Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031517

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031517
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031517
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGGTTTACTATCGTACTATGTATTTTTTTTCACGAACACGTCATAAT AGAATTAAAATAAATCCATATGAAATACCAAACATGTCAAATTTGGAGAG AAGCGGAGATCTGACAAACAGTACTATAGAAAAAAGATGTATTTTATACT CCCTCCATCTCAAAATAGATGTTATAGATTTATTAAATTAAATAAATCTA GACACTATTCAATATATAAATACATTGAGATTTAAATAAATTGTTGACAT CTATTTTAAGGCCCAGTTCTTTTTTGGGCTTCTTCGAGAAGCCGCCCTTC CCCAGCTTCCTGGGGAAGTGCAAATTTGTTTAGCCTTAACTATTTTGGAA GCCTCATAAATTTTTTGAACCGGCTTTCCCAGAAAGCTGGGGTAGGGCAG CTTGTGGGAGAAGCCACCAAAAAAACTGGGCTAAGACAGGGAGTATAAAA TAGTGAGGGCATGTTTGATTCAAAGGATTTGTATAGGAAATTTGTAGGAT TAAATCCTATAGAAAATTTTCCTATGGCGGTTGTTTGATTTGTAGGGTTG ATTCCTATAGGAAACTTTCTAGGAAATCCTTTGCACCAGGTTGCATAGGA AATCTAACATCCACCCAAAGCTCTTTCTTAGAATCCTAACAAACTTTGTT GCATGTGGGTTTCTATAGGATTGAAGTGAACATGACATTGCAATTCTATA GTTTCCTATTCCTTTATTTTTCCTATCCTATGAATCAAACAAGCCAGCCC CGAGGGTTTGGTTGGGATTAAGCTGGAAAAAGTTTGTCCGTTCGATCCTG GTACTAACACGATCCTGACTGTCCAACCCTGTGCAGAACGTTCCCCAAGC CATCCCCCTCGCTCCGTTCGTTTCGGCTTGTCCCCTTCCTCCTCACGCAG GACTACCTCGACATCCGCCGCCGCCCCTCCGTCGCGGTTGGGCCATCCCG GCTCGCCCCATTCGACTCCGCGGCCACTGCCGCTTGTAGCGGCAGCCGGT CGCTCGAGATCGACGTCATGCTGGAGAAAGACAGGATATCCTACTTCTAC GATGGTACGGCCGCTACGCCCCCCCCTCTTGTCCACTGTGCACTCTCCCT AACCACTGTACATCCCTAGCTCTCCCCTTAGTTTAAAGTCGCTATTCTTA CACCGCCTGCGTGTCTCGTCTAGCAATTTCGATGATAGGGGGAAATATTT CGTGGGCCTAGTGGTTCTTTGTTCTTGTTTCGCTGATTTGTTAATGGCTA GATGTGATCATGGGATATTTTCTCTAAATCTGTGCCGACGTTATACGGCG AAGGAAAATTTCAGGATGCTATGGGCTGTTGGATTTTTTTCGAGTAGAAT TGGTGGCTACCCTGTTCATTGGCCTACTATTTGCTTGAGTAGTTCAGCCC TAGCCTTATGTGCGTTATAAATTTGCATTAGTGTATACCTCATTCTAGGT CAGATAAGGAAGTCAAATGTAACAATTTCTCCCGTTATCTTTTTATTAAC AAGGTAGGCTCAGGGTAGATTATGTTCTCTCGCGTGCGTTCAGATTTACC TGATCCCGGTTTTACGACTAGCTCCTTTATTTAAGGTCCTTAATTACACT TTTTGTATAAATTGTTCAGTATGTTTTAAAGGTTTTCACTGTTCACTTCG TTATGATTGCTTACTTGGTTACTTTTGTGTGACCGAGCATCTCAGGGGAT GTTGGCAATGTGTACTTTGGGCCAAATCACCCGATGAAACCGCATCGTCT TTGTATGACACATCATCTCGTTCTTTCATATGAACTTCACAAGAAGATGG AGATATATGTCGGTATTGAATTCACTTTATTCCTTTTCTTCGTACTTACA AAGTGTCTAAATGTGTCTTTTACCTTATTTTGCTCCCAATGGATTTTGCA GAGACCCCACAAAGCATATCCAACAGAGCTTGCCCAGTTCCATTCTGCTG ATTATGTGGAATTCTTGCACCGGATAACTCCTGATACTCAGCACTTGTAT GCAAGTGAATTAACTAGATGTATGAATGATGACACTTTTCTCTTCTACAG ACTACTCTTCCAGGCTTTGCTATTTTCACAATAAAATACATGCCAAATAT ATCGCGGCTTATGTTTGGCTGCTAGTCACGTGTGGCTGTATATTTTTTGT CGAACTAGGTTAGAACATGTTTATGACGAGTAGGCCATGTTCCTAAGAAC ATGTGGTGCACCACTGCTGTTTATATTCCGCAGTTGTTTATATCAACCAA ACGCCAGCAGCAGTTAGTCAAACTTGTGTAACTTCAGAGTGGCACCAATC GAATTCCCCCAAATTTACTTACCTGGATCTAAGGCAGTTCTATATTAGCT TAGGTCTTAAGATGTATACTTAAAATAGAAGCAGAGCATATTAAGATGGT CTGATCTATCAACAAATTTTTGTATGCAAATGAAAGATTAGCTGTTTCCG CTTAAATGGAAAACTGTCTGGAATACTTTCCACAATATGCCTGTTTTACC AAATGGTATTGCTATTGGATGAATTATTATTTTACTTCACTTATCTGATT TTTTTTCATAAGTGTACCCAGTTAAATTTTGTAATCATTGTTGCCAGACA ATCTTGGAGAGGACTGCCCTGTCTTTGATGATTTGTTTGAGTTCTGCCAA ATCTATGCTGGAGGAACTCTAGGTATAAAAATTGTCAATGCTTCTTTCTG TTTTTTTATCTCTCTAAGCTGTTCTTTATTGTTCAGATGCGGCTCGAAGA TTAAATCACAAAACATGTGATATTGCTATTAATTGGGCTGGTGGGCTGCA TCATGCAAAGAAGTGTGAGGCGTCAGGCTTCTGCTACATTAATGACCTGG TTTTGGGCATTCTGGAGCTTCTCAAGTATCATGCTAGGGTTCTCTATATT GACATTGATGTTCATCATGGAGATGGAGTTGAAGAAGCCTTCTATTTCAC TGACAGGTCCACGCTTTCTTTGAGTAAAAAACATGAATGTGTAATTATTG ATAGTTAGTTATTCTTATGTTTTCACCATATTTTTAGCTTAGTTGCTATT TCTGTCTCTGTCTTCTAATGTGGGTATTGTGACGGTAATGTATAATAGTG CCAGTGTTTTCACGAGCCTTTAGATTTCTTATCTGATTTTGTACTATATA TTTGCAGGGTAATGACTGTAAGTTTCCACAAGTATGGTGACATGTTCTTT CCTGGCACAGGTGATATTAAGGTATGTTCGAGTTCGACTGATGAATACTC CCTCCGTCCCAGAGCTTAAGGCTTATATTATTTTTGAAAAGTCAAGTTAC GAAAAGTTTGACCAAACTTTTAGAAAAAATTATCAAGAATTATGATATTA TATAGATACCATGTGAAAATATGTTTCATGATGTATCAAAGGGTATGAAT TTCGTATTGTAAATATCAATATTTCTCTAAAAACTTGGTCAAACTATACG TTGTTTGACTTTTGAAAACAAAAGCCCTAAGCTCTGGGATGGAGGTAGTA TGATATTTATGTTGTTGCCTTTTTAGTTTCACAGGTTAGTTCATTGTTTT TCCCCTTATAATGCAGTCAGGGGTTAGATCCTTATCTATATCTTAGTTTG TGCTCACTGTTAGGCATGAAGTGCATGGGGTTTGTTGTCTCCTATTTACT GTATGTCAGTTAAAGTTGGCATTTGAACTCTTAATTGTGTGAAACAACAT AACAGACATTTATCAAACTGAGTTACAACGGGTGTTGGCATAATGTTACC TCAAAGTTGATGGTACTGGAGGTAATCAATAGTTATAGAAACCATTGCAA CATACTTCAGTCCGTTGCTTACTTCACTGCCTCCTGTCCTCCTAGATGCT GCAAATATGTGACAGATGTATCATTGAACTCTCGTTCCTTTACTGGAGAA TCTTGGCACAGTATTCTATCTAAATACCCAGTATAATATTTGGGAATAGT GGAGGTTTATAGTCTATATATGATAAACGGTCATGCTCTAAAAGGATTTT CTTCATTCTGATGCATGCAATTAAGTGAAATTATCTATCGTCTGAGCTGA GAAGAATAGAAGCCGTTAAGTGACCAACATAACTGTTTCAGTCGTGCTTG AACTACCACTTGAAGCTTCACTTTATCGTTTTTTCCATGGGTCATGATGT TTTCTCTTGCCAGCGATGCTTCTTTTGCTCATGTATGTGTGGGTCTGAAT GAGTGAAGGGTTTCTTTATCCAGTTGCATTTTATTGAGCAATTCTCCAAA CAAAATTCTCTCATTAACTGGAGTTTTAACTCTCAAAGTAATGGAAAAGG CACGGTTCGATACGAGCACAAATATGTGCCTTTCTGTTTATAAACATGTT GAATAAAGTTGGCACCTACAGAGCTTGCATCTTGCTTTGCCTTTCTGTTT ATGTATGTGCTCTTCATATCGTTTTATTTGACTGTCATTTGAAGGATATA GGAGACAGGGAAGGAAAATATTATGCCATCAACATCCCACTTAAAGATGG CATAGATGACACTTGCTTTACTCGACTTTTTAAAACGGCAAGTCAATGTG CATTATTTTATGGTTATTTTCATGTTTTTGTTCTCTAGTCTTATCAGGGT ATATAATTTTGCTTATCATGTAGATAATTGCCAAGGTTGTTGAGACATAT CTACCAGGTGCTATTGTTCTTCAATGTGGGGCTGATTCATTGGCGCGGGA CCGTCTAGGGTGTTTCAATCTTTCTATTGAAGGTACAATAATTCTTAAGG ATATTAAGTGTGCTACTCATAAATTTGCCAAGACTGCATCCAGATATATA ATTAACTAAGCCGTGGTTAACCTTTGTCTCCACTTAATTCTAAATTACCG TATTTGGGGGATTTGTTTTGCATCATTTCGTGTTTAACTTGTTTGTTTTC ATAAACAGGTCATGCTGAATGTGTAAAGTTTGTGAAGAAATTTAAAATTC CCCTGCTGGTATGGGAGAAAACTATTGCCACATGATTTCATTCTCTTCTT CAAGGATGTCCACTTATTTCCAAACATGCAGGTGACAGGAGGTGGTGGGT ACACCAAAGAGAATGTAGCACGTTGTTGGGCTGTTGAAACTGGGGTCCTT CTAGACACAGAGCTCCCAAATGGTATCTCATTTCTTTGCTCTGTCCTCTT AGCCTTCTTTTTTGAGTTACAGTAGCTAGTAACCCTTCAATGGTAGAAAC ACTTTGTCCTGTATTATTTTCCTTATTTCTTGGTCTTTTAAGGCGAGAAG TGAGAACAAATCCAATAGTGCCCTAATACTCTTGGCCTCTTGCCTTGTGA ATTTTTGTTAGTGATTCTTCCTTAATGGTTATCCATGGTCCAGAGTTTTA CATGGCATTTTCCTTGCAGAGATCCCTGACAATGAGTATATTAAGTACTT CGGTCCAGACTATACATTGAAAGTACCAAATCTGAACATGGTATGAATCT TTTCTGACTGTGCTTTTCTTTTGCTCCTATGTCTGTCTGGGGTTTACAGA AATATTTAACTGCTGTTTGGTGCATCATCCTTTTAAAATATCGAGTATGA TCAACTAGAATATCCATTTCTTTCTCTAGGGATGTGTAAATGCTAATTGT CTTTGTATTGTTTAATGGAACAGGACAACCTGAATAGTAAGACCTATCTC AGTTCAATCAAAGTGCAAGTCATGGAGAGTTTACGGGCCATACAACACGC ACCTGGCGTTCAGATGCAAGAGGTTAGTTTGTACTCACATTCGCATGTTG AAATATCCCAATTGAAACTGAATACAATCAGAACACTAGAATATGCCTTT GCAAGTTTTGTTGCCTGTTTTTGTTGCTTCCATCAGTATGTGTGGTTTCT TTTTTTCTGAACAGAGACCGTATACTGGTATACATGACGAGTCATCTTGC AGGTTCCACCTGATTTCTATATCCCAGACTTTGATGAAGATGAGCTGGAT CCTGATGAGCGCGTTGACCGTAAGTAGACTACCTCTGGCATGTCTTATGG TGCCCATGTGTATGCGTAACAACTTTGTAGTTTGTCCTTGCTAATTCGCC GGTCTCTCGAAGCATATGCATGGCACATAATAAGATTTTTCACTTGAAGA AATGTGATCCAGTTTATTATTCTATGTATTCTTAAATATGCTGTATTCGT TTCCATTCAGTGAATTCCTTACCTGTACTGTTTTGAACTTCTTCATTGTG CTTCTTATGGAACTGTTGTTATGTTTTGCAGAGCATACCCAAGACAGGCA GGTTCACCGTGATGACGAGTACTATGAAGGCGACAACGACAATGATCATG ATGACGGCACGCATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.