Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA004475

[Submit comment/correction]

Sequence
AA004475
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004475
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCAAATGACTGGCTGAGAAGAAGGAGAAGGACGAGCCGCGTAACACTC
CTCTCTACTTTTTTTTACAGCCTAGTACGCCCTACGTACACGCCCTCCCT
CGTCTCATCTTCTCACCTGGCCAACTGGCAGCCACGGCACCTGCGACGAC
ATGGCCGCCGTGCTTCCTTTCAGGCTGCTCACGGCCGCCACCACCGGTTT
GAGCTTCTCGACTTCTGTCTGTCCTACTCCTACCAGGCACCACAGAGTCG
CCGGCGGGGGCAGGTTCGTGCTCTCTCCGCTTTCCTGCCGTGCGGCTGCG
GCGGCAGGGGGGCCGATCACCGTCACCGGTGACCCGCCCACCTTCGTGTC
CGCGCCCGGGCACCGCATTGTCGCCGGTACGTATACCATGTCCTCATCCA
GTTTTTCTTTTCTTCTCTCTCGGTTCTCAAGAAATATACACCTAGTACGT
ATTTTCCATGTTGGCACACGACACGTACGGTCATTTTTGGTCAATTTTGG
TGGCAAATTGTGCAACTGCAAAAGAAGAGCCAAACAAAGCAAACCAACAA
GTGATCCTTTTCATCTAAAAAAAAAGCAAACAAACATTGGACTTTGTGCC
TTGGACTCTACTAGTACTAGGAATATGCGTCGCATTCAGAACCAAAACTC
TGTTCTTCGGGATGGCAAATATCTGAATACCTGTGATCTTTCCTGTTCAA
TTCCAAGTGAACCCACCACCCAACTTCTATTCAAGATGTCATGGGCCATT
CATTCATTACCTTTCCAAATGTTATCATCTGAACACTGTCCATGTTGGCT
TGCTAATTCTCATTGCATTGCAGTCGGCGACCTCCATGGTGACCTCTGCC
AAACGGAAGCTGCCCTGGTGATGGCCGGTGTCCTTTGCCCGGAATCAGAT
GGCCACGTATGGACAGGCGGGCAGACGGTAAACTCATTCCTCTTTTCAAC
TTCCACTTCCCATGTTTGCTGCGCAATTCAAGTTTTTTTTTGTTTCGTTT
CGAAGTAGTATTCATTTCCTGGTTATTGTTACTGTAAGAGAATCCATGGA
ACATGTGAATCACACATTCATCTGGTGCATTCATTCTTCCCCCTGTTTGA
TCTTTTTTGTTTCTTTTTCGAAAAGGAGGCAAAGCCCCAGGCCTCTGAAT
TGATTGATGCACACAACCATTGAATGATGTCAACTATGTATTTTGTATGG
ATGCCCACACCTTGTGTCGTACCACTACTGGGCTTCATGTGTCCCACGTG
GATGCACACACAGCACATTTTAGAATTTTGTCTTGGTTACTGTTCTCAGG
TGAAGCTTTTGTGTAATTCGCTCGTGTACAGGTTCTGGTTCAAGTTGGGG
ACATCCTTGATCGCGGCGAAGATGAAATCGCGATTCTATCCCTATTGAGT
TCGCTAAACATGCAAGCAAAATCTCAAGGCGGTGCAATTTTTCAGGTTTG
ATCCTCACTTCATGTTCATCTCTACGTGATCTACGACTTCGTAATATTTA
ACATAAATGTTAGGTTAATGGGAATCATGAAACCATGAATGTGGAAGGCG
ATTTCCGGTGTGTCCACCCAGGATCATTTGACGAGTGTATACGCTTTATG
GAATACTTGGAGGAATTTGATGGCAATTGGGATGATGCTTTCGTCAACTG
GGTTAATGTTTCTCAAAGGTCGAAGGATGACTATCGGGCATCACCTAATG
GTGACTGGCTTCCTTTGAACTTTGTCAAGGTAACGTTGACTGTTTACTCA
ATGGATAATTACTGAGCTTGCTCAATTAACCAATTTTGGATATACATGCC
ATGATCTGTATGTTTCAATTTGATAAGTTGGTAACTTAATCCACAAAAAA
GTAACATTAAATAATTAACCACCAGCATTTCTTCTATTTCTGATATATTT
CCCTCCAAATGCTAAGACAGAAACAGAAAGGCTTTGCCGCAAGAGCATCA
CTTTTTAAGCAAGGTGGCCCATTAGCTTGTGAATTGGCACGACATCCTGT
TGTACTTATTGTCAATGACTGGATATTTTGTCATGGTGGCCTTCTTCCTC
ATCATGGTGAGCCCCCTTGTTCTCCCACGTTTAAGGAATAGGTCGTGTGA
TTTGTGCTCAGCATTAACATTTCTGCTTCTGGTATAAGAAATTCACCTAG
TATGTTCTACTTGGTAACAAAAATTACTGTCCATGTTATCTAAGTTAATT
TCCACTCAATTCATAGTTGAATACGGGATCGAGCGCATCAACACTGAAGT
ATCAAATTGGATGCAAGGTTTAAGTGAAGACACGGATGATCCCGATCTCC
CTTTCATAGCAACCAGAGGCTATGACAGTGTAGTATGGACTCGGTTGTAC
TCTCAAGATTCAGTCGAGAGGACACAACGGTCTTGGAATGTGAGAGAATA
TCGGATCCACCAAACTTATGATTTCCTTTTTCACCATGGAAAATATTTCA
ATTACAAAACTGTTAAAACATGCTTAACAGAATTATAATACAAATATTTT
TGTTGGTTTAGCTATCTTCTGTTATTGCTGAACAAACATTGAAATCTGTT
GGAGCTAAAGGGATGGTTGTAGGACACACTCCCCAGACTCGTGGAGTGAA
TTGGTATTCATTGTTGTCAACTGAGTAATGACAATATATCGAAATTTGTC
TCCCATAAACTATAAATAACACTCTCATTGTTCCCAGCAAATGCGATGGT
AAAGTTTGGTGCGTTGATGTGGGCATGTCATATGGTGTACTGCATTCGAG
ACCAGAGGTAAATATCTTCCTTTTAGTCTGGAATTTATGATATTTAGTGT
TCTCTACATTGAACTAGGAATCATTTGCTACATTCATAGAGTGTGTTCAA
TGTTTTAGATCTGGTGCATCATATATGTACTATTTGCAATAATCTCATGA
TACTCCCTCCGATCCAAATTAATGGTCTCAGATTTGTCTAGATTCGGATG
TATCTAGTGAGTACATTAATTTGGATCGAAGGAAGTATCTTTTCTTGTTT
AAAAAAGAAATGACTTGTTTTATTGAAAATTTCGAGCCTGCTTGACTAGT
AAATTTTAATATGTTAATGCACGTTCTTATTATCTAATCATAGGGATGGC
GCAAAAACCTTTTATGGTGTTTGATGTTCAACTCTTATGGCTAGGTCCTG
GAAATAGTTAATGACAGACCAAGAGTTATAAAGGAACAGAGGGACTTGTG
CGATGAGATGGAAGTGTTGGACTACTTATGAAACCTTGAAAAAATTCTGT
AAGCCCTCTTAAACTCACCTCATCCTCCTGTTGGTCTCCAAAAGATATTT
ATAACCATGCTACGTAAGAACCTGGCGAAATAAGAGTTTTTATTTTATTT
GTTGGGCAAAAATTTTACAACTATCATTTATATTTATTGTTTTCCATTAG
AAAACACATGGATGAGATAAGTATGATATTGCAGGTCTATAATAGCTAAA
CAAAAGCATATAAAGATACTATACAAGACATTTTTGGGTTGAAGAAAACT
GAATGGTAGAGGAAGGATATACATCTAAAGGTACCAACCCCTCGCATAGC
GGTTAGTACATTTTCCATTCATAAAACTACATACCTCTCTACACTTCTGC
AATTGTATCATCTAGCTTCGTAAACATGAAGTTACTTCTTTTGTCCATGT
TTGCACCATAGGTGCTTATTCATTGTTAACTGTTAGCTGACCGAAAAATG
TGGTGTTGTTAGTGAGGTTAGCAAAATGTCTAGCTATATATCAAGTTGGC
TAGAGGTGAGGAAGATCTCAAATGCATACAAATTTTGAGCATGCAAGTAA
TCATATGTTGTATAGAAATGTAGATATAAGTCTTCGCAGTTACCAATCTG
AATTCTGTGATGGATTTCACCACTTAATACGTGAGTATGTAAATCATAAT
TAGCAAAAATAATTCCTGCTAAAATAAATTGTGTCTGATATATGTTAAAG
TATAAGTATGAAATAGAATTGTGTTAATTGAAGTCTGATGTACTCAGCAC
TCAAGGGGACTTCATCATTTTCCTCTATTTTTCCTTCAAAGAAATTCGTA
TGTATTATAAAATCATATATCATGGTATCTTCATTGATTACGTTAAGAAG
AGTCTCCAATGTTTCAAAAATGTTGGAATACTGAAACCACCACTTAAGAT
GTTGATATGTTAGATGCTCCATTCATTATACAACACATGCCATTTTAGGT
TTTGACACGGTATCTAACGTGCAACTTCAGCTGCCATCTTTCACATCCTT
GATTGTTGGTGCAAGACCGTGTGCCGGTGGATCCCTGATTACTTTCCTTC
GTTTCTAAATAACCATGACTGGTGCCATGATTAATTGGTACATAATACTT
TCTTAAACGGTATTTACTTTCCATGTTTTCACGCACTATTAAATGGATTG
GATACGCGCAGAATAGACGGTTATGATTCTTCCAATGTTTGGTGAGTGTG
TTTGAGGGCGATTTGATGGTCGTGATTAATCTACCGACACCAACTCCTGT
TAATAATAAGATTTGCAGTACTTATCTATCGAACGTGGCTTTTTGGCTCC
CGGGTGCATATGCACCCTTTATTTGGATTTGATTTTTAAAAATTTTAAAT
GCCAAAAAAATTCAAAAAAATAGAACTTCAAGTTTTAGGTGTGCGCAAAG
TCGTTTCACGAAAAATGAACATTTTGGATGGCTTGTGAAAAAAAGACAAA
ATTTGGTGCTAAAATAACGTGCTCCATGACGCAAAAAATTGTCTTTTTTA
CACAGCACACAAAACATATCGGTTTTCGGTGGAATGACTTCGTGTGCACC
TCAAACATGAAGCTACACATGATCATATTTTTTTCAATTTTTTTAAATTT
TTAAAAAATGTGTTTTTAATACCGGGTGTATATGCACCCGGGTGTAGAAA
GGGGTTTCCGTTATCTATGCTTCTATGAAGACTACCCGTGCTATGGCTGC
AAAACAATCCAGTAAATATGATATAGCTCAGGCTCTTTCTTCCAGAGTTG
AAACCTTGTTTCCTTCCCGGTCGGTTTCATTTCTGACATATATATATATT
CCATGTTTGATTTATATTTTCCTGAAACTCCGATGTAAAAACTGCCAAAA
AATGTGCGGACGCAAATGCCAAATCATTCTTTCCAAATTGCATCAACTCT
TGTCTGATGATTCTGTGATGAACGGTATGGCACTTGTCGAGAAAATGTCC
AGTACACCCAGCTCTAGTTGGCATATTTAGAAGTTACTAGCAATTCTGAA
AAGAAGGTAATGGCATAGAAGCACAATAAAAAAATTCAATTTTCTCTTTT
GAAGTTATGGTTAGTCTTAGACTAGAATTTTTGTGACGATGTAGTTTATG
TTGTGTCTGCCTTAATTGTTACCATGATTTTGTCAAATGACATTATTATT
ATGGAATATGGCTGAATCCCAGCAACAAAACCGGGTGTTTGTAAGTTTAA
AAGGTAATTTAATGGTATCAATAACTCACTGCAGCATTATCTTGGCAAAT
CAACTCAATATGTACAATCCTCTAAAAAAATATTTAACTACTCCCTCCAT
TCCAGAAAAGATGTGCAACTCGTCCGCTCCTAGTTCATTTTTGTTTTTGC
AAAAAACTCCCTAATACAGTCAAATCGTTTCAAGTTTGGTCAATTCAAAC
TCAAATCAGTTTGCATGCTTACAATGAACTTCTCTGCAGAACCAGCTTTT
TCATAAGCATTAGCAGTTCTGAAGATAGCTTCTTGCAAACCAGGGAATGG
GCGGCGATGGTCTTTAGCAGTTTAGCACCTGCATGGTAACATGCTCTATT
TGAGTAGGGGGCATCAAACTGTGAAGCCATGCCACCTTCAAACAGAAAAT
GCATGGTATCTCACCTTCAAACAAAGGTAAGCGTTAATTGAAATACTACA
TGGAGATTTATGAATGGTTTAAGCGTACATCTGATAAGAAAAATGCAGAG
AAGTAGCAGCTGTCATAACTTGTGTGTCTTTAATTACCTTGATGTTTCAG
CAAAAATCAGGAAAGCACAGTAATTATATGCTTGGAACAGATCATTATGT
AAAAAACTCCATTTCTGATTCCCTGAATTATAATAGTCTATACAGTTTGT
TTTGGGCATACCAAACCAGTAAGAGCACAATGATAAAGAGGAAACTGTAA
CTTTCATCTAGAAAAGGAGTAAAATGAGTACTAGTCTCCACAATAATTGT
CACTGTTGTAACCATGTTTCCAGTTGCCCCATTGGCATGCATCAGGTTTG
CTTGTTTCAGATTTAATTAAATAGACATGCTAGGAGACCACCCAAAAACA
GAGCAATATCTTAGCAGTTTTAGTTACAGAACAAAGCACACTTTGGATTT
CAAATCCAGAGATTTATATATACATATGGTTTAAGTTATGGCAACACATA
GTTGTGTCTTTCCTTGCAAGTATCTTTCTACCGGCATTAGAACAAGGAGT
ATAATGTTTTATTGTTGTCGAAGTTTCATTTTTGTACTCCAACATCAATA
TTTATATGAATTCTATCAATACATGCAGGCAAGCAAACAGTTCAAGACAG
AGATACAGAACAATCGCTCTATCTATCCTAGGCGAGCTACTTGCACAAAC
CAAAGCCTTATAGAAGGAGAGGTAGAGAAAGAAAATGAGATGTAGAGAAA
GGAGGATAATATATACTTGTGTGTAGCACAGACAATGGAGTACTCCCTCC
GTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCCTTTTTCTGAAACACATGTATTTAG
ACATCTTTTAACGTGTAGTTTAGGAGCAAAATGAGTGCACCTCACGTCAA
AAAAAGGCTAAAACATCTTATATTTTAAAACAGAGGGAGTACTTGTGTGT
GATAAAAGAGGTAGAGGAAGGAGGGTGAATGTATACTTGTGTGTGTACTT
GTGTACGATAAAGAGGGAGAGGAAGGAGGAGAATGTATACTTGTGTATGT
AATGATTCAGTACTATATTGTCTTTCTGATCAGTCATGAACCTTAATTAA
CTTGTGTTATTGACAGATTTAGCTTGATAATTCAATACAAATTCAGTTGG
AAATC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.