGTCACAACTACATAT CAGGTCTTGGTAATACACAAAATTTCACAAACGGAACAGATTTGAGTACT CAAAACTAAAACAGGAAATATAAATCAACTATGTAAGAGACCTGGTTACA CCAACATATAATGCCCTTCAACTACAAAAAATTTACAACCTACCAAACAT CTCCTTTAATCTCAAACTGATACAGCTAAGATGGACATTAGCATACAACA ACTGCATTTACTGATACTGCTAAGATGCACAAGCATTACAAAGGTTGCAA TATTCTGGGGATAAACTGCATTTACTGATACTGCTAAGATGCTGCATAGT GGATGATAGTAGGTTTTAGTAACCTGTCAAACCCAACAACTAGAAGAAAA CTCAGAACAGAATGTTCATTATGATTCATGAGCAAGACTCAGAAACAGAT AGTTCATGAGTGAGACATAAAAGGAACACAGGAGGTGGTGCTGCTTCTCA AGGGCACAATCCGAAATACTACCAGAACAAAAATAAAAAAGTATTTAGCA GTACCAGATGGGTGTTTCCAGAGTTCAGAGTTGTAAATGCAAAGACAACA TGCAATAGAGGATCTGAGGTCTAACTAGTAACAAAAACCCAACTATAGAT TTTAATGTTTTAGTGCTTCTACTCTACTTCAGAAAGAGAAATTCACTAAT CATTGACACATCTTGAAACTGCTCCATCCTTAAAATAATGCTTGCATGGC AGATAAAATTAAGCAAAAGCAGCCCAATTTCAACTAGTTCTTGCACTTCA GAAAGACGAATTAACTCTGAACATTAGATCATAGAAGACATTGTTCCCAA GAAAATTTACAAACAAAGTTCAGTTTTAAATAAGGCATCTGTTGATACAA AGAGTGCTGATTGCCAAAAAAATGCAGAACTTATCTGGAACGTTGACATG CTACAAAGTACTACAGAAATTAATTCAAGGACGTAACAACCTTGCACTCA TACTGGCTCAAATATGCACTCAGGATCATGTAAATATGACACAAATAACC AGAAAGAAAACGCAAAATCATATAGTTTGATACAAATCCCGACTACTTTT ACATAAAGTGCCAATGTACCTTCCAATCTCTTATCAGAGACACTACAACA TACCTGCAGCAACTAACCCAACAACCCCACAAAACCCTAAATCCCAAAAC AAAACCCTAGTTGTCCAAGATGAAACAACTCTGTAACACTCAAGTCCCCA GGTGGCTACTGATCTTATTCAGACTAAGATGACTCCAACGAATCGCAAGA TGGAATCCTTTACATCATACAGCACACCAAAAGAACACAATAACTTTAGT TTGGCATCAAACTACTCATGCGAATTGGGGAGGATTCCACCTCAGGTATG CTCAGAATACTACCAGAACAAAAATAAAAATGTATTTATCAGTACATGAT GGGCTTGATTAGCTGCAGAATAATCCCAAGTCACGAGAACAGAATGATTA AGAAAATTAAAGAAGACCACACATAACAGAATGCTCATGTGAGGTTCAGT AAGCTAGCAGGTAACAAAGAATGCACATAATTCTTCAGTTTGAGGCCATA ATAGGCACAGAATCATTCACCCAGAGGCATGCAAGGGATTCAAGAGATGA TCATCAGTTTATCCATACAGATTGGTGAGGATTCAACCAGAGGTATGCTA AGAAGGGAAACCATACTTACATGTGGCTCAGGTGGCGGAGGTGGCGGAGG TGGCGGTGGCGGTGGCGGTGACGGATGACGACGGCGACGAAGAGGGTTGT CTTCGTACAAGGCCGCTAAGGCGCGGCGCTGTGGCGGCGGCGGCGGCGGC TGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCCACGGAAG CAGCAGGCGGAGGAAGAAACCGGGGACAACCCCGCGCACGCGCTGGAGGA ACTGGCGTACTAGGGAGAGCGCGCGTTGGGGGAGGATGCGGACGACGGCG AGCGCGCGCCTTCCGGGAGCGATCATGGCCTGGATGGCTCCGCCGGCGCG AGCCACCGCTCGCCGGAGAAGAGGGTCCCCTGCGGGATCGGGGTCGTCGA TCCAGGCGCTCCTCGCCCTGCGCGCCGCGACGCAGCCCCTCCTCGCGCTC CTGGAGCGGAGCACGCGCCAGATAAGGCGGCCGAGAGGGCCGAGGAAGAG GCCGAGCGCCACCGCGCCCCGACGAAGAAGGGGGACGACGCCGCGCTGTG GGCGCCCTCCCTGGAGCGCCGTCGCCACGGCTTCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.