Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016393

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016393
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016393
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTCAGCCACTTGCCACTCGAGCTCTTGGCTGGTGGCTGCGCTTTCTTCCT CCCGTGCCCCGTCCCGTCCAGTCAGAAGAAGAAAGCAAAACGGTTAAAGC CTTAAAATTCCCCGACCTGACCCGCCACTAGAAGCTTCCGTCTACGCCGC GTGGGTCACGCCTCCTCGCCCGCCTCGCCTCCGGCCGCACGTGCCGCTCA ACCCCCAACGCCTCCCCCCCTCGTAAACCAGGTCCAGGGCCACTACCCCC CTCTCTCAGATCTCGACCTCCCCGGTGGTGGCGCGCTGCCGCGGCGGTAG CCCTCCTGCCCTCTAGGGTTTTCGACCGTCCCGCGATCGAGGAGCGACAT GGATCAGAGCCGGCGCGCGGTGGAGTCCTACTGGCGGTCGCGGATGGTGG ACGGCGTCACGGCCGAGGACGACAAGGTCGCCCCCGTCTACAAGCTCGAG GAGATCTGCGAGCTGCTGCGCGCCTCCGACGCCAGCATCGTCAAGGAGAT CGCAGACTTCGTCCTCAAGCGCCTCGACAACAAGAGCCCACTCGTCAAGC AGAAGGTGGGTCGTCGCCTGCCGCCGCTCCTCCTCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTTTCTTTTTGGTTCATTTGG GATCGTATTGACCTGACGAGGGGTGACGATTGGTTGGGCGGTGGCGAAAC GACGATCGCCCACGAATTCATGCCCAGTGTAGCCTTTTCTTTTTTTAGAC AAAACATGGTCATCAGTACAGTAGCGGCAGCGATTACTTCTGTAGTGTTT CGGCTGATCGATTCCGCGGATGTGATGATGAATTTGTGATTCCTGGAGCA TTCTGATCTAGTTACAGGGGCGTTGGACATTGTTTTTAGTTATCGGTGTG GGTTGCAGGTAAGTAGGTAATGTCGAAGTGTCGAGATAATGGTAGTGTAT CCTAGGTCTAGATGTGCTACCACATGTTGCCGTACCTCACAGCGAGGTGC GGCAATCCGCACTATGTCCGACCGCTCCTTGATGAATATGAGAGTTCATG GCTGGTGGGCTGGAATGGAAGGCTAAGAATCCGTGGTTCGCCAAAAGCTG TGGCAAAGCACCAAAACAGCTGCGCGCCACTTAGTTTCAAACCTGCCCAG TGAAAATTTGGCCAAGTGTGCCGGTGAATAAAAATGCCTAGTAAAAGTGA AACTGGAAAGGTCGATTACAGTTTCTTTCTTTGCTACTAGCTGTGACCAA CCCTGCCAGTAGAGTACCTTCATTTCACGTTGAAGGTACTGCCACCCCAC ATATCTCCTAACTCTAAACCAGATGAGCGGTTACCTTCTGCGCAGTTTAT CTTGACTGGATTTATACAAATCTTTAGCTCTTATTGTTCGATATCAACTG TCGATATGCTTCTTAAAAAAACCAAGAATGTTTCTTCAATCCAACTCGCC TGCATGTATCAGCTGCAGATACTGGGTTTCATTAGAGTAACATTTCTGAT TAGGTTGAGTTTATTTAAGGGTTATGCGTGATTAGTTACAATGTTTGACA TACCACTGGGTTATATTTTTTGACCATGTACCGGTGGGTTATATGATTGT TTTGTTGCACTCTGTTGCTACTAATAGAAACCTGGGGCGATTAATGTGGA CTTAGCAAATACTATTGCATCGGTCAAATAGAAGGTGTCTGTAACCATAT ATTTCTTGACCAATTTAGTGAAGTTCGATGTGAATATGATAACTTACACT AGAATTGTGGTCGCTAGTGACATTTAATAGTAATTATTGGCCATGGAGTT GTGCTCTGACTCCAATCCCAGTGATAAATAGAAAATCTATATCAAGATGT ATAAAGTATACTAAACTTATGGGTAACTCCTCTACAGGTGAACGAAATGC TGCTCAAGGACATCTGTTTTGCTAAACCTTTGTATTGAATTCTTTAGAAT GTATTTACTAAATTGTATGAAATTGGGTCCTCTGTAATCCTTTCATCTTT CAGTCATGACACCTTGGCTTGCTGTATATATTCGAAAGTGCTTAGCACTT GCATTGTAATACTGTAATTTGGTAGCTGCACTACCTCTAATTTAAGTACT CCCTCCGATCCATATTAACACTGAATTGGATGTACCTAGCACTAAAATAT GACTAGATACATCCGATCTAGCAGACAGTTAATATGGATCGGAGGGAGTA CATTGGTTTGTTTAACCTTTTGGAGCCCTAGTCTCGATTTTTTCTGATTC AGTAGTTTATAATCTCTTTTCTCCATACCTGCTTTCCAGGCTTTGCGGTT GATTAAATACGCTGTTGGAAAATCTGGCACCGACTTCAAGCGGGAAATGC AACGGCATTCAGCAGCTATGCGTCAGCTTGTTCACTACAAAGGACTCCCT GACCCCTTAAAAGGGGATGCCCTTAATAAGGCTGTCCGCGAAACTGCCAA TGAGGCTATTTCTGCTATTTTCTCCACTGAGGACCCTAAAGCTGTTGTTG TGACAGAAGGTCTAGGCAAGCGCATACAGGGCTTTGGAAATACGAATTAT GAGCCGTCGAGAGATGACAAGAAGTCTTTCCTCAGTGAACTAAGTGAAGT TGTGGGCATCGGTGGTGCTTCCATCAAACAGGGCTTGAGCAACTTTGCAG CCACACATTCAATAACAAATGATAATGGTACTATGTACAAGAGCCCAATA CGTAGGTCTCTGACAACAGAAACTGATAGATATGGTAGGTATGATCCAAG TGAAATTCAAGGTGAGAGCCGTGCCACATCTGGTGCTTCAAAGAATGCGA GTTCTGGTTCTTGGGGTGCAAGTCCGTCAAGTTCAGCATCGGTTGGCGAT ACTGGCTCAAGTCAATCAGGAGTTAAGACTCGTGAGGAGAGACTTTTGGA GACAATAGTTACTGCAAGCGGCGTTCGGTTGCAACCAACTCGAGATGCTC TGCAGATATTTCTAACAGAAGCCTCCAAATTGGATGCAGTTGCTTTGAGC CGTGCCCTTGAGAACAAACTCAATTCTCCATTGTGGCAGGTGAGTTTAGG ATAATCCTTTTTTGGTCTATTTTAACCTTTTCGGACTTCAACACTCATTA CTGCTTGTGTATAAAATAGCTAAAATATTAGTCTGAATTATGTCTCTTAG CTCATCTGACAAGTGACAGGTGATGAGTGCATATTTTATGGACAGATCCA TATGTTTGATCTTGTTTATTCAAGGTTACACATAGGCAATTCCAATATTA TGCTAGCATGAAAATTGTGGATAGTGCAAAATTAAGAAAAGCATTCATAT AGACAAACAACATTTTGTTTCTTCTTTGGTGGCTATGCATACCAGTTTCA TTTCTTGCCACATTTACATTATCACCATTACTAGATCATGTACATCTCAT AGGTATTTAGAAAATCAGAACTGTATGCAGTGGAGGTTTGATATAAAAAG GACTGTGCTCAACATAGATAGATGTAATTAGATTTTTCCAAGGTTCAAAA GGTTCTAGGTGTTGATTCTTAGTTTTGCCTCTGCCTAGCGCCTGAGCGCG CACTTAAGCGCATGTATAACACGATTAAAGCTAAGTGTTTTGCTGTCGCC TAGCGCCTAGGTGCGCTTAAGCATACGCATAGGCGCATCGTTTTTAACCA TGGAATTTTCCAATTGTACTTTAATATATTGAGCAATATATATACTCCCT CTGTCCTGAATTAGATGTCGCAGATTTGTCTAGATTCACATGTATCTGTA CACTAAAACGTGTCTCGATACATACGAGTCTAGACAAATCTGCGACATCT AATTCAAGACTGAGGGAGTAGTAGAAATGCACATAAGCTGTACGCAATTT TCAATAAAAGGCTTAGTTCAAGGACCTTACACGAGCATCCGTGCTATTGC AGTCCATGATATGTTTGAGCATATTTATCCAGCAGGCAAGCACACTGGTC CTGGTACAATTGCCAAGCAACTAGCAGAGTGCTTTTAAGCGTCTGGATTA ATGATGTTTAGCCTTCTTTGCCAATATATACCAACTTTTGTTGAATCAAA ACGGATTTATTTCTGGCAGGGGTTAGTGATAACAACTGATCTTTGTTGAC CTTGTTTGATATTTGGTGCAGTATTTGTTCAAATCATTAATTCAATTGGT TGGGTCACTGTTGTTTTATCTTCACTGATCATAGCAGTTTGATGCTTTCT GTCTAGTATATTACATTCACATAAATATTGAATATTGTTGTTCACTACTC AGGTTCGCATGAAGGCTATCTGTGTACTGGAAGCCATTGTAAGGAAACAG GATACTGATCCTTATTCTGTTGTTGCTTCATATTTCAGTGAGAACAGTGC TTCTGTTGTCAGATGTTGTGAACTGCCTCAAGTTTCTCTCAGGGAAAAGG CTTCAAAAGTGAGTCAATGTGCAAAGCTGAATTTTTTAAAATCAAAACTT GTGTTTCATTGACAAAATAGTATTGTGGAATATGCACATTCTGTTTTCTG TAAACCACTATTTGCAGTACCTTTTTCCTTATGACCAAAGTTTTTTCTAC CAGCCATTGTCAAAGAAGTAATAACTTATATCACTTTTCTTAGGTATTAA ATCTGCTGGTTGGGGAACAACCTACTGGAAACAAACATCTTTCAGAATCA AAAACTACACTACCAACTGTTCAGATGCCCGACTTGATTGATACGGGGGA TCAGGATGATCTAGGAACTCAGAGTTCAGCTCAAGAAATCAGTGAGCAGA TAATAGGGAATAGCACACATGTTTCTTCAGTTGATGATTTGCTTGGCGGG GAACCTATTGGTAATATCAGTGTGACTAGCAATAGTAATGGAAGTGATCC ATTTGCGGATGTATCATTCCATGAGGAAGAGGTTAAGGAGACAAATGACC TATTCTCAGGAATGACAGTAGAGGAAAAATCCCCAGCATTTGTGCATGAT AACTCTGTGATGGACAAAATTGAAATGCCAGATATATTTGGCAGCAGCCC TGAGCCATTGTTCCAAGAAAGAGTTGATGATAAAGGAACTGTTGACGATT TAATGGCTGGTTTGAACCTTAATGGCACTGCCCAAGCTCAGCCAGGAGTA AAAGCAGAAACTAATAGTAATCTCAGTGGTTCACAGTTCTTTGACATGAA CAGCCAGACTAGCCACGTGGCGAGTGCTGCAGCACTGAATGGTATCCTTG GTCAAAGCTCATTCTATCAGCAGGTTCCCTTGCAGTACAACATGTCACCA CAAATGTTTGGTCAATCATTTCCTGGGCAGCAATTAAATTATGGTGCCAT GGAAGCTCTTCTTGCTCAGCAGCAGCAGCTACTACAAAATTTAGGAAATT TCAATGGTGGTCTTGGTCATTTGTCTTTCAATTCAATGAATGGTGCAAAT GCATCTGGAATGCCAGATATTTTCAATTCGAGTAATCAGCCTCAACATCA TGTGGCCGTGATGAGCAATTCCAAGAAAGATGAAACTAAAGCTTTTGATT TTGTCTCGGTATGAAATTTCATTTAGTGCCTGGTTTGTCACGTTTCATTT CATGCAGAAAATAGTTGCTATGTGCAGTAAGTACTATCTCTAGTCACAAA TTAGTTCTGGGCATGGACCCTCTCCCAAACATACCTTTGATCACCATTTT TTACCACTCACAAATTAGTTCTGGGCATGGACACAGCTGATGCAAGTAAA TATCATGTCAAAAGGCAAGTTATGTAAACATGAAAATAATTTATAGTAAT ATAAATACAATTAGGAAGTGATTAATTAAGAGACACTAACTAGCCTACTA AGTATAGGAGATGGAAGACGATGAATTTGTTCCACAGGCTTAGATCGAGA GTATCCGAATCAACTTGTGCTTTTTTATTTTATAAAACCCAAACCATATT TTTTCAAATGGTTTGTCAACTATGAAGTGAAAGCAGTGGATTGTGCACTT TCTAGGATATCACCTATTTCTATCAGAGAGAATATAAGATGTTTATTTAT TGCTTATCATTTTATCTAATTAATATGCTCCTTTTGCAATCTAGTACTCC CTCCGACCCATATTAGTTGACTTGGATTTGTCTAAATTTAGATGAATCTA GACACTATTTAGTATATAGATTCATCCAAATTTTGAAAAATCCAAGTCAA CTAATATGGGTCGGAGGGAGTATTGAAATTTGAATTGCAAATCTACATTT GATTTTAGTTATGATGTTTCTTGATTACGTTCTAATTTAACAACAATTTC TCTCTTTTTTACAGGATCACCTTGCGGCAGCACGTGGTTCGAAGAAGTAG ACCCTAAAAGGGATGGCATGTTCAGGATTTTTGCAACAACGGAACTGTTG GGCTTCGTGGAATTGGCGTACACGGTACATCTCGTCATGACTTGAGCAAA CGATTGAACATTTTTCATGAGGTTGGTAGACGGGATATTGTGTTGTATTA TGTATTTAGACGAAGGCTGGTTTCAAGTTCAAATAATTTGTAACTTCATT TTTTTTCTTTGGTAAAGAGTCGGATAGTGTATATTGCAATATGCAACGGG ATTCTGTTTTGTTACTTTACAAATACATTTTTGTTCTTTTGATGGCAGCT GTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.