Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039639

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039639
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039639
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAAACACATGGTCACTCTGTCACTCAGTTCCATCATTAGAAAAGCCCAAG CCCATTAAAAGTTACAACACAAACAAGAAACCCTTCCTCTTGTCTGACGT CTCCGGCCCTGCAGCAGAAGAACTCATGGCCTTGGCCGCCGCCCTCACCC GAGCCGCCACGCGCCTCCTTCGCGACGGCCTCCCGCCGTATGCCACTTCT CCGGCGCTACCCATCCGCAGCCGCCTGTTGTGCAGCCTACCCGCCGACAA CGAGCCCTCGGCTCCGGGGGTCGTAGAGGAGCCGTGGGAGGAGGCCGAGG CGGAGATCCTCCGCGACGTCAAGCCCATCGTGGAATTTGTCAGGGGCATC CTCCACTCTGGCAGGTCAGCTATTGGTTCCTTGTTGCGACGAATAGGAAA CTCGAACAGTAGCAGACAGACATAAAGATTTTTCAGTCGCCATGCACATT TAACACGCACAATTTTCATAATGTCGCGAAAAAATATGAGCTATTATAAT TAGGATTGCTTGAGAAATTGATCAACATTCCTCTAAATAGAACTACACAT GCATATCATTTATGTCAAGGAGTAATCAGAAGCTATCTTAGTGTAAATAT TTGAGCAAAGTACCCTTGTAATTTCAGCACACAAATGGTTACAAGCTTCC ATTTCCTATAGGTTTTTATCATTTCTGCCAGTATGACCAACCCAAAACTC AGTTTTGCCATTTTACCGATCAAAACTTCAATCTTGACACTGCTCCGTTA AAACACTCCTGAGTTTTTTCATTCCGTTATCTTTTAACCATTAGTGTATA ATCAGTTTGCCATTCTAGGTTCTCCAATACCAATCAGTGAAACAGACGGT ACCAAAATACGTGCGCCAGGGAGCAATTTCCGTGCTACCCCTTTGCCTAG AATAGTGGATATCTAGATCTAGGCATGCAGCTTATTGGACCTAAACTTAC GACCTGCACGGCCAGTATTTATTTTGTCATTATACTTTCTAAGTAGAGTC AGTGCAATTTTTTAGCGTTCAGATACGTATCCCGAGAACTTATCAGGCAA CCCCACATTATAAATCTTGTAAGACGGATCGATCTTCACTTGCACATGCA AAACCTGCTAAGAAACAAATCAAAGTATCAACGCTTTGACTATGAACTGC AAAGCTCAAAGGAACGTACGGCAGAGACAAAGCTTAGGACGCACACTCAT GTGGTCCTCCTGTCAGCGTTCGTGGCTCCAGGAATGTATATTCCACTGCA GGTTAGCTCTTTGATCATTCGATCTTCTCGGCAGTGTGTAGTGCGTGCAG CATGCTCAGTCGTCCTACCGTGTAAGCCTGGTTCAGATTGGATATCTTAT TTGTTAATCGATCGGCCTGCACCTATTACTCTAATCTCAGAAGGAGATGT ACGGCTACTTGCAATTGGATCACTTCCTTTAACCACCGCCACTTTAGTTT TTTGATATTCATCTGATATAGTTTTTTGCTATTCATATGATATGGTTTTT TGTTATTCATGTATATAGTTTTTTGCTATTCATCTGATATAGTTTTATGT CTAGAATGGAAAAACTGATTATAGACTAACGGTGAAAAGATGCCAGAATG GCAAAACTGAGGAGTATTGTAACGGAGCAGTGGCAAGATTGGAGTTTCGG TCGGTCAAATGGCAAAACTGAGGGGTTGGTCATAGTGGCAGAAATGATAA AAAACATTTCTTATATTGCTGTGGTTGTGCTTATAAGAAGGGAGTACCTA ACTACTAGTATAAGATGTTTTAGCAAACTAACTACTCCCTCCGTTCACTA TGTAAGACGGAGGAAGTAGAATACTAGAATGCCACTTTGAGAGTGCTCAG TATTGTTCATTAAGGAAGGGCATTGGATTGTTGGACTGGAGTATCTAAGA AGGGTTGCTTGCACACAGTGGTATGGCATACAGAAATGTTTGTTGGTTGA ACGAATGATGAATAGAAGTTGAATATATTCATTTCACCTCTCCCAATCTC GCCGCCATCCCTTCTCCCTCCCTTCTGCCCGCTATACCGGCAAGAATGGA GGAGGAAAGGGGCGTGGTTTTCCGGTTCGTCTTCTCTACAATGATATTAG CCATCAAGGTGGCACTCTGACTAGATTTTGTTGCTCCGCTGAGGCTGCTT GTTGCAGATCTTGTTTCCCCCTTCGTCATTCTGTCCCAGTGATTTGGTGT TATCTGTCTTCTTCTTCTCCTTGTTTTATTAATAGAAGTCCTGCTTTTGG TTCACCTGCATGGCTGCTGGTGGCAAGTTATCCTATGCATAATGCTCGAT GGTGTCTGCTTAAGCTTTTTTTTGGTGAAGTTTGCTAGTGGGCAACCTAA TTTCTTGTCACATAGTAGATGGACAAACTCTACAACTCTTGCCTGGCGTC CTCTTGAGCTTCCACAGGCGGATGCGGCTGCTAATTGGAGGTGCTTAAGC ATGTGTATGGCAGTCCTTTTGTCCCGCCTCACATCTCTGCCACAAAAAAG GTCCAGACTTGTGGCAAGATGTGTGACCCAATTGCATTTTAATCCAGTGG TGGCTTCTTCCTCCCAACCCACATGTGTATGGTACTGTAGCCTGCTTTGG CGGTAATGTGCTTCCATTTGCCGGGACTTTTCTTTGGCAACCACACTCCT GTGGCAATCATATGAGATGGTGAGCGGTGTTCCTTCCATCAGCAGCAGTC GGCTTCATCGTCCTTCCACATGGTAGTTCCTGAGATGGACATGTGACTTG TTGCCAGGTGTATGTGAGTTTGCCCAGACATATTTCTTGGAGTGCAATGT TTTAATTCCCATCTCCGTGCAACGTGTTCACTCAATTGGGTGTTTTATTG CTGTGACAAGTTCTTGGTCCCCACCCTTGTCTTAATCCAGTGCAAGGAAT TTTTCAGAAAAATGGTGCAGCTAACAAAAAGGACAGTCAAGTAATTGGGT TTTGATGTACTATAGTACTTGCAGTTTGCAAGGATGTACTGTTGTGTACT CACAATCATATTTTATTGCTTCACTAATTGTAATCTGTTATAACAGATAT GGAAATGGTGTCTTTTTAAGTCCGGACGACGAAAAGGTTATAGTAGAAAA GGTTCTCGCTCACCACCCTCGTTCGGAAGACAAGATTGGTTGTGGACTTG ATGCTATTATGGTGAGTTAGGATGATCACTGCTATTTAATGAGAAGGACA TGAGACTCAAACAAATCTAATTTCTCTTCTGTTTCTGTATTACTCCCCTG GATGTTTATTTCTTCTTTGCCAAGCTTGTATTATTAAGTACATTTCCTCA AAGAATTTATTATTTGTTTTTTATTAAAATATCTCAAAAGCTGAGACCGT GAGTACTCTTTGTTCGTAAGGTAGCCGTTTTTTTTGACACAAATACAGTA GGGAAAGACTCCCTACTATGTCATTGTGTATTTTATAAATGGGATGACAT ATTTACATGGTCCATGGTTCAATTATTACAATCTCATAGAGTATCCAGCC ATGTCTGCATGCCTTCCTTGAGGCTTGGTCTAGCTCTATGCATAGCCAGG GAAAAAAATGATTTAAATCTAGCTATACATCTAGGAACAGAGGGGATTTT CTCATTGAATATGTAGTCATTTCCTTGGTCCCATAAGCTCCAGCATCCAG TAATCAAAATCTCCATCAGAAAGGTAATAGAGTATTTTCCTTTGGTCTCC AGAATCATATTATGGGTGTCATAATCAGCATTTCATTCAGCCAATTGCCC ACCAAAACTTTGGCTTAAGCTGCATTCTAAGGACAAATTTATGCGAGTTG CAGTTTTGAGTCTCGATCATTCCCCTGGTTTTTTGTTTTTAAAAACCTTA CTAGTTGGACGTCTCGTGTGGCTCAATCTGGATAATCTGCAAGTTGATGT TTCACAACAGCCATGGTGCTGGCTGCTTGCTCTGAACTGAAGTGCTCGGT GTCAAGTAACTAACACAACCTCCTCATTTAGTAAGCTGACCACTAAGCTG CAAAGTATAAATCTGATCAGGCGATTTCTTTTGCGGGGGATATGACTTTC TAATACTTAAAACACTTGTCTCATTCCTAACTGCAAGTTTATCTATTTGT CCGCTATTTTTTTTTTTGTTAATGGCTTCCTTTATCATTCAATAGCTTGT TAGAAATTTTGTTCATTAAATGCCATTATGAAATAATACTAGATCATATA GGACAAGTTTTATGTGGCGATTATCTGTTGCTTAATAAAGGCTACACCAC AACACTAACAGTCTGAAACATTTAGTTTACCTGATCAATCCTCCCTACAG TTAGGTTCTGGTTTCTCTGGTCGAACCACTGGTTTGACCTGGCCTTTAAC ATTATGAGTTACAACCTTCTAGGTACATACTCCCTCCGTCTAGAAATATA AGACGTTTTAACTTTGTAAATGAATGTATCTAGATGACTTTTGTATATAG ATTCGGAGTGAACCTATACACTAAAAGACATCTAGATACATTCGTTTCAT ATTGCTAAAATGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTACATAACATCATA TAATGGAGAATTACAGTGTGGCTCCCGGGTGCTACACCCATACCTGGAAA AATTAAAAAATAATTAAAGAAAGGTTTAAAAAATTTGAACTTTTTTGGAA ATCAAAGATGACCAGGTATGCTACTTGTATAAAAATATTTTCCTAGGAAA TTACTTTCATTGCATCCTGGGTAAAAAAACAAATTCGAAACGCCCCATGA CCAGGTACTATTCACCTTTGATTCATCATAATTTTGTTTTTTTGCCCTGA AGACCATGCGAATCATTTCCTTTCCAAATATTTTTACACGAGTAGCATAC CTGGTCATCTTTGATTTCCAAAAAAGTTCAAAGTTTTTAACCTTTTTTTT AATTATTTTTTTATTTTTCCAAGTATGGGGATGTGTAGCACCCGAGAGCC AAAAGTCCATATAATGTCTCTATCTTTCATATCAACTGTTATTTTGCCAT TCTGATGGTGCCTCTTTTACACCTCGCCGTGTCAAAGTGAAACTAATAAT ACCAATCTTTGTTTCTGAGTACGAAAATTGGTTGCTACCTTATGACAAGT GATCCTTGCATTGCGAGCCTCCGACAAGTAATTTTTGTGGATATTTCCTA ACTTGTGCAGTGCTCATGTTTGTAGGTTAACAAGCATCCTGAGTTCAGGA GGACCAGATGCCTCTTTATCTCTAGAACAAATGGCGATTTGGAGGATTTC TCATACCGCAAGTGTCTCAGGGCATACATCGAAAGGGCCTATCCATCCCA TGCAGATAGGTTTATAGACAAACATCTCCCACAGAAGCCGTCGGAACCTG TCCATCCTCCCAAGTAGAGAATATTTTGCGTTATGCTACTTTTAGCAGGG GACGGCACTGAAATCTTATATTTCATCGTCTAATGGTATGTCAGGTGAAA GATGTCATTGTCCAGATGTTTTTATGTGACGTCTGATTCTTCTTGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.