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GrainGenes Sequence Report: AA020027

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Sequence
AA020027
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020027
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCCGTCTCCAGCCGCGCCCTCCCTCGCGGAACCTTCCCGTCCGCACTC
CTCCTACTTTCCCTACTCCGGTCGCACCAACCCACGCCCAATGACGCGTG
GACCCGGCACGGCACCACCTGACCGGCTCCACGCGCCATAGACTTGTGTT
TAAACAGCTAAACCTCACGCAACGCAAGCACCTCTCGTCCCCTTCTCGCC
GATACCTCCCCTCCCCCGTATAATCCCCCGGCGGTGGAAAAGCTCCGCAG
TGAAAAAAAATCTCCTCCCGCTTTTCCTTCCCTTCACGCACGCCGCACGC
GTCCCCCGCTCTCCCGGCCGAATCTCCGTCGCGTGCTCCCGTCGGGTTCG
AGCGGCCGCGGACCCCCTAACCCTAGCGCGCGGCGTCGCCGGCGGGCAGC
GCGCAATGTCCTCGGACTCGGACACATCCTCGCGCGGTGGCGCCGACTAC
CGGACCTTCCGCGAGGTCACCCGCGACCGTGAGTCTCTCCGCTCCCTCTC
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GAGAAGTTGTGCTCCAGTTGGTTGCTGCTTCCGCCGCGCAATGCTGATTT
ACTGCCTATACCTGCTCGGACATTTAGTTATGTTCAAGTGATACAATGTG
TAGTCTCGCGTCACGGTTTTGCGATTCAGCGGAATTTCTTAGCAGCCTGC
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GTTCTGAGTTTCAATAATTAATATCAGTTGAGCAACTTGTGGCTCAGCAA
TATCTTATTGATGATCTGTGCTCATTGCTCAGAATTTCGTTCATGCTTCA
ACTGAGAAACTCTGTGTTTGTAATTTTGTCACATCATTTTCTTGTTATTG
GCATCCGGCCAGTTTCCTGATTTACCGTTTATTTTATTTTTCTTGTTGCA
CATATGTAGGTTTGTTGATCGAAATGTTAAAATCAACTAGGAACAGCTCA
AGATCAACATGGAAGGTATCATTTTTCAGTTGGATGATTTTCAGCTTTTC
GATATTGTCCATCCTCTACCACCTTGTGAAGAAAAGTCTGACATGCACAA
AAATTGTGTTGTGACTAGGTTCTTATCATGGACAAACTTACCGTCAAGAT
AATGTCATATTCATGCAAGATGACAGATGTTACGGAACAAGGGGTTTCAT
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ATTGTGTGTCATTTGTATTTAGAATAATAAAACATAAAAAACTGATTTTA
TTTGAAGAATTGTTTCTTATGACGTTCGATTGCTCCTGGCGTTCAACTAG
ATACATTTGTTAATGTGAAGCATGTGTTCTGGCTAAGACTATATTGTTCA
ACTGAAAGAGTTCTGTTTCTGTAATTCCGTCGCCAAAGCTGGACACAGCT
TTAAATGCAAATTTGAACTGGACCCAGTTGGTGATGCAGTCTAAATATTT
GTCGTGTCAATGTACAGCCTCTTCAATGGTTTAAATGAGGCACTGTGATT
CTACTGCATTATGCAGATCCGTTTTCTTAATAGCTTACACCATGTCTATA
CAAGCTGCATAGTTCTTTGATTGTGCTGCAATTTTTTTTTACACTGGAAC
TGTTGCTAATTCTGAAGAACTCTTACCAGCTTTCCATTGGCAATGGAAGT
ATTTCCTTTGAGTTGTTTTTAGCATTTAGCTTGCAAAATCTGTATGTGTC
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CAATTTATTTCATGCAACCAACTAAAGAGAAGTGAGTTATGTTAGCTAAT
TTACTCCTCATATTGTCTTGTTCTTTAACTGTCGTTTTTTCCTTCTGCGG
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TTTCACCTAGGAATCTGTATAATACTGCATCAGTTCTGAAATGTGTTTTG
ACTGGTATCTTACCTTCCTCTGACACAAAGTGTCGATGCTCCAGTAGTTG
AGTCGATCTGCTTTTGATTCCCTAGCTATGTGTTCGCAAAGATATCCAAT
GGTTAAGTTCTTTGAGGACTTACTGTCAAAAAGAGTTCTAGGACTAATGC
TAAAGAACACATGCCCGAGGACCAATGCTAGGATGTTTGCCATCAACTAA
GCTTCCCATTGCCACTTGTTGACTCCTCCTTTGCTACCTCCAATTCAAGC
TCCTCTGCCTCTGAAAATAACCCCCCCAGAACTGAGTCAAGTTCCTCGCA
GCAACATTGGCCCCCCCTGCTGCTCCAGCTGCTATTGCCAGTGTGTGCCC
GTATGTAATGAACAGCACAGGATTGATCGTCTCAGTGTAGGAGACATGGA
ACAGGAGGAGGGTGCAAGAGGGCACTCATGGCTGCTAGGTGATAACCAGC
ACAATTTTATTTGCTTAACTTCACTATGTTTTGGTAGCATTTTAGGCCTT
TAGTCCTTTTGAAGTGGGCTGCTGGACCGGCTGTTTTTTCCTTGCCTGCT
GCTTTTACAAATTCTGTTGATACCTCCTTGTTGGATTGCTGCATAGGCAG
CTGCCACCCACTTAGCACTGAGCAACTGTGGAATACTTAAGGTTGGAGAA
GGAGGGACAGGCTAGGAACCTTGCTTATTCTTTTCAAATTAAGAGATACA
GCTCCAGCCTTTGATCGATGGATGACTTCACAACTAAAAAATTGTCCTTA
AACAAGGAATCTGAAAATACCCAACTAACATGATTGACTACTAAATTATG
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AGCATGTCATGCTTCCTGCATCCATGACAGCAGAGATGGGTTTTTCATCA
ATCCCCCCACCCCCCTGATGATTACATCTTGGAATAGTCATTTATGTATG
CTTAGAATCACAGAACATTTGTTTGTCCCAAGAGTAAGTAAATAATCATA
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TTTCTCCTTCAAGTCGTGGTGAGAAAGATAGCTTTTGATTAAACTCAAGT
CTTTCAACCCAGTAGGCAATGTAGTGTCCTAGTTTTTTTGTTTTTTTTGC
TGGTTATGTTGAAATTTTTCTTGCACTTCCAAATTCCCTAACCAGTTATT
TTGTTCATAATGCAGTATTCAAATATTTATGTCCGACATGTCAGGGAAAC
GTCCATTATACAAGAAGTATGTGATTAGCGTATGTATTTATGTATACACA
TTTGCTCTGTTACTTTAAGTGTTGACACAATGTTGTTGCTCTTGCAGGGC
CTATATATTTTTCAGTTCTCCTGTACAGAAAGAATGGGTGGATCAAATAA
AAAAGGATTCAAGGGTTATAACACGTGTTGGTGCACTCAGTGAGGTCTGT
TTATCTACTTGCTCACAAGCATGCATGCTAATTCCTTTAAATCTCATTTC
CTGTTCTATATTGCAGATGAATCTGGAATATTTTGCCATTGATAGCCAGG
TATTTTGGTATCCAACTTCTTTCAAGATTGCTGTTTCCAATTGATACTTG
ATCATTTTAAACACCATATTTAAATTAAATATCTTCTTATTTATTTATTA
CAAAATAATATGTTTTGTTTCAATGAATGCTTTGATCTTATTTGCAGGGC
TTTGTAACTGACCATGAAAAGGCTCTAGAAGAGCTTTTCACTGAAAGTGC
AGAAGGTTCAATGAAGTACAATTCATGCATTAACATGATGGCCACTCGTA
TTGCTACTGTACTTGCATCAATGAGGGTATTATTTGTTTTACTGTTTATG
CTATTTGCAGTGTCTTCATACCCTTGATGTCACTTGGGGGGGGGGGGGGG
GGAATCTAATGAACAAGGAAACATTGTTGTGGTTGAGGGCTTGGTACACA
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AATATACAGAGTGAATATCATGTGAAACTCATTACCACTTCACATTGTTA
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GATTTGAGTTTGAGTATATATGATCAAGAGAGTTCTTTGCCAGCATTGAA
TGTTTCCAAATATTTCAGGAATTTCCTCGTGTGCACTATCGTGTTGCTAG
GACGATTGATGCTTCTACTTTGACAACTCTTCGAGATTTAGTCCCCACAA
AGCTTGCTGCTTCTGTGTGGAATTGCATGGCGAGATACAAATCAACAATA
CCCGAATTTCCTCAGACAGAGACCTGTGAATTACTTATTGTAGACCGATC
AATAGACCAGGTACGAGATATTCTTTTTTATGTCTGAGATGCTTTTCAGT
TTCCACCAACTGCCATGGGAATGTTGGTTGCTCCCTTCTATGTTTCACGT
TTTCATGATATTTACAGATCGCACCTATTATTCACGAATGGACCTACGAT
GCAATGTGTCATGATCTACTATGCATGGATGGTAACAAATATGTACAAGA
GGTGACATATCAAAACTATTATAACGGCCTGGTTTTTAGTTCTGTTGTGC
CCTTGGTATCGTGTTTTTATGTGTGTTTGAAAACAACAGGTGCCAAGTAA
GAACGGCTCAGCTGCTGAGAAAAAGGAGGTTCTGTTAGAAGATCATGATC
CCATATGGCTTGAGCTTCGGCATGTACATGTAGCTGATGTGAGATTATTG
CCACTGTCATCTTCAAACATTGGCATATGTTTTGGCAATTGCGTCATGAC
ATTAATGTTGCAGGCTAATTTAAGATTGCATGAGAAGATGGCCAATTTTA
TATCAAGAAACAAAGCAGCTCAACTACACCAAGCAAGATCTGGTCCAGAA
GCAAGGTTAGTTCAACAAACGCAACTGTTGCAAGGTGCGATCATAATTGA
CAATTAGCTTAAGGGAGTATGCAGTTAGGTTTATTAGGAGAAACAGTAGG
GAATTTCCCCACTTCATTTTTTATTTTTTTATATATTAACAAGTACAGTA
CATACATGTGCACAGTACAAAGACAGAACAATAGAAAAGAGAAAAGGCAG
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TTAGATTTATGCAACGCATAATGACAGTGAGTGGTATCTAAGATATACTT
ACCTTGATGCATTGTAGTTAGATTATTAAGATATGTTCTATGATGAATTA
ATTCTTATAATTGATAAGATCCTTTTTTTTTGTAATATCGAATGGCCCTG
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GTTGAGGTTTGTAGTTTTTTTTTCCGGTGTGTGTGCTGCGTATGTAAACT
TGAGAATAGTTACTTCTCTTTGACCTGTATAGTTCAACAAGATACTTCTA
AGATTACTGAACTGCTACTTGATTTCTTAAAATGGCAGTGTTGACCAGAA
ATAAGGATACATGAAATTATCTTAAAATTAAAGTGGATTTGCCTTCTCAT
CAGTATATCAACAACAAATGCTTGTACCTAGCAACTCTTAAACGTTACAA
CTGAGATGGCATGGTGAGTTGGGGCATCTTCTGTGGCCTAGACCTTCAAG
CCGTACAAGCGCAATTTTAATTAATTTCCTTTTCTCTTTGAGCTAGCCAT
AGCTTGTATCCACTGTGACAAGCATACAGCTCCACTAGGTGTTGCCTCTC
TAGCATATTGTCTCGTGCTAGCCACTCTGGTTGGTTCTTCAAAGTTGGAA
CTAGGATAGGAATTGCATAAGAACTGGCTTCCTGAGTATCAGCTGTTTGG
ATATACCAAGGAACATACATAAGTTTGTTATACTCATTTTTGCTACAGAT
TGCAGAAAAGCTCTTTGACATAATCAAACAACAACATTTGAAAGATGTTG
GGCAGCTTGAGCAGGATCTTGTGTTTGGTGATGCTGGGACGAAAGAACTA
ATTGAATTCTTTAGGACACGTCAGGTAATTATTAATTGGACTATAACCAA
TGAAATGCTTATTCTAGACCTTGTCTGGGCATTATATTGATATTTTACTG
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TATGCTGCAATTAATCCAGAGAAGATCCAAAGTGACAAGGGAGGAAAGCT
CATGCAGGTAACTTTATTTCTATATTGGAAATTAGCTCATTCATTTAGAA
ATTACATATAATTTGGGTTTGACAAATGGGCCTTGGGGTAATGACAACAG
TACTTGGGGCAGCCTGTAAGTAATATGTCGATGCTATTTTCCAACCTGAA
TGGTATTTCAGTGTTAATGAGAGATTACTCACGAGTTTTTGTGTTTATCA
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TGCACTGTTGCATAATTCTTTCATGATGGATAGGACGATAGGTTAGATAG
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GTGCATTCTGTTTCTTCTGCAAGAATACAGGCACTGTGCGGATCAAACTG
TTCATTTGTTTACCTAAGGAAGCTAAAAGCCAAAGAACCAGTTCAATATT
AGTAAGCTAAACCCTGTCTGTTCATAATTGGTACATTTACTAGTTGACAT
GCAGCAGTAACTTGTCTACCCTGCCAAGAAAAAAGTGCTGCCGTGGGAGT
GTGTTGTCAAATAACATGAACTTTGAGCTACTGTATATTTGTAATAATGT
CTTAAATGCCACATAAAAATGAGGTCGATCTATCTGCGAAAATACCTGAA
AAAATCGTGTATGTATCTTTACAATATAAGCTTAAAAATGATATAGGGCA
TTTACGTTGAAATGGTGAATTTGTAAAAATCTACCTTACATTTATTTGTT
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CCTTGCATAAGAATTTATGCATCAGGCGCTTCTAGCTTCAGTTCCCCAAT
CAATCAGTTGTTACTTTGTCATACTATTTTATGACTAATATCCAAATTTA
GTAAGAGGTCTTTTTTCTTACAGCTGGCCGGATTATCTGCTGACGATATG
ACCGCAGTGAAGAATATGCGTTGCCTATGTGCTAATGATACTAAAAAGTC
TTCAACAGGTGGCTTTACTATGAAATTTGAATTGCGTAAGGTAACTTGTT
GCATTATTAAGTCATGTCTTAGTTCTTCCATTCATGTAGCTTTTGAATAA
TTATATTATTGGAAAGTTACTCACTCAATCTACAATTTTTAGAAAAAGCG
TGGTATCAGGAAAGAACGAATAGGGGAAGAATCAGCATGGATGCTCTCCC
GATTTTATCCCATCCTGGAGGTAAAAAAAGTTAAGCAAACAGTTATGTAT
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TTATCTTTTCCACCAACCTCAGCATTGGTATGTTGGTTTCTTTCAGTTAT
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ATCTAGACTTCTTTTAGTATGTAGGTTCACTCAGGTTTGGAGTGAATCTA
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ATATTTTGAAACGGAGGGAGTAACTGTACCCAGTCTTTGGTCTCATTATT
CATGTGCATGGCCCACTAATTTCCTAATTCCACCACTGCGTATGTTCTCG
GTAGCACTTTAGTGCAAACAATTACCATGGATACATGTATGAAATTACAC
TCATCCTGCTTCCTTTTATCAAGTACACATCTTAGCTTTGTCTGATTTTG
TTTCTGTGGAATTATTTTATTAAGTTTTTGAACTGATTAAGTATGTGAAA
ATATATGTGTACAAAGAAGATGATGTTCTCCACTAAAACATATGCACTGT
TGTATGAGTGCATGCCTATTGCTCCTAATACCTTTACTTAGTCCTTCCCT
TCGGTTTTATGGAAAAAGCAGAGCTAATTCTGTTATGAGTCACCAGCTGA
CTAAATGACGATAATTCCATACTATAGGTATTGAACAGTTATGAGAAGGG
GATATGTGCCCCTAACTTCTACTCCCTCCGTTTGGAAATATAAGATGTTT
TAGGTTTGTGAATGAGATGTATCTAGACACCTTTTAGTGTCTAGATTCAT
TTGAACCTATACACTAAAATGTGTCTATATACATCTTCTTCACAAATCTA
AAACATCTTATATTTCTAAACGGAGGGAGTACTATATAATCTCGAGTTAC
ACTGCATGATCCGTTCAATTATGCTATATAATCATAGGTAGTTTTACCAA
ATTTTATAACCTTGGTGCTGGAGCCTTAAGCTTGTTTCGTGACCATTATA
TGTCAAACTAGCTGGCATACGCATGCTAGCAGCCACCGTGATGCATGTTT
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GTGTTCCCGTGTTGCCTGGCGCTTGTAGTTGGAAGTGTTTTTATTTTTGG
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CAAGTCCAGCTCATCAACCAGCTCAATCCATGAGATCTAAATGGAATGGT
GGCACATGGGCTAGGCCTAGAAACTCTGATGATGGCTATTCAAGGTTGGT
CATAGCGACTCCCATCATCTTTCTTCTGTTTTGACTTTCATGCATTCATT
TTTGTTCAAGATGTTCATGGACTGTAGTAAGCTGTTTTCTGTAGTTTCTC
CAGATCGTACATGGATTTGTATATTACTCCCTCCGTCCAGAAATAACTGA
CTTGGTTTTGTCTAGATTCCAATGTATCTAGACGCATTTTAGTATATAGA
TACATTCGAATCTAGGCAAACCCAAGTCAGTTATTTCTGGACGGAGGGAG
TATGAAATAGTATATCCTAGCCATTATGCAAGTTCTGGTAGTTGATAAAA
TTTGGTTCTATCTGTTGGTATTAAAATAGCCAGCTACCATGGGGGATAGC
TACGTACGCACAACTGGCTGTCAGATGAGCCTATAGGATAATTTCTACCG
TAGATCTATTTGACACCATTCCCTCGCTGTTACCATCCACTTCTTTCTGT
ATTTTTTATGGGCTTTTTTACGGAAGGAGGAATACAAGCGTTGTTTTTTT
CCTGGATGGGGAAACAAGCGTTGTTTTTATCCGGGATGGTGGAAAAGATA
CTGTATTTTCATTCGAACAGGGAAGATGTGTTAACAGCATTACGCGTGTG
TAGCTATCACCCTGGGTAGAAAATCCATGTTGGTTTTGTTTTATATGAAA
AAAATCAATACAGCCGCAGTTCATATTAGCAAATAGCAACAGTAGGTTAG
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TGCAGAGACATACTTTGATAGTTGTGCTATCCGGAAAATTAAGTCAACAA
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TTACAGCGACTCTGTACTGAAGCATACATCAAGTGACATGAGAAAGTTGG
GCCAGCGCTTATTTATCTTTGTAGTTGGGGGTGCTACTCGGTCCGAGATA
TGTTTTAGTTGCCTCTAGAATTTACTCCTTTTTTTATTCCAATCATAGTG
CTTTATGATAAAACCTATGAACTTCCCACGTTCCCCTATTCATGTTTTAT
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AAGAGAGAAATTATCCTTGGCTCCTCTAGTCTTGATGATCCACCCAAATT
CATTACTGTAAGCCCGTTGATTGTCCTTGTCTCCTCTCCAACGTACTAGC
TATGCCTTCCAACCTGACTGTGTGCTGTTATTTGCAGAACCTAAAGATGC
TATCAAATGAAGAATTGACACTGGACGATCTGCAGATATAGCAATAGGAA
GGAAAGGGAATATACACATCCATTGTAATTATCTACAAATTTCTCGGCCT
TGGCTCTAGATGTAGTTGAGCATTATATAGGGCATATGATCGCCGACTGG
CTAGAGGGGCATGCTATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.