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GrainGenes Sequence Report: AA041964

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Sequence
AA041964
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041964
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTAAACGGAAACAAAACCCAGCCCCCCAGCCCCGCGCCCCTTGGTCTCG
CCATCGTCGCGAAATTACCGATTCGGCCCTCGGCCGCCGCGGGATCCCAC
CCTCCCCTGTTCCTTCCCCCGGCGCCCGCGATGGTCGACACGCGGCGGAG
CTCCGCCAAGAAGCGCCCCCCGCCGCCGCCCTCGTCGGAGGAGGCCTCCA
CACCCCCTCCACCGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCTCGGCG
GCGGACGACGCGGATGCGTCCGCGTCCGCCGCGTCCAAGGCGCCCGCGGG
GAAGGCCGCGTCCCAGCCCCGGGGCCGCCAGAGCAAGCGAGCCAAGGTCG
CGGCCCTGCCCTTGCATGCGCCACGTCTCTCCGCACGCCGGTTTCGGGCA
ATCGATTGATCTGATTACCGCGGTTTTCTGTGGCAGGCCACGGACGAGGA
GGTGCTGGCGGCGCACCAGTCCCCGGTCAAGACGACGGCGAAGGCAGTGG
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GAATTCTGATATTTATCTTCAGTTTGCAGTCTCTGCATTTGTAACTCTAG
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ATGCTAATCATCATCAGGACTATCATCTGATTTTGTAAAATTTTGAACAC
TTCTTATTTGGGCTTTCAAGTAGAAACATCTTACGTGCTCTGAAATCTCA
TGGAGGTTGATGCACACCATTTGAGTGCGCTCTAATATATTTATCATTCT
GACTTGATTACGTGATCTGGATAATCAACTGCATATAGCGAGTTCCATTT
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TGATGCAGACCATTTGAGTGCGCTCTAATATATTTATCATTCTGACTGAG
TACCTGATCTGGCTCAGTTTGGATGAGTTTTCTCTTGCTTTTGTATAGCA
CTGTAACCTTAATAATGTTTACATCAATCAGTACATGTCCCATAAATCAT
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TCCATGGTGCAAGAGTCTACTGATTTGTATTTTTCTTAATGGATTGTGTC
GCCTGCTTAGATTGCTACAGTATTCAACACAATAGGTTGTCTGCCACATT
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TCTACCCATTTCACTGTTGGCCACGGTGGCAAATATGATTTGAGACTGAC
TGAATCATCTACTGGAGCACTTGTTTGCAAACTGAAGCATGTTAGGGTAT
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CTGCCCTTGAGGTCTGTATATCCAAAGCTGTCCATGTAAATGGGAAGGCC
TTAGACAGGCCTTCTAAGGTTACCTTGATTGGAGGCGATGAAGTTATTTT
TAGTTCGGTTGGGAGGCATGCTTATGTATCCTTTTTGATCAGCAACTTCT
TAATACTTGTGTATTGCTCCTATTATTGGCTAAGGGCATGTCTGGATGTC
TTTGTGACTTGCTTTGGTAAGCAAGGCTAGCAATTTTTAGGTTCTCTTGC
CTCGAAAATGTAAACTGAATGTGTGTTTTCTATTAAGTATAATTATTGCT
CAAAATATTTTATGTATTTACTTAAGACTATCTAGTGCACTACACCGGAG
AAAACAGAACAGGCTAACATTGCTGACATGGAAGAGTGGAGAGCTAATTT
GGGCCTCCATGCAAGAAACTTGCTTGAGAGAACAAGCTTTTAACTCTATC
TAAATATCGCCTTACTGGGCACAGTTAGATGACAATTGTGGGGTTAGCAA
TGAATCAAACACCTTGTTTGGAGAAGTATGCATTTTAGATGTAAAAGTCC
TTAACGTGGTGGCAGATATTTCAGCAACTTCCAGAGGATAAATCGAGCAC
ATCAACCTTTTCATCACCGCACATGTTTCAGCAAGGGCAGTATCCAGCTA
TCGAAGGCACACTGGATCATTTGTCATCTAAAAGAGCCAAGTTATCAGTG
CCATTTAATTTTGGAAATGGCCGCCCTCCATTGGTTCCTCATGGTGAGGC
AGCTTCAGTTCTTCCCTAAAGCTCTAATTCTTAAGTTTTGTTATATTAAG
TTCATAGCATTTGTAGCATTTAAGATAGTTATAAAAAGGAGATGCTACTC
CCTCCATATCACAAATGGATGTCGTTTTGGACACGTTTCGAGTTAACTTT
TGAAAACTTTAACTATAAATATTCTTTTAAACTTTTGGTAATGTGTAAAC
CATGTGTTTATATTTGTCTCGAAAAGTATATTCATAATACAATATTTCTC
GTGTTTTATACGTATATTATTAGTAGTATAAGTAAATATTAGCGGTCAAA
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GAGGGAGTGGCAAACATAAGAGGACTTGTTTTTTTGTCTAGTGTTTCTCA
AACCTGGGTACCTTTTATTTCTTCTTATGCTGCAAGGGAGTCTAAAAGAA
TGTCTCTTTTTTGTTCATCAGATACAGAGATAGTCAGCAGTTTATGTAAA
ACAATGGAGGAGCAGGACCAGTTTACTTCTGAAGAAAATGTACCTTTTGC
TGAACATCAACTGTTAAAAGAAGATCTAAAGAAGGCAATTGTTAATGCTA
GTGATATATCAGAGTCATTTGATAGTTTTCCATATTATCTGAGGTATATA
GACTACCAACTCTCTCCTTGTAAAAAACAGCTCTTCTGTTAAATTGTTTG
CCACTATTTGTTTTGGAGACGTGGAGATGTCTACACTAGCTTGGCATCAC
CATCACTGGGCTTTGAATAGTGTAATTTGTTTTATCAGTAGGGGCCTATT
GGATATCTTATAGTGCAGTTTATTTTATATGTACCAATACACTGTCATTT
ACCCTTATGAGTACTGGTAACTCGAGTACGACCTACCTTCTGCTCAGTTA
ATTGGCCTGTTGCATATTGATTCATTTCTCTCCGGGGTTAAGAACGATCT
TTAATACCTTGACATTCTTGCAGCGAGAATACCAAGAGTTCTCTCCTGAC
ACCAGCGCATGTAAATTTGTGTTGCAAGGAAGCCATGAAGTGGACAAAAA
AGATATCTTTTATTTCTCAACGAGTATTATTAACTGGTCCATCAGGTTAT
CATTTTTACTCAGTGAAATTATGGATATTGCAGTTAGTGATTTTGTATCT
TTGTTAAACGCTGCTTGGAGTGCTGACTAAAATCAATTTACTTTTTGTAG
GGTCTGACATATACCAAGAAATATTGGTGAAGGCTCTGACCAAACACTTT
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CTTAAATAGCTACAATGCTTATATTGAACAGAGCCACCAAAGTTTTTCTT
AAAGAGATATGCTTCTTTCTGTGAGATGACAGATATGCATCTTCTTTTTG
TGAGATGAGAGATATGCCTTTGCTATCCTACTTCAACATTCTGTGCAATC
CTGCTAGTTTCTGAAAGATTGAAATGTTTTTTCTTTTAGAAGTTAGAATT
TTTTAGATAAGCTATACCGCAGGATCGCATGAAGTTCACAGTATTGCTAC
TGTTTTTTCTCGAGAAATCGCAAGAGAATTGCATATCGATATATCGAAAA
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TGAACATTGGGATGTAAATTATCTGGTTCTGGTGTATATTACTCCACTGC
TCTAAGTATATGCTTGCTTGAACAGTTACAAAAGGGAAGGGGCAAAGCAG
AAAATTTGATGATTACTCTCTACAAGTACAAAACAACCTAGATCTATAAA
CAACAGCCAGATAATACTAAGTGAGCCGGGCAGGGGATGGCGTGTTCATC
TTATCCTGCTTTTCTTTGCTATTTCTTAAGTTCAGTGATTTGGAACTCAA
GTATATTTCATCTTTTCAGGGACAGTCGTCGAAGTTAAAGGAGTCATACA
GAAATGGTAAGATGGTCATGCCTCCTGTATCAATGCTAAATTGCGCGACC
TTCACTATCTTTTTGGGCTTTTGTTTACTACTCCCTCTGTTCCAAATTAA
TTGACTCAGCTTTGTCTAGATACACATGTATCTAGACGCGTTTTAGTGTG
TAGATACATACGTATCTAGATAAAGCTGCGTCATTAATTTGGAACAGATA
GAGTATTTAAGTGTAGATGTATAGTTACAGTCGAATTGAGTATGGTTGCA
TTATATTTGTTTTTATAATATTTCATTATGGTAATGGAACCCACCTTATA
TAGCAGTAAAATGCTTCTGATGTTTTGTTCAGGTGATAGGGTGAGATACA
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TATGATGGACGTGAGTTGCTAAAGAGAGGTGATTTAGTCTTGTTTGGTAT
ACAGGATTATGAATTTTGTAGGAAAGTGCTCATCCAGTGAATACATGTTT
CTTTCTGTTTGGTAACCTTACGTCCCAAATGGGCAATACAGAAAAGTAGT
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ATTCCTTCCCTTTGTTTCAAATGAAATCTCTCAATGCTGCCATTTGCATC
TTTTACGTGCATCTATTAATGATTTGCGCCAAATTATACAATCTGCAGAG
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TGATCTTGGAGGCAGTTGTGAGGTTGATCATGGTTTCTTCTGTCCAGGTG
AGTTTCTCCCCCCTGCTGTTCTTATCTACTTACTTCCTCTGTTCGAAACT
ATAAGACGTTTTGGCAAGCTAAAACAATTTTCCAAAACCTCTTATGTTAT
GGGACGGAGGGGAGTAGTCATTTATATAACTAGATCATATACAGTGATTT
TTGCCATTTATTGCTATATTTTTGTGACCACTCATGTATGTTTATGTGTA
TTTCCAGTTGATTCTCTGTGCCTCGATGGTCCAGGATGGGAAGATAGAGC
TAGACATCCATTTGATGTAATATTTGAGGTATGTAGGATCTTCTCACCCT
TTGTCAGTATTTGTATTATTTTCCTATTACTTACTTGGATTTTTGTATAG
TTTGTTTCTGAAGAAAGCGAGCATGGTCCTTTTATCCTATTTCTGAAGGA
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ATGTTTTTATATACAGCTAAACAACGGGTCTCCTTTCCTTTCGAAGTTCC
CGTACAGCCAATCAGCCATAGTTGACCTTGTGTTCCAGGTGCCCTTTCTG
GTTTTGCTGAAAGTACCTTGCAACTTCAAGTTTGCTCACATTAAAGCATA
CCTTGTTCTTCTAGTACTCCCTCCGATCCATAATAAGTGTCACTGGTTTA
GTTAAAGTTGTACTAAATCAGTGACACTTATTATGGATAGGAGGGAGTAC
TATAATCCTGTTATATTCAGATTTTGGCCAGCTTCATCTGGTTGCTACAC
ATTAGATTAGGATATTATAGAAATGACCAGGGGAAGAGACAAACTTGAGA
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GACTCTGTTGCACCACGTCACATTGTCAGCTTATTATACTGAAAAGGTTG
TTTCTGATATATATCCATATTGCTTATTATCCTGCCTCCTGTATTATTTT
TCTTACCGGACCTTTTTGATCAACTAAATTATGGCTTCCGTCTTAAACAC
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CTACAGGATGACTTGGAGCTATCACAGTGGAAACAGTTATTAGATCGTGA
TGTCGAAATTCTGAAGGCAAAGGCCAATGTTTCAAAAGTTCAATCTGTAA
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GAAAAGGACGTGCTACTTGCTCTTTCTGGTGAAAGGTTTCTTCTGTAACC
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AGGCCAGAGTTGTTCTCTAAGGGAGAACTTATGAAGGTAAAAGTCATTCT
CAAAGCTTCAAAATTAAATATGAGTGTGTCATTTTGGAAAAATAAAAAAT
GTAGCCCAGTATTTTGGAAAAATAAAGTGTTACTCAGACTTTTCAAAAAA
TTATTATTTTGGGTATGTTGATACATATTTATATTATCTACAGATCTGCA
AAGTTTCACCGGAACTATTGAGAATTTTGGGCTACACAAAAATGACCAAA
TTGTGGCTCTGAAAATGAAAAAAAACTTGTTTTTGACCCCCACATTTTTG
TTTTTTGTGAAGATGACGAATATTAACATATTGGACGAAACTTGTGGCAT
ACTCCCTCCGTTCAGAAATATAAGACGTTTTAGTATTGTGAATCGAATGT
ATCTGGGTGCCTTTTAGTGTATAGGTTCGTAGAGGTTCAGAGTGAACCTA
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TTGCTAAAATACTCTGCATGTTCCTTCTGTGAGTCCTCTGTTTTCATCTG
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TTTGTGCTTTCTAGAATTAATGTTTTTATTATGACTTCATGTATGATACC
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AAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACAGAGGGAGTAGTTAGTATCATA
CATCCCCAAATTTAGTTAAAAAAGAAAGAAGAATCCGTTCAAACTGACTG
TAAAGTAATATTACATTAATACTTCTGGATCATATCGTTTTCCCAGTTCA
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CAATATATCAATGTCAAGCATCGCATCTAAGGTTTTTTCTATAACAGACA
CTCATCCAGATTGCTCTCCTTTCTAGTACTACATTTTCTTACCTGTAACT
GTAACAGTGGTTTGGCGAGGGAGAAAAATATGTGAAAGCTGTGTTTTCAC
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AATTCTTTCGTTGCTCATGATATGATTATGATTCAGCAGGCTAGCATAAC
AATAGTTTGGTTTACCTTGGTGAACTTCTTGCTATGCCCCCTTGTTTGTA
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AAAGATAAAGAACGTGTATTAGTACTTGCTGCCACTAATAGGCCATTTGA
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TCTTTAAAGTCTACTTCAACAAATAAATGCAAATGGTGGCAGTGGCATGC
CGACCAGTCAATAACTCTTCAGAAAATATTGTTCAGATTGATGGTGAATT
TACCAGATGCGACCAATAGGAAAAAGATTCTTAGTGTAATACTATTGAAA
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CTGCTGCACATCGTCCCATAAGAGAAATCCTTGAAAAAGAGAAGAAGGTT
AGTTTCAATTCTTGACTTCCTGTACTAATTCCATATGTGTTCTGTCAAAT
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GAATTACCGGATCATTGGTCGACCAAGTCACTAATTTTTTGAAGTGATTT
ATGGCTGTCCTTGTTAAGGCTACATCAGGCCTCTAATTTGTCATTTTGTG
AATACTTGCAGGAGAGATCCTTAGCAGAAGCAGAAAATAAACCGTTGCCT
CCTAACTATTCTAGCAGTGATGTCCGTTCCCTAAATTTGCGTGATTTCAA
ACATGCACATGAGCAGGTAAATAGTACTGCTGTTTTAATTTATTTCTTAC
CCTGTCAAAAGAAGGAAAAGAAGGTAGAAGGAGAAAAATAAACTTTATGC
AAAGCAGACTTAATCACACAAATAGATTCGATGCCCTGAGGGCCCCTGAA
GCTGATGGATGCTCTGTCCATCTTCAAACATATAGCAACTGCTGACTACA
GTTTTTGACTGTTGAGGACTTAGATTAGACTTTAGAGAGTATGCAATGCT
AGTATTGATATGTTATGGGTTCTAGCATTAGAGAAACAGACTTTCTTCTT
CTACGGTACTACTAGAATACATTCAAGTTTTATCATTTGACGTTTTTCGT
TATCATAAACTTGTGATGCTGACATAACTTGCATCGTGTGTAGGTATGTG
CAAGTATATCATCCGATTCGACAAATATGAACGAGCTTATTCAGTGGAAC
GACCTCTATGGCGAAGGCGGATCTAGGAAGAAGACACCTCTAAGCTACTT
CATGTAGCTTATGTGTATTGTAGTCTGTGTATATACAGCAGAAATATTAG
CATGGAGGGACCAAGGTTGACGATGAGTAACTTTCTTGTCGTCCTTGGTT
GATAGGCAACTGTCGAGTTTATTAGTTTCAATCTTTATTGATGTCAGTGC
AAAGTTCCAACAAAATAATACAGGGCCGATTTGGTCCCACCCTTCTCCAG
ACTTTGAACTGTCAAGACTGTATGTAGCTTTAGCCTCAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.