Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028893

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028893
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028893
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGATAAGGCCCCCAGCGCCGTACGAGGTCACGGACGCTCTTCCCAGCCGC CGATCACACACGCGCCACAGCCTTTCCCATTCCCGCCATGGCAACCACTT CCCTCGCCGCCGCTTCCCACCACCATCGCCACCACATCCTCCTCCCCTCC CGCTCGAGCCCCAGAGCCCCCAATCGGGTCCGTCTCTGCCCCGCCTTCCC GTCCATTCTCTGCTCGTCCACCTCGTCGGCGTCTCCCCAGCCCACCGCCG GTGGCGAGGAGGAGGCGGAGGACGAGGCGGCGAGTGGGGGGAAGCTGTCG AAGCAGTCCTCGTGGGAGGCGAAGGATGGTCAGGGCGACGACTACCTCTA CCGCCTCGGGAAGGAGGCCGAGAACATGAATATCGCCGTCGGAGCCCGGA GCGGCGTCATCGACGACCTCTTCGTCGGAAAATTCCTCGGAAGAGACTGT ATGCTCCCCACTGCCCCTCCAATCAAGCCATTGGATAAAACTTGGTAGCA GTTAGTATAAGCTTAGGTAGAGGATAGTACATTTCTGTGTGTTCAGAATA GTACATTTCTGTGTGTTCACCAATGCACTAAACAATCACTGGAACTGAAG AGGCTGATTCTTTAAGTTCTTTTTTAACTGAAGACCTTGGTTTAAGTTAT ACAATATTGACAATTCCTTGTGGAATGTGGCTGCAGCCGATATCGTGTTC GATTACCGCCAGAAGGCGACGAGGAAATTTGAGTACCTCCAGGGAGATTA CTACATCGCACCCGCCTTCCTTGTGAGTTTGTTTAATTCATGGACACCTG TTCTGGTGTATCTAACCATCTTCTTCCGTGTTGTTATGTTCTTCTCAGCA TCTGATTGACAGATATTTGACACTGCAGATTCGTTGTGTTACAGGATAAA GTCGGTAAGCAATTCTAATGCATATAAGGAAGTTCGCGACATTCTTGTAA TCAGGTATTAACGTCTCAATATTTCAGTAAGTGCATTTCATTTGAGTCTG TGTCTACATATACAATGCTATTGCAGTATGCATCTATGTACATGAAACTC AACTGTTCAAAAGAGCCAACTGTCTGGCTACTAAATTCATACCGGAAAGT AATTTTGGTGACTAGTTGCCAGTTCATCCTGTGTTCTCTCTATACCCTAG AAACACTATTCTTATACAAGGGCGTGCGAATGGCAAAATATACTTTACTG AATGGATGATCAACATAGAGCAATCAAGTCAACCTGTTAAAATAATGGCA AACAACGTGTGCAACAGATGAAGTAGTAGCAAATCGTGTATGTTCTTTAG TAGAGACTCTGACTCTGCTGAACCCATCTAATTAGTATCTTGGCTTTTGA GAGGTAAGGTTTAAAAGACTAAAACATATAGTATTTTTTATTTCTGTAGT ATATTTCAAGATTCGACTGGTAGTATTTGGTACATTTTTCAGAGGTAGCT ATCATTTGCTTAACATTTTTTAATCTTTTTTCTCCAGGTACATGTGCTAA AGGACTGTTTGTTGTTTGCAGCCATCCACATTGTAAAGAACTTCCTTGCA AATAATCTTAATATTAAGATTCCTCTTATACTTGGTAGCGTTCTCCACTC TTTTTTTTTTCTTTCTGTGTGAGTGTATAATATGAAAAGGAATGAGTAGT ACTGTAGTGTAATCCAGTGTCATGCTTTATTATTTAATGATCTTGAGTAA CATTGCACCATGCAGGTGTCTGGGGTGGAAAAGGCCAAGGGAAAACGTTC CAAACAGAACTTATATTTAAAGCAATGGGTGTTGAGCCTGTTATTATGTC TGCTGGAGAGCTCGAATCTGAAAAAGCAGGTCAAGGAACACCCGAATTAA TCTATGTTTGCATTCTTGGTTTACTATGCGATATGTTTGCTTGTCAGATT GATGTCAAGATGTAACTCATTTGTGTTCATGTAAACGTCAAAACCAAACC CTTATATAGTTGTTTCAGGCATTGTTCGTTTTCCTTTATTAACAGTGAAG AAAACTGACACCTTAAACTTTTGACATCATTTAGAGGCCATTAAAGTTTT CATTGACTTACATTAATGCACCGAACGTCTGAAAGTTATCTTGTATTTGC CTCAAGCCTACGGCTAATTGTATCTGTCGTTAGTTATTCATGTTTTTTCT GCTCATGTTGCAGGAGAACCTGGGAGGCTTATACGTGATCGATACAGAAC GGCATCTCAAGTAGTTCAAAACCAAGTAAGAAGGTGTATTCATATACTCA ACTTCATAATGTGCCTTTCAGATTCAGTTTTCTGAGAAGTGACTAGTGAT CGTGAAAGGAAATATTATTAATAATATTACAGACTTATGCATTAGCACAC AGTACTTGATCATTTATGTATGTTGACGGGTAGCCTTACATACAAATTAA CTCTAGCAGCCAAACTAGCTTGATGACTTCCATTTCCATAGTAGAAAAAA GAAGCGACCCAGGAGCAACAGCAGTCTAGCACCCCGCATATTCTTAAGAA AAAGGTGTGACTCAGACTAGGATTGCTTGGCAGCACAACTGTGTGTCCTC CTATTGAACTACCCACTGATTCCTTGTATATAATAATTGAAAATTATTTG AGAAAAGCTTCTAGCTCAAGATTGTTAACGTGTGATAGGGGAAATGCTCC TGAACTACCAAAGATGGTCCTTGTTACTCTTTTATCATCTTAATACAGTG TTTGTATCTTGTGACGATGAAAATGTTTTCATGACTTGGAGCTTACATCT CCCAATAGTTTCAAGTGCTCCATAGTGATTTACTCTTTTGTGTCACTACC AAATCATTATGCTAATGTTGCCATACTGAGATGCTTCTAAATTTTTCCTT ACAAGACTATGCTTTCACAAGTTTTTGATGTTATAGGGGAAAATGAGTTG TTTGATGATCAATGACCTAGATGCTGGTGTTGGAAGATTTGGTAAGTCAT TTATTAAACATACTTAGATGGCATTGTTGATTATGGTGGACATGTATATC TATTTTTCAGCCTTTTAATCAAGAGCTTGGATATTTGGTTCATGTGTCTA TTTTATTCGTGTGTGCAAGACATGTTTTTCAAGAACTGAACCTTATATTT ACATGGTTGAATATTATTAGAGTTTATCATTCATACATATCGATATTTCT ACTTGGGAAAAAACCTAACTACTATAAGTTACCGCTGTTTCCAGGAAACA CACAAATGACGGTCAATAACCAAATCGTGGTTGGAACTTTGATGAACTTG GCGGATAATCCTACCAGGGTTAGCATTGGGCAGAAATGGAGAGAATCTGA TATAACACATAGAGTGCCAATAATAGCAACTGGAAATGACTTTTCAACAC TATATGCTCCTTTGATTCGTGATGGGAGGATGGAAAAATTCTACTGGTAT GTTTGTCCTTGCATCTCAAGGAATCTTGTTGACCAACTCGAAAATATCAT TTGCGCTATTTTATTTTTGTTCTAATGCTTTGTATTATTTGGCGCCTGCT TAGGCTAAGTTCTTTGTTTTACTTTTCTGACACTACAGAAAATAAAAATT CCCTATAAGCAATTATCTACTTCAAAGATTGTCTTAGTTTGAAGATTAGC ACCAATTTGATATTCTTTCACCATTTTTTGTTAATTATATGTACTTTCAT GCCACTTACTTAAACCAACTAGGACATTTAATTTATTCAAGAAAAATTCA AACCCTTGCACTTGATGTGTGATCATTTGTGCTTAACAGGCAGCCCACCC GTGAAGATATAATTAATATTGTTCACCGTATGTATACGAAGGATGGGTTA TCTTCCGAGGAAGTGTCAAGGATTGTAGATACGTTTCCAAATCAAGGTAC TCGTTTCAGCCAAACTGTAACTTCTAGTTTGCAGCGCATGAGGCTTGTGT GGTTTTCGATGATGGAACATGCTGTAAAAAGTCCATTCACGTCATTTTGT GCCTTAAATATTTTTTGTTTTGTTTTTTAAGATATTATTTCGGGGCTTGA TGTAGTAAATTCTTATTTCAGATATACATGAGAATGATCTTTCTTCATTT TTTTTAATGCATTCGTGTTTCAGATGTACATCAGAATTATCTTTCTTCAG TTTTTTAATGCATTCATACCTAAATTTCATACGCAATTGTTTTAATACTT GGAGAATTGTTTTGGCCATGCAATAGCCATAGTAATAATTTCTGTTGTTT TAAAAACATTTGCAAATTGGACAGCTTTGGAGGAAAAAACGGTTGTTGTA CCCATGGGTTTTGAATATGTAAAGAAAAGGGGAAATAGTTGTGAATCCTG TAATCCGCTTATCACAAAAAAAATGGTAGAGCCCTGTTTTTTTTTTTTTG AAGGGAGTACATTTTTTTGAACATATTGCATCCATGGTCATAAACCAGTG CAGAACTGGTTCAGACGTAGTGTTTGATTATGTTTTGTTATGTTGATCCA CAAGTCTTTAAATGATAGCAAAACCATTATGTCTAAAAAAAACACCCCTT TCTCATTTTTAGATTCTACTACGCTGTGTGTCTTGCTTCTTTAGTTATTG ATCAAAATTCTCTTTTTCTGTGGAAAGAAAGTACCTCTTTTTGCTTCTAT ATTAACTTATTCAAGATGACTTCAACTTGCTGCAGCTCTGGACTTTTATG GAGCTTTGAGATCTAGGACATATGACCAGGCTATCTTGAAGGTACTTATT TTGATTTATGACATTTGATATGAGGTTTACGTAGAGACCCAATTCATATT CTTATGGTTGATTTAGAAAATATGTTTCCATGATGTTGTGTTGTGTATGT GCAAAAAGGTCGTCTCATGCATTAGAGTTTATTTACACATTTTTCATAAA AAGAGACAGGGTTAGGCTAACTAGGTCGTGTTTGGTATGCAACAACAGAA TATTTACACAAAGTTTGGCAATGCCATTCCCAAATGTGTCTTTGTACCGT CTAAAATTGTTCTTCAGAATTTTCCAAGAGAAATAATTTATCATTCTTTG AAAATGTTCTGAAGAAATAGCTAAAACAATTTTTCATGCTCTAACATGTG TTGCAGTGGGTAAATGACATTGGTGGTTATGAGCAACTAGGTGAAAAGCT TCTCAAGCGAAAGAACAGAGAGAAGCTTCCAACATTTATCCCTCCAAAGG TATTTAAGTTTCAAGCAATGCACTAGCCTTTCAATATCACAGTAGATGTA TTGGCTGTTCTCTCTTCAGTTGAGAAACCAAATCCTATTTCCAATTTCTA ACATCCTGATATTCTTTTGTGTTTTCTTCAGCCAACAGTAGACGCGTTGA TCGAGTCAGGGGACTCTCTGGTGGCAGAGCAGGAACTGATAATGAATTCG AAGTTATCGAAAGAATATATGAAGAACTTAGAAGACTAGTCCGAAACTCA AAAAACAAGTAAAACAACCTACATCAACCACGTCAAGTATATATTTTTTC TGCTTCCAGTTTTCTGTGAATTGCACAGTCCCTGCAGATGAGCTGCACGT AGTATATAACAGAAATGTAAAGAAAAAGCACATGAAAATATATATAAGAG CATTTTATTTTCCGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.