Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE001139

[Submit comment/correction]

Sequence	AE001139
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE001139
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology	WG983-5 MWG825-3
DNA	TTCGTATCCAGATCGAACCGAGAAGAGAGAGCCAGCCACCGCCCGCCCGC GCACGCCACCGCCGCGCCGGAAGCTTTCCGAAGCGCCGCCCCCCCGAGGA GGCCAGGCGATAGAAGAGGGATCCGGCTCCGGCGAGGAGGTTCGGTGAGA TGGGAGTCCCGGCGTTCTACAGGTGGCTCGCGGACCGGTACCCGCAGACG GTGTCGGACGCGGAGGAGGAGGAGCCGGTGGAGCTCAAGCCAGGGGCCTT CGTCCCCGTAGACCTCCGCCGCCCCAACCCCAACGGCCTCGAGTTCGACA ACCTCTACCTCGACATGAACGGCATCATCCACCCCTGCTTCCACCCCGAC GGCCGCGTACGCATCGATTCCACCCGCTCCCTCCCTTAAACCCCCCAAAA CTCGTGTTATTAGTGTTGTTGCTCCTCTGCTATTGTGCTGCTGGTCTCAC GGCTCCACCCCTCTCCTCGCCCTCCCTGCAGCCCTCCCCAACCACCTATG ACGAGGTGTTCAAGTCGATTTTTGATTACATCGACCACCTATTCTGCCTC GTCCGCCCCAGGAAGGTCCTCTACATGGCGATCGGTGAGCTGCTAGCTGC TTTCCGTTAATGCCGTTTCCCGTTCTATGCTAAGCTGGCTTCACCCGCTG AATTCTGCAGATGGCGTAGCACCGAGGGCCAAGATGAATCAGCAGCGGTC CAGGCGGTTCCGGGCTGCGAAGGATGCTGCTGATGCGGTAAGGTTACTTG CTCGGGCGTGATGCCACTGCGCCTACCTGTGTTTGTTCTCATGCTTGTTG GCTGTTGCTTTCTTCAGGCGGCCGAGGAGGAACGGCTGAGGCTGGAATTT GAGGCGGAGGGGAGGACCTTGGTCCAGAAGGAGAAGTCGGAAGCAATCGA CTCCAATGTCATTACTCCCGGGACACCGTTCATGTTTGTACTCTCCTCGG CGCTTCAGTACTACATACAGTTGAGATTGAATCACTCCCCTGGGTGGCAG TCGGTCAAGGTGTTGATACTACCGCATGCTGGGTTAATTAATCCGTTGGT TTTGTGTCCTATTTCACTAAACGGAAACTGCATTTGGGTGCATTTTGCAA GGTACTATTGTCTGACTCGAATGTTCCTGGAGAGGGGGAACACAAGATCA TGTCGTATATCAGACTGCAGCGCAACCTTCCAGGGTTTGACCCAAATACA CGCCATTGCTTATATGGCCTCGTAAGTGCACTTCCAAATTTCAAAGTAAC GGTCTTTTGTGCGCCCACCTTCCTACTCATTGATAACCACATTTTTCAGG ATGCTGATTTGATCATGCTTTCTCTGGCAACCCATGAGATCCACTTCTCG ATTTTAAGAGAGGTAAGTTTGTAACAACTTTTTTTGTTCAGAAGTGCACG CGTGCATCTGTACTCTGGCCATTCATTCATGAAAGTCGAATTTCGTGTTC TTTACGGTAAATTTAGGAGTACTTCCATAACTACAGAATTCAACTGACTT TACAGGTGATCACCATGCCAGGGCAACATGATAAATGCTTTCTGTGTGGT CAAGTTGGGCATTTAGCTGCCGAATGCAGAGGCCCTGGTCCAGCTGATAA TGTCGTGGAGCTCCCTCCAATTCATAAAAAGAAGTACCAGGTACTCAGAA GCTTGCCATATTTTGCTCTACCATTTTTATTTTTCTTGTCCGTCTCATAT GGTATGCATCTGCTATGCAGTTTGCAACTTGATATCTTCTACTGCCATTC ATTCACTGTGTAACTGTTGACCTGTTAACAGTTTCTTAACATCTGGGTGC TGCGGGAATACCTGGAGAAGGATTTGGAAATTGTAGACCCTCCCTTCAAA ATAAACTTTGAACGCATCGTGGATGATTTTGTATTTATCTGTTTCTTTGT TGGGAATGACTTTTTGCCTCACATGCCGACTTTGGAAATTCGCGAGGTCT GTTGATTTACTTACTTGTCTTTATTTTAACAGTTTCATTTGTCTCATTAG ATAATTTGTGTGTAGCTATGAATTGATCAATTTCTTGTTGTACACTGTAG GGTGCCCTTAATCTTTTGATGAATATTTATAGAGTGGAGTTCAAACCAAT GGGCGGTTACCTCACTGATGGGGGTGAGGTATAGTTTCTTTGCGCTCTTA TTCTTTTATGGTTCAAGCAATACCGTTGCACCACTTTTCCTATAAAAGTT TCTTATATAATGTATAACGGAGTTATACTGGATTATTACCAGCTTTAGCT GTAGCATTGTAATATGATAAACTAGTAATAATCATTGAGGTGTTCACATG TTGTATCACTAAGACCATTTAGTGAAACCAACTGAGGACATCCCTGCACA TGTTTTAATATTGTTGTATCATTACTTTGTAAGTTACAACGTAAACACTC ATGAATATGAATGGTAGCAGTCATATCAACTAATTGTAATGGTAGAATAA AACTAGAAATATTATAGTAAAATTACTAAGGTGAATGCACTATAGATTGA ACCTGATTTCTATACGCACAGTTTGTTGAAGCATCATGTCATGTCTAAGT TCCTTTTGGACTCTTACAGTCTTGATCATGATCGATTGACTGCATTAGGC TCAATTTCCGTGACACATTAATTATATTAACGCTATGGAGTACGGACCAC AGCATCCTAACACAACATTGGCAGCAGCAAGGAGAGGCCGAATTGCCAAC AGAATGTCACATAGTTTTTTTCTGTTTCGATTGGTTTATTTCTGAATTAA ATTTTGTTATGGTTAGCTGGCTAGCTTGTCCATTAAAGGAACCTTGTGCC ATTTGGTTGCCAAACAAGAAACATTGAGCTCTTGCCCCTTATGTCATCCG TTTTTCACACATCTAGTTCACTCTCTCCCTCCTGCATATCTATTTCTCCT TGTGTACATGCTGCTTCCCTTATATCACCACAGCTCTAGGACCTCATCAC CCTATTAAAAAAACAAACTGATGTGCTACCGATGTGACTGGCATTCTTAA ATATGGTAGATAGTGCTAATTAGATGTGCCAGAGGATTTTCGATGGGGGG TACATACATCTTCTCGCTCGTTACCTCTAAAAACGTAATTCTGTTGACTT GAGAATGTAGGAACATCTGTTATTGTTGAAGTTATGAGGTTTTGGCTGTG TAAGTCATTAGAACTTCCCTTGTTTAGCTTGTCTTTCTTAATGTGCAAGG TGGTGGATGTCTTCCCTGTAATAGGAAAAATAAAAAATAAATAGATGTGC TTGACTTCAACCATGATATATTGGCTTGGTGGAATAACCTTACCTATAAT GAAATTCCGAGTGAATGTGGTGGTGACATTCACAGTTGTCTGATAGCATG ACATTTTCTCCTTTTCAATGGAAGGTTTTATTGGAACGAGTGGAGCATTT CATTCAGGCTGTTGCTATCCACGAAGAACAAATTTTCCGGAAGCGTACAC GTATGCAGAAGGTACTTTCTAGCTACTCTTCTATCAATGCCGCCTTTTAC TTCTGTAGTCCTATACAGCACGGCCGTCGGCACCTTGCCGTGTACATAGG CATCAGGCCGGCCACGCATGTGCTCAACCAAAACCACCCATGAACACCTA GTTACATGCAGATACAATCGAATCAAGATTAGAAAGCTAACACTATACAC TTCTTATGCATGTAAATATGTACAGAAGCCTACATATGTCATTTCCTGTA ATAACTATTTTATGCTGTAAATATATGTCTGGTATGAAGATGCTGAGGTG TATTTTATGCTAATGTTACTTGGACCAGCTCTAAGATGTAATTATATGAT TTTTTTGCAATGTATCTGTATCCATACAATGTGAGTCGGGACTTTTATGC TGTAAATAACTATTTTATGCTGTAAATATATGTCTGGTATGAAGATGCTG AGGTGTATTTTATGCTAATGTTACTTGGACCAGTTCTAAGATGTAATTAT ATGATTTTTGTGCAATGTATCTGTATCCATACAATGTGAGTCGGGACTTA AGTTGCATTGAAATCGTGAAAGTGGATTGCAATAAGCTGCTGCTTTTGAT TCTTACATGCTAACACTTCTTGAATGCCTCCACATGGACTGCAGTTGAAC TGTCATGTACTCATGTGAACATACAAAAACAATTTGTTAACTTGCTTGAT TCATGGTAACCTTAGTTTCAACTAATGAAGGAAGTGTACAGAACCATGTT TCCTAAGTTTGTCTTTGCTACTCTTATCCCAATTGAAAAGAAATTTTATG ATTGCTATATTGCAGGCATACGAGAATAACGAGGAGAGACGTAGAGCGCA GGGAGAGAACTTGGAGGAGAATAAATATGTGGACATGGTTTGTTTCTCTA CTTGTAGTGGGAGAGTGGTAAACTGGTGGTACATTTATACAAGATGCTAT GAAATAAATCCGGACAATCTTTCCAAACAGACTTCTAGTTTGCACTATTC TCATTTGCATCCCCTGTTAATACTTCAAATCTACTTTTGGGTTTCTTCGA CACAATTTGGACATGCGTTGGCAGATGATACCTTTGCATGATTCAGAGCA CGATCATCTGTCACTATGTGAAAATGCCACCTGGCGATTGCTTTTCCTAG TCGGCACTGTAGGTTGTCTTTGTATGTGAGTAACAGTATGTTTAACACAT GGTATTTCAGATTACAACACTTGGTTGCTCCAAAGTCTGAGTATTGTTGT ATTTGGCAATTCACATATGCTTAAAATCCAAAGAATCTGTTCATATAGTA TTTTTTTGCGTTTTGGTTCTCTTCTTATAGTAGATTAGGGAGTGCTGCAG TTTGTGTTATAATTTTTGCCTATCTTTTATTTTGCACTGACTCTGCTTCA GGTAAAACTAGGAGAGCCAGGATACAGGGAGAGGTACTATGCTGAGAAGT TTAAAGAAGAGGCAGAATCAAAACCTATTGAGCAAGTTCAGAGAGATGTT GTGAGTCTTGCTATTGACTGTTAATTTTTTGAAATTGCACTTGTTCCTAG TTTAATCATCAAAGCACTACCATATGCTGTTAGGCCTAGTGTGCCTCCTT ATTTTAATTTGACACGTGGAATATGACTGGACCTCACATGCTAGAAAATG AGTGGCCCAGAGTAATTTTTTTATCCACAGTGACGACATGAATGTGTTGC TCTCCATGATTGCATTGCAGCTATAAAATAGAATTTGCATCTTGCAAGAC ATTATGGATGATTTTTTGTGTTCAGCAATATTTGTCACATTGCTGCCATG AAGACGCCATATTTAGTCTTGCAAAACAAGCGACATTACTTTATGGCAAT TTACTGACTGCAATAAACCTCCTGATGTATCCCAATGGTGGCTGCCATAT TTCTGAACAGATTAATTAAAAAATGGACCACACTGTCTTCTAAAATCAAA ACAAAACTTCATATAAAGTGTTACCAGATTGGGCTTTCAGTAATTAAGCG TATAGCCAAAGTGATTTTTGACTCTTAGATCTACAAGTAAAGACTAGGCA CACTCTCCACCCTACAGATTTACATGTCATATTAATGCTTGAGAAATTGG TTCTGGATTAATTGAGAATATTATGATGCGTTTTCATCAGCCCAATTCAT ATATTATGCTAAAAGTTTGTCAGGTTACTGTTCAAAGCAAAATTGTAGAC TATGTAGTATGTATCTGCCTATTTGGCCACACCAGCTCTTAACTGATGTT TATCTCTATCTACAATCCATGTTTTCAGGTTCAGAAATATGTGGAAGGTC TTTGCTGGGTTATGAGATACTACTATCAGGGTGTTTGTTCATGGCAGTGG TAGGTAATTGTTGACCATCAGCTGTGAGGATTTATAGCTACTGTTCTTTC TTTTGTTTGAGAAAACATCACTTGATCTTTCAGCAAGCATTTTTCACTAA TCATGTCAATAGGTCTTGTTAAAGATTATCAACTCAACTCCATGATTATA GTCGATGGATTTATTAGTTTTATGCATGAAATTGTCAGTTGTTTTATTAT TTATAGCAACCCTAAGTCTAAATCTTAGAATCCATATGTTGCCATTTGTT GCACTATCATGGCGTTATAACTTGGTAATAAAACAATCCAATATTGTTCA ATTGCAAACCATGAAATCCAAGGTGATACTTCTTTGTGATGATGTCAGGA ACGTCTGCAATTCGTCTACAGTGTGACATTATGCTGCAGCTGTAGAAAAC TGGAATTTGTCTCAATATTAAACCAGTCATGTTGCAGCATTATTAAACCA GTCAATATTAAACCAGTCATGTTGCCAGAAACCATTCACACCCTGTCATA TCCACATGCACAGCTGATCACCTGGATGTAGGCACATAGCAGTTATGCAG TTTGGTTGACAAAGCTCGTAAGTAACCCTTTCATTTGGTATCAAGTATGA ACTCCGGTTTTTACTTTTCTTCACTGAAACAGGTTCTATCCGTACCATTA TGCGCCTTTTGCATCTGACCTGAAAGGCTTGACTGAGTTTGAGATAACCT TTTTCTTGGGTCAACCTTTCAAGCCGTTTGATCAACTAATGGGAACACTG CCAGCTGCTAGGTTTGTCATTTCTCTGTGCTAATGAGTCTATCCATACTC CATACACATATCATGAATGGTAAGATGAAAATCATCATATATTCTTCCAT TTCTTCTGTAGCTCTAATGCATTGCCAAAGCACTATGGGGATTTGATGTC TGATCCAAATTCACCATTGAAGTATTTCTATCCCAAAGGTACCACCATCT CTTGTCTAACAGGGAGTAGAAATACTTAAGAATTACAAGATACCTTGAAG ATAAAGAACTAAGAATATTGTGTGTGCCCCTTTCCTGAGGACCTCACCAT GCATATAAGCTCTTACTCCATGCCATCTTCCTTTTGTAACTGCAGATTTT GAGATAGACATGAACGGGAAACGTTTTGCATGGCAGGTAATCAATCGATA GATTGGTTTCGCTTCAGGTGACTGGTTAATTGTTGCTTGAAGGTCCGTTT CTGTTTTTATTTCCAGGGTATTGCAAAATTGCCTTTTATTGATGAAACAC GTCTGCTTGCGGAGACACATAAACTTGAAGATTCGTTAACAGTAAGTAGC TTCTAGGATCCTTCTGTATCAATGCTCTAGGCTTCTTATTTTTCTTTGAC TTTTATTTTAGGATCCTTTTATGTGAATGTTGGCTTGTATTTATTTTTCT GTTGTTCAGTGTGCTTTGGTTGTTGCTGGCTTTTGCAGGAAGAAGAGAGA TTCAGGAATACAACAATGTTTGACATAATTTATGTGCGTGAAACTCATCC ATTGGCTGCGCAGATTGCCTTCCTGTATCAGATGTACTCCCGACATTCAA TAACAGATCCTTCCTATCTTATCCCTATTGACCCTGCCGCTAGGTTGGTA TATACTATATAGATTGATCTGGATTGTCTATTTCTTAGTGATACCGTTCC CCTCAATAATTAACTTACGCTGTTGGTATGTTGCCTCCTTGTGTCAGTGG CGGAATGAATGGGTTTCTTTGTTTATCGCAAAGAAATTGGTACAGCATTT CTGTAGAATCTCCAGTTAAGGGGTTCAATGGCATCACCCATAACAGAGTT CTGTAAGTATTATAAGATGAAAAAGCACATTGTAAGCCAGAAGTCATCAT CAAGCCTTCAAGTGCTATATTGATCTTCTATTTTTTTCCAGGAATGGTAC CTATCTTAACCCTCAGTATCACAAACACATCGCGGAGCCTCCAGAGGGTG TCATTATACCTCCAAAGGTATTTCCTAACCCTGTTCGCATTTAGCTGTAT AATGAAATACTACTTATTTGGGATAGCTTTAGCATATTTGGCTTTATTGT TATTAGATCATAAATCATTTCTACTTCACCCTTTTGAACTTCTGCCCTCG TTAAATGGAGGGATTGTAGACTTGACTCAGCTAATAAGTGAAAGTAACGA GTGGTATTGATCTTAATTACTCCCTCTGTCTCAAAATAAATGTCGGAAGT GTGTCTAAATTTGGATGTATCTATACACTAAAAATTTGGATGTATCTCTA CACTAAATAGTGTAGAGATACATCCAAATTTAGATAAATTTGCGACATCT ATTTTGGCACTTAGTGTAGAGATACATCCAAATTTAGATAAATTTGCGAC ATCTATTTTGGGACGGAGGGAGTAGTTTTTGCCCTGCTGCCTCATCACTT TCATGCTTTTGGTATGTTTTCATACTTTTCATTGTCGGATATATAAATTT GACCATTATTTTTCTACAATACAATGATGTTTCCAAAAAGTGTTTCTGTG ACTATCTAATTATTTGGATTGGTTAACAACAGTTAAAATATATCGGCTCT TTTGTTGAGATATAAATTCATGGGCTAACATAGGTCAATCGTTCTGTAGA TATTGAAGCCTTATGATTTCAAACCTTTTCCCGTGTTGTGGCATGAAGAT AATAGCCGGCGACAAACAAGAGAGAGGTATGGTTACCATTTCACACGATC TTACCAGAAACCGCTGATACCACTTTTATATTAAAAATACTGTATATAGA TTAGTACATATATTCTACCAGATGCAGGATTAATACACATCTTTTTAATG GGAACAATACTTACTGAGTAGCATATTTTTCTGGAGTTGTAGGTTGACTA ATTGGTAAACTGTTTGCTTACTATAAATCATTTGATGATTCCAGGCCTCA GGTGCATGGAGCTCTGACAGGTTCTGTCTTAGGAGAGGCTGCACATCGTC TACTGAAAAATTCCCTGCAGATGAAATCTAGCAGCTCTGCTGGGCTGCTT GATATGCCATATAGGGGTGCACCATATGGCCCTGGAAATGGACCAAGGCC CTTTGGACCTTCGGGGTATGAGAGGGGTTTTGTGGATAATCCCTACCATG CGCACATGTCCAGAAGCGCTCCAAATCCTCGGCCTCAGTTCTTTAATGAA GCTCAAGCCAACAGAAAGAATGTGCGGATACTAGAACGGCCAAACACTCA AAGCCACGATGGTGGCATCCATTCAGGGATGTCCAAACTGACAATCCAAG ACGGGCCAAGGATGCATCAAAACAACAGGATGCAGAATACAGGATATATT CCAAATCAACCGTATCCGAACCAGTATGCTGGGTTCCCACCTCAGCGGCC CGTGCATAACACCAATTATGCACCGCACCGACCTGTCCAAAATCCAGGAT TCCCACAGCAGCGACCGGTCCAAAATCCAGGATTCCCACAGCAGCGACCT GTTCAAAACCCAGGATTCCCACAGCAGCGACCTGTCCAAAATGCAAGATA CCCACAGCAGCGACCTGCTCAAAATGCCGGATTTCCACAGCAGCGACCTG TTCAAAATGCAGGATACATGCAGCAGCAACCAGTAAATGGGGTTCCTCCA CCATTACCTCCCAGTACTTGGATTGGCAAGCAAACGAGCGGAGGAGGCCA GAAGGGTATACCTGCCAAGCAGGATCCAAGGTCGAACAGACAGCCTAAGC AGGATAACCCAAGATCACAGCATGAGAACAGACAGCAGGCTACCAAGGTA GTATACCGTGTCAAAAGCCAAGCTCCTGATGGCCTGCCAGAGTAAGGTAA CCATGAAGAATCAGCAACACAAGTCATTTACCGAGTTGCTGCAAAATGAT GTGCGGTGTTCCATGCTGCGAAACGATGCACGACACCAGGAGATTCATCC AACACAACCTACTCCTGTTGAAAGCAAAGCAGCCATAAGGCCATAGGGGT TTGTTTCTGTGTGGCCCCTATTGATTCATATCCCGTTCCTGGACTGTGTT GTATCATGTCAAATGGAGTTGAACTGTTGATCACGGTCGGTAGGATTTTT AACTGTTGTATCATGTCGAGTGGAGCTGGTAATATTTTAGGACAGTTATT TACATTAAGCCTTTTTTAGTCAGTAGGACAGATGTGAGCAGCTGGCAACC GCTGCCATTGTAAATCTGTAACCCTGAAACTGTTTTGTGCTGAACAATTT CCCTTGCCGGTAGCAAGCAGGGAACTGAAACATCACCCTTGTCGTGTCTT GTGACAACACTGCTGGCTTGTGCTGGGGTAACTTTTTTTTAGACCTGTGT GCTGGGCTAACTTAGTCTTTGATGATGAGTAAATCTTGCCACCTGCCCGT GCGAGGAAAACATTTTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.