Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044656

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044656
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044656
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCCAACCCTAACCAGGCGGCGCCATGGACAAGTTCCTCGTGGCGGCGCC GCCTTCCGCTGGAGACGACCCTGAAACGTCACGACCGCCGCCTCGGAGGT ACTCCACCTCGAACCCCGTACATCTCCCCCTGTACCGCTCCCGCCTCCTC TCTGTTCTGACCTCCCGTTTGGTCCGCAGGTGGCACCGGTGGAGCCGCAT CGCCGTGGAGCTAGACGGGCGCATCGACGCCAGGTTCCGGCATCGGGAAC TACGCCGCCTCCTTGACTCCTACGCCGAGGTGGTAGAGATTTGGAAACAA GTGATGTTAATTTTTTTGTTCGGTTCTCGCTTGGTTGCTGTGTTCTCCAC TGAAATTACTGCATAGGTGTTTGGGAATAGGAACTGAAATTCTCCAGAAC CGCAGAGATGGCTAATTTATGACATTCTTAGGGAATTTAGTGGTAAGGCA ATGCTAGAGTAGTTTAGTGGGAGCAAAGCTTAACAGTTATACCCATGTCA GTGGACATTGGGGAGGGACTAGTTCAGATAGATTATCTCTCTTGTGGAAG AACTGTGAACTATCCTGCTTGTGTTTTGTAGTTTATCGATATTCACATTT GTGTGTTAAATTTAGAATTTTATACCGGAAAATGGAGGAATTTTGGCAGT GCCTAACTGCCTATGCTTTTCCGAAGTTTTTTTTTCTCTAAGCAAAGCAA CTATATTCTATTTATATGTTAGGAGATAATGTTGAAAACTGTTTCTGTTT TTATTCTGAGAAGACTAGGACCTTCGAGCACAAGTACTACAGACATGGCG AGGAACGGTGCCCGACATATGTAATGCTGATAAGTACACTGGTTTGTATT TCGTGGTGCTGATTCGGTGCGTATTATCTGGCTAATCTGTTTACACTGGT GCTCCTTTTAGGTGAATCACATGATTAATGCTTCAAATTTTGGCGAGTAT TACCATCCAGCAAGGTCAGTATCTATCTTTTTTCTGGAGCATTTCATTGC AAAATTACTAGTGTTATGATCACTTTGTATAATTCCATTGCACCTTTGTT ATAACATTCCTTATTAGATAGGCTAATAAACTTGTTTTATTGCATTTGGG CAGGGAGGGAGTTTCAGCAATGGAATTTGATAAAAAGGTAGCATGGAAAT GTATAAAAACATTCATTATTTCTAGTTTAGTATCGCTAGAACAGGTGTAT CAATGTCAGACCATTCTGCTTGGAATGATTGTTACGCTCCGTTTCACCTA GAGAAAGGAATAAAAGGTCTCACGTTTATCCTACCAATACTTCTACAGTT CCACTCATTTCTGCCCTCTCTCCAGTATGTGGCCAGAATGTTCCGTGCTG CTCTACTTGGTACCAGTTATTTGGCAATCTCTTTCCTGTTAATATATGTT TGACTAGAAATATTACTTATATATTTTTCCATTATGTATAGGCTGAAAAA TTGAACTTGTATAGTTTTCTTATAGAGTAGATCATTACCCACTGTAACTA CCTAGTACCAGAGCGTCCATTCCAACCATTTGAATGGACTTAACAAGTAT AACCAAAGTTTGTTGATTCCTTACTGGTTTTTAGTCAGATTGTGATACAT AAAGTATTTAAGCATCTTCCTTGTTTTTTTAATTGTGCAGGGAGTATACC TTGCATCAGTGACAATGTCAGGGTGTTTAACAGTACACGACTTTGAGACT TTATACTGCTCCTTGTATGGCCCATCATGTAGTAAGTTGAGCTTACCCGA CTCACTTCTCTGAAAAATGCTGAAAACAGATGCCTTTCAAAATAACATTC TCGGGATTATGATTATAGTAGAACCGCCTGTAGATGAAAATATCTGTGTT CTGCATAGGATCAGGATTAGGATGGTCCAACAGTAACATATGATTGTATA CTTTACAACCAATTGCGATCTTTGCAATTTTGCTTTAAATACATCATGCA TTCGGGAATACTATAAAATATGCAGCAATAACTTCCCTAAGAATGATGGT ATAGTTTTTAAACCCTGATGTTCTCCTAGTTCAGGTTACCTTCTTCGAGA AAAGAGACCAAGTTCACCATGTGCATGTGATTTGGATGGGATTAAGGATT CCAATAATATGGATGTACTCCGTACGTTCTGTTGATGTAAAATGGCCTTG TTAACCATTCTAATATCCAGTTAGAGTTTATGCTTTATATATCCATATAG AGAACCAAAAAGTTGAAATGAAATTGTACTGGTATTTCTAAACCAGTTAA TTTTGAAAATAACAACCTTTCAAAATATTCAAGGACATACTCTGAGATAA GGATAGGTTGAACACAAAATGATTATTCATAGTTTACTGTCTCATGCTTC GTTGGTAGGTTTGCCGGATGACTCATCAAACTATGTGCTCCATATATCAA ACCAAATGCCCCTATGTGCTGTCCGATGGAATCCAGAAAATCAAGACGAG GTCGGTATCAGCATTGATTTTTCTATTTTCACTTTTCTTGAGTTAAGAGA ATTTGGCACATTGATGAGGAATGACAAGTGTATCTGGCATTATGGACTAC AATTTGGTTTATTTTAAGAAGTAAATGAAGTGCTTTTGACTTCCATGTGG TTTCTATCTAACTCTATTATTGAACTTTAAGCATGCCTTATGCAGATTGT TTGCTCATCTAGCCAAAGTGACAAAGTTTTTCTGTTTGATATTGGCTATG TCTCATCTGTTCCGACTGAAGTAAGTACCTCTTTTACATTGTTCCTTAAC AAATGCTTCACATCATCACATATTACTCAAGGATACTTTAAGTATGTTTT CTACATGTTGACTTACATCTGAATTTCAAATATCAGAGTTCTTCCTTTTC TCCTTCAATTCCTAATAATCATGCCAGTAAAAAATATTTTGGTGTTACCT TCCCTGTTATGTTTCTGCCAAACGGCACATGTGGCCATGAAATTTTGAGC TTACGTGTATGTTACATAGCACACTATGTAGGATTTTTCCCCAGTTTGTT TGGTACAGTACAAATATCCAAACCACTAATGGCCAATGGGTACACCCGTG TTTAGAAATCTGTGATCCTTGGTCTAAATCGTATAATACTTTAAACAAGG TTCACTCTGCATCACTAAAAGCTAAGTTACACAGTATTCTAAAGAAACAG TTTCCAAACAATATGTTTAGAAAAAAATACTTCCAGATGTTTGCACTTGT ACATCTTAGTCCATTAGAAGGAAATTTGTTATAGTAGCTCGAGGTCCATT ATTATGTAGCTCATATTACTACACAACTTCTGTCATGGCCCTTCTGATTT TTATGTTATTTTATTTTAGGTTTTACAGAAAGGGAAGACCAAATTTCACG CTCTCTCCTCCGAATCCCGAAAGGGTTTGACTGATCTAGCTTTCACATCA GATGATAAGTCACGGTATGTGACAATTTTGTGCTTATTCACACCATCATG TCATTTGAGATAAGGGCCAATCATAAACATTTCTAATTAGCAATTAATAC GAAGCTGTTTATAGACAACTGACTGCATAATATCTTTTTCCTTCTCTTTA TTAAAGTGGAAAGTTCCTCTGTAGTCCCTTAAAGAAAGACTGAAGAATTA TTAACAGTTGTGAAGCTAAATAAATGGAGTCGTGCTAATATTTGCTATTA CTCTGATGATAGACCTTTTTACTTTTCTGGATGGAGTGAGATGTGTTTGC AAGAACAGAGTATGTAGATTCTGCTTACATTGGGTGTCAGTGTGAAGTTT AGGTTCTGCTTATGGTGGATGCTGGTTCACCAGGTAAATGCAGGTCTCAG TGTTAATCACCAAGTGTGCTGACAACATTGCTACAGCCTTACCGATATAT TGGTATTTTAGGAGGCATAAACTATGTATACATGCACCAGATACTAATAT TCTTCATGAGACTTTTCTTGCTGGAAATTATGCATAAACTTTGCACTTAT TGGCTCTCCACATCTAGGCTATTTGCATCTGGACTTGATGGTGCAGTCTA CATGTGGGACAGGCGGTTAAGTAAGACTCACTGTGTTGAGCTTACAGCAC TCCCAGAATCTCAATTTACCAGTGTCGAGCTAAATATGGATAATCGGGTA TGCTAATTCTTAGGTTAAGTATATGTTGTTCTGTAACAGTTAGTATGTAC CTCTCCTAATTCTCAGGTTAAGAACATGATATTCCATAACAATAGTTCTT TAGCTTTGTTAATGCTGTCCTTTTATACACCACACCACCAAACCTATGTT TCAGATTGTCTTGCTCTTTTATTACCACCTAATATATTGTAATGCACTTA GTCTGCTGATTTATTTTTTGGATTACCCAACCATAATATCCTGTTTAGGT GCATCTATTCTATGATCAATCAAAACTTTGGTCTCGTCCAAATTTAGTGT TAAAAAAGAGAGCAATTTAGTTATTTTTTGTCGATGCGGCTTACATTTTC TGTTAACTTGACTAGTTAATCTAATTTAAAATTTTATGTTAACTTCAGCA ATTAATATAGTCTAACCATAAATATCGGACCACTCACGTATAGGAACTTA CTGTTTATCTTTTCAGACAGTGTTTGGTGCAACTAGAAATGGTACAGTTC ATGCTTGGGATACGCGTGGAGGGAGGGCATCAGCTGCTTTTCAAAGCCAT AATGAGGTACATTCAGCAGACAAATATTCTGCTAGTTCTGCTTATTTTCA TGTGATCTATTCTAAGGTCATGCAACTTCCAACTTGATATTCAGCATGAT AATTTTAGCACTCTGAGAATAAAAAACCAAACTTCTGTTTGTGAACTTTG TATAGGCTGTACCAACAAGTTTCTACAGATTTACACATGCCTGTCTGGTA GAGCAAGCCAGCTTGTTTACAAGTAGTACAAGCTAGTTTCTTTGATTGTG AATGCACACTTTTTACTAAGATATTTTGAAATGATATCCCAATAGTTTCT TTTGTTCTTCCATCTTTATATACCTGCAACTGTGATTAGTGGTTTCCAGG TGCCAAGAAAATAAAAAATGAATAAAATCTCAGAGAAAGGAAACATGCTC CTTGTCTACCGTGCCCTTGTGATAAATATTAACTGTGGGACTTAATCTGG AACTTATTAAAACTTAAAATATGCTAAAACCCCTAAATTGTAGAAACAAT TTTTGTTGAGATATGTTAAATAGCTGTGAAAGGTTAGAATAGGTAGTGTA CTAGACTACTAAGTGCAATTGCGAGGGATAATCTGTCTTTTTATACTAAT CTTGTATTTCATGTGATGACACGTGACAAGCTAGTACCATTTATATTCAG AGAAATTAGTAGACAAAGAATTGCCCTTTATTGTGAACCTTTAATATGCA GCAATGTCAGAGCTGTCTTGGCAACACGAGTACTAGTTTTTCTTGCCTTG GTTCTAGGCTGACAAAACTTTTGTCCAGGTTCAACCATTATCGTCAGTGA AGATATCAACGTTGTTGGGAAAAATTGCATCGCTGAAGGTATGTGAAAGA TAAGTAGACTTAATAATTGACATTTATGCTACAAAAAGTTCATGCACTTC CCTTTCTTGTGACCCATATTGACGCCTCACATGCACATAGTGATGTTTCT ATATCAAAGCCATCTGCATGAACTATCAACTAGTTCGGTTGTTAGAATTA TTATACAAATATTGGCATATGGTGACTCACATGATAAAAGTAGTCTAGTC CACTGGACCAACGTATCTGTTAGGCACCAAACAATATTATATACATTATC TTATGTTTTATTAAATGATATATAAGAACAAATGTCGGATTCTTTTCTTT TCCTGACATAAGGCACAAATGGTAAGACTAGGAATCAGCTACAGAGTGTA TCATCTGTAGAAGGCACAGTTATATTCATATACTTATATTGCTAACAATA TTGAAGCTACACATTGTATTTCCTATTTTAACATTATTTTCACCCTTTTA ACTATTTTCAGAAACAATCAAACATTGTTTCAAGTGAAGTTCTGTCTATA GACTTTAACCCTAGTTGCTCATATCAGTTGGCTTTCCATCTTGATGATGG CTGGTAAGTATCTCGGATTTCACTATTGTTATATAAATCAGAAAAAGAAA GGGTTACTTTTTTCTTTCTAGAGTTTTGTATCCATCTTTTTTTTTTCTAG TATAGATTTCAAGGTGCTGTGTGGTGTTACTATGTGCCAGATCAGTGATT TCTCTTCCATCTGAATCCCATGTTAGGTCTGGAGTCCTCAATGTTAACAC CCTCAGTGTGAGTCATCTGCACTGCCCTCCTCCTGCTTGGTTGTAAGTGT TGATCTATGGATTTCTTCAAATTTGAACCACATTACAGTTTTTTCTTATT AAGCTTTGCAAATATGACCAAATCATCTTCCCCAAGGAAATATGACCAAA TTGTTTTGTGGTCCTCTGCTGTTGTTATATTAGGGAGGGTGTGGACTCTG TGTTGCATAAGCGGAAAGCTACCTGGCTGTCGACATCTTCAGTAAGAAAA TATTATAGGGCACCCCTTAATCTTAGCACATGAAATCTTTTTCTGAAATT GTACCCCTTATGAAATCAGATTGAGGCGAATAAAATTTCATGAGTGCTAA AACATGTAGTCCCGCGTACCATGCTAGCCATAATGTCTACTATTTCCACT TCTTGACAGAAATTATTTTGTTTGAATTGTTTCTTGACATAAATTATAGT GAAACACATTGAGGAATTTGATGCATGCCACATGTTTACATTGTACAGAT TTATGCAGTTGGATCTTCCTCCAGTAATGGAATGTATGTACTAGATTTTC ATCCACATACAAGCTCTGCATGCCACGTGGACTACAAGTGAGCTGATATT TCCTCTCTTCTCTCCTGGTTTTCACATAACCAACTAACCTGGCAATCTAA TCTTCTACTACCTCCGTACCATATTATAATACAGATGTAGTAGTTGTTTG CTGGGAACATAGGTGGAGAAGTTCCATAATTTTAGCAATTCTTGTTATGA CTGGGTTTCAGTAAAAAAAGTTCCGTAGGAAATAAACTCTTGTTTCGGCC CAGTTTAGGCATGATATTCATTCACTTGGTATTCCATGTTTCAGTGAGGA AACAAGAGGCTCCGAAGAAAATCAACCTGCAGAAAACAAGTTTATTCCTT TATCCGAAAGGGTTCTGTCATGTGCAGCCCATCCACTCAGTCATAACATA ATTGCTGGTACCGAGGTTCGTTTGCTTACATTCTGGTTAAGAGCTGTACA TATATAATCTGATGCAAGTGTCAAGCCATACTCGATTCATGTATATGCCG AATGGATTTAGTTCTTACCTTGCGTGTAGAATTGGAAACCATCAGATTTA CGAATCAAATTCGAGTCAGGTGGCAAAAAATATAACTAGTCATTATTGTC TGCAGTTCTCATCGTTGCTCATGATATCACAAAAGTATGAGACCATCAGA AATCGAGAGTAGTGCCTGGGTACATCAGGAGCTTCTTCCAAGCACAAGAA ATGAAATATCACCGATCGCAGCATTCACAATGCCGCTTATTTGCTCATGG CCGTCCTGCAACATAAGAATGATGTGCAGCATCCATGGGACCTTGATGTT GGCAAAGAAGCTTTGAATTTGGCTGGCAGGTCGGTCTATCGGGAAGATGT GCAGTCCATCGCAAGATTCAGCATGTGGACAGTACCCTACTTTCCCAGAT AGCCAATGGACATCGTCGTTGCTGACATCCAAGCAAGTGTAGTGATGCCG TTGCACTCGATCTTCAAAGTGTAGACCTTCAAGGCATGCTTCCAGGGGCA CAGAGTTTTCTTCACTTGTGATTACTGTTTCTACTTTTTTATTCGACATA GTAGTAATCAGAAAGGGCTGTCCTCTGTATATGCCGTGTTCTATATGTGA GCTGTTTGGTATCTGTAATTTGTGTTCTGTACATGAGCCTTGTTGCTTAC CATGCTTTAAGACGGTGCCGAGATTTCAGCAGGCTTCATC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.