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GrainGenes Sequence Report: AA039504

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Sequence
AA039504
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039504
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCCAACAGACACCCACTACTAAAAATTCCATCCATCTTCTCTGCCCCGTT
GGTTCCTCCTCCTCCCGTCCTCAGATCAGATCCGATCTCTCGCTCGCACC
GGCCGGGCGGAGACGTCACACGACCCGAGCCCCCGTCCGACAGTGTCCTC
TCGCCACCGCCGCCTGCCGCCATGGCGGCGGCCAACGCCCCCATCGCCAT
GCGCGAGGCCCTCACGGTAACACGCGCGCACATCAACACCGTCTCGTCTG
TCTCCCTCGGAAGTCAGATCAGATCTCCGGGGAGAGGCAGGGGCTTGCCG
CTTGACCAGCCGACTGACTGACGCCGCTTCCATGTCGTTGTTGCTTGCAG
CTCACCAGCCTGGGGATCGCGCCGCAGTTCATCACCTTCACCCATGTCAC
CATGGAGTCGGAGAGGTACATCTGCGTCCGGGAGACCTCCCCGCAGAACA
GCGTCGTCATCATCGACATGGCCATGCCCAGCCAGCCCCTCCGCAGGCCC
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TTAGAATTTGGCGGTGATCTCGGCTTGTAGCTCCGTATTGTAGTGCACAA
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AAGTCACATACATTCTTCTTACCTTCTGCTGAGGTCTACTGATATGGTAC
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GCTCGCCAGCAACCCTGATTGTAGCATGGCATCTATTTCGCTGCTACTGT
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TGTTCTCATTGAGTAGATGATGAATTGCATCACCTTTTATTGTTGACGAT
ATTTTTTTGTCAGAAAATGATTCCTTCGGTTTGAGGATAAACAGTAGGGT
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GCTTTTATTTTGTTGACGATATATTTTTGTCAGAAAATGATTCCTTCTGT
TTGAGGATAAACAGTAGGGTAGTGCATGACAGTATATGTACTAGTATTAA
CAATTAGAAGGAAATATGTACAAGACATGGCCATGTGGGAGTATAAAAAT
TACATACATAGGTCCTTATCCTAAGGGGCTGTATGTTGGAATTATCCCAG
GCATAGAGAGAACTCACATACCTTCTCCCTGAACTTAAAGGATTGAAGAA
GAGCCTCCCTTTTAAAATGGCGAGCCCACTAAGACCTAGGTTAACATCTT
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CGTTATTATCTTCCTATTTTTGGGCTAGTTAGTTGTCATACAGAAGAACC
TGCAGGAAAAACGAATTCATCTGATAGGAAGTGTATGTTCTGTACTCGTT
TGATGTGATAATTTGTTTATCCTGCTTTCTACATAACACTCCTTACAAAT
AGAGTTAGTGATGTTGATTATGCAAATAGAGTGCTAACAGTGAGGAGCTG
TTCTCGCAGAATCAGAGGTGTCCTAACTTAAATTGTATAAGTTGAAATGA
CTGATTTATAGATCGGCAGCATTGTTTCTGGCTGCTAAGTAGTGTCTTGG
ATTCATTTTTGTTTGTGGAAACTGCGTATTCGTACTTAAACATTACTGTC
TGTGTACTTTGATCTATGTATTTCAGGAAGTTACAGACAGTAATAATATT
TTTCACTGAATTTTGCAGCTCAAATAGCTGGAACCACACAGGATCACTTA
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GAATGATAATGTATTAATGTATAATCCTATTCAATGCATTATCATACATG
TCGTCTGTTCTGCAATCGCAGGTAGTGTTTTGGAAATGGATCACACCAAA
GATGTTGGGTTTGGTAACGCAGACATCAGTTTATCACTGGTCAATTGAAG
GTTACTCTCCTCTGACAAATCACAGCTATTCTCTGTTTAAGCACTTCCAG
CTTTGCATGATTTGGCTGCTATGTAATATGTATACAAAACCAAGATAATC
ATTGCTTGCTTTTGTTGGAATGCAGGAGATTCTGAGCCTGTTAAGAAGTT
TGATAGGACAGCTAATTTGGCAAATAATCAGATTATCAACTACCGATGTG
ATCCAGCAGAGAAATGGCTCGTGCTTATTGGAATTGCACCTGGTGCTCCA
GAGGTGTGCCTGTGATTTACATTCTTGATAGTATCGTCAAAACATATTTG
AATGCAGTATGAAGACCATAATTCCTTTTGCGCCCCTTCCTTGTATTGTT
TATTCCGTTTCTTTGATAATTTTGACCGCTCTTGATGTGTAAGAATATAA
TTTTCTGTTTTGCAAAATTCTAAGCAAATCTACCATGATGAGTTATGAGA
GCAGTTGTTGTAGGCACTTATTAAATGATACTTTGTCATATCTGCTTCTC
ATATTGATGAGCTTTCCTTTTCACCTATCAGAGGCCGCAGCTGGTAAAGG
GAAATATGCAACTTTTTTCTGTGGATCAGCAGCGTAGCCAAGCACTTGAA
GCCCATGCTGCTTCTTTTGCAACATTCAAGGTCCTTTTCAGTTGTTTAGT
GCTGCTTATATAGTTTTTCTTCTAGTGTTTAACAACTGTGCTTGGTTTTC
CTATCCAGGTTCCTGGCAACGAGAACCCATCCACCCTCATCTGTTTTGCT
TCGAAGGCATCTAATGCTGGAACAGTTACTTCTAAGTTACATATTATCGA
ACTGGGCGCCCAGCCAGGTCTGCATTTTAAACCCTGAAGTTCTACTTTTG
ATTATATTGTCTTTGCACTTAGTCTTAGTAGAACAAACTTGAGACAACTA
CCATGTTATAAAAGCAACTTAGTTTTTTACATTATTGCCATTATATTTAG
CTACCAAAAAATTGTTTTGTACATTTTATTATTGGAGGCTTTCTTCGAAG
TATCTTGCACTGTCATTAAAAGTCAATTTTTTTAAGAATCATTATCTTGT
TCTTATTTCTGTTGCTGATTCGTTTCTTGCAGGGAAACCTGGCTTTTCCA
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GTAGCCATGCAGGTATTGTTACAAGTCTCAAAGGTATTGATACCCTGTTT
GTTACCACATATTATCTAATTCGTTTTGTCTTCTTTTGATTACAGATCTC
TCAAAAGTATGGCCTTGTCTATGTAATTACGAAGCTTGGGCTTCTGTTTG
TATATGACTTGGAAACTGCTGCTGCAGTTTATAGAAATAGAATCAGTCCA
GATCCCATATTCTTGACTGCAGAGTCTTCTACTACTGGTGGATTTTATGC
TATTAACAGAAGAGGGCAGGTTTTGCATGCCACAGTTAATGATGCAACCG
TTGTGCCTTTTGTCAGTGGTCAAGTATGTCGTTCTGCTTTCTTCTATTCC
CTGGCTGGTGCATATGTTGGATAATCCTATTAAAATTTAATACATCCTTG
TTTGTGCAGTTAAACAACCTTGAACTAGCCGTTAATCTTGCCAAAAGAGC
CAATCTCCCTGGGGCAGAGAACTTGGTAAGCTCTATAGCTAATATGCTTT
CGCAAATGTTGGTTTTACATTTCAAAAACTTGCTTGCATTTTTATCTATG
CTTGTATTTTTGCATAGTTCTTCAGTACGAGTTTTGTTACCGTTTGGTTT
CTTTCTAGATTGTTTAGCTATTTGTTTCTAATTTCGCCGCTCTCCATAGA
AGTTCTGTAGCTGACATGTTTCAGTCTCCTACATTTTGGCACTTTATTGC
CGAATGACCACTGTAGTCTTCCTAAGTTGGTTACACAATCATTTCTTAGC
ATACTTCTGTTCCATCAAAGTTCATGCTTGTTCGTTAATCATTTTGTCAG
TTACGACTAATTGTTCTCTAGATGGCAATAATCATTTTCCGCCTATAACT
TGTTATAGTATCCATTTTGTCCAAGTACTCTTGGAGTGCTTATTGCTTGT
GCTGTAAGTATTTATTTGTTTGCACTGGAGTGCTTACCCTTGCCCTTGCA
GTCAAGCAGATGTTAAGCCCTATACTGGCTGTAGCATTTAAGATATTTAT
TTGGAATCATATTTCCGTGTCTCATTTCAATGTGTGGGACTAAGTGTTGA
ATTTTCTGAATTGCAGGTTGTTCAAAGATTCCAGGAACTGTTTGCACAGA
CAAAATACAAGGAAGCAGCAGAGCTGGCTGCAGAATCTCCTCAGGGTCTT
CTGAGGACTCCCGAGACCGTTGCCAAATTCCAGGTGCCTTTCTTTTTATG
CTGCCTATGAAGTGCTCTTAATGCTTATATACTTAGTGGTTTGTTGAGCT
TTTGTTTACAATTTCTGATAAACTCTTGGTATTTATCATTTCTTGAGAGT
AGGAATGTTCAATTACAAATAATATATCATCTTGTTTTCGCTGGTTAATC
TGCTTAAAGTATTGCTTATTGCGTATTTGAAATTATTACCTGTTCACAGA
AAATACAATTGCCAAAAAAAAATACTACCTCTGTTTCAAAATATAATGCC
TACAAAAACATCTTATATTTTGGAACAGAGGAAGTATCATATTTATCTTT
TACACATATCTACAGTTAATCTGTTTAAATTGTAGGTTTGTCTACTTGGC
TGATTTGCTATTTATGTGCTTCAAATGCAGAGTGTTCCTGTTCAAGCTGG
GCAAACGCCTCCACTCTTGCAGTACTTTGGCACATTGCTTACTCGAGGGA
AGCTCAACGCATATGAATCTCTCGAGTTATCTCGCCTTGTTGTAAATCAG
AACAAGAAGAACCTTTTGGAAAATTGGTTGGCAGAAGACAAGTTGGAGTG
CAGCGAAGAACTTGGAGATCTTGTTAAGGTAAAATTGTGTTGAGCCGTGC
TCCTCATCTGCATATAGTTTGTTGTGCTTCCATCAATTTTATTCACTGTT
GTGTCTGGAATGTTCACTCAATTTTATTTTATTGCAGACGGTAGACAATG
ATCTTGCGCTTAAAATATACATAAAGGCTAGGGCAACCCCTAAAGTCGTT
GCCGCTTTTGCTGAGAGGAGGGAGTTTGACAAGATCCTTATATACTCAAA
GCAGGTATAGTGCTTTGGCACTTCAGATTCTTGTTTCCAGTTGTTACGTT
TGTCCAGCTTGGAAATTAACCATCAATCTAATACTTTTGCTATTCCAGGT
CGGATACACTCCTGACTACCTCTTTCTCCTCCAGACCATCTTACGTACAG
ATCCACAGGTAATAGGTTGTTTAACTGTGCTGTGATGAAATATTTCATGC
TTTTTTGTTCGGTTCTTTGATCTGCATAAATCCTTGCCTAACCGTTTATA
TATATTTGTGATCAGGGAGCTGTCAACTTTGCTCTCATGATGTCACAAAT
GGAGGGTGGTTGTCCACTGGATTATAATACCATAACTGATCTCTTCCTTC
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TTTTTGCATGTTTAACTAATTTGGCCGTATGTTTTTGCCTTGCCCTTATG
TCTTCTGTTGACAGAGAAATATGATACGCGAAGCAACAGCTTTTCTGTTG
GATGTACTGAAACCAAATTTGGAAGAGCATGCTTTCCTTCAAACCAAGGT
TGGTATCTCTGTCTTTCTTTGAATATAGATGGTTTACCTGCATGCTTCGT
TACTCAGTAGCTTCTGTCTGAATCCATTGTAGGTTTTGGAGATAAACTTG
GTGACATACCCCAATGTTGCTGATGCCATTCTTGCTAATGGTATGTTTAC
TCATTACGATCGGCCTCGTATTGCTCAGCTGTGTGAAAAGGCTGGTTTGT
ACTTGCGGGCCCTCCAGGTCAGTATTTTTTTGCATTGTTTTGGTTGATTC
TCTTATGCTCTGTGATTAATTATTCTTATATCCGCGATGCAGCACTATGC
AGAGTTACCTGATATCAAGCGTGTTATCGTGAATACCCATGCTATTGAGC
CACAGGTTTGTTCTTTTCAGTTATGATTGGTTATCAGTCTCTTTATGTCC
GGTCCATTAATATTTTTTGTGCACAGGCACTTGTTGAGTTCTTCGGAACC
CTTTCTAAAGAATGGGCATTAGAATGCATGAAGGACCTTCTACTGGTCAA
CCTTAGAGGAAATCTTCAAATTGTTGTGCAGGTAATCCTGCAGAGTTCCC
TTTTAACTTTTCTTTCCCATAGCTCTTTTTTTCTTTATTCTAATTATTAG
AAAACCTATGGCTCGTCTGCAGGCTGCCAAAGAATACGCTGAGCAGCTTG
GAGTTGACGCTTGCATAAAATTATTTGAACAATTTAAATCATACGAAGGC
CTCTACTTTTTCCTGGGATCCTATTTGAGCTCAAGGTAGTTACTTGTGAT
GTTGGTATGTTTCAATTGGCCTTCTCTTATAGTGTCATCACACTTTAACA
CTTGACTTCATCACATGCAACAGTGAGGATCCAGATATCCATTTCAAATA
CATAGAATCAGCTGCAAGGACTGGACAGATTAAAGAAGTTGAGCGAGTCA
CCAGAGAGTCTAATTTTTATGATGCTGAGAAGACAAAGAACTTCTTGATG
GAACAAAAACTACCTGATGCCCGTCCACTCATAAATGTTTGCGACCGCTT
TGGTTTTGTTCCAGATCTTACTCACTATCTCTATACAAATAATATGCTCC
GATATATCGAAGGCTATGTACAGAAAGTATGTAATTCTTCAGATTCAGGT
TTATTTGAGTATCACTTCTAAAATGTTGAGTATATGAATGAATGGCTATT
TCCTTTTTTCTGTGTTTTGTAGGTGAACCCTGGAAATGCTCCTTTGGTAG
TGGGGCAGCTACTTGATGATGAGTGCCCAGAAGATTTCATTAAGGGTTTG
ATTTTGTCTGTTCGCTCTCTCCTTCCTGTCGAGCCACTGGTTGATGAATG
CGAGAAGAGGTTTGATTGTTAGCTCTTATCCTGGACGCACATGCACAGCT
GCCTTTTCTCTTGGTCTTATTTGTTTGATATTTTAATCAGGAACCGTCTA
CGGTTACTTACACAATTCCTGGAGCACTTAGTGAGCGAGGGTAGCCAAGA
TGTACATGTCCACAATGCTCTTGGAAAAATAATCATTGACAGCAACAACA
ATCCTGAGCATTTCCTTACTACCAACCCGTTCTATGACTCCCGTGTGGTG
GGTAAATACTGTGAGAAGAGGGATCCTACGCTTGCCGTTGTTGCTTATAG
GCGTGGACAGTGCGATGAAGAACTTATCAATGTTACCAACAAAAACTCGT
TGTTCAAGCTGCAAGCTAGGTATGTAAAAGTTGTTGTCCTTCTGATGCCA
TATTGTTGTTGTGATTCTTTATCTCAGTTGGCTGTCTGCTTACATGCTGA
AATTGCATCATTTGAATGAATTATCAGGTATGTGGTTGAAAGAATGGATG
GTGATCTGTGGGATAAAGTTCTACAGCCTGAAAATGAATATAGAAGGCAG
TTCATTGACCAAGTTGTTTCTACCGCATTGCCAGAAAGCAAGAGTCCTGA
GCAAGTTTCAGCTGCTGTTAAGGCTTTCATGACAGCTGACCTCCCCCATG
AACTGATAGAGCTACTTGAAAAGATTGTCCTTCAGAATTCTGCATTCAGT
GGAAACTTTAACCTTCAGAATCTTCTCATCTTGACAGCCATCAAGGCGGA
TTCATCTAGGGTCATGGACTATGTTAACAGACTAGACAACTTTGATGGTC
CTGCCGTCGGAGAAGTGGCTGTTGAAGCACAACTCTATGAGGAGGCTTTT
GCTATATTCAAGAAGTTCAACTTGAATGTGCAGGCTGTCAATGTTCTGTT
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CTAGTTAGCGAAGCAATCGAATCTTTCATTCGTGCAGATGATGTGACACA
TTTCCTTGATGTCATCCGTGCTGCTGAGGAAGCAAATGTATACCATGATT
TAGTTAAGTACTTGCTGATGGTAAGGCAAAAGGCAAGGGAACCCAAAGTT
GATGGTGAACTCATCTTTGCATATGCTAAGATTGATAGGCTCAGTGACAT
TGAAGAATTTATCCTGATGCCAAATGTTGCGAATCTCCAAAACGTTGGTG
ACCGTTTGTATGATGAAGAGCTTTACGAAGCTGCAAAGATCATCTATGCC
TTCATCTCAAACTGGGCCAAGCTGGCTGTCACCCTGGTCAAGTTGAAACA
GTTCCAAGGTGCTGTAGATGCTGCTCGCAAAGCTAACAGCGCTAAAACAT
GGAAGGAGGTCTGCTTTGCTTGTGTTGACGCTGAGGAGTTCCGTCTAGCA
CAAATCTGTGGCCTCAATATTATCGTTCAGGTATATAAGCAGGGGCATCC
TTTTGTAGCAAAAACATTTGCTAAACATATTATCCTTTCTGAGGACCTTT
TCCATGCCATCCTTTCTGACATGCCTTCTTTTCTTTAGGTTGATGACTTG
GAGGAAGTAAGCGAATACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAGTGAGCTTAT
TTCCCTCATGGAGAGTGGTCTTGGACTTGAACGGGCACACATGGGCATCT
TTACAGAATTGGGAGTTCTCTACGCTAGATACCGCCCCGAGAAGCTCATG
GAACACATCAAACTCTTCTCCACCCGTCTCAACATTCCTAAGCTTATCCG
TGCTTGTGATGAACAACAGCACTGGAAAGAGCTTACATACCTATACATAC
AATATGATGAATTTGACAACGCTGCCACCACTATCATGAACCATTCTCCA
GATGCATGGGAACATATGCAATTTAAGGATGTTTGTGTTAAGATTGCAAA
TGTTGAGATATATTACAAGGCAGTGCACTTTTATTTGCAAGAACACCCTG
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CTTACACGGAAAGGGTCTCTTCGGTTGGTGTCCCAGTTTCATATGCCATG
CTGAAACTTTGAATTCTTCTGTTATCTTCTATGCAGGCTGGCCAGTTGCA
TCTTGTGAAACCGTACATGGTTGCAGTTCAGAGTAACAATGTCTCTGCCG
TCAATGAGGCTTTGAATGAGCTTTATGTTGAAGAGGAGGACTACGAGAGG
CTCCGTGAATCTGTTGACATGCATGATAACTTTGATCAGATCGGTCTTGC
CCAGAAGGTAAAAGTAGTAGACGAATGTGGGATGCTTCTTTATGGTGTGT
GACTGTTTTATAACCAATGCCTTCAATTCTTGATCAGCTCGAGAAGCATG
AATTGCTTGAGATGAGGAGGATTGCTGCCTACATTTACAAGAAGGCTGGC
AGGTGGAAGCAATCTATTGCCTTGTCGAAGAAAGATAACATGTACAAGGA
TTGCATGGAAACATGCTCACAGTCTGGTGATCGTGAGCTCTCAGAAGACT
TGCTTGTTTATTTCATTGAACAGGTTTGAATTCTCTGTGAATTGAGTTAT
ACCTTCTCTTGTGCTGGTTTTAGCAGCGTGAATTTCTATTATGAAATTTT
GAACTTCAGTCCTTTTGTGGCATCTATAATCAGCATACTGACCTAGAATA
TATAAATCTTTAGGCTGCAGGAGTTGTCTGCGCAACATTGCAATTTTTAA
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CTGCCTCTTCATTTGCTACGACTTGATTCGTGCGGATGTTGCTCTTGAGC
TTGCATGGACGAACAACATGCTTGACTTTGCTTTCCCCTATCTGTTACAG
GTATACATATTTATTTCAATGTGAATGTTGAGAGCTGTTCTTATATGTAC
AATTTGCTATAATAGTATCCTCTCTGCATGCAGTTCATCCGTGAATACAC
AAGCAAGGTAGACGATTTAGTAAAGGACAGGATTGAATCACAGAAGGAAG
AAAAGGCCAAGGAGAGCGAAGAGAAGGAGCTAGTTGCTCAGCAGGTAATC
TTGAAGTGCCTTTCTTTCGGTTGAACGGCCTATTAATCATATGCTTAAGC
AGCATGCATGACAAGTTGGATTCTGTTGTGTAGAACATGTACGCCCAATT
GCTTCCTCTCGCCTTGCCTGCTCCGCCTGGTATGATGGGCGGTCCACCTC
CGATGGGTGGAATGGGCATGCCTCCGATGGGCGGAATGGGTATGCCACCG
ATGGGTCCTGGTCCGATGCCAGCATATGGGATGCCTCCGATGGGAAGCTA
CTGAGTTATCCTCTCTCATGCTTTTGAGGAGTGTAGATGATGTCAAACGT
TTCAGTTTACCCAGAGAGAAACATGAGTACCGACCCCAAGGTATCTTTGA
AAGTGTTAGATCTGCGTTATTGGTTGTTCCAGTTAATATTCTTTCCGGTA
CCAGGACAATTTTGGAGAGCGGAATCTCTAGCCGAGTTTGAGTTAATTAC
AGGTCGCTATATATATATTACGATCGGATAGGATAAGCAGCATGACTATG
ATTAGACTCAGTTGAGGTGGGAATTGCAAGACTGGTACCATTTGTATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.