Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035939

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035939
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035939
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCACCGCCGGCCTCCCGTCGTAAACCCACTTTCCCACAGGCAAAGGCAG AAAACTCGATCTAATCCTGCCTAAGCCACCACCCCCGTCTCCTCCCGCTC AAACCCTAATCCGTCAATGGCCTCGGACATCGACTCTGTTCCTTCGCGCC TCTCCCCGCAGTCCGACTCCGACCACCTCCCCCTCGCCACGCGACGTAAC CGCCTTCCTCGGCCGCCGCCGGCGTCGCGGGTGGAACCCTCGCCTCCCAC GCCGGACAGGTGCGCGCAGGCCTTCTTGAGTTCTTGCTCTTGTGCCCTGT TGAGATCTTCGGCGTCGTGATCTCTGTCTGTTCTGCAGGTGTGAGGCTAG CCCGGCCCCGGAGGGTAATCGTGGAGCAGCCCAGCAGGTGCAGTTCTGAA TTCTGATACATTTCCGCGTGATTGTTAGACCTTCCGAAGTTGCATGTTTC TCATGGGTCTCGGGGCTGGCTTAGAGCCACATTTCTTGTTATGCTTCTTT CTCGCTTTCCTTGATGTGTCAGTGTCCATGAATTCGTTTAGACTGAAAGA AAATTTGGATGCTTTGAAGTTTGTGAAATGGTCAATTCAGGTCACCATGG GATTTCCCCAATTTTCTCAACCCTACATCGTTTGCTGACTTAATTCTACC CATATTGTTAGCCATAAAGATTCCTCTTTTTTGCTCTAAAAAAGGTTCCT CTTTTGTGCCACAATCTAAGCCTGCTCGGACAGTGACACCTTCGCTGTTA CAGTCTTAGATATTCTAAGAGGGGTACTTATCTGAAGTAGGGAGGAAGGA AATAGGTCACGTGTCCTGATACTACACCAAGAGTGTCTTGCACTGCTTAC TTGCAACCCATCTCCAATGCAAATGGTTTGGCTATGTCTGCATGAACCTT CTTTTGCCACCTGATAGTAAAAATAACTTTGTCTTATGTGCGCGCTTACT TAAATTGGTATCACAATATTGTTCATTACCAAGTTGAGGCATTCAATGAT CTGCTCTTGTAACATTAAAGTGGGCCAAGATCTTTCCTGTGAAGCAACGG TATTGAAGCTGCTTGGCAACACGTTAAATTGCTTATTTACTTTAGCATTG TGCTTGTCGTATTGCAGAGTTGGCCAGGTTTACCAAGAGGCGTACACTTT AATCCTAGCGATAGTGATCTTCTATGGCATCTGGCTGCAGAAATTGGGAA TGGCCTGGCTCATCGCCATCCATTCATTAGCGAGTTTATTAAATCTGGTG ATGAAGATGGGGGATTTGGCTGCACACATCCTCAAGATTTGCCGGGTATT TTACTCTTTACGGAATGCAAGTACGTCTCTTGTTGGAGCGTTTATGTCAT TACTAATTAGCAATTGTATATTTTGCTGTAATCTTTCAGGTACGAGGCAG GATGGACAGGCATCATACTTCTTTCACAAAAAAGTTAACTTGTACAACAA TAAGAATGACAAATATATTAGCTGGCAGAAAAGTGGGGCCTCTAAATCAA TAATCATGGATGGGAGTCTGCAAGGTTCCAAGGAAGTATTTGTCCTGTAC GCCTTCAAGAATAGTAACGACAGCCCTCAGAGAACTGAGTGGGAATTACA TCAATATCATATAAAAAATAGAATGGAGGATGAGGCTGAACTAATGGTAT CAAAGATATTCTACAAGTCACAAAATAATCATTGTGAATGGGCTGTAAAA GCTCCTATTCGATCTGCACAGGTACTATCTGCTCTTACTTCCATTGCTAT AACACAGTCTCATGAACGGGTGGTTATGGAATACCAATATAATTTGTACC ATTATCATCGTTTACAATTGGTTCTATAGATTTTGTTTCATACAGTATTT TGGTTAGTCAGTTCATCCTGCACGAGAAATTGAAAAGGTTCCTTTTCAAG CTTGTTGGAAGTAATTTTATGCAGTAATTCGAAAGAAGAAATGATTTGCT ATTTATGATTGTGCTCAACAGGCAATTTGTGTTGGTTTCAGTATTTGAGT GTTCATATCTGATGCATAGTTATTTTTCAAAGCTACCAGGAATTACATGC TATGTGTTATCGTGACAGTTATCCGGACAGCTTCATGTTATGCTAATCAA TCAATCTAGATGTTACTTTTGACATTATTCTCCTGCTTGTTTGTCGTTAT TATCATTTAAATCATTAAATGTCCTTGCAAAGATAGTTCCGCCTATAATT ATAAGTAGATAAACATATAAATGCTTTTTCATATCTGCTCATTCTTTTTT CTGAGAGAAAAAGGCTTATATCTTATCATTCCTTTTTTGGAGAAAGTTCA TGATCTATATGTTGTCATTCTGTTCCCTGGTTTAGCCAGTTAAGCCGGGA CGGATCTTTATGTTTTGGGAGTTCAATCGTCTTATATTTAGGAATCACAA GTAGTACATTTGTTCAGTGATAGCTTATTCTCACTAATTTGTTTGTTATG CGTTGCTTTGGGGCCACATTGCAGGATTTTTTTCCTACAGAATGAGTTAT GTTTGACCAGTGGCCATTGTCTGGTTCTTTGAAAACATTTTCTTGCTGTT CAATGTTTAGTTTATTTGAACTTTATTATTCTACTTCAAATTGAAAGATC CTTTTCAAGTAATGTTGCTCTAGTACTACTAGACTAGCACTAATTAAATA AGTAATGTTATTTGATGTTTGGACTTTGGAGCTTTTTGTATAATTTACTG CTTTTCCCTTATGTTTTATGTTGGCATCAATTTGATTGTTTTTTGCATTA GTTCTTACTAGCACAATGCCCGCGTTTTGCTAAGAGCAGGTTTGTTAACC AAATTAAAAAGAATAGCATAAATACCCATGAGTTGGAATGGTTTTATTTT AATTACCTTTTAGGTCATGGGGTGACACAAAGAGTTTTTAGGAAACACAT CCATCGTCAATAATCATGATAGCTTATTTGTCTGGCCGTGCAACCATCAG GAATGGCAAGTTTTTCTTGATAGATTTTGTGACCGTCAAGAAATGTTGCT TTTTTCCTTGATGGTTGTGTGTCGGCTGTCCAAGTTAAGAAAGGCCTACG CCATACCTGTCGTCGTCATTAAAAGATCAATTTAAAATAATAATAAAACA TATAAGACCTCCAAAAAGGACAGAAAGAAGATAGCCATGATGCGGATTTT GTATTTGGGATGTCTATGTCTTGCACACTAAAAATTAATTTTGTACCATT TGTTCCAGTACATCAGTTCATATCTTCTATACAAGATAAATTTAGTGTGG AAGCAATGAAGATTAATATGTAAGTGTCTTCTAATCCAAGGATTAGTGGA TATTAATATATAAAAGTGTTAGTATTTATCCTTTTTGAGTGAAACCACCC AGTCGACTGCACCTTGCAGACTTGCATAATGAATTTTTCGGAATGAAAGC ATCCAGCTGCCGGTAAACTATTTTCTGTCATGACAACAAACAAGCATTCA CGAAGAATACGTAAACCTCAAATATTCAATTCTATCACTGCTTCAGGGTA AATGCAGAGCTGTTAAGTCTCCTATTTTTCCAACACACTTTGCACAAAGC TAGTCCATCTAATGCATTCTACCAAAATATCATTACTGGAAAAAATCCAT TATATTCATCCAGTCTTTTGTACAGATATAAAATCCGTCGCACCCTGTTC CATCATAAAGACTTACCAACAGCTATTGACTGCCACGGATGATGAAAGGC CACTTCCATGATTTTCTCGCCATCAGAACATTAGCTATTGCCTTATGTGT CAAAGCGCTGCGCAGACATCCCCAGGAAGGTGGGCAGTAACATATGGCAG CTTGCTAATTTTCCTAAACACTAATTACTAAGTACTATGAAGGCGACGAC CAAAACTGAGTCCCTGGAATTGAATTAATTGAACTGAACCCCAGTTTTTT TGGACAAAATTAGCATCAGGTCCATCACCTAGCTATCATCAGTGCAGGGC ACACCTTTTTTCTTGTAGGGAAGCGTAGGTCACACCTCGCATAGCAGCAT TAAGCAGCACGGATAAAATCAGAAAGGAAGACAGAGCGAGCACTAACCCT CTTGGCCTCTTCCACATGTGCATGATCACCTGCAGGACGACACTCTAGTC CAGACTCCTGCTGGACTGCCCATGACGGCTTCGACGGTTTTTCCAGTGCT GGCCTCACCTTTGTTGCAGATCATGGTGGCAGCACCATCCCAGATACAGA GAGCACCTTGCCGAGACAGCGAATCAAGAAGGGGAAAACATAGTAAAATT AGATCAAGATGGGGATTAGATCAGATCGCGGTGGGAACACATCAAATCGA AACGGGGAGCCTGCGCTCAAAGGCGACGCGTGCGACCTGGAGTTGCCGTG CGTGAGGCAAGCTCATCTCCCCTCCCTTGCTGGCCAATCTCGCCTTCCTC CCTCACCTCCCAACCAGCGGAAGGTCAATGTCGACCATGAATCAGGCGGC CGACGGGGAGCGGTCTGAGCGTCAAGTCTACCGGCGTCGGTGGCGCTCTG TCGCGGGAGAACGGGAGGATCACGAGCGGCGTGGGGAGATGCCCATACGG CTTGCGCAGGACGAAGGCTGTCTCCCCCGCTGCTACCTCCTGTCTCGAGC GGTTCTTCGACGGTGGCGGACTGGCGGAGGCAGGGTTCGGCGGCTGCCTT TATGTTGCGATCGGAGATTGGACTGGCGAATTTGGAGACTCCGTTGTTCT TCGAGGCGGCGGACTGGCGGAGGCAGGGTTCGGCGGCTGCCCTTTAGGTT GCGATTGGAGATTGGACTGGCGAATTTGGAGACTCCGTTGCGGAGGCGTG CGCTGACTCGTGGGGGATTGTTTGGCTTGTTGCTGCCATATATATATAGG CTTCTAGCTAGAGTTGGGGTCTAACATAATTTCCAGCCCACGATTTGTTT GCAGCCCCGTTTTGTACTGATGATAAATCAGGTAGGAAGAAAACGGGCGA AGCAACGACAGACTAACCACGGTACGATGGCACGATCGGGTAATATGGCA AGTTTATGTATTTAGTTTTTTGGTGGGAGGGTAAAAAGGTCCAAAAAAAG TGTTGGACCGGGAGAAACACTTCGTGCTTTATTATTAGGTATAGGTATAT ATAGTTATAGATTGTCTCCTGTAGTCCTGTTATCCACTTCTTTGTCATGT CTAGTGTGTGTGTCTTTACTTTTGTGTGCAGTTAATGTTTCATTATTACC CTTCAGTTCTCTGCAGTTGATGTGACTGATAACATCAAATCTTATTATTT ATTTGTCATTTCTTGCTACTTTTAGAAATCATCAGGCTCACTACTTTCTA AAGCTTCAAATGCTTTTCTTGCATGTCAGTTATAAATAGATGATTATTTC TGGGCAATATTGTGCAGGATGATTCTGTGACTGATAATGATTCCAAAGAA GAAAAAGAGGATGCAGAGTTGGAAAATCGTTCTGTGAATGTGACCACTGA CAGCTATTTCGTTGAAGGTTTTGATCTTCATTTGCAGTTCTTATTTTTCA ATGTACTTTTGTTCAACAGATTGTGACAGTGATTTTTTTCAGGCAATGGA AACAATCAGGGACAGATACTGGTTGAGATGTATCCTGATCAGGACAAACG AAGTTCTTCCAACATTGTATTGGATACCACAGATATCAATCTTGAAAACC AAATTAATCATCAGGCTGAAACTGAGCTTGATCACATGTCTCTGCAAGAG CGCTACAGAATCCTTCTAGCAAACAAGTGTTCTTGCTCTGCGAAGGTATC TGCTGAAACATGTGCAGTCAATGATTCAGATTTATCCATACAAATGGATG CTGAAACAAGTGGGCCAGTTCCCAAAAGTGAGAGTGAGGAAATGTATGAA TCTATTTTAGCTAGCTTTGATTTGTCCATGTTACATCGATTAAAGATTTG TCTTGTAACATTGCTTGCAGAAAACATGAAGGAGCAACCTGCAGGGAAGA TATATGTAGCATGTTGCAGGTTCTGATATGCTTTTCCCAATTATCTTGCT TATTATAGCCGTTTAGTTTCGGCATTAACTTTTTGTGTAATGTTAGTAAC TTTTTAGGATTTGCTAGAGGTTTCATAGGAACATCTCATGATCTTTGTCT TGTTCAAATGCTGTGAACATTACATTGATAATACTTTCCAAGCGCCGCGT AGAAAATCATTTCTCATATTTTATCACGCAGATCTAAACCTGCCCAGTCG ATGTTGCCGTAGTGGTTAGTTTCATATATTGTATCTGTGGTTACTGATAT AGGTGATCCCATATATGTGTATTCAATCCAGTTAGACGAGCAGGGCAGCA GTTAAGCAAGCAGCCACAGCTCATAATATATTAATCTTATTTCTGTCGAC TGTCGAGCATTAATTACCTTTGATAATATTGCAATTATCTGTGCAACTAT CTACATTTAGTTCATATATGCATACTATAGGACAAACAGGTTGCAAATAG TAATAATTTTCATAAATACTTGCTGAGGAATTCCATGACATTTCTTGGCA TTTGTCTGTAATGACCTGCGGTATTGAGTCTGCAATGACCTGCGGCAGTG ATCAATAGGAGTAAGCCTGATATCCATATTGGTCTCTTAAACTATTTATA ATTCTGCGCAGGAAATTTCTTCTGCACCGTCTATTATAGATAGTATGGAT GCTGACAACAATGTGAGGTTACTTGGGGAAATTCCTCTAGACACCCAAGC ATCTTCGGTGGAATGTTTTGTCAATGACAGGAAAATTTCTTATGACCCAG TTGAGGATGCTGAAGGTCCAGTAAGTGACAAGACCCTTAATTCTAGTGCT GAGCTGCTTTCAAGTCAAACACTGGCTTGTGGGGATGAAAATGTTCACCT TGCAATGAGAAATTCTGGGACCAAATTGGTTGATGTAAAAATGGAGCCTG CATTGGAAGGTTATGGGATTTACCCTTCTGAATCTCCTTGTGTGAAATCT CACCACTCAAATAATGATGATCTGAATGACTCTGATTCTGTTCCAGAATG TATGTCAAAAGACAGTGGAACTGATTTTGTACTCTTGCATGGCACGGGAG ATTCGGCAGTGAAAACCTCAGCAGGTTGTTCCTGTTCCGAGCAGAGTACA TACCAAAAATGTGCCATTGAGGGATGTAGTGGCTCTACAAATTCTGCATC TTCAGATATTTGCAGTACACATGCTGAAGGTTCACCACCATCTTCAGTAG TAAAAAGTGAACCAACTGGGTATGAGTTACCTGGCTTATGTGAGAAGGGC TTTATCAATAGTATGGAGCCTATTGTGAAAGAAACTCATACCAAAACTGT AAATTGCAAAGGGGGCCTTCCGTACTGCTCTCGTCAAAGGAAAAAGAGGA AAATTGCAATGTACGCAGTATGAGTACATGTTTTTTTAATGTTTACACAG CATTTCATATTTGTACTTATAAAAAATACCTGGGCAGGGATTCAAGTGAA ACAGTGCTTGAAGAAGATGCTTGCAAAAATGATGAGGGTATTGCTTACCC TAGGCGAAGGAGGAAGAAGAAAACCGCGACGTATGTTGCAGTCTACTTGT TTGCACATTAATGCTATATTCGAAATTATGCTTATATACAGAAAAAATAT GTGCAGGGATTCGATTGAAACAGCTCTTGAAGAAGATGCTCCAGGACTTC TACAGGTACCTATTTACTGTGTACATAATTCTGTTTAAATACAATAATGT TAACTTTGTGATTTATTGTGTGTTTATTTCCCCCCTTTAGATTCTTCTGG ACAGAGGAATAGTGGTCAATGAGATCAAACTTTATGATGTTGGAGATGAT GATGAAATGCTTCCAGACTGCACAGAGAGTGACTTTCAAGATCTCGAGAA TGTCATAACAAAAGTAAGATGTTCTACAGCAGTACTTAGTATAACACAGA TTATTGCTTATTTTCTTGAAAAGAAAAATAGCACTTTACATTGTTGAAAG ATATACAGTCCTGCCACTTGATGCATCACAGCCAGGATAGTCATTAAAGA AACATCATTATACATACTTTAGCAAAAGAATGGAGCATTTTGAACTGCAA AGTTACTGTGTTGAGTGGTCATAGCAAAAGCTAAATTGCTAATTTGCTAC ATTTGGAATGATTGGCCAAATTGCTATATTTGGAACAATTGGTCTCTGTA ATACCTACGCACCTTACCTTAAAGAAAATCAGGTGGTTTTGTAAGAAATG TGTCCTGTCAACAGATCCAGGAAATATTTTTAAAACTTCTTATTATGTTA TTTCTTATGTATAAGGAGGTTATTTATGTTACGTGGAACAAGTTCTCCAA GCTAAAAGACCCAATCTATGAAAAAACAGAAAATCTTATTATGTTGAGTA ATTATATTCAGCACACACTGATATTGGGAGCTAACTGTTAGCAAATGGTA GCCATTAGAAAGTACAGAACATTGAGAGTCTGCCAGGTTTCCCTTGTTAG ATTCTTCAGTTTAATTAACTCTAATAGGGTACCCTAAAGTGAAAGTAGTT TTAGAAAAACCTGCATTGCTGGCACTGTAGTTTTAAAACATGGTCAGCTT ATTAGTGTACTCCATAAAAGTACAGTAGTATTACTCCACATTCCGCACAT GGATAAATGATATCTTACAATACACTATTTGGGCTAGTCCTGCATTTATC ACTGCGTACTCTAACATTGAGGTAGATGCTTCGACGAATAGTAAAAGAGT TAGTAAACGGATACAGCTCTTGTACATGCCTACTTAGCTCCAGAGTTCTC CGGAGATGTTGCAATTGTATCTTGGTATGATCTTATATATGAAAAGTATT TGTTGACAATGCTACTCGTCAATGTGCAGTTGTTTCCACAGAGAGTATCC TTGTTGAAGTCTGCTGCCAGACATGTGAAGGGGGGAGGAAAGGCTATTTA CTGCTTGGCTTGCTTAATTTCTCTCATTGAGCAGGTATTGAAACCATATC TGGATAATCTGTGCATTTTCCACTTGATACAAGCTTGTTTAGCTTCATAC ATCTGTATCTCTTGTAGTCGCGCTATCTTCAGTTCCGTGACTGTCCTGTG GAATGGGGATGGTGCAGGGATTTGCAATCCTTCATTTTTGTATTTAGAAG CCATAATAGGTAACTTTTCTTACGTTGTATGCTTGTCAACATGGTGACTG ACATGTATGCTTATAAAGCTCCTTTCAAATTTTGTTACAGGCTAGTTCTT GAGCGCCCTGAATATGGTTATGCAACTTATTTCTTTGAAATTGTGCAATC GGTGCCAATAGAATGGCAGATCCGAAGGCTGGTTACTGCTATGAAGCTTA GTAGCTGTGGCAGGACAGCTCTTATTGAAAACAGGCCACTATTGGTGAGA TTTATCGTTCTGTGTTTCTTTCACTTTCTTCTGCAGAAAAATTGGTGTTA CGTATTATGTACAAATATAATAAATCAAACTTAAAGCCAGTAACCCTCCA TTTTTTTTAACTTTTTCTATAGTTCCAACAAGTTATGATGTTTGTTCTGC TTTGGTTGCTCTAATCTAAATATTTGTTTTCAGGTCGGTGAAGATTTATC AGAAGGTGAGGCGCGGGTTTTGGAAGAATATGGTTGGATACCAAACACTG GGCTTGGGACAATGCTAAACTACCGCGATCGGGTAGTTCATGACAAGTGG AATGAGAAATATAGCACAGATTGGAGGATGAAGATTGGAAAGCTCTTAAT GAAAGGTTATTCTGAGGGGCACTGTATTGTAACTCATGATCCCACGTTTA TGTTGCCAGAAGAAGAAATCAAGTTGGAGGATCCTTTATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.