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GrainGenes Sequence Report: AA016864

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Sequence
AA016864
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016864
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGTCGCATACTCGCATAGCCGACGACGGCACCCACCCACGCCGCAGGAC
CCCCCCTCACCCCGACGCAGCCCACGCGGCGGCGCTGCCACAATCCCAGC
CGGCGTCCACTCGACGGTCCAAGATTCCAGGCTCTTCCCCACATCGAGAC
CCCATGCCCTAATCCCAGATCCCGGCAATTCCTCATCCACCTCAAGATCC
CCCTTCCCCACCCCCCACCCCCACCCCCCTCCCCCGCCAAACCTCGCAGA
TGGCGCCAGGGGTGCCGAAGCAGCTCGCGGTGCGTCTCCCCGAGAACGAG
GAGGTTGCGCGTCTCCTCCTGGAGAAGCACCGGTCGATGCTGAAAGAGGG
CCTCACGGATAACCTGAGCCTCACGCTCTCCACCGCCTACCGCAACGTCT
GCGCCGCCAAGGAGCACATCCGGGTCCTCAAGGACCTGCTCAAGATCAAG
TACCCATCTTTCCGTACCCCTCCGCTGTTTCTTTGTTTTCCGTTCTTGGG
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GAGCCCTCCTGAACCTAAGATATGCTCCTCCGTTTGTTAGGTCATAGATA
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CTGTTTCTACTTTATGTTTCAGTGAAACTACAAACTTGTTGTATCTCTTT
TATAACCGAGGACTGCATAATGTACCATTGCTTGCATCTTAAATTATCAA
TTTATCGATGTTTTCTTACTGTTGTCACTTGTCAGGGGTGTTGGACCTTG
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GTTACAGTTCTGAAGTTCGAACTACCGTATGGCCTACCTTTGACTTACAT
AGTTCTTAAATTTTCATTTTTTTCCATGAGAAGGATAACATTGAATCGAT
GTAAACAAAATGACAGATTCTTCTAAATGCTTAGATATGCAACATTTTGC
TTTCTTTGTCATATTTTCCTGGTGAAAATTTTCAGTTCTATGTTCAGTCT
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AGTGACACAATTTGGAGAGAATTAACTTCATTTCAGATCTTTAGTCCAGC
TATTTTTGAACTCTATTTAAGTTTCTCCAAATTTATTAAGCTTCCTCAAC
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GACCCACTCATTAAAATATGTGGTTGAAGAGTTACTTGTACTTTCTAGTT
TTCCCTTTACGAATAGTTGATATTGTTTCACCTGTTACTGCTTACTAGTA
TAAGACACAATCCTGAATTGTGATCTACGATCTACTTTCATTTTTCTCAT
CATGATAGAATAGATGCTAGAGTGTGTTTTTTTTGCTAACTCATGGTTCT
CTTATTCTATTTAGAGTAACGGTTCTGGAAATATCATTCTCGGTGATTCA
AATTCTGATGAACCATATAAAGGGAACAGTCATTTTATAGGTATTGATTG
TTTGTACTGCATAAATTATCAAACAGCCTTGTTTATGTTCTACTGCACTA
GAATTAATCCTGACTACTCAACTGTAGGTTCTGAAAATTTTATTGAAAAG
AGGGATCGTCCAAAAAAGAAAGCACACAGTTCTGGTTCCCTTGATATGGG
TATGCTGTCAATTCAGATCATATTAACACAGTACAAGAGTTCGACATGAT
GAAAATGCTGGGGCAACAGCAAAATAACATGCCCAAAAAGAAAAGAAACG
CAAAAGTAATGTTCTCTACTAAATTCTATCTTGTAGGCAAGGGGCAAACT
TCTAATTCCGGAGTGTCAAATTATTCAGTTTCTATTACACCTCTTTCATC
TCGAGGAACATCTGAGCTGCAATCTTCTAGTACAACGGTACAATTAACTG
TTGTTGGAAAAAACTTTACTGTGCCTTGCTTGTTTTTTTAGAGTAGAACT
TATGCTATTCTTTTTTTGCCACTACCAGGGTTCTGCTGAATTCACTAATC
TAGACAAGGATAATGGTATAAGAAATTCTATACTAGCTATGCCACCTCGT
CTATCCAATGAAAAATTTCTGGAAGCTTATGAAGTGGTGTTGGTATTAGA
TGATCGTGAAACTTTCGGGTTCGTATGATTATACCCTACTTACTCAAGAA
TTAATGTATCTTGTTCTGCGGTTATATACTTACATCCTATCTTTAAGTCA
TTAAGTGTGATTATAAGATTGTCTTAACATATGTGTGCTACTCAGAATTG
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AGTTTTGAACGATGTTATTGCCCTCATTCTTTTTGGGGTGCTCTAGTATA
ATTGTTGTAGGAATGATTAATTCCACCCGTTGTCCCATTTAATCCTGCTA
GCATATAACAATGCAAATGAAGTCAATGGCTAATCAACGAAGGCCCAAGT
TTTCGGCATGACCGCAGGCCAAGATAAAAGAAAAGGCAAAAGGAAAAGTC
CAAGGAAGGCCCAAGATGAAGAAGGGCTCAAGGCAGATAGAAGTCTGAGA
GGAACGAAGCCTACTTGGGAGAGGAAATAGAGGGATTGGTCCACCATGGA
CTACAGACTCCTCTTCCTAGTCCACCATAGACTAGGTGAATCAAACTTTA
CCAATACACCCTCCCACATACCACTCATAATGGGCACCCTTGGTCTTTTA
CCAAGACCCTCAAGCCTATAGCAATATCCCCAAGAGCATGTACACCATTC
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TGGGGGGCTCCAGGGTCAATACATGGAGTATCGTATGACTTAGACTGATG
TCGAGGAAGAGAAGTTTGGAGTTGCCCTCGAGGAGTCTCGCACAACTCGA
GCCTTCCATCAAGCCTCCCTAGGTGCCTTCCTAATATAGGACTAGGAGCC
CAAGTTTTTCCATGACCAACAAGCCAAGAAAGGCCCAAGACGAAGAAGTG
CCCAAGGCAGAAAGAAGCCCACCTTGGGAGAGGGAAGAGAGGGCTTGGTC
CACCATGGGCCAAGGACTCCTCTCCCCTAGTCCACCATAGACTAGGTGGA
CCTAACTTTACCAATATACCCTTCCACCTACCACTCATAAGGGGCACACA
TGGTCTTTTACCGAGACCTGCAAGTCTATAAAAGGACCCTCAAGGGAATG
TAATCCGTTCACTAACTTGAATCGAGGAGTCTCGCGTGACTCGAGGCTTC
GATCAAGCCTCCCTTGATGCCTTCCTAACATAGTACTAGGTCATGCTCCG
GTGAGTCGATTGAATGTATTCAAAAAACATCCGTGTCATTAGTGTCGGTG
TATGACGACCTTCGCTATAAGGTCGTTGTACACACCACCTACTAATACTT
GTTGCGACTACATTGCTAATGACACCCCCTAATCACTCGTTGTTTCATAA
CAACAACAATGGTCATTTGAGTATTTGCAGCATCTGCATTTGTTCTTATT
TGATTAAGTTGCAAAATGTGCAACGGCATTCTGTTCTTTAGATTTGATTT
TAGTTTCTGTTGAAAGAAGATAATAGTTTTCACATGCTTTCTGCTGGATT
TTTCCTGAATTTAAAGACAGTTTGATTTCATAGTTTCTACCTTCTGCTAA
TGTTTGTTGAATTTAGTTTCTATCCTTCAAGTTCCATGTGTCATATTTTA
ATACATATTCAGTTTATCATTCAAGAAAACAAATTGATTATGGTTGCCAT
CAGTCATTTTAGAAATGCCAAAGCACCAAAATGAATTGAACTGATCCCTT
TTCTCTAGAAGTATACTTCCATATTTACTGCAGGACTACGTAGTGGTTTC
CTTAGTTTTCATGAAGAGTTATAAGTTACTATGTGGCTTGACCACACATG
GAATTGCATATTTAATTTTGCATGAATTGCCATTTGCATGTAGCTTATCC
CCCCACCACATCAACTGCACAACAGTTTAATGTTGTTTGGTCTTCCGTTT
AATTGCATATCAGAATTCAGATCTCATGATTGTTCCATTTTTGTGTAGGT
CCCGTGGCAACAGAGTAATTGGTAACATCCATTCCAAGTTTCATGTACCT
GTAGAGGTTGGTCAGATACAGACTTGTGTAGACTTACCTTACTAACCATC
TTCTCACTTCGAGTATTCAGTTCATTTTTCTAGTTTGGGTGTTATCTTGG
ACTCTTTGTACACATCTTAGATCACTAAATGTCGCTGCTACATATAATTG
ACACTGCATCAGCATGACTCTAAAGTCTAAATCAATGATTTGATTTGACA
TATTATACTATGCCGCTCTGCCAGTTAGAGAACTCTAGAAAAGATTAGCA
TACTCTTTTGTTATATGAGCAGTTTCCGTGTTGACCAGCGACTTGGCCTT
TTTGGCAGACGTGATCAAAACTTTTACTTATAAGTTAATTATGTTTTAGA
AATGTATAAAAAATGCGATGGAAAACTGGAAACTCTTTTCAAGACTCAAG
AGTAGCACATTGCAGACCATGTATTCTGTGAATGCACCAAATGACATTTC
GTTTGTGAGGAGAGGGAATATCAGATATTTTCTGTATTGCTAGAATACTT
GGCTGATATTTGTGGTCTGTGCTCCATTGTCCTGATATTTGCTACTTTCA
GTGTTTGATTGCTTGTGTTCAATGGAAAAACACATATAGCTTCATTGCCT
CATATCAAACTGGACACAATTTCCCAACTTGTCAGATTGTACTTATATAC
TTTAAACGTTCACAATCTGCTGGGTAGTACTAATGTACAATGGTAATGAA
TATGCTTTTCCTTTTCTTAAGACAGAAAAGTTGACGAGAATCTGCTGGGT
AGTACAATTGTTATGAATATGCTCTCCTTTTCTTAACATAAAAAGGTTGA
TGAGACATGGATCTTGTCTTCATTTGAAATGAACTAAAAATGATGAGAAG
CTATGCTTAGGTTGAACTGTTCGTGTTATCTGCCAAAGAATGTGGTGTTG
ATCGTGTTGTTTGAATCATGTTATCCAGATGAAACGCTTGCCTGTTGGAG
ATGGTATTTGGATTGCTCGTCACAGAAGATCTCGCACAGAGTATGTTCTT
GATTTCGTTGTTGAAAGGAAAGGTGTCACAGATTTAGTTAGCTCAATTAG
AGACAGCAGGTACAAAGATCAGAAATTAAGGCTAAAGGTAACATCTGAAC
TAGTATTAACTTCTGTTATTATTTTAATTTTTTTAACTTTCAGATTAACT
TCTCCTGTTCTTATACTTCCAATTTATGTCTGATCGGAGCAATAGGAATT
CTGTGTTTTAAGACTCTAGTTTGTTTCTTGTGTAATCCCAGTCACTGGTT
GCAGCAACCTAAAACATTGTTTTTGTCCGCCAGGGACAAAGCTAAAAAAA
TCTGTCAATGGGGTCAGCTGTATAACCTCTAAATTACATTGGGGTCATCT
TCTATAAATAAATATCACTTAGTACAAATTAGTGAGGATTTTGCTAGTTT
TCATTGGGGTCAGCTGACCCCAATGCCCATAAGGCAGCTCCGTCCCTGTT
GTCCGCGAGCCAATGACCAGCACAAATATTTAAGTCATTAGTTTGTTTGG
CAGCATTGTCGTGGAGGCTTATAGTGGATGTTGAAGTACCTGCAGCGTGT
AATGTTTGCTTTATATGCTCTGTAATTTTATCCTACAGTTGAAATCGAAC
TGCGCTACAAAATGCTGGATAGGAAGAGTGTTTCACTTGAAAAAGTTCTG
GAATTGAAAGAGTTTAATGTTAAACCCTAAACCCAAAGTTAATGGACCTG
TAGGTACAATCATCTGTTAACTACTTTTCACTAATCACCATGAAAAATTA
AAAAAATGTGTGAATAGTTCTTTTGTTACCTACATCAGTTTACAATATTG
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AATCCACAAATAATTTTGCTTATAAACAGGTTGGTCCTACATTTCGTTTG
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TGCAAACGAAGATGCGTGATTTTCTGATATTTATACTAAAACATTTGTAG
CTAATGAAATTTACTTTTGTTCATTTCTATGGTTAAAAAACTTGAGCTTT
TTAGCCGCTGATATTTTTTTCCAGCCATTGTGTTCTTTGTTCATGTTTAT
AGTTCGGCAGGAGAGAACTTAGTGTCTTACTAACTTTCACTAGCAGATCT
TATCTATTTAGCAACTATATCCTCAAATGGTGTTTTTTGTTTCTTGCACT
TCGCAGAAATGTGGGCTAAGGAAGCTGATTTATCTGGTTGAAGGTGATCC
AAACCCTTTAAACGCATCAGAGAGCATCAAAACAGCGTATGCATTGCATA
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GTTTGGTGCAAGAGTCATTTTATCAAATTGTCATGCAATGCAGGTACCAC
AGGTTACAGAAGAAACCGCGCTCGCCATTACAGAGCTCTACCCGACTCTT
TTCTCGCTTGCTCGGGCATACTCCATGCTTGTAAGTCCTCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTAAATTCTACTCTCTCTGTGCTTGCCA
TCAAGTACTCTTGTGTAACATCTATATATCTCGAAATGCTTTAATATGTC
TTGGAACTAAAACTTGTTCATGTAATGTTTATCAGGGTGACAATACTCGT
GAACAAGAGCAGATGTTGAACAAGAAGAACAAGATGGTAAACACTGGTGC
TAGCAGAAATATCTTCAAGCTTATCTGGGGTGAAGGGTGAAATCTTCCTA
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TCTTGATGATTTGGGTGCCACCTCCTGTGATGAAGCTCCATTGGTTCTCG
GAGATTTCACTTCATGATCTGAAGGAAAGAAGTAGGGTTGCTTTTTGGGT
GCTATGGTGCCTTCAGGTTACCTCCTGTGATGAAGCTCAAAGAGTGTGTA
ATCACCTAAAAATCTCCGATCCAGGTTACCTCTCTGTTGTAGACTTGCAG
GTCGTGCTATGAGTTGGTTAATGTAGTTACGGAGTATTATGTACTCGGCT
TCTTGGACTAAGCTGTTCCCTCAAAGGGCTAGTTTGGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.