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GrainGenes Sequence Report: AE000860

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Sequence
AE000860
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Title
Methanobacterium thermoautotrophicum from bases 749346 to 763438
Probe
AE000860
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAATTCCCCGGAAACCAGATAAGAAGAAGCGATAGCGCTCGCCCCGACGC
AGAGACACGCCCCACATGGCGATGGCCACCGCCCTCTCCACCTCCCTCTC
GCACCTCCAGCCTCGCCGCCTCCCCTCACTTCCCGCCACCGCAGTCTCCC
TCTCCTCACGTGCCGTCCGGCGGCGAGAGGTTCCTGCTCGTCTCGCGGCC
GTCGCGGCGGCCTCCGAGGTCCTCGACTCCACCAACGGCGCCGTTCCCGC
GCCGACGAGCGGCGCGGCGTCGGGGCAGCAGCAGTACGGGAGGGAGTACT
TCCCGTTGGCCGCCGTAGTCGGGCAGGTGAGGAGACCATTTCGTCGCTTC
TTGCTGCCCCGCGTGCTGCTGATTGACTGGTTGGGGTGGTGTGGTGGTGG
TCGGATTGGTGGTAGCATTTTCCCGAGCAGGTTAGGCGCATTTCGTCGGT
CTAGTCGAGTTCTTCTGCCAATTCCACCAAATCCTTTCATGCATCGTGAG
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TCAAACGCTGACCCAAACATTCCAGAAGAGTAATGTTCTCACAGTGCCAT
ATCTGATAATGCTTTGAACGTTTTGCCTTCCGATATTCAGCTTCTTTTTT
CTTAAATGTTTTGTCGACTTACTTGTTAAGTTTATCTTATGGCAGATGGG
AGGATCATTTAGCTGGCCAAGTGCAATATGATGCTGATGGTAATGTTAAA
TCTGAGATTGTTAAAGCACCTTTTGTGCAGGTATAGCACACCGGCTCAGC
ATTGTAGTCTCTTCCCAAATCATTGTTAGTTTCATAATGCTACAGGTTTG
CCTTTGACAGATTCCACTTGGTGTCACAGAGGATAGGCTCATTGGATCTG
TTGATGTTGAAGCATCTGTGAGATCAGGAACTACTATATTTCAACCTGGT
CTTCTTGCTGAAGCTCATAGAGGTGTTCTTTATGTTGACGAGATAAATCT
TTTGGACGAGGGCATAAGCAATCTGCTTCTGAATGTCCTGACAGAGGGAG
TTAATATTGTGGAAAGAGAGGGCATTAGCTTCCGTCATCCATGCAAACCA
CTTTTAATTGCTACTTACAACCCAGAGGAAGGATCTGTACGTGAACACTT
ACTTGATCGTATTGCAATTAATTTAAGGTACTTTTTGGACTTGACGATTG
CTGTCTTATTTCCTTTTTATTACCAACTCCATAGTTTGCTCATTGTCATA
CTGTTTCTTGTTGCAGTGCTGACCTTCCATTGAGTTTTGATGACCGCGTG
GCGGCCGTCAATATTGCAACCCAATTTCAGGAGTCCAGCAGAGATGTTTT
TAAGATGGTGGAAGAAGAAACCGATGTTGCAAAAACTCAGGTATGACTGG
AAAACTGAATCACTGGTACCTATTATTAACAAAGGTTACATTGTACCTGC
CTTACCAAACCAGAGTAGGGTGCAGAGTCTATCTAGTTTGAGGGACAGAT
CTCTCTGTTAACTACACACTGTTGTTGAGTAAACAAGTCAGGCACATATT
AAGCAGAAAACACAGGATGCATTTAATCTGAAGTATTCATCCAGTTGTTT
ATACTTTGATAGTTAAAGCACACAGATCCATCTCATACTAGTACTTCCAG
TATATACAGCATTATTCATCTGTCTTGCATTCAAAGTTCAAGACTGAATA
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TGAAGTTTGTGTTATATACTGTCCATCTCACAATGGTAATCATGGTTACA
CAGATAATTTTGGCAAGAGAATATTTGAGGGATGTTGCTATCAGCACAGA
GCAGCTCAAGTATCTTGTCACAGAAGCTATACGTGGTGGGTGTCAGGTTA
GTTGACTTGTTGAATCTATGTATTATCCACAGTACTGGTAGCTGCTGATA
GCAGTCAATATTTTTAGCCAGAATTGGCTACCCTAGTACTTATGATATCA
TTTTAAGCATGCATAGGCATCATTATTCCATGTCTTGGCGGATCTTTTCT
CCATATACGTGCATCAATGTAACTGGATAGATCACACCACCATTTTCAAG
TGCTCCAGATTGTAGTTTTTGGCAACAAGCCAAGGTCACTGTTCTTTTCC
ATGCCTTAGTAAAGTTGCAACATGCCAATTTATTGTCCCTCGTGTGGTCA
ATTCGTTATGTGTCGTAACCACTTAGGTCATTGTAAACTCTGAAGTCAGT
GTGGCCTACTGGCCTTACCTTACTGTCTAGATACTATACCTGTCTAATGT
CCATCAATCGTCATGTTTTATTTTTACAACGATATTGATTGTTGAGACAG
CTATGCCAAGTTATTGAGACAGTTATGTCAAGTTGAAATGGATGTGTTAT
CATATTTGGATACAAATTCTGAGTATTACCACTTGTTGCAGGGGCACAGA
GCTGAGCTGTATGCAGCTCGAGTGGCAAAATGTCTTGCTGCCATGGAAGG
ACGTGAAAAAGTTTATGTGGATGATCTCAAGAAAGCTGTTAAGTATTTTT
ATGCCTGTGAATTCTTCATTCTGTAATGAAGCAAGAAACCCTGTGTAATT
GTAGTTGATTGTTTTCTTCATCTTTTTTACTCGACTAATAAAATTTACTA
TACCTGCTTGTTAAGAATAAATTGTAAATAGCAATGGAAATTTAGTGCTG
GCCTAACTCCTATTTTTTTTTTTTGATATGCCATTTCTATTTGCATTTTA
TGCCGAAATATTGAAGTTTGATTCAGTTCATATTTGACACACATGGCACC
TTCTTGCAGGTAGAGCTAGTTATTCTACCTCGCTCGATCATATCTGATAA
CCCACAGGAGCAGCAAAACCAACCACCTCCACCCCCACCTCCACCACCTC
CACAAAATCAAGATTCTGCAGAAGATCAAGATGAGAAAGAGGAAGATGAG
GAGAAGGAGGAGGAGGAAAAGGAGGTTGATTATTATGGTTAAGCAACTCA
TACCTGCCTTGTTCATTTGGTTTTCTTAGCTCATTATTAGCTTTTTTCTG
ACAGGATGATGATGAAGAAAATGAACAACAGGATGACCAGATACCTGAGG
AGTTTATTTTTGATGCTGAAGGTGGACTAGTAGATGATAAGCTCCTTTTC
TTTGCTCAGCAAGCACAAAGAAAAAAAGGAAAGGCTGGACGAGCAAAAAA
TGTCATATTCTCAGAAGACAGGGGCCGATACATAAAGCCTATGCTTCCGA
AGGTCTCGAATTTACCTCGTCAGCTTTGCTACTTACACACTTGATTGTTT
GAATATTCCTGGATCCATGCTCGTATTTGTTTCCCAGCTCAAAGCAAATA
GTGCTTTAGCACTTCTTCTTATCTTGGTCTTGTTACATTTTGCATTTTTC
CAATGCCTTTCGGTGTGTTCCTTAACCTCTTACTGATACACCAGACACCT
ATATTGCATTGTTCCTTTGCATATCACTCCTACCTTATTGCTTGGTACCC
TTTCTCATTAAATAGTCTCCTCATCTAATCAGTTGATTCTGTAGTAGGGT
CAAGTAAGGAGATTAGCTGTAGATGCGACACTTCGAGCAGCTGCACCATA
CCAAAAACTGCGGAGAGAGAAAAATATTGACAAGACAAGAAAAGTTTTTG
TCGAAAAGACTGATATGAGAGCGAAAAGAATGGCTCGAAAAGCAGGTGCT
CTGGTATGTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTGTAAA
TTTGTAGGTTCTGTTGCTCATATTTTATGCTACCCGCCTAGTAGTATCTA
TCTTCTTTTCTGCCCTTATTATGCGGCGAATTGAACTTTCCAGTCACATG
ACTCAACAACTGTGAGTGGACTGACTTTTTGGCAGGTCATATTTGTTGTG
GACGCTAGTGGCAGCATGGCCCTGAATCGCATGCAGAACGCCAAAGGTGC
GGCACTGAAGTTGCTTGCAGAAAGCTACACAAGCAGAGATCAGGTACCAC
TGAAACGTAAAAAATATTTCTGGCATTTGTTGCTTGTTTCATACCCTGTA
AGCCACTTTCAATCGTTCTTCCTTTTGAGATAATTTTAGTTTCTGGTTAT
TGGATAGTTTGTACACCAAACTTATCTTTCATTTTGGCATCCACCCATCT
CAGGTTTCAATCATACCCTTCCGTGGAGATTATGCTGAGGTTCTACTTCC
ACCATCGAGATCCATAGCAATGGCCCGCAAACGTCTTGAAAAACTGCCAT
GTGGTGGCGGTTCTCCTTTAGCCCATGGCCTCAGTACAGTAAGAACTAAG
AATTAAGAATCATGTTGAATTTGGCTATGCTAGGGTATCTATAATCTGGA
TAACATGTGGTTTTTTACTTCAAGGCTGTCAGAGTGGGGTTGAATGCTGA
AAAGAGTGGCGATGTTGGACGTATCATGATTGTTGCAATTACTGATGGTA
GAGCTAATGTATCACTGAAGAAATCCAATGATCCAGAAGCTGCTGCTGCT
TCAGATGCACCAAGACCTTCTAATCAGGAATTAAAGGTACAACCGGTATC
CTAACATCAAACAATGTAGTGTGATATAAAGTAGCATCTATTTTCGATGG
AAGCCTCTGGCCATCATTTAGAAACTTCCTGCTATGCTCTAATTGTACTT
CCGAATTTGCTTTCACTTGCAAGGATGAGATACTTGAAGTGTCTGCCAAA
ATTTTTAAGGCTGGAATGTCACTTCTCGTTATTGATACTGAGAACAAGTT
TGTATCTACTGGATTTGCCAAGGAAATTGCCAGGGTTGCCCAAGGTATTC
TCGCCATGACATCACTCAAATCATTAGAATAATCGCTACTGCATCTTATA
CTGTAGGAAACCATGTTTTTCTTGTTTGGATTTTTACCGCAATTTCATTG
TAATATGAGTTAGGGCATATGGTAGTCACTTGAAGAGATATCTGCCATCT
TCATCACTAAGCACCAACACATATACTTTAAATTATTTTTCTGCGGAACC
TCTATGAACACCTTATATTTTCCATGCTTGTTCCAGGAAAATATTATTAT
CTACCAAATGCTTCAGATGCGGTAATATCTGCCGCCACCAAGACAGCGCT
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TTGTACCGTCCTATATAAGTGGCGAAGCTTCTTCATCCGTGCAGTAATTT
GTGCAGCAGTGTTAATTCTTTCTATAACTCTGGACTCTTATGACCCAATT
TTTGTGTAGGTTTTCTTGTCTTATTTCTTTTTCTTTTTACCAGCGGAACT
GAAATCCGAGCATAACATCATGTAAAGATCGGAAAATCTCATGTACCTAT
TCTGAAATAATTGGCCCTGTAAATCTGTTGCTGTTGTTTTGAAGGCAGAA
ATGTGCTGCTGTTGAGCGTCATGTTCGAGTCTATGAAAAAATATTCTAAG
ATCATGCCAAGAAAAATTCACCTTTGATGGCTTGACAGAACGTGGTTTTT
TTTTGCGGGGGTGATTGAATGTTTTTTTAGTAAGGTATAAGTTGATATAT
ATTTTTAGAATCCGTAAGGTAGTTGAATTGAATGGTTACCAGTTCCGAGT
TCCAAATAAGGGGTCCAATAGAGGACGTCGGCCCAGGCCCATGCTTCCGC
GGCACCGGTATGGGCCCACCTGTCAGCCAGCACTGCTGGAGAAGAAACCA
GACCTTGCTGTCATTATGGCGCGAACCGCTGCGGTGGCGGGAGACGGAGG
AGAGAGATTTGTCTTGTCGGATTAAAAAAGGGGAAACCGAGGAGACCTTC
CGCCCTCGCGCCGCCCCTCCCGTCCTCTCGTGGCGGCGCCCAGCCGCAGC
CGCCGACTGCACCGCCGCCATGTCGACCTGCGGCTACCACTCGCCGCGCT
TCTCCGAGGTAACCCACTCTCAAGCTCTTTCTATCTCTCGTTCTCTCTCT
CGGCCGGGAGGGGAGCGGCAGGAGGGGAGGGAGGGGGATGAGATTGGCAT
GGGATGCGGACTGTGGGGATGCGCCCTTCTCTAACACCCCTCCATGTTTC
TTCGAGTTCTGCAGGATAGTGCTTGGCTCCCGCAATGGCTTCAGCCGCAT
CGTCAGCCGATGGTCGGCGAGCACCGAAGAGACAGCGCCGGCGTTTCGTC
GCCGCCCTGTGAGGTGCTCTTTCTTGTCTTATTTGTGCGTCAATTGGTGG
TAACCTCCATGTAGACTCTGATTTTATCCTATTTTGTTTTCTTAATGCCT
GTAAGAACCTTGTCAGTTCCTCTAAGCATGCAATGGAAAGGGGAAAATCA
GTTCTCAAACTTTTTTTGCCTAGCCATCCCACCTCATAAACAATAGCCCA
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TCTGGTGTGTGCATACATGCACTGTCCGTTCTGATCTGATGTCTGTGTTT
TCTCCATTGAACTGCAGAACTGTGTGTTTCTTCCGGACCCTGCACAAGAG
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TTGTTTGCATCTGTCGGGGAGTGAGGATACACCTGCTGCGAGTACTCCAA
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GAACCTGTGGGATCAAATAAACCAGGAGATGGTATATGCAGATTTAAGCT
TTAATGTTCAATCCTGCATAACAATTATTACTTTGTGGGTTTCTCCTTTG
CCCTGAGATACATCTTTTGTTTCAGCAATGCGCACTTGCACAATGTACTT
GTTTTTGTTCCGCCTGAATCTTCGGTTGAATTGGGGAAAAAGGAAAATTG
TAGGTTCAGTATGCCATTTTCATCTTGTCTGCTGTGTATTCTTTCCATGC
TAATTATGCTTCTGATTTTTTATTGGATTCTAAACTTTGTGCATATGTTG
TTTGATTGTCAATAACCTCGGTGGATTGCATTATGAGTGAACAAGTTAGT
ATAGCACCAAACATCGGCTTGTAGCAGTCAGAATAATTGTCTCTTCCTCT
GCTGCTTAGAAAATTTCTTCTACTTTTCTTGTGCTGTTGTAACATAAATT
GAATACTTTCCCTCCAGGTACTGCCTTTCTCTTTGCACCTTTCTTCAGAA
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AAACTCTGATGCATCAAAAGGACTGTTAAAGGGCTCTTATGTTGACGGTC
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TCCGTAATGCAGATGCTAATGATGCAGTTGAGCTATCTATTGCTGCTTCT
GAGGCTATGGTTATTGCAGAGATGTTACTTAATGATTGCCAGCCTGATAA
GTTGACTGCAGCTACCCTCGAAGCTGCTCTGCATGTAAAGGAAGCTCGGA
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TGATGCATTCAGAGATGTTGGCCTGTCTACTGTTCAGGCAGCCTGTTCAT
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TGTGCCCCACGTGATCTAGAAGCAGACAACTTAGACATTTGTTCTTCTGA
GGAGCAAAAAAGAAGATGGCACAGCCAAGATGCTAGTACCAATGACCATG
TACCTGATTCTCTGGAAAATACTAACTCAGCTGGTACGCTACTGAAAGAA
TCAACTCCAGGATGTGATTCTGTAAAGCAACCAGCTCTGGATAAAGCAAT
CTCATGCTCAAGAAATAAGGAAACTGCTTTCCAGATGTTCACACAAAACA
ACCTTGCTACTCTAGTAGGAGGTCAACATATCATTAAGGTAACTTTGTTG
CCAATCAACGTTTTGGTATAATTAACTTAATTAATCCTATGTCTACCTCA
TTCAGCACTCTTCATCTACATAATTTCAATGTAAAATTTATTTCCAGGAA
GGTGGAAGAACTGCTGAAGAGAAAAAGGTTGGTGGTGCTACAAGGAAACA
TATAAGAACTAGCTTCATTTCTGAGTCAATGGATAGCATGTATGAGTGCT
CTCCTGCACCTAGAGTGATATCCACAGAAATGGTTGCGTCTTCAAGAGCA
TCTTTTCCCCAAGACACTGAAGGTTTCTATGGAGAGAATCAAAGTGCAGA
GTTAGGCTATGAAGTAGTATGTTCAAGCTTACCACTTGAGGACCCTCTCT
GTTCATTTGTTCCGTGTAGCATATCTTGCAATGAAGTTTCCACTAGTCAA
GCTCCTGAATGCAAACAGAGGAATGAGGAGAGAGAACCAATGTGTTCAAA
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CGTTAGACAAGGCATCGGAATCTAATGCACGGAGGCGCAGAATATACAGT
TCACTCAGGCCTTTTAGCATGATGGAACCTATGTCAAACATATTGGGAGG
TAGTGCGACTCATATTGATGTTAATGTGGCAGTTTGTCAGAAAGAGAGAG
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GTTGGTAAACAAAACCTTAAGAGAAAAGGACCCCCATTGTGGAATTCTGA
ACTTAGTGCTAGACAAACCAAGACCAGAAGGGTGAAATCTCGATTCAGTT
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GATTAATACCTTCACAATCATTACATACTTTTGGTGATCCTCACATTTGT
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GTGCATTTTCAAAAAAGAGAACATATTTCATGGACTAGAGTTTCTGTTGA
CTGGATTTCAAAGTCATAAGGAAAAAGAGGTTGAGTCTATAATACGGAAG
TCTGGAGGCTGTGTTCTTTCTAAAGTGCCACCCTGTCCATTTGATAAAAA
AACCAAGCTCACAGAGCTTGTGAGGTGTAAGCCTCCCATAGTTCTTTCAC
CTAAAAAGGTTAGTTATCCCATTTCCTTTTTGTTTTTTTGGTACTATCAA
TCGTTCATTACTTATCTTCTATGTTTTAGTATATGTGTAGGAACAATGAG
TGTAGGCTCACACTAAAAATTGCCCATTCATTTTTAACAAATTGAACTTG
TTACTGATGGGTGTTTGTTGCAACAGGTGTCAACAGCTAAGTTCTTATAT
GGTTGTGCTACCGATTGTTGGATTTTGAATCCCAGTTGGCTTTTTGATTC
TCTTCAAGATGGCGTCCTGTTGCCCCCTGGAAAGTAAGGCAATGGCACCT
ATCCTGTGAAAATGGAATTAAATTTTATGCATGTTTGTTCATGAAATCTT
CCGTTTTGCATATCTTTCTTGAAATAGTGAAGGGAAAATTACTAAATACT
CTAAAAGTATTTATGCATTTTGGGATCTGTCAAAAATCATGAAGCTTCTC
AATTTGATGCCAAGCTATTTTAAGCTACCTAAGAACTTCCTTTTTGAAAG
GTTATATAACACTGACATGATTAATTAGCTCAGTATCCATACATACTTTA
ATTCTTGAGAAGTCAGATAAAACATGGAAAGTGGCCAGTATATTTTCTGT
GTATATGAGGTTGCTTTGTAAGAAATCTGAGTCAATCGATTCTTGTCTCA
AACAAGCCACTTTGCTGTGAAGATTGTCTGTCCTAGCTTTGTTTTTCGCA
ACAGTCTAGCAAGAAAAAAATTCCCTGTTGTCCATATGAAATAGGTTTAG
ATGCTTCTTGATGCTCAACATTTGATATGCCCTTTTGATGCTCAACATTT
GATATGCCCCTTTGCTAGGTATTTCATTCGACAGAGCCATACAGTGGATG
AGAGTTCAAGATTTGGCCAGTCACTTCACCTAAGAAATAATAAATTGGTA
TTTCGTGGAGTAGGATTCTTGATCCACGGAAAAATCAGCTTCTGCTCTAA
ATTTTCCAACATTATCAAGGTATGTTCAAGCCTGATCAGAAAATATGATG
TATGACCTAACAATGAAGCAATATTCCCATAACTTATTTAGTGAACTGCA
ATATATCATATATTTATTATTATCATATTTAAGGGCCGTTGTGTCATTCT
CCCTTATAATTAGATGGACCTTAGCTACAACTACCTAGAAGAATCTGACT
TTGTGATTGTTCAAATATGTAAAGCTAGTTTCCTAATTTCTACGACGTGA
CCTCGTATTATATTTGTGTTTCACAGCATGGAGGTGGCCAAGTTTTTGTA
TCTCTTCAAGGATTAATACAAAGCTTGAACGGTAGAAGTTCTTCACATGG
GATCATTCTTGTTGCGAACGAGGCGAGTGCATCACGTCATCTAAGCCATT
GTGGGCTAGAACATGACATAAAAACAGCGGTTAGTTGAATTTTGATTGCA
GAGTTTCCATTCCAGTTTATAAGTAAATTGAGTGGAGTACCAGATAGCGT
CGACTGTCTTGGCACGACATATCATCTTCAGGGCTTCTTCTAATTCTCCT
CCATGTCTCTCTTGCAGCCAGCAAGCTGGATCATAGGTAGTCTATTTTCT
GGGAAACTGATTCCCCTGAAGAAAGACCGGTGCGCTTCATTCCGTCGGAT
TAAGATGCCATCATTCCAACAGCAGCACGTGTTTGACATGAGTCAAGAAA
TATAAGAATTCAATCAGAGTTTCCAATGGCATGTCTCTGTCGCATATTTG
GATTTGCCCACGGTGCATGCGCTAGGGCTGATGCCAATTGTTTTCATCAG
TTTCGCGAGTATCGAAAATGGTATGACGTGGAAGCACCTGTAGTGTTGCT
AAACTGATTACTTGAGCCATACTAAGTTATCCGGGGGAATGTTGTCTGTT
TCCTGAATATCATGATATTGTCTGGAGACTGCACACAGCTTTGTAATCGG
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GATTGGTCCCAGACCAATCTCGTTGCCTGTATTTTTAGGAACGCATGTCC
AGATTGAAGAGTATATCAACAGGGGAAAAAGATAGTTCCACTATACTTAC
AATCTCCTTGTCTGTATTTTTAAGACTGCATGTTGTTGTTGCTGGAAGTT
GTAAATGCCAAATACCAGGAAAAATATATAAAATCATGGTGGGTTTTATT
CTTTTGCTCTGAAGCGTTTATAGATTTTATTCTGCACGTTTATCTAGTAC
CTGTATTTACATTAAATTTGACGGTTCGTTTTTTGGAAAAGCGATGCTAT
GGTGGTTGGATTTAAAGATTATCTATAAATCTATCGAACAGAAATATTGC
ACGATCCGTCGTAGTCTAGGTGGTTAGGATACTCGGCTCTCACCCGAGAG
ACCCGGGTTCAAGTCCCGGCGACGGAATTGTCTTTTTCGTTTTTTGTCCA
GTAACCAGGGAAAAGTTGTGCAGAAACTAGCTCAGAATTTTTATTGTTTT
GCGGGAGGAAAACGCGCGAAAACTGAGCGCATCATTTTCCTCCAAACACG
ATATTGTAGAACGCTCGCAGCTGGTACATCACGGCCTACTCGTAAACAAG
ATGGCTCTTGGACGTCGATGCAGCTGAGTGAGTGTATTGTGGATCCTTTC
AGAATGATGATCTGGATGGGAGTGACTGGCTTGCAGAATGGGATGAGGTC
GAAATGCTTGGATCTGCGAAGCTGAATCCCCTGATGGAAGACCGCCGCGC
TTCATTCCGTCAGATTAAGATGCCATCATTCCAACAGCAGCATGACATGA
GGCAAGAAACATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.