Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA005046

[Submit comment/correction]

Sequence
AA005046
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005046
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAACTTTTAGATCTGCCGGTAGATAGAGAGAAAGAAATACTCCGATATG
GATTCCCTCGATAAAAAAACTTGGTCCTTCATTGGTGTTGTGCGCTCGAC
CCAAAATGGAGGCCGTACGATGAGGCCGGCGGCATAAAACCCTAGCCCTC
GGTCGCCCCGCGGCATGGCCACCGCCACCACCTACACGCTCCGTCTTACT
CCGCCTCCGCCGCCACCGCGGTACCACTCACCGCTCCTTCCGCAGCTCCG
CCGCCGCGCGGCCGCTAAGGTGGCTGCTAGCTGGGGCCCAGCCGGCGGTA
GCAACTCGGATGACGGGGTTGGCGGCTGGTGGCTCCCCGAGCAGCCGGTG
GAACAAGGGAGAGCAGGTAGATCTCCGAAACGATTTCGTTTCTCATCGAG
TAGTGGATGCGGAGAGGTTCCATCTTCGTGCGGATATTTTGTTGTTCTGC
TGTGACTCGCAGGGATGGCATTTACAGGGTCCGGGAGAGCTCTTGTTGTC
GGGTTGGGGGCTTTGACGGCGATCGCGTTGGCCGGGATCACTTGGCGCTC
GCCATCCTCGAGGAAGTGTAAGTTCCTCATCATTTTAGCCCCAACCATGT
AAATACTCAATGTACAAATCCCCCCTTTTGAGTTCAATGTGATACTGAAC
TTTAGATGTACAAACATAGGAGGATTGCCCATTTCCTACTACTACCACTG
AACTTTCAACTGGAATGCGACCGCAAAAACAATATCTGCAGCAGTTAGTT
CTAAGAGGATAGAAGAAATACAGCATACCATTGTAGAACTTTTTTGAACC
TACGCTACCTTGACACCAGTACTATTCTCACCAGCTTCCTGCTATTCAAA
ATGGAAAGCTAGATTTGGTTCTTGCTATAATTTTTTGTGTTGTTTTGCTT
GTTGGGAACTGTCGATTTCTGTACAGCATTAATCTGTGTAACCTTTTATA
GGTTAGCTTGATACCTTAAGTGTTTGCAATGGCAATTTTTTTTTCCTGAG
AAGAAGCTTTTCTAAGGAGATTGATATAACCCAGTTAGCTATTCAATAAT
ACGGATGTTCAGGTATAGAGCATCTTCTTGGAGCTCCACTTCATTATGTT
CAAGAGAAGTTGTCAGTACCAGAGTCAACAGAAATTCCTGAAGATGAGGC
AAGCGTCAACGAGTCGATTACAACTGATGTTTCGGCGATAATTCTCGATG
AGAGCACTGACACATCATCTGTTGATTCAAGCCAAAGTCACATACCAACT
GGTGGTGGCCGTGTTTCTTTTACAGTTCCTGTAGATCCCATGCACGAGGA
GGCTTTGTCTATATTGAAGAAGCTACAGGTATGTTACATATTTACAGTTG
TAAGTTGTAACCATACATATATGTTTTTTTAGGAATGGTGTATGTATTAT
CTTCTGTGAACGAATTGGTTTACAACTCGATTTGCAGACAAGCTGTTTGC
TAAACCACGTTACAAGCTTTATACATACATTTGTTTGTTGCCTTTATCAC
TTACAAGTCAGTATGCACTCGCTGGTCATGGGGGTAGGAAAGACTACCAT
ACTGTGAATTGCCTTGATCACTTCTGTTTGCCATTATTTTGAAGGGTTTT
AGTTCTTTGACATGATATTCATAAATGCAAGTTCAAAATTCTATCGCTAA
GATGAACTTAATATACACTTTACAGTTTCTCATTGGTTTTAATATAATTT
ACACCTTACTTGAATGGGTACAAAATTGGATTCTGTATCTTCTTTTCACA
CCAGTTTGTGTGTTGTTGTGCAGTATCACCTGCAAGAGATCAGACAACAA
AATTAGCTCCATCCCCTTAGTTCATATAATTCTCTAAATATCATATAGGT
TTTAGATTATATTCCTACTACGTATAAGCTGTAAGTGTTTCTGTAGTTTA
CACAGTGTTTAATGAGTACTTTCCTACTATGTATTTTATGAGTGCTTTCC
CAAGACTTTCAGGTTAACTCTATTCTGTAAGAAACCTTGTAGTTGTTTTA
AATAAAATCATTATTTCTTGATCTTTTCATCACCTTCTGTGCCTCAGATA
ATTGAGAAAGATGTCAACTCCAGTGAATTTTGTACTCGGAGAGAATTTGC
AAGATGGTTTGTGAAATTGTGCTCAAACTTAGAGAGGTAATGAATCAACA
TAGTACTAAAAAAGTGAGCTTTGCCTGGCATTTTAGTATTTCGTTATTTA
TCGTTGTCTTGCAGGGAAAGGATGCACAGGATCATACCGAATCTAATAAC
TTCTTGTTCATTCGAAAGTGCGTTCGATGATGTAAATTTTGATGACCCAG
ATTTCTTATATATCCAATGTAAGTTTCTGTTTATATTGAACTGTATTAAG
CTCAGTCTAGCAATTCCTCACATCTCAGAGACAGGCCCATATACTATGAA
GTGATGAAATTTTGATTTCTGAGCCATTTTTTTGCCAAACAAAATATTTT
CATGAAATTTCCAGATGCTGATAATCTAATAGTCGTTTGTTGATGATGAA
AAGCTTTAGGAGAATCTGGCATTGTGCCTAGCAAGTTATCAAGCTTCTTT
GGAACATCGACAAGTGGCTCTCAAAGTGGCAACAGAAATTCCAAATTTCT
ACCTGAAAGGTACTAACATATGAAAATTGTACTTTTTCCCTTATGGTGAT
GAACTGATGATTAAAATGTTTTTAATAAAACATGTTCTCTATTCTGGAGT
AGTTACCTATCACGGTTTGATCTCATCAATTGGAAGGTATTAGTGGAGTA
TCCACTCGCATCAGAATTAGACCAAAAGGTACATATACCTTTTGATCTTT
TTATGTTCTACTGCATTGTTTCTAGTATTCTATTGTTGCATCTTTTGTGA
ATCCTGACTCTGGTTACAGTCCAGATGCTGAGTAAAAATGTTCATACTTT
GGATTTGAGAGCTTGGCCAGATGTATCAGCATCCATACATATGGATTTGT
TTGGTCACAACCACAGCATCGTCAGCAAAGTTTTTGGTAGGCTGTGCTCA
TAATTTCTGTATGTAACTATGTATGCTGTTAGTTGGTTGCAAAGCTACAG
TTCTCTATAAATTGCAATACTGATAGTCTGTCGGGTCCTAAAGCAAGACT
ATAAATATTCCTTTTCATTTACTCATTTTGATGATTTTTATTTTAGTGAC
TGGGAGCTCCATTTTATTTGGCATATGTTAGTCATGTTTTTCAACTTGTT
ATATGTATGGTTTGTTTCATTGTATGCATGCATCTTGGTGGCCTTATCTT
TGAATTAGTTGTCTTATGTTTGCTCGTATTGAGCTCATGCATAAAGTATG
TGGTTGTGTTTTATCTTCATATTAGATGAGGACACCACAGGCCCCTACTT
CCATCAAAGTGGTCTTAAAGCCAGTCAATTAGTACCAAGATTGACACCTA
ATTGGTTGCAAGTTTAGTTCGTATCAAATTCAGGAAAGGCGCCTGCTTGC
AAACTCTTTTGAGTTCGTATTAGGATATGATTCTATTTCAATATCACTAG
AGGATGTAATGTTTGCTATGAAGAGCAGTATGCTGTACTGGAATGGCAAA
TAGACAATAGACATTCAATCAATGAAAGCCACAGTTGACTATTAGGTCTC
TCAACTTTGTCTTAAAGTCAGTCAGTTAGCACCACATTAGGATTGCCACC
TAATACGTTGCAGGTTTAGTTCATATCCATGTCAGGACACCTGATTGGAA
AGTTTTTGTATTCGTTTTAGGACAGGGTTCTGTTTCAATTGTACTAGAGA
TTGAATCCTTTACTATAAAGAGAGATAGGCTGTACGGGGAAGACATAGTC
AATCAGTAGACTAGAAAAAAGGGAACCCACATGCACACAGCAGACATGAT
CACCTTCTACACTAAAAGTTCCATGACATTATGATTTTTTGGTTGTGGGA
AAACCTTTCTGTGTTGCTTTGCCATATAATAGTTGGCAGAGCCCATGTCA
CCCTTTAGGTTTCCTCCTTTTTGCATTGGATGAAATCCCTGTAACACGTT
GTAGTGAAAAGATTATGCTTGTCATGGTAAAAGTTCTTCGGAAACGTGAT
TGTGAATTATTCTGACCACCATTTCCTATAGTAAATAAAATGCTCATTGC
TCAGAGTACTCTGTTTTCTGTGTTCTATTCATCTGACCCGAGTTTGAGCT
GGGTTGTTTCTGAGTAAACAATATGGATGGAGCTTGAAAAGACAGGATCG
TTTGTTAGCAAGGGAAAGAATATACAGTGAAAACTAATAAATTGGGGTCA
TGTTGGTTTTTTCCCATCTACATAGTTGTCTCACTTAACGCTTCTGTCTT
ATTTGCTTTCTAAGTGTTTTTCATGTTCTCGGAATGATCCAAGTGTGTCG
AATTAGGTTGTTCTATTGATTGCTCAAACTACAGTTTTGTCCTGCTACTT
ATTTTTGTGATGCTATCTATGTTCTTAGTTTAGGAACTCTCACGAAAAAT
ATGGATTTAGGACAAACATGATCTTAGCTGACTATTTTGTGTATGAACCT
ACATGTACAAGAACTGCTCTCCATACTCGACTTGCTCTCGTGTTATTTTG
TGATTCATATTTTTAGCAGATCAGCTATCCTTTTATCCGATATGCTAGTT
CTCAGTAACTTGTGCAATTGCTCCATTTGATAGGAAATACCAGGCGCCTT
CAACATCATATGCCTGTAACAAAAGCACAGGCGGCTGCTGCATTGACCAG
TGGCCGAATGGAAGAAGTAATCCATGATGAATTAAACAAACTTGAAGCTG
AAAACGAGTCCCGCCGTTCTGTTATGGGTGAAATTATGGAAGAGTTGATT
AATAGAGGGGAAATAAAACAATATTGGGAAGACAAGATGAAAAAAGAGCA
AGACCGTGAGTTGGAAGTTGATAAGCATCTTCAACATGTGCTGCATGAGC
TTGCAAATGAGAGGATAGTTCAAGAAAAAGAAATCGCAGTCTTGCTAAAA
GAAAGAAAAGCTTTAGAGTGTCAGAATCAGGAACTCGAATGTTTAAGGTC
AGAAGTTGATAGCATGTATGATAGACTAGCCATGGAGAGTCTAGAGGTGA
TGGCAGATGAGCAAAATCTGGAAAAGTTGTCCTCTGATGTGAGCAGCAAG
CATGAAGCTGTCACTGAAGCTAAATCGTTTCTTGAAGCTGAGAAGGAAGC
TCTGACTATGCTAAGGTACAACCTTCACTCCTGGTTATTACCTGGTACTA
ATACACCGTGGTTCTAAATTTATATGGTACCGAAGAAACATTAGTTCATC
ATCTTATGTCAGAGTAGACTTGTAAATGTATTATGTGTGTGTGCACATTT
ATTAGTTCAGAAACGGTGCTTCATCCTATAGTAGTGAACATTTCATACTC
TTAAACCTGCTCATCTGAAGTGATATTAGGGGAAATTAACTAGTACCGCG
TACAAGGAAAACAAAATACAAATAATACTTTGATCTTGAAGGACTGGTCA
AGATCCTCCGTCAGAATTGTATGCAATTTAGATGTTCTCTGCAGACTTTG
TATCACAGATTGCTTTTTCCCCCTAGAGTACTCCAATGGAGTACCATACT
TTTATAGAAGCCGGCCGGCAAACTGTTTAACTGGTGTCTGCTGTGTACAC
AATTCCGTAATACTTATCTAATGGCACTAGCTGATTTGTATCAGGTCGTG
GGTGGAACAGGAAGCAGAGCGCGTGCACGAACGTGCCGAACTTCTCCAGA
AGGCTGTGAGAAGATGGCGTGTTCCGGCTGATTGAGCCTGCAAAATATTA
ACCTGGCATTGTATCTGGCGTAAGTTACACAACTTGCTGTATGAATTCTG
TGTTCTGTTGCCAACGCTTGTGCTGTCAGTTATAAATAATTCACCTAGCA
GTGTGGAATGTCCTTGCCTCCGTTCATGGTTTTCCTTGAATGTTTGTCAG
TCGCTTGCTGTTTTATGTTTCACGGGGTTTGATCAGTTTTGTGGTCTACT
TTACGTAGTTTTAAATCACTAGTGAAGTGTAGTATGATGTACACTACTCC
CTCTGTTCAGGATTGTTAGTCCGGAGAGCTTTTTCAGATTGTTCGGGTTT
GTTAGTCCAGAGACTTAATTATTTCTAAATATTTGTGCATGCAACTTCCT
TAATACCCTCCCAGCCTCTGCATGCGCCCCCTAGTTCCGGTGTGTTATCT
TTAATTAATGAGCGAGAGTCCAACAAACCAATACATGCACGGCAAAATTA
AAATCCTAGCAATTAAATAGGAGAGGAGAGGGAGAATTAATTGGGGTCTT
AATCCACGAGCTTTTGTCCTCCGGCCTTCTATACCCGAACAGAGGGAGTA
CTACGGAGTACTAGGCAGATTGGAACAAGGGGAAACGGACGATCGTGAAA
CCTTTCCTAGTGGGCGACAGTGGAAGGTGAAACGCTCAACACAAGTAGGC
GCTGGCTCAAGTGTTCGTGCACTCCTCTTCTCACTGGAATTCGTCACACG
CAGAATCGGAAGAAGCATCCTGCAAGATGCCAGGATGCGAGTCTGCGCAC
TCGTTACCGCCCTGGGTGGTTGCTCACTCAGTGCCCACCTTCACTCTCTT
TGCCCTTTTGGCTAGCCTCCCCCTCTGACAGTCCCCACTGTCCGGCGGGC
CCACAAGACCAATCGGTTGCAATCAATACATGCCAATGAAGCAGATCTTG
ACGACGGCACGGCATTGCACTATCCTACGAGGTCTGGTGGTGGCATCGGC
ATCATTTCCTCGGCGCATGTGCGTGGTGGGATGATCCGCGCGTTTGGTAG
CCTGCACGAGACTAAGCCAGCCTCTGAAAATATGAAATCGGCTTGATTGG
TTGTATCCAATGCGAGTTTAGACTACATCAGCATGCTTCTCAAAGCAGCC
CAGAGCGTGCAATAGTGTCTCCTCCTCTCCTTTCTCTCTTCTCTAAACAA
ACATAATCTTCACAACTTGTGATTAACACATACAACTTTAAATCGAATTG
ACCTCTACATGAAAAAGATGCGTATCGACGATGGGGTTCTATCCTGACCA
TCGGCTTCGAGGTTGGTGAACTGTATCTTCTCAGATTCGTGATCAAAGTT
AGTTTTTTTGGGCTTATTTTTTTTTAGATTTGTCGCATAGAAGCAATCAT
TCGAAGTTTTTTTTTTAGGAGTAGCTTGATCTTGTTGTTTCCCACAATTT
TTGTGTTGCAAGATTTGTATTTTGATGAAGGTATAAGGATCCATCTAAAG
CTCTCCTCTCCGGACTGTAAACCGTAGGTGTACGTATCTGATGAACTTCT
TATCTTGTACGTGAGGTTGAAAATGATATTGACAAAGATGGTCTACTCGA
TGGAAGGTCGTGCAGGTAGGGGAACGCCAAGGTCGTTGTCGTCGTCGACC
GCGCGTAGCTCCCCTTCGTTCCAGGCGTTCAAGTCCGCCGTGTCCGACCT
CGAGTTCCTGGACGCCACAGGCAAGGGAGCCGACACGGCGAGCATGTTCG
ACCAGTTCTTACCAGTCCGCCATCGAGCAAGACCACCGTGTCTGGCCGTG
CTTGCGTTCTCCGCTGCCAGCACAGGTACAACAGTTGTCCCGCCGGCCTC
CGTCGCCGACACAGCCACAGGAGGTGTCCTGCCGACCTCCATCGTTAGGG
CAGCCGCAACAGTTGTGTTGGCACCCTCCGTCACCGGCGCATCTGCAACA
GCTGCCCCGCTGCGCTCTGTCGTCGGGCTGCAGTAGGCGAACATGAAGAA
CAAGAGCTACTAATGACTGTTTAGATGTGCATATTAGTGTGATAGATATC
TGGCGCAGGCAACCAAACAACATACATTTGTTGCTGTCAATGTAAAAAAA
AATACATGCAGGCTATCAAATAAGATGCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.