Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE000962

[Submit comment/correction]

Sequence
AE000962
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000962
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
CDO520_WHE2F0032
DNA
GCTCCATCGGCCACGGCAGCCATCCACCATTCCAACCTCCCCGCGCCGCG
CAGGAGCAAACGCCGAGTCCCCACCGGCCACAACTCCGCCTCCGCGATGC
AGATCCTCCGGCGGAACCTTCTCGAAGCCTCCCGCCACCTCTCCCTCCTC
CTCCGATCCCCACCTCCCGCCGCCCACCACGCCCACGCCCATGCCGTGGC
CACCCTCTCCGCCGCCCGTCAGGCCCCTTCCGCCGGCTCCCTCGCCGCCA
CCCCGTGGGCCGCCACGCAGCGCCGCGGCGCGAAGATGCTCGGCTCCGAC
GTAATTCCCCTGCTCTCGCTTATGCTTGCTTGACCCGTGCCCGCCCAGGG
TTTACCTAGGGTTCTGCCAAAGCTAGTGCAGATCACTCTTCTGCCTGATG
CTGCTCTGTTCAATTCGGAAGGAAAGATGCTGTGTCATGCTCGATTTGCG
TAATCGGTTTGGCATCCTCCATGGACGCTGTAAATCAAACTCGTTATATG
GTGGTGTGGATTCATCATGTCACATACAGTCCTAGTGCAGCTGGTGCAGG
GCGCATGGGCGCCAGGAACCTATTAGATAGTGGATTTAGCTGAGTATTTT
AGTTAAGGGCCGTGGAAACCGGTGAAACTGGCCGGTGGTAGCTTAGTTCA
TTTCCTATCACGGATTCATTCCCCACTTCCGAGTTAGTACAAAACAATGA
GCTAGCGGAAACTATGAAACCGTTTTTGCACACCCTTAAGTTTAGTATTT
GATCGATCGGGTTGAGAATTGAGATGGATGCTACATTTAGAAGCTATTGT
CAAAGTTGCAATCTCTATCTTACATTTAGCAGGGAGGCTTCCAGCTTCCA
TTTGCCCTAAACTTTACTGCAAAACAAATTCTGGTGTTCAGATTAGTGAC
ATGTTGATTATATCCTCAACCTGCATTTTGGTATTGTTTTTATTCAGTTC
TATTATTCATTAATCTTTGCAGAAGCACATAACAATGCTTACATTGACCT
GAGACTATTCATATCTTGTAGGTGAAACTTGGAAATGTGATACAGAGAAG
AGGTGTGTGATTAACTGATTACATCCCTTTCGTTTCGTTTTTTACTTCCA
AGTGTCATGGACCATTTACTTATCCATCTTTTGGGTCAACCTTAAATCAA
GGCCGCATTTATCAGGTACGATTACCTGCTTTTCGTATTCTGCATCCGTG
CATGTTCCTGCTTTACACAAACTATGGTTTTATATTTGCCTATGTTTCTG
GTGTGCTAAGAGCAATCAATTTATCCTCTTGGTTGTGTTTTGCTTAGGTG
ATAAAATATAACCATTCACATCAAGGAAGAGGAGGAGCCACAATACAGGT
CATTTATTTTGTTTCATTCTTTCAATCTGTTCCAGCACTTAACACTGCGT
ACTTAATAACTATCATGGAGACAAGCTAATGTAGACTTTACAGATGTTTC
TTGCATCTATGGCGTTGGACACAATTAATGTCACTTTGAGTCATTAGAGT
ACTTATTATTTTAGCATCAGCGAGGGAAGATGCCAACATGGAGAAGATAA
CTTGGTGATAAGACGCAATTGAGTAACAACGAGGATAGTTGAATAGACAA
CTAGACACCAAGAAATACGTATGAGTAACCCCAATGATATCTGGTTGACT
CACTGTTACCCCATTGGCATGTCTGCAGTTTCATGCAAACTTCCCGTCAA
ATGATGTAGAACTAAGTTCGGGGCACAGTTTTTTTGTTAACTTACATATG
TGATTAACTTAGCTGGAGCTTAAACTTTCCATTTGTTTGATCATCATTCT
GAATTTTATTCTCAACTCTTGGTTGCTGCAGGTGGAACTGAGGGATGTTG
ACACTGGAAACAAAACAGTAGAAAGATTTCGTACCGATGAGGCTCTTGAG
AGTATAGACATTTCTTCACTCTGTATATAAAAGGCATTGTAGAACTAAGT
TATAGGCTTTTGTGTTGTAGCTTGATTTCTCTTGCAGATATACCCTGTCC
TTATTAAATGTCCTCTTTCGTAAGGATGCAACTGGGTAACCTTTAGGGTA
CCCTAAATCACATCTGTTTTAGAAACTTGTTTAATTTGTTCGAACTAGAA
AAGGTTAGAGGGTACCCTAAGGGTCACGAACTTGCATCTTTACTTTTTTG
CAATTTTTGCTGGGCAGCTCTTTTTCCTGCTTACATAGCTTGAGCAATAA
TTTCTTCTAATGTGTTTTATGACATTCAGTCATACATGTGTCGTTACTTG
AGCTGTGTTATACACTCATAAGCTACCAAACAAACCTGAGATTATGACCA
TCTACAATTAAGTAAAATCATGATAAGGATTCTAGAAACTGCATGCATTG
CCAGCCTGTTGGGAGTCTTACAACCAGCACCTCATATACTCATCACAACC
ATAGCTTCTATAAATTAATGGTTTTTACACTACGTTTGTCGGGATTTGGG
CAACATTTGACGTTATTTTTGCACATAAACACATCGTACCAATAATTATT
TAAAGAAAAAAGTAACTGGATGCCGAATTGAACTATATTTTGCCAGACGG
CGGCCAAAATAACCTGGTTCTCAACAGGCTCTTGCTTGAGTTACAGCTAA
GCAACACTTTTCCAACAATATCTAGTCCAGTGGCAGAGTTTTCTTAAAAG
TACAGCCGTGATAAACAGTACTCCCTCCGTTCGAAAATATAAGATGTTTT
AGACTTTTTCTGATTAAACACATATATTTAGACGCCTTTTAGTGTGTAGG
TTCACTCGTTTTGCTCCAAACCTACACACTAAAAGACGTCTAGATACATA
TGTTTCAGAAAAAGGCTAAAACATCTTATATTTGGGAACGGTGGGAGTAG
TTTGGTTTGGTTGTTTAGATTCAAAATTTGTAGTTCATGTTCATGTTGAA
ATTCTAATCATTACATACTCTTTTTATCACAATCAGGAGTTTTTGTTGAG
GAGAAATCTTTTACATATCTGTATCAGGAAGGAGACAATGTGGCTCTTAT
GGAGTATGTTTCTTATCATTCCTTCGTTCACATGATATGCTGTGATACTG
TCCATATTCATTTATACCCATTTAGCGATGACTTATCTGGAATCCTTTTT
GCCAGGCCTAAAACGTTTGAGCAACTCGAGGTTTCAAAGGAACTGTTTGG
CAAAGCTGCTGCATATCTGAAAGGTCCTAACAATATTAATCGACAACCAG
TAGGCACACCAATTGTTATCAATACTGGATTCTAAGACTGTGCTTGTGTT
TTTACCTTCTGAATAGTTAGATGCTTTGTTTATTTTTGCGCCTCTTGCTC
TCATATATGCAGGATAGTGCTGCTAGAGTAGCTGCTTCTAATATGATCAC
AGCTGACTAAAGCGTCAATTCCGGTTAATATAATACGTGGGACGCTTGAG
TTTCACCTTACAAATGATAGTGATCTGTATAGGTGCCTTGTATTTGTGGG
CTTAACCGTATCCAATGCACAGTGTAGACGACTCACTCGAAGTTGATATT
TCTTGCTCATTTTCAGAATTGTGGTTTAGAATTTATTATTTCATATCGTG
GCATCCTGCTTATTTTCTCACTTGTGACAGATGAGATGAAAGTGAGTCTA
CAGTACTTTGATGGCCGACCATTGTCTGGCTCAGTGCCTCCTCGTGTGAC
TTGCACTGTTGTTGAAGCACAGCCTAATACGAAAGGGCTAACTTCTCAAC
CACAGTGAGTTTCATATTACTATTCACCATCAAATTAATCTTATTTCTGC
AACATTCATTTATTATGTCTTGACCGTTTCTGGCTTATTCATTGTTCCGC
TACCTTTAATGGGCTGAATATTACTAGGTCATGTCAAATTGACTTTTCAT
ATTGTGTGGCTCAGTATAAGCACTCTTGTCCATCCTATTGTTGCATATGT
TGCTTGGAATGAGTGTTCATAGTGATTTAACTATAATATGAGCCTTTTCG
TATGGAGTGAGCTTACCAGATGCATAATTATTTGCGCTGAGAAGAGATTT
GGAAGTTACTTTTTTACAACTAACCTGGACTTTGTAATTACTTGCATAGT
TAGTAGTTACAGGCAGTGAACGTATGACAAAAGGCCAGCTTTCATAACAA
ATAAGCAGCAAAAGCAATAGCATTAAGTCATGTGTACTAGAGTTGTCCAA
AACATTTATTGCTGGATCCCATTTAGTTACTCGCAAACTTCCACTAACCC
TAATTTGTATTTTGTTTTGCCTCAGGTATCCGCTACCATGTTAGTAATGT
CCTAAAAAATCTGTTAATAAATAATATTGAATGTAGTTTGTGCATAAATC
CCTATCAGCAAGGCGGGGTATGAAAACCTTAACATTTGATAGATCTAGAA
GTGCGTTATCTAATGCCGCAGACTACTATTGGGAATTAGATTTGTTGAAC
ATTGTTTTATCATTCTCCTTACACGTTACACTAAGCACATATTTTCTCTG
ATGCTTTTGACCTGCAATACTACGGAATTTTATCCATGCACATGCACATC
ACATATTTCACTTTAATCAGCTTTATTTATCTTTTATTAGCAAATGCTTA
AGGCCCAGCATTATGTGGTAACTAAGCTCATGTTTGTACTAACTGCAGAT
ATAAAAGGGTCGTGCTGGATAATGGTCTTACAGTGCTTGTAAGTTGATGG
GTACCCATTTGTAGAGTCTATTCACATAGCCCTTCAATGAATTGTTGAAG
TACATCTAGAAGTAGTTGATGTTTAAAATCGAGATAAATTCCTTTTATAT
TGATTTCTCATGACCCATTTTTTTGTTGCCTTTTTTAGTGATACAAATGT
AGCCACTGCAAACCTGCTTCACTCCCCTCTTTAATTAATCAATGCAACAT
CTAGTTTTTTTACCATGAAATAGCTTTTTATCAATGGTAAAAATCAGAAG
CCACGAAATTTGATGGAGTCCTGCAATTTGGATGCATTTCTCACTTCCCA
TCATCTTTTTTGCCAATTGTAGGCTCCTCCTTTTATTGAAGTAGGCGAGA
ACATTGTTATTAGTACTGTGGATGACTCATATATGACGAGGTAAGTTGTG
GGATAATATGATGCTTTATTATTCTATAAGTGAATGCTGCATAACCATCT
ATATTTTGATAGTTAATTTCTTGGTAAATTCACTGGAGCAATTTTGCATT
TCAGGGCCTAAATGCTTGTGTCATGTAGATGGCATTGTGTGCTCCAATAT
TTGGATTGGACTTGTGCTTGCCTTCTTAGATGTTTGCTTGTACTATTGAC
ACAAGTCTGAATTTGCCGCCTCCTCAGAGAAGGCACTGAGCTTTACCAAG
AGTTCAGTATTCAACAACACATTTGTTCTTATAGATAATAGTTTTAATAG
GCTTCTTGTTCCAAATTCTGGGGAAACGCTGATAAAGAATGCAGGTTGCA
CTGTACTGTACACGCTGACATTGGAAAGTTTTTATCCCTTGTATAAGTTG
CATTTTTGTGAAATGAAATAATAACGGGATTTGCTCAACATCTGCAGTTC
CATGCGCAAATGCTGATCATATAGTCTATTATTCTTTATATGGTTTTGCT
GTAACAACTTTCTCCATTCGCCTGGTAATAGCACCCAGTTTTTGATACTA
CAAAATATTGTAGTTCCTCTTGTCCCGCCTATGTCATTTCAACAGTCGAT
TTGAAGAAGCCAGTGTTGGTAGAAGAAAAACTAGTTGCTTTATATACAGC
TACAACTTTATATCAAATAATATAATGTGCTTCATGTACACTTTCTAAGC
TGCATCAAGTCAGAAGCTACAAAGATCCTATCAACGAATAGATAGAGGAT
GCGTCTTCACTTGTAAGCATGTACATAGTCCTGGAAGTAGAAGTTCTTCT
CAATGAAGTTCGCGAGCCAGCGGGATGCAGCGAAGCATAACACGGCTAAA
GACACGACGAAAGTTTTCTGTACAACCGATGTCACCAGCGTGCCCTTGGC
AATGGCAAGGAACCCCACGACGGCAACCGCCGCAACCTGCAGGGCGACCT
CCAGCGCCTTCATGGCCTTCAGCGCCATGCTGCAGCTCCTGCACTGTGCA
ACGTGCGACCAGTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.