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GrainGenes Sequence Report: AA014040

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Sequence
AA014040
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA014040
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGCGGCGACGGCGGCGTTGAGATGAGCGGCCGCCGCCGCCTTTCGGC
GGCGCCGATGGAGCAAGAAGACGTCGTCGGTGAGATCCTCGAACTGGTAT
TCACCTCTGTTCTCGACCCTCCCGACCGCATCCCCCGAGAGCGCTTCTCC
ATACGACTCGGCCGCGTGAAGTTATATGAGGCGTTTAATTCATGGACTCT
GCTCGGGTGCCGCCATGGCCGCGTCCTTATCACAAGCTCCTATGAACCTG
TTCTCCTTGTGTTTGATCCTATCTCTGGCGGCCGGCACTACGTGTCTTTT
TCCGCCGGATTTCAGCCACTCTATGCGCAACGTCAGGGGAGCTGTGCTGT
GCGCTGCCGGAGATGACCAGGACCACGTGCACGGAGACTGCCACTCGAGC
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CGGGCATTGCCAGCAACTGTATCCGGATCATCAGGGCAGAGGGTGGTGGT
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GGGTGCTTGCACCATTTGAAAAACAAATATAAAATCATTATGAAAATTGG
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TACACCTTAAAAGCTGAGCGTACAATGCTATAAAGATGACTCCATTGCTT
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ATGTTATCCATGTGTAGATGTAGCCCGTCATCTTCCTCTTCATTTTAACT
TGTTGACTGAATGCTTCATTGAAACCATAGAAATAGATTTGTGAGGCTGA
TTGACAGACATTACTTGTTAAGTTAGTGATACTTGTGTCTAGTTTGCTCA
TCTCTTTGTAGTTTCATAGTTTGTGTTTGGTCTGGATATTCAATGTTTGA
TATGGTGATCACACTCGACCATTTTGTAATGAGAGTATTATTCATACATC
GTCCCTTAGCTGCCATGCATTTGCCACTGGTCAATAATTGAGGTGCCACC
TCTCATATGCCCCTAATTTGAGGTATAATTTGCTATTCTGCTATGCAGAA
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AGGATATCTCTACTTGCAGTATTTTAATGTTTAAGACTACTGTTAGCAGC
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ATGTGGAGTTGTTTTTTACCGTTTCATACTTCAGCGATGTTAGGTTCGAT
TTGAACCTGAATTCCAGCTTGTTGAGCTATTTTACGTAACATTGCTGGAG
TGACCTTACTTCAAAATTTTAGTCATAAATTCTGCAAGGGTGAAGTTAAT
TCTCCCTGATCTTTTTGAGCTATGGCTTGTGCACTTGTCACTAATTAAAT
TGTTTGCTGCACAGGTACTGTTAAAGCGTGAAGTTCTGCTCCAGCCATTG
AGCCACCGCAGCAGCAGGGTCTATCCCTATATCGGCATACATCTCTTGAG
CCACTGATCTGACTTCAAAGGTTCAGCCATTAATTCTGTATGATCTGCGT
ATTTTGTATTACCTGGTTGATACAGTGCGATTTTTGACTCATATGGACAC
CCTGCGATTATCTTGAGAGAGAGCCTTGTCACTTTGTCAATTATCTCTGT
TTTACTAGTTAACTCTGTCAGTTGGTCTATCCGTATAATACCGTATGAGT
TATGACTAATGTCACAGCAATCCTGATGCTGTGTTACCTGGGTTATGTTT
TCTTTATAATGTGGAAATGACATGTTTATGTGCTAGTTGTTACTGGCCGC
CACTTGTAGGATATATAACATCATTCCCTGTGCAATCCATATCAAAGATG
AAGTCGTCTGCTCGGTGATGGGGTTCTGGATTGAAATTCTTAAGCCATGT
GGCCCATATCTTGGTACTCTGGACTTTTTCCCTCTCTGAGTTGCCACCAT
AGTTTCGATAGTTGAGGGCCAAGGGTGCAAATTTTTTACGATTTTGAGTT
TGGGTGTAAACTAAACCAAGGCAATAGTCAAGGAAACAAAAAGTTAACCT
ATCCCTTAATTAAAGTGGGCATGCCATGCAATTCCACCACATATAGTATA
GTATGACCTGAGTGTATTAGTTTCTTTAAATGGTCCTAAACCCGGGCTGG
GAGACTAGTGATTGGCGATCGTGGGTCGTTACCTCTGGTAGTCGTATCTT
TCTTTCCCTCTCCTGGACACTCGTTTTCATCGAAGCTCATGTATTTTGGT
CATTTAGTCGCTTCTTCTCCGCCAGTGGGGGCCTCTGTTCTCGTTTGTCC
CGCTGGCAATGGCAGCATTTTCTTCTTTTTCTTCGCAACTCCTTTTCGTA
CATCTCCCTGGATTGGCCATGAGGCACAGCGTTTGGTTTGTTACCTATGC
TGCTTCATGCACGCATTATCCGATAGGTCATATCAGCTGTGTCCAAGTTG
CGTATATTTTTGGGTTACCGTATTTGTTTTTTCTTTTCCGCACAACTCTC
TCCTCATTGACGTGTGTCTGCATGTTTCGGGTTGGTGGAGAGCTGCAATG
TATCCGGGTTCTCCTTCCCATGGTAAGAACCTATGAAGCAAGTGGTCAAA
TCCTAATCATCTTGGTGAATAATGATGCAGCCCCCAACTATGCGCTCCCC
CCTTTCCTTTCCTGTTGTGGTATCTGGCATGCTGTTGAGCTTCCGTGCCA
GTGTAATGGAAAGGGGCTCACAGTGTGAAGCACCAGTGTGTAACCGTCTA
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ATGGACGATGGTGAAGCACCATGCAAATGAATCATCCAAATATTTTCCTG
TTTTGCGCAGGAAGATTTTGTTCATAAACGTTACCCATCTATAGTTTTGC
TATATCGCATCATTAGACTGCAGCAGACTTGCTATTCAGTTACATCCACA
TTTTAGGCAAAGATCTTAATGTGGTGTCCAACAACCTTTTTATGACCGCG
GTAGTATACAGGGATCCATGGCATAGTTAGTGCATCCAATACCATCCCTA
GTAAGGGCCTGTTTGGTTCAAAGGATTTTTACAGGAAAAGTACAGGATTT
CGGTTCCTGTAGGAATTGGCACTGTAGCATCATTTGGAATGCAGGAATCG
AGCATAGGAAAAGTGGAGGAAACTTTCCTTTGAAGCCGTTGTCGTGGGAA
AATCACAGGAAAGGAAACATTGGCTCTGACCTCATTTTTTCATTCCTGTG
CGATGGTTGGAGGCAAATCAAACACATGGCTGCTCGTAATACTTACATTA
ACTCTACAACCTGCACCATGAGATCCTGCAGCCACTGGAAATGCTGCAAG
GGGTACCGCCAACAAATAGCTCAGACTTCTCCTTAGCCTCCAGACCACAG
TTGAAGAAAACTTCTTGGAAGCATTGGACGACCGTAGGCAAGATGCAGGA
GAGAGATGAGAGGAAAATCGAAATGCAATTTTGGGTTGCGGCCGCATGGT
CTATGCATACATTCTTCGGCTTTGGATCATGCAGATAGCCGAGAGAAGAA
TACATATGGTGCCAAAGAGAAGAACGACCACGTGCATAGGACCAACCAAA
GGGCAGTACTTATTCTAGTCTGTAAGCCTAGGTAGCTAAACAAACATTTG
TGTGTTTGTTATCAAGTATATCATTCAAAGGGCAAATGGTTTTAATCTTG
ATTCCTCTGGTCTTTTTCCTGCGTTTCAAACAAGCTCGTCTGATCCTTTC
CTGTGTTTTGCATTCCTATGGTTTGCACTTGCATTCCTTTCCTATTCCTG
CGTTTCTCCTATTCCCGTGTTTTTCCTATCCTACGTTTCAAACAAGCCCT
AAAATTGTGAAATTTTAGCTGTGATGTCCTCTGCCAGAGAGGAACTGAGC
CTAGCTCACTTGGTGGGAAGCGGGGATGCATGCCCCCACCACTCAGGTTC
GAGTCTCCAACTCGAATTTGGGTGTCTATTTCTTCTATAAAAAGTTACCT
AGTTCCTCATAGGTAATGTCTTTTTTACCTCTGCCAGAGGTTTTTCCTAT
TTAATTTACGAGAGATGTTTTAGTCACATCTTTCCTACTTATAAAGATTC
TTGTTGGTGGTAGTCCGTTCACTATTCTTGTAGCCTTCATTGTTTCAGTC
GAGAGAAGTAGGACCATACAAACCTATGAGCATAGCTTGAATCTATCGTC
TCCTCTGCCTCTCCTGATAAAAGAAAGCACCAACATATATTAATTTGACT
TATAACTTAAATAAACTCTGTTCATAGCGTAGCACGGGCATCTTACTAAT
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TCAGTTGATCAGTAGGTTTCTTGGCACCAGCCACCAGGTATACATTTTTA
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TGTTTCATTTCATTGAACAGATAGAGTTTGGTTTACATCCTCGCTAGGAG
GCAAGTTACAGAGATACAAACTGAATATTTCCTTTGTATGTTTCAGCCTG
TCATACTACGTATCACCATGAATCATATGAAACTTCACCAATAGTTGATG
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GCAGACCAGAGAGGATGTAAAATCAATAGTCAAATGTAAGTAAATGCCTC
CATTATGTTTTGATTCACATGGACCACACCTCCAAAATTTGTGTAACTGC
TATCTTAAAGCTACTAAAATTCATGCGTCCTTTTCAGTTTCCTCTGGTTC
TCTTATCAGCACTTGATGGTATGAGTTGAATCGGATAACAGGAGTTAGGT
AAGCACTACGTCAGTCCTCACTCTTATTGTGATCTCTTTGCAGCTTCCTA
AACATGAGTGTTCTGTCATGGTTATTTGATAGAAGGAAGGAAAAAAGGAA
TGTAGGCTGATAGAAATGGAAATGTGTTTTTTATTGAGAGATGGAAACAG
TGAGTTGGCACCTTGCTTTCAACAAAAAAATTCATTTATTTGTTCCCTAG
TTTTAGGATAGCAATACATACCAGTAAAAACAAAAGAAGGGTTACAAACG
CGTCAAAGAATATCACTAAAAACTAAAGCATACCTTGTCACCACATCATA
TTTTTCCTTGGCAGATATTTTGTGTTGCATTTTTTTGAACTGTATCTTCG
GATTTTGGGCAGGTGGATAGTTTGCTGCTACAAAATATTTATGTGCTCCT
TGAGTTAGATATTTTTATGACTTTAGGTGTTACGATGTGTTTTTACCGAC
CAACTGGTTTGCCCTTTTGCTACATGTAGCTTAATTATACATGTACTAGA
ATTGGTGGTTTCGATTTTCTGCAGTTTCCTTGATCCAGTAGATGCGTAGT
GTGCATCAATATGGTGTGCTAATCGATCAGCTTTTCTGCTAACATCAATA
GTTTAGGTCAACATTTATTCATCCATGGGAGGCAAACATTTGTTCGTGTA
GACTTGGTTGTTTGTGGTACGCCATATTTTCCTACAGGGCCTGTTCATTG
TCTTTTCTCTGTTACCTTTATCTTATAGGATGCCATAATTGAACATCATG
TTTGATAAAACTGCAATAACCAAACATCATGTTTGTCCCTTTATTCTTGT
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CTAGTTCTGTTTATTCTTTCCCCTTTTGTGTTCTATCCCATTTTTGGTGC
CTTCTTCATATGTTTTGTATTTTCAGTTTGCACAGGATGTTAGCAAGGTA
GCATACCCAATCACTTGGATGCATTACCTTGACCTTTTGCTTTGTTCACA
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CTAATGAGTGAATTATCTTCGGTACATTATTTTGTACCCTCACAGCTAAG
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CATAGTACTACCTGCTTCGGTAAAGAAGTGTGACCACTTTTATTTGCTTT
TAACTCTTAAATTGCCATTTTTCTAATTGCCTTTTGTCACAAGCAAGGAC
TAATGTCTCTAGGATTTGGTCATATCCTTTGTTTTATATCCCTGGGCTTT
TGTCATATTCTTTGTTTTCCTATCGTTTTTCTTGGATAGAATCAAGTCTA
CATTTTGTTATTTTCTTCAAACTCGTTTCTCCGGATTTACATGGTTTATT
TACCATGTCTATTTAATACCAGCAAGAACTCTGTCTATGATTTTGGATTT
TGGTAGACATGGTTGCTGTTGAATCCGCGGTTGCTTGGCCATTGAAGAAG
CCCTAAGCCATAACTGGCCCAGCAATCATCTGAGATCTCATGGTTTATGA
AGGTGAGTGTCTGTTGGCAAACTAAGGATTGAAGTTGTCTTATGAATAAA
CCTCTTTAATCATCTGTCCCAGAATGTCTTGATGAATGTACATACCTGGA
AAGTTGCTCTATTTTCTAATCCCTCGAGCTGCTGGTGTTCTTTTGAATTC
TTAAGCCATGTGTTATACTCTGCACCTTTTTCATCTAGACTTGTCACTGT
AGTTTTGATAGTTGAGGGTTGATGGTGCAAAATTTTGACGGTTTTGAGTT
TGGGTGTAAACTAAACCAAGGCAATACTCGAGGAAACAAAATTAGACTTT
TTCCTAGACAGGTCATTACTACAGCACTGCTACTGTGAAAATTAGGGTGT
ATACTCTTAACATGTTATCCTTTAATTGAAGTGGGCATGCCAATGGAATC
CCACCACATGTACTACAATATGAGTGTATTACTTTCTTTAAATGGTCCTA
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CGAAGCTCATAGACTTTGGTCATTTGTTGTCGCGTCTCTGCCAGCAGGGC
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GTGTTGTGGCGCTTGACTTCATTTTCACCATGTCTTCTTTTCATGAAGGC
TTTTTCTCCCATCATCTTGGGTTAGCCGTGAGACACAAAGCTCGGATTTT
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TCGAAGTTGTGTAGTTTTTTGGGTTAGCGTATTTGGCATTTCTTTTCCGC
ACAACCCTCTCATTTAAATCTCGTCGTGTCTGCATGTTTCGGGTTGGTAG
AGAGCTGTGACATAGTTGTCGCTCTCACCCTACTCTTCTCTGGTTAAGCT
GCCTAGTGCCTGACACCAGTGGCGGAGCTTGACAAAAAACTCAGGGCGGG
CCAAGAATAGTGTTTGGGGAGAAAACGGCATGGAGCAGTGTGTTTGGACA
GAACTAACGGGGTTTTTATTACTGAATAATTGCTGATAGAAGAACAAATA
CTTTTGGGCTGGGCAGCCCATGGTACATGTTTTTCCTTCAATGTAGTTAT
GCCACTGCCTGACACTAGGCCATAGCTACTGTTGGGCCTGCACGGCAACC
GGGTGCTCCTTCCCACAGTAAGAACCTATCAAGCGAGTGGTCAAAGCCTA
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GGTTGTTAGCATGTAACCGTCTGTATGAGCCTATTACGTGGGGCTTGAGG
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TGAGTCCATCCAAATATATTCCTATTTTGTGCAGCAATATTTTGTTCGTA
AACACCACCCATCGAGAGTTTGACTATTAGATGATTATTAGGCTGAAGCA
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CTACCGGATTTTTTTGCCTATACAATTTACAAGAGATGTTTTACTCAGAT
AGTTAGAAAATATGGAGCTCCTGTTAGTTTGTCAGATAGCGGCACGAGTA
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GTTAGATCAGTATGTTTTGGGGCAGCATCCACCAGGTATAATAATTTTAT
AATTGCTCCCTTCGTATGTTTCAACCTGCCATACTATGTATCAGCATGAA
GCATATGATACTAAATCAATTGCAGAGTCATATTGTTGATGATTTCAGGA
TACCAAGTTTTCTTAATTTTTCTCCTATAAAGACCAGAGAGAATGTAAAA
TCATTAGTTGAACTTGAATGTAAGAAAAATACCTCCAGTAATTCCAATTT
TTGTGTAACTGTATCTCAAGGCTAATAAAATTCATGTGTCATTTTCAGTT
GCATCTGGTGCTCTTATCAGCACTTGGTGGTATGAGTTGAACCGGAGAAA
AGGGGTTAGGTAAGCATGACGTCAGTCCTCACTCAGTCACTCTTATTATG
ATCTCTCTGCAGCTTCCTAAAAATGAGTGTTCTGTCAGGGTTATTTGACA
GAATGAAGAAAAAAAAGAGTGTAGGCAGACATAAATATAAATTATGAGTT
GGCACCTTGCTTTCAAAAAATAAAGTTCATTTATTATTCCCTATTTTTAG
GACAGCAGTACATATTAGTAAAAACAAAAGAATGTTATTAGCCAGTTTTA
GACATGGTAAGAGAATATCAGTAAAAGCCAAAGCATACCTTATCTATACA
TCTCCTTAGTGGATATTTTGCGTTGGTTTTTTTGAACCATAACTTTGGTT
TTTGGGAAGAAGCACAGTGTGCTGCTACAAAGCATTTATTTAACCGTGCG
TTCGAGGCAAACATTTGTTTGTGTAGACTTGGTTGTTTGTGGTGTGCCAT
TTTTTCCTACATGGCATGCCCTTTGTTTTCCTCTGTTACCTTTATTATCC
TCTGGGATACCATAATTACTGCATCGGTCCTTTAAGTGCATCCGTTTGAT
AAATTGCAATAACTGAACATTATGTTTATCCCTTTCTTCTTGCTATATAA
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AGTTCTCTTGGTTCTTTCCCCTTTTTGTTGGATCCCCTTTTTGGTACTTT
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TCATGCATTAATCTTTGGTTATGTTGCTATTATTCAGTTTCGAGCTGTGC
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AGTGGCCTAAGGAAATTTTATCCCCCCACTCTAAGGTTGGTTAGTTTCAA
TATTACTGGAGTATTATTTTTATCCTGGGAAACCATCGAAAAAGGCACAA
ATAAGAAGCATTATGTACTTTCCAAGCCCTCCAATACTTTTTTGAAGATT
TAATTGAGTTAACTAAGTTTTTCTTTATATATTTCTAATGGTTTAATATG
TAGAATGTTATTAGAATTTCAGTTCACTTGCTCTAAAAATATGAAACAAC
GAGAATTATCTCTGTTTTGTTAAGCCAGCTAAATTCGCTATTTCTCTGTT
TGTTGCTTTAGCCTCCAAATCAGATGTTCTAGAGCAATCTTTAAATTACC
TTTTTATTTGACTAACTGCTTGGTTTGGTGAAGTATGACCTCTCTTATTG
CTTTCGAGTTTTAAATGCCACGTTTCCAATTGCCTTTTATGAGAGACATG
GATTACGTCTCAATGATTTTGTTATATCATTTTTTGCTTTCATGTCGTTT
TCTGGGATATACTCAAGTCGGTGCATTTTTTCTTTCCTTCAAAATCGTCC
CTTCGGATTACTTGGTTTATTTACTGCATCTCTTGTGATACAAGCAAGAA
CTCTGTCCATGATATTGGATTCCTGGTATAGGCAGTGTTGCTGTTGAATC
CTCAGTTGCTTGGCAGGGCAACAAGCTGGAACTCGTAACTGGCCCTGCAG
GTATTTGAGATCTTGTGGGTTTATGAAGGTGAGCTCCCGTTGGCTAAATA
AGGCATGAGGTTGCCTTGTGCCAAACCCTCTTTAATCAACTGCATACCTG
AATGTCTTGCTGAATGTACATACCTGGAAAGTTGTCGGGATTTACTAACT
ATTCCAGGTTTACACGGGAATGAAGGTTACTCTATATTGTGATCAGGGTG
AGCTGTCAAATTTTGGTGTGCGTATGTGCTCAAGTGATACTTGGCCTAAA
GACTCGCAGCTTCTTTTTTCTTTGGCTCATTACAGTTTAACATTCATGAA
CCGAAAACTCGGAAGCTGGAGAGCTCAATGAATTGGCTCTGCTCAAGCTT
ACAAAAATGGTTAAAGCTATCTATTTGTTTTGACAGGGTTGAAGATACCA
GGTTACTTGCGTCTAAAGTGTAGTACCCCTTGATGATGATTCAGAAGCGG
AATTCTTGGTTTAGACAAAAGATATCAAAGACTTGGATCGAGCAATAGAC
AATTATCCGATAAAATGGAGTAGAATTTTTGTAGTACATGTGTTGTAAGA
CAAAATTGTATAGCAAAAGCTGTATACTGAACATGTTTGTGTACCAGCTT
TTACTCATCGTAACAATGTACCTATGGTTGAGGCATTGCCAGTTTGTCAC
TGAATATATCGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.