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GrainGenes Sequence Report: AA006258

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Sequence
AA006258
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006258
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGCCTCCTCCCCTCGGCGACCTCACCCACCTGCTCGCCGTGGTAGC
CTCCCGCCTTTCCCGCCCTCCCGGCGGCGAATCACTCTCCGCCTCCATCT
CGTCCCTCGCGACGGCCCTCAACCCCAGCGCCACCGCCTCCGCATCCGCC
TCCGGAACCAGGGTCCTCGACGCCGCGCTCTCCCTCATGTGCTTCGACCC
ACAAGAGGCAATCCCCCCGTCTTCGACCACTCCAGTAACCTACCTCCCTT
CGAGCATCGGTTGGTTGCTGATGTAAGCGAGCGCGCGTTTTCGTTGCAGG
TGGATAGGTCTCGACTGAACTACCTGGTCCGCACCATCGTCTCCGCGCTC
ACCGAGTCGGTCTCGTGCCGAGTGGTCCGGACCGGCGAACGGAACGGCGG
CGGCGGCGCCGCCGCCGCAGAGATGCTCTGCTTCGGAAGCTCCGTCTCTC
CAGGGGACTGCCGCGAGTTGGTCCGCTCCTGTGCTGCCCTCGTCGAGAAA
TTGGGGGATTCTGACAGTGAGATTTCTCCCCCCTCCTATTCTTTTTCTTC
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ACTGAAGGTGTTGTTTCCTTTAATGTCGATGTTTTGTGATTTTCTCTTGT
GCAGTTGCAGGTCACTCATATGATCTCCTGCACGCTGTTGTGAAAACGGC
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GCTTTGAGTATAGGATTGAGTTATCTTATTTGTGTTTATATTAGGTGACA
ATTTCTCCTTTTGCCTGACTTGAGGAAAATCAGCCTGCCATTTCTTGTAC
ACATTTTACTGATTTGCATTGCATTTTGTGTATGTTTGTGATAGGGCCCT
TCTGTGGCATCTCGATCCATCAATTCTAAAACATGATCTTTCAGCGATGC
TACGGGAAGCCATTTCAAGGCCCTTGCTTTATCTGGGAAAAGAATTACAT
GATCGGGTAGCATGGCGTGTGATTGTAATATGCTTGGTTTGCTCCCCGCC
TGCATTCTTGGAGATGCAATCATTATTCCATATCTGGTTTCTTGCAACGT
AAGTTCACACCTCATATTAATTGGTACTAACTGATCTATATTTCTGTGTG
GCTCTGACTTCGTGTGTTTATGTCAGTTGGCTTCTCCAAGCATTTTTACA
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TGATACCTGCAAAGTTGAGTTCAGTTTAGGAAACAGGGTAACGGGCATGG
GAAAGTGAACTCTGCAAAGCTTGGAATCAAAATACCTGAAAACTGGACAT
GCATTTGTATTGTATTCATTTTAAAAACTCGTTGTCTGTTAGTTATTTAG
TCTCTGGAAATGGAAACATTGTTAACTGGAGACTTATTTAATCTTATGTA
GCATTCCTTCCTCCTTGTCTAAATCATATACCCTCAACACTATTATCGAT
GCAAAAGGGTCTGTATATTGTATCAATGCATTGTACATCTGCACTTGTTT
AAGGAGTCCTCTTTATAATCTGTCCTTATGTATACCACTTATGTATGCAG
GGGTGTGGGTTCCGTGCTAGAACTTTCCCAAGCGGTGGTATCATCAGTAT
TAGATGTTCTTCTCGAGCCTATGAGATGGGGAATATCCATGGAACTGGGA
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TTTCTTACATAGAAACTATAGCTCGTTTAGATGAAACAAGAAGCACCAAC
TCTTTATGGAAAAACGTACAATCACAACCATCAAAGGGAGCACACTTTGG
CAAAAAACCAACATCAAAGGGATTGGTCAAATTCAAATATAGTTCTGCCT
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ATCCAACTCAAAGCTAATTGCCCCTCCATGGTGCTGCAGGTTGATGATTA
CAAATTTCCCCATCTGGTTCAGTTTTGCTACTGCTTTACTTTTTCATCAG
GAAAGTTCACAAGGTTATTTATCAGAAATATTATCCAAGGAGAAAACTGC
TGGATCAATAAGTGATATCAGTCTTGCTCAGAGGGCAGCATTTTACCTTT
CATGGGTCTTATGCCCTTCTAATGTAGATGGATGTCAGGTATTAGCTAAC
AAGATGGTGAACTTATCACATGCTTGGTTCAGGAACAACAAAAGAGGCCC
CAGTTACGCATGCCATACTAGTACTGTAAATCACAGGAGGAAACTGCGCA
TACCCACAGCTGAGAATACAGAGAAACTTTATGCATCAACCAACCCTGTC
AGTACCCTTATTAAGGAATTCGATGAGCACTGCGTGAAATTTTGTAGCAT
AACTGCCATTAGTCAAGTGCAAGATGAAGACATGTCAGATGCCCCCCTCT
CATGCCCTAATTTCCTGCATTTACGGATTCCTTTAGGAGCGTTGCTCGTG
TCCTCTAGTTGTATAAGTGAGCAGGACTGCAACATGCTTCTGCACTACAC
AAGCACTGGTCTAGTTCTGCAGCCAAACGAAGTGCAGATAAAAACGAAAG
ATCATTCTGGATATGCTGGTTTTTCATCCACCTACAGAGGTTTTACTGAA
AGATGGGCTTTAAATGGTGCATGCCTCATCTTTGGCTGGCTTGACATCAT
TGATGATATGTCGGCAGCAATCTTTGAATGTGAAGATACATGTCGTCATT
TTGTCAGTGAACTCAGAACCAAGACAGGCCCATACTTGCTCAAGTGTGTA
AATTTATTGCTGAATCAGGCTGGTCAAGATAAAGATTTTATAATCGATCT
CCGTGACAGGTTGCTGAACTGGAATAATAAAGGGCAGAATTTTGATGGTT
GTGAGGCATTCAAAGACGTTATCCTTCAAATGAACACCAAAGTCCTGCTT
TCTCGATAGCAATGACCAGGGCTTTTATGTGACTGAATGTGTCCTGATGG
ATTCCTGGTCTTCCTTCAGTGATTATACTGCCGAACATGAACTGTTGAGT
TGAAACATATCCATTCAGCTGTTGGTGCTTTCCTATATGAGTTCAGAGGT
TACCACAAGTCCCAGCTTTTTAAGCATCGCAACTGTACAGGCTCTGATCA
CCTCTACCCTTGTAGATAATGTAAAATAACGTCTGTCAGTTCTAGATAGT
GTAAACTAACATCTGTGGAGAATACACTGGAACAGGCAAAGTAGTAACAC
CGCCTTCAATTGGAAGTTTTGCTGTTAACTCCATTTTTCATGTTTCCACT
TCATTTTCTAACATGACCCATGAGTGAGTCCATGACTAATATCGGTTGAT
GTACATGAATCCTGAACCAGAAAATTGTTGTAATCACCAAGTTTATTTAG
GAAAGTATCATCACATGCTATACCTATCTTATCCAAATGCAGGAGATATT
TATATTTAGATTGAACCACTGGGACTTCTATATGACACGCTACTTGGAGA
TGCTCTTGCTGCCATCACATGCTATACCTATCTTATCCAAATGCAGGAGA
TATTTATATTTAGACTGAACCAGTGAGGGACTTCTATATGACACGCTACT
TGGAGATGCTCTTGCTGCTGCACAACTGTTTCTGGCCCAGCATTCTTGTT
GTGCATTAACTACTACACTCTACCAGTGCCATTGCTACATTTGGTGTTTC
AGCTTTGATCAAACTGCTTTTGGAGAATGACCTCAATGTACATCCATTGT
ATTTTTATCCTTTCCTGCCTTTATATTTGGCATACTAAGTGGTGAAGAGA
AAAATTAAAATGTTTTGAAGAACTTGTGTATTATCAGGCGTAAGATGTGC
TCTAACAGTATGATTTGGTGTGTCAGTGTTATTTCTGCCCTTCCAAACTG
CAGAAATAACTCTGATGGGTTAGCAGTTTCAGGCAATTTTAGTTCTTAAT
TTTCTTTTTGAAACACTGTTACCTCTTAATTTTACTTTTCAATTTTGTTA
CTCTATAAACTGGATATGATAGACAAAGATGACTGATATGTTTGCACTTT
GTGGCCTCTTTTGTAGGGCTTATATGAACTTCATGCCTGCTAATTTCAGA
CTGCAAGATTCCTTGTATGGTAAAACTTCTTGTTGCATATATAGAAGAGA
AAGAAACATGAGGGTGGATCTGGTCTCCATGGCTGTGTTGCACACCAGGG
ATCTCACTGTAGGACCTATGCATCAAAATTCGCTACCAGATGCATGTCAC
GGGTAAGTAAGCCTCTAAACACTTACCTATATGTGATATGGTACATGTTA
GCACTGTTAATAGTACGTCGTCGGGCTCCATTCAGGTACATTGTGCCAGC
AGTATTCATTGCGGGTCATAGGCTTGTGCCGCAGAGACTTGGTACCTAAT
TTCTGGTCGTACAATGCAATCTATTTGGAACGGAGGTAGTATAACAGACG
GCACAGCCTAGCTGAAACTCAATTCTCTAGTTTTTTTTGAAAAAAAATCT
CTAGTGTACATCTAGATTTCAATCTATTGTACTCCCTCGGTCTCGAAAAG
GATGTCATGGATTTGTCTAAATATGTATCTAGACACATTTTAGTGTATAG
ATACGTGCAAATCTAGACAAATCTGCATAGTGTGGTGAACAAATGCAGTG
TGTTTGGCTGTATATATAGTATCACAAGAATTTAATGGGCGCGGCGAGAT
CAAACTCTAGCAATACATCTCCCGTGTTGCCCCGAACAACAGGGGCACAA
TTTTTTTGGGCTCGGCGTTTGATTCCGTAATGTTTTTGCACCGTTGTACA
CACTTAAACGAAAACATAGCACCAACAGCTCCACACGATGTGCAGGGAGT
AGTACATACGTGCCTGAACACACCTAGCCATGTCTTTATATTTGAATTTA
AGGACTTCAATGCGTTGTACGTTTGCATGGTACCACCACTTCAATAATTC
TGTGTACGCTTAAAACTCGTTAGTGGGCGTGTAGGCCCATAGTGGCTATT
CAACACTGCGTGGCATCTGCATGGTACGACCACTGCGACATGGATGCATG
TTTTGGTGTTAACGTGTGTTCAGAGAACAACTTAGATTCCGGCCGTCCAC
CACTCCATGCAAGAATCTAATGTTGGCTAGCTGCGTGTGTATCATACCCA
ATATTCGTATGCATATATGTTGATTCTTTTTATACATATGCATAGAGACT
ACAAAATATAAGAATTTGCATCATCTTCTACCGTAGATTTCTACGATTTA
ATTCATTAACTTGGGACCGGCTTTGAAAGTCGAACTGGTATTATAATCTG
TTCCTCATCAGCTGTTCATTAGAGTTGGTTAGTTAGTCTGTTATTGGTTC
CATTCAATAACGTCACCCTGAATCTCAATTGTAGGAGCTATTTTAAACAT
GGAAATAAATCTTGAAATCTCTAAATTAATTAATTTTCGAGCAATGCCAG
TAGCTGTTTACATCAGTACAGCTGCTGCATCATAGAGGAGTACCTTGTCA
GCAGGATCTGTAATCACTGATGTCTTAGTGATGGACGGGACCCGACCGGG
GGACAGTTCAATGCAGGAGACCCTATCTACTGGTTAAGGTTCATCAACTA
TTAATTGCGTAATCAATGTGAGTATGTGGCAACCATCTAAAATGTTTAAA
AATCTTAGATTCTAGGCCCTGGAGGTTCACACGGACAGTTCAATGCAGCA
GACTGTATCTACTGGTTAGAGTTCATCAACTATTAATTGTGTAAACAATG
TGAGTATGTGGCAACCATCCAAAATGTTTAAAAATCTATAGATTCTAGGC
CCTGGAGGTTCACACGTCGCTCTCCAGTTCTATTCGCATTAACACAACAT
CACTGCAGCCTGCTTACGGCTCCAAGTTGGGCAGCGGCTGAGGACCTGAT
CTTTATCTCTCCACGCATAAACACAAGGCACATGTTTTCAAGATTCAACT
TTATTTACTGGTTAGTTCAATTTTATCTTGACTATTTGATCGAAATTGAA
ACCATTGAAAAGTTAATAACTATGAACGTTCCTTCTTGGGAAAAAATATC
TGTTTTGCGTCACTTATATTTTCAGCAACTTTTTATTGTAAAGAAACATG
CATGTCTTATATTTTTGGATGAAAGCGTACTTTGCTCCTGTCATTTTTTT
ATGCACATGGCTTTTTTTTACTTTATTCTGTTCAATGTTCAAAACGTCGA
AGTTGACTAGATAGGCTTAGAAAATGTAAAGCAAATAATTAACAAATTTT
CAACCGCGAATCAACCGTGGGAACAAGAAAATTGAAAGTCAAAACCCCCG
TGACACACTGAAGGATCAAAGCGAGGTGTCCGCCTATGGACGGAGACATG
ACTAGTGAGCATGTGTGTGAAATTACTCCCTTTCCTACCGTCATAATTCT
CTAGTGAATGAGTTTCAAAAAGGATATTCCTGTTTGCAGGTAATTTCACA
TGAAAATTTCAAGGTTCCTACTGGAACACCTATAGCAACCAATCATCTGT
TGGATGGTCAGATGTGTGGTTGTATCATAGCTCACTAGTAATGATCAAAT
CTCGTGTTAATTCGAGGCTATATGTGTGTCAGTATTTCCATCCATAACAA
GACATCCTTGGTGCATCTACCTCCCTTAAAAAAAGACGTCCATGGTATTC
ATGCTGACTTCGTCAATCTTTAACTTCTATCGATCACTCTAGTGTTCAGT
AGAACGAAGAGAACCAAACCAAACCATGCTTAAGCTAAACATTCCTCCTC
TGGAATTAAAGAAAAGCCGAGAGAGGCCTCTACCCAGGTCATTCACAAAC
TATAAGGACATAATGTATACGGTATGCTCGTCGATCTTGAGCGGCCGGGC
GTTTTTGTTGATCTAGGTGAGTAAGCCGACGCCTGCCGAGACCATGGACT
CGGCGATGAATACGTTTGCCGCCTCTGACGGGTGCACGCCGTCGAAGTAT
ACATAGTTGCTGGCGTTCTGGCACATCCTGACGGCTGTGTCCGGGTCACA
GAGGTAGACCCTCGTCCCACTCTTCCCTGTGGTGCAGCACGTCTTCCTCG
CCTCCGAGAAGCCCTGCGCAGTCGGTTTTTCGGAGAGTTCCCGGAGCGGC
GTGTAGATGTCGAACACGGCGTTCAGCTTCCGGTTGAAGGTCTCGGCATC
GCCGTTTAGTCTGCGCACGCACCCACTGCAGCCCTTGCCATACAGCCCGA
TGGCCGCTGGCAGACACCCCAGCGGCGGCATGGATGTCACACCAATCCTT
CGTGCCCCCAGCTTGTACAGCTCCTGCAATCCACAACCACACAAGACCAT
GCACAGCTGCGACTGAGATGCCTACAGGCGATATGGGCGAGTCCGTGTAC
TTACATCGGTGAAGCCAGAGAAGATGCCGACGAGGTGGTCGCAGTAGCGG
TCGACGTCGTAGCGGGCGGACAGGGAGGCGTTGTGGTAGTAGTTTTGGAG
GAAGTCGCCGCTGCCAGTGCTGATGACGTACAGCGCGTCGGCGAGGATGG
AGCGTGCCCCGCGCCGCCCGGCCACTGCCACCAGCTTGGACTGGTACTCC
TTGTAGTACTTGAGCTGCTGGGACAGCGTGATGGCATCCTACAAGAAATA
TGGATGGTTGGATTGTAATTTGTGAAGTAGTACTTTCTTTCTCATGTCGC
TGTCGCGCGTCAAACATCTCACTAATCACTATCATCTAATGTAGAGGCCA
ACTCCAAAATATCAAGCCGGTTTCTCTGCTGGAGGATATACACTTACATA
CATGGCGGCCGTATCGTCGTCGTAGCTGGACGCGGCGGAGCCGAAGTTGG
CGCCGGCGAGGAGGTTCTTCCCCGACGCCAGCAGGCCGAGGTATGGCGGC
GGGTAGCCCGCAAAGCCGAGCGTTTCAGCTGCATACACACACAATCACAA
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ACAACCTATATCTAAGAGTGACCCAGCTGCATGCATGATACGCATGAGTG
TTCCTATAATGGCAGCGTACATGTGATGTCGGTGACGATCTTGCCGTCGG
AGAACCTGCCGGTGGCCGTGTGGCGCCGGAAGTTCTGGCCGTACGGCGCA
TAGTTGGCCTTGAAGATGGCGCCGGGCAGGTAGTTGTTGTTGCCGACGTC
GATGGTCGAGTCGCCGAACAAGATCATCGCCGGCACCACCTGCGCCTGGA
CGCCGCCCCAGGAGAGGAGGAGCAGAGACAGTGTCAGCAACACAAGCTTA
CGTTGCATCGCTGATGAACCCCTGCACCAAGACATGTTGTATGCAGCTGA
TGAACCCCTGCATCGCTGATGAACAATCCACTAATGGTAGGTATATATAG
AGGAGTAAAATGGGCATGATTAGATCTCAGGTGACTGCGTCAGCAGCTCT
GCGAACCTTTAATTGTTCTTGTTGTCAGGTGGTGTTACCTTTAATTGTTC
TTGTTGTCAGGTGGTGTGCCCCAAACCGTTGACCATTCTATTCATTCATA
TATATAGTCAGTCAGATATCAATTTTTTTAACAGCAATAAATAGTGGTGT
GCTACTGTTTGCTATTTTAACTCAGCTACTGTACTTTTTGTTTGTTTTTG
TTCATAGTTTACTCTGAATGCATACGCATCTGCTTTACTTTGGAAATTAT
TATATTCCCTCTGTTCTTCAATGGAACTGAAGTATTTATGTTTTTTCTTT
GAATAAAACCCTTTCAAAGTGCAATTACTGTCAGGTAGACAGAGCTATCT
CCTGTAGGAGCAAAGCTATGGAGCTCTGCAGACTGCAGCTGGCCGTAATT
CAAGACCGTGCGAGCCGACGAGCTGACGGAGGTCCATAGGTGTACATAAA
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AAAGTTCAAGTTGTTAGGTAACCATCGGCCCTAATTACTCCAAGAAATGA
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TAATTAAATTCATGGACGGACATTTATCTTGCCAAAACTCTCCTCGGCAA
AATCTGTTAGATTAAATATTCAGACATAATCATTGCAAAAATGAGAGCAA
GTTGGGCGGCATAATTAATTCCTCGTGGAAAAATATATCTTACAAAGGTT
TTGTTTGATGATTTTGTTGAAGACGTCATTTCTGCACACCAGCTGCATGC
ATGCAATCCAAAATCAGACAGCACAAAAAAGTGTATATGGGAGTTAAAAA
CCAGATAAGGAGGTAACAAGTCGGTGATTGTACTTACGTGAACCCTGAAT
ATGTGCCAAGAGAGAACACAGGCAGTGGAGCAGCCAACTACCCTTCAAGG
TTTTCCTTGACTATCAGCTATGTACTCCATTGCTTCCAGAATAATTACCC
CTTCTCATTCTCAAAAAAAAAACCCTTCTCTTCCCTTGCACCTGCTACCT
GTAGATACCAGCCATGGATCATCAAACCAAGATTTCCGTGGAGAAGATTG
GTGTCTTGCTCCACTCGGCACATGAGATCTTAGAGGATATCCTGAACAGA
ACTTCTGAGGAGAAAGTAGAAAGGATTTCCGAACGATCAAATCTTGATCC
GCAAAAAGGATTGAGGTTCCTGGAATTGGAGGCTCATAACATTCATGATC
TGGCCAAGAAGGTGGAGATCAAGCTCTCAGAATGCAGGGAGAAGGAAAGG
AAGGAGAAAAGCAGGATGGAGAGTATGATATCAAGCTTAATGAAGGAGAA
CCAGGATACCGGGAGCATGTTGGAAGTCGCTATAGCTGAGAAGGAGGCGG
CAGAAAATAGCCTCCGTGTACTGAAGGGCGATGGTGATCAGAAGAGAAGT
ACAATCCTGCAGATTGCTGAGAAGGGATTGCAGAAGGTTGGCTTTGGCTT
CATCATGGAGGTGATAAGTGGAGAATCAGAAGGAGATGAGAAGAGCAGCT
GCGGTGCCAGTGCGGCGTCGAATGGAATAGAATGTAAACAGGAGGTTGAC
AGTTTGGTAAATAGTTCTACTCAGTCCTCTGTATCTGCAATAGCTCTCTG
GTGGTTAGACAATAAGCTGAAGCACTTACGACAAAGTACAATACAGAGTT
GTTATTTTCTTAGATTATATATAGTTGTTATCTGTGAAGTAATTGTCAGG
TAATCTATCTGTCATGCATGTGATGCAACTAGAAACCATTAATCATGCTA
CGTTTATACGTTGTTAACTGAATCATTGCCCACGCGAAAACTTGTCAGCT
CATAATCTCCTTCAAGTTGTTTCCTTTCAGGCTTTGATAGTTGGTAAGAC
GCTCAAAAACCTGCATTATGAGATCAATGATCTCACACAGGCCTTAAACG
AGTCCAGGTAAACAAAGAAGTCATTGATGTAAGATGTCTTTGATGAAGTT
TTGATGGACGTCTTGAGGGCCTTCTCGTAATCTTTGATAACTGATGAAGT
GATCATATCAAACTGCTCCAATAGGTCAGATTGTGAGCATTTGTACCTCT
GTGCTGCCGAACAGGCTCAGAAGATAATCAAACATGAGTCACACATACAG
GATCTGAGAGAACGAGAGATTTCCCTTCTTCACAGTGTATAAACACATAT
ATTATTTATTTATGGATTTTCTTTTATTTGCTAGCCCTGTATTTTACAAG
GATCTGAAGTCTGTTTTTCAATACTTTAGGTAGAAGAGCTCACTGCGGGG
ATAAAAGAAGTAGAACATGAGGCTACAAGATGGAGAGAGGCATGTGCTTT
GGAGGTAGAAGCTGGAAAAGTTGCCATTAAAGCACTAAACCAGGAGGTAA
TCCAAGAGAAATACCTAAGCTTCACTAAAATGTCTTCTTGAGGTCATGAG
ATGTGCTTCTCAGACTGATAAATGATAATTGAGAATAATGCCATTTGAGA
ATTGATATGATGTACCTTCAAATAAATCAAACACAATATTTAAAGTCTGA
CCTAAGCTTCACTAAAATGTCCTCTTGAGGTCATGAGATGTGCTTCTCAG
ACTGATAAAATGATAATTGAGCATAATGCCATTTGAGAATTGATATGATG
TACCTTCAAAGTAATCAAACACAAAATTTAAAGGGAGAAACATGCCCAAT
TTTTATTAATTTGAAAAGTCATAAGTTTGAAATCCTTGAGTTTGTAATAA
TAGCAATAGAGAAAACATCTCTGACAAGACCTTTAATAGTGCACAGTAAC
ACTCTCATCTAGTCATTCATCAGAGGAGCTGTACATGTTCTAATGAGGTA
CCTTTTCAGGTGACCTTGCTCAGAGAAGAACTGCAAAGGGTAAAGGCAGA
CTTAGATGCTGCAAGCAGCAAGATACATCTAAAAGAGAAATTAGCCGCGA
GTGCAATGGCAGCACAAGCTGCTGCAGACACATGCCTTAAGCTTGCAGAC
AGTAGATCTGCTGGACTACAACAAAGAATAGAAGAGTTGACAAGGCAGGT
AGAGCAAGAAGATGGAGATGCAAGAAAAAGGCGAGAGAGTGCTCGCAAAA
GAATAAGATACGTCTGCTGGCCATGGCAGCAACTTCGAGTCATATCAGCA
TCGTCTCGTGATAGGACATGGTTTATTGATCAGAATGGTAGATTGTTACC
AGGGACAGAAGCGCTACTTCAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.