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GrainGenes Sequence Report: AA027681

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Sequence
AA027681
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027681
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAAGATCGGCAAGGCAGCACAACACCAGAAGAAGGCTGCTGCGATGTG
TAAGAGCAAGACGGGCGTGCTCGCGGGAAGGCTCCTCGTCCTCGCGGTGC
TCCAGCGCCGCAGGATGAGCTCGGTCGCTGTGATCTCTCACAAGATCCAC
GCTCTTGTCGGCCAAGCCGTGGCTGACAGGGAGAGAGTGGACTGCCACAA
GTCTCTCGTGATGCGCAAGGTCGAGAATATACAGGTTGGTGTGCATGGTT
TTGACATGCCCAACGATCTCTCGTATCAATTGGCTCAGTTCGATCAGGAA
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GCGCACACAACACTGTGGTACTCGTCATCCTATGGTCCATATGGAAATCC
CGCAATAACACGTTGTTCGATGCGGACCTCCTCTCTATGCATTGGATCCT
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GACGGAATCCGGACGTTTAAATGCATTGCACCGCATACGGGGCTTGGACA
CTCGCTAGAGTAATAGTTGCATGTATCGTTGTTAAGTGTTAACACTTTTT
ACCAAGTGTTGTTTGAAAGCAATCGATAAAAAACACTCGGCATAAAAAGT
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GCGCTGCGCAGCAGAAATATCTTCAGAGTTTAAGAGCATTTTTAATGGAG
TCCTTAAACGCTCAGCCTCGGCTGCTGTACTCACGATTTACAGGTTCGAG
TTTATCGGCGCAGATCGGAGCCTGTGAAATCAATCCGTAATTTGAATTTT
AAAAACTCTAGCAAGAAATTTAACGCGCGAATGTACTAGTTCGTCGGCAG
ATCGAGCAGTTCATACAAAATACATCAAGATCATTAAGAAAAACTTAAAT
AGGAGGGGGGACAGCTCGCCAGGGACGCCGGCGCGTCCACATGTGGCCAA
AATCGAGCTCTCCGTGAAGACCGGAGCTCCGCGCCGTCCATCTAGTCGTA
GAGGACGACGCCTCGCTGGAAAGAGGGTAGGAGAGCTCGCAGTGCCTTCG
CTTCAGGCAGGCATGCGACATAGGGCTCCAGCGAGAGGGGCGGCCATAGA
CCCTTGTTGGTCTAGCGGCGCGCTGCCCGGCACTTGGCCGCGATGGACCG
CACTAGCTTCGCGGCCGCCTCGTCGAGAGCAGGGATGCAGGGACGACCAA
GGGAGCGGCCGCCGTCCACCACCTCCTCCTCCGCCGCTACAACCTCCTCC
CTGCCTGCATCCGTCGTGCAACATTGACATGGCGAGGGCGCCGTCGTCGA
TCCGCAACTGTCGTGGCCTGATTCGCTTGCCGGAGGAGGTTGCTGTGTGG
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GTAGGGGATGTGGAGGGTGGTTTAAGGGGCCCGTGAAAAAAAGATTACAT
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TCATGCATCTATCACGAGATTGGTTCCATGCGTACTGCGTAAAACACAAT
TGATAACTAACCAAAATCTGGGAAAGTGACACGCACACGGTTTACAATCT
TCCGGTGTGCGCGTACCTAGCTTTACAATCCTCCCATGAAAATCACACGG
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GTCAGACCATCATCAGCTACACTACTAATTAATAAATTAAAAGAGATTGT
GGAAATTCGGGATCCCAAAGCAGTCAATCAGCTGAGTAGGAGGAGCAAAC
CACCCGCGCATGATGCTGCTGCTGCCGACATGGAGGGAGGAGAACGACCT
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CTTCTATGCTGCGACGACCTCCGGCCGGCCGGCACATGACAGCTCTCTCT
CGGCAGCACTCGACGCTGCCTCGTCTCAAGGCCTCATTCATTTTATTAAT
CTATCTGAACGTGTGATTTCTCCATATTTATCTGTTTTTTCTCCACAAGT
GATGTGTCCGTGTGTGACCCCCTTTGTGCACTCATACCTCTATTGCTTGT
TGGTACTCCCTCCGACCCTTATTAATTGATTTGAATTTGTTAAAATTTGA
ATGAACCTATATACTAAATAATGTCTATTTTAATGGAATATAATTTATAG
ACCAAAAGATCAGGGTGGTCTCGGTATCGAGGTTCTTGACATAAAAAATA
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TGGCAAGAATTGCTTTATAATAAATATTTAAGTCAAAAAACTTTGTCTGA
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TAAAGAATGAGTTCTTCGCTCGAGGTCATTTCAAAGTTGAAGATGGTTTG
AGTATTAGGTTTTGGGAGGATACATGGTTGGGTAACACCCCGCTAACACA
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AGCGGTAATAAGTGGAATGATTGGCTGCATTTATGCCAAAGGCTAATGAT
GGTCCAGCTGTCGGAGGATGAGGATAAGTTTGTATGGGACTTGACCTCAT
CTGGGGTGTTTACAGTTAAATCCATGTATGAAGACCATATGAATGATCAT
ACGGTTTTTCTTCGGCAATATCTTTGGAAGTTAAAAATCCCACTCAAGAT
CAAGATTTTTATGTGGTTTTTTAATAATAAGGTGTTTCTCACAAAGGATA
ACCTGGTTAAAAGAAATTGGGTAGGGTGTGCTAAGTGTTGTTTCTGTGGG
GCACAGGAAACCATAGAACATTTATTTATATCTTGCCCTTTTGCTCGCCT
TTTATGGCGCATTACTCATTTTGCTTATGATCTACCCCTCCTACTAATAT
CACAAATATGTTTGGAAATTGGTTAAATGGTGTTGATAAATCATCTAAGG
CTCGAATTCGAATTGGTGTTTCAACCTTATGTTGGTCTATTTGGAGATGC
AGAAATGATATTATATTTAACAAAACAAAAACTTTTAATCGTTTGCAGGT
TATCCATATGGTGGCACACTGGGTGCAGCTTTGGGCGTTCTTGTCGCCGC
AAGACCAGAGGGATATTATGGCTACTGGGTGCAGCCGTCTCCTGATGGTC
GTTGGGCACATTTTCGGCCAGTCTGGATGGCTGCGTTTTAGTCGACTGGA
GCATAATGTCTAGTCATCTATTTAGTCTTTTCCGCTGGTTGATTCATGTG
TCGACTTTGTGTGATCCATGAATTGTAATCGTGGTGTGAGTTGTCGACTT
TGGATACCGAACTTTTAATAAAAGGTTGTGTGCATCAATCGATGCAGAGG
CCGGGGTTTTACCCCTTTTCGAAAAAAACTAAATAATGTTTAGACAAATG
TGAGTCAATTAATATGGGTCGGAGGGAGTAATTAGAATGATGCAGATGCT
GCACCTGTTCGATTGGGTGAGGTCGCCCATGATGTTGGATGACTAAAAAA
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GATATTAACTTATTGGCAACTGATTTTGGTTTTAATTTATGGGTTTGAAC
TCCATCAAAATCGTTGTTCATTGCACATATTATAGATCCATTCCTATTGT
TTGCTCCGGATCCAAAAGTTTCAGTGGTGAAGCTCTTTTTTGGAAACACA
TGTTAGGCTGAATGCGCATCTGAAAGACAGAAACCAAGGTGATATTATCC
CGGCGGCCGCACTGAGCTTGTAATCAAATTTACAGGCTGATTAGGCTTTA
AAGAGAGGCTACGCTAGTACACATTGGTAATGGTTTAAGCACTGTTTTTT
GGATGGATAAGTGGACAAGTGATGGCCCTTTATACATTCTCTCATGCTCT
AAGACTGGATATTACACTGGCGTAATGCAGAACTAGGATGTGCTGGGTGG
TGCCTATGTGTCATATTATATCAGAGGGCCAAGAGACAGCTTGGAGCATT
AATGATTTTCCTAGATAACTGTAATTTGGATTCATCAAGCATCGACAAGA
GGGGTTGGCGGTATTTCTTGGTGAAGAACCTATACCAACTCTGAATGGCA
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TGGTGATCATCGCGACCTTCTGGAGTATGAAAATGTTTTAATGGGATTAC
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GCACAAAGTAAGATGCATGAACTGGAAGCAACAAGTGAGATGGATGCAGT
CCTGGCCCAACTACAGTCCCTTTTTTCCAACTCTATAATCTGACCAGGTT
GGCGTGGTCCTATTTTTAATTAAAATCAAGTAACGGGAATTCTCCCAACC
TTTGCCCAAAAAATGTTATGATTTTAGGGTGGAAATTGGATTTTTTTGGG
TAATCAGTTCTCTTTGTTCATGATCCAGAATTGTAATATCGGGAGCGGAA
TTCTCTTTATTTCATCAAAAAAAAGTTTTCAGGGTGGAAATTGGATTTAT
TTTAGGTAATCAGCTCTCGTTATTCATGATCCAGACTTGTAATATCGGTG
CGTACTTCTCTTTATTTCATTAAAAAGGTATATGTGGATATTATATTTGG
TTCCATTAATTCATGAATTAGTTGCATTGTAACCTTACCTGATTCATGCA
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TCATGAAAATGCATAAAAAGTTGTATAGCATTAATCATGAACTGACCTAA
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TATACAAAACGTACAGGGTTGCATAATGCAAAAACACTAAATCTGATATC
CTTTTTCTAACAAAATAAGCACAAATCTTGAAGAAATTGACTTTCGGGAT
AGCTAAGGGACTTCCAACCTGTTGTAGGGTTGTATTCCCCCGTGTTCCTC
TCATCTTGTCATTTCCACCACCAACCGCTTTTCTCCTCATGACCATGGAT
CGAATTACCATGACAATTTTGGTAGATTGGGTCAATCTGCATCTCGACTC
CCCCAACGATATATCGGCTTTTCTCTACTTTATCTAATTGCTTAGCTCGA
GGAGGTGAAGGCCTTTGCCGATTAATATGAGCTAGCGGTGGAAATGGGCT
AGCTGAAGTAGCGATGTGCATAACCACGGAACACGCTGTGAATATGTTGA
AGCTGAGTGGTTTTTATGAAACACTGATGTATATTTATTCTTCCGGTGCA
ACGCACGGGCACGTGTGCCAGTGATTTCTAATAATCGAGTCTTTTTCTTC
CAAACTCCGTACTGAGAACCGCCGACTCTGAGCAATTTCTATACACGAAC
ATGTCATCTATCCCATGCACAACTAAAGCAGATCTGACTGCAAAGTGCAA
AGGAGAAATGTCTTCTCGGTACTCTGAGAACACAAAGTCACGAGAAATGC
AAGCACGTCTTCGCACTTCTCCACCGGCCGCCTTCTCAATTCCCATGTAG
TCCTGCAAATAATGGACTTGGTGCACCAGTTTAGTCTTCTTTTCTTCTAA
CAAAGAAGACGCACATACTTGTGTTGCTTCCTTTCCTTACCGCCGATATG
TGGCGAAGTGCCTGCAATTGGCGTGTTCTACTCCATCATGTTGTCACAAG
CTGCACCCGTCGACGTCATGAGAAAATGTTAGAGACTCCCATACATCTAT
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ATGAAGCTCAAGGAAACTGCCAAGAACGAATTAAAGTTAGCGACACCGTT
TTGTTTTTCCTCGTCATTCTGGTTAACCCAACATCAGCTACTACCACTTG
TAATTAACCAAACCAGATACTGGAAATTTATATGCTCCTAAAAGAGCCAA
TATGTGCCCTGGCGCATGTGTCCTTTGTGGCCTAACTGGAATATTTTCTC
CTATGATTTCCCACGGCTAGCTTTCCTTGCCTCTTTAGCTTGCTTTCTAC
TCCCAACATTCCCATAGTGCTAGGTCCACATTGCCATGCTCTATTCTCCG
GATCTTCCTTTTGTATGCTCGGTTTCCAAAGTTTCCTTTCATATGCTTTC
CAAGATGAAAAGTTGGGTCGCATGACACGAGCAAAGTTCTACTTCTTCAC
ATGCACGCCCAGTTCCTCACTATAAATACTATCTTGGAGCTTCAGGACAA
GCAGGCCCGTGAATAAGTGGCATGCATTGCTCCCTCTTCTCAGTCAAATA
CTCCTGCCAAGCTTTAATGCACCACGGCTCCCTAGTACTAGTTGTCTTTG
ATAGGGAGCTTCATCATCTCTCAGCCATCACCGCTTCTTTCACGTCTTCT
GCAGCGAAGATGAAGATCGGCAAGGCACCAACACTCCTGAAGAAGGCGGT
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CTGTCACGAGGCTCTTGAGGTGCGCAAGGTCGACAAGATGCCAGTGATCC
ATCGTGGTGAGATTGTTGTCAATCTCTCTCGCCAATTGGCACTGTTCGAT
CGGGAGAATGAAGGTGGTAGTGGCTGCCCTGACTGGACTCTGCACCCCAT
CTTCAATGACCACGATAACAGCTACCCTTGTCACATTGACGAGTGCGAGG
TCGATGGCGAGGAGGATGGTGATGATGATGTTCTTCTCAATATGTACCAT
GAAGACGGTGGTGAGGAACGGTCAGTCATGGATGTAATCAGGAACAACAG
AGAGGTTGAAGGTTTGGAGTTCAACTTTGATGACGAGATCGATCAGGCTG
CCAATATGTTCATCACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.