Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA042661

[Submit comment/correction]

Sequence
AA042661
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042661
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
MWG2257-3
DNA
CGTGGATCCCGCCTGTCATAAGGCTCTGCCCCATAGCAGGAGTGGAGAAC
TGGAGAGGCCAAGGGGAGAAGGGGACAGCAGCGAACAGAGACAGAGAGAG
AGAGGGAGGGAGGAAGGGAGGGAGACGAGAAGAGGACATCAACGTCGCCA
TGAGCGCCCTCAAGTTCTGCGGCAAATGGTGAGCAGACAAATCCCTTGGT
ATTCGTCTCCGAGATTTGTTCTCCGATGGACCGAGGTGATTTAATCCAAT
GTATTTCTGTCGCGTTTCTTTTCTTGCAGCAACAACATGCTGTACCCGCA
GGAGGACACGGAGATGCGCACCCTCCACTACGCCTGCTCAGCCTGCGAGC
ACAAGGTGGTTAATTCCCTTGCTCCTTCTCGGATGACGAATTTTCTTGTG
TTTGGATTTGGTTGTGCATTCTCGAAACCCTAAGGTTTTGTCTGTGAAAC
TGAGGGCGAGTGACCTGGGTTCTGGGAACAGTATATCGCAGCCTGGGGGT
CCGACGGTAGCTATGGGTTTAGGTTTGGTGGCACTGGCACATTATTGAGG
TTGTGATTTGTTGGGTTTTTTTAGGGATGATTTAGGCCAGGCTTATACTC
ATCTTTTCATTTTGCCAAGGGCGTGTCTGTCCATGTTTTTGGCTTGGAAG
TTAAGGATTATAGACTAGTACAAACCAATTTCTCTTCGCCTTGTTTGCTA
AACCCCAGCTAAAAAAATTGAAGTTGGTTTAAGTGTGGAAGTTCCGATAA
ACTTACTTGGAGCATTAATTTTACTCCATATCATTGTATTTATATTTCCT
TAGAAGCTGTCTTTACTCAAGTTCATCTGGCCAATAATGCCCCCAGACAA
ATAGATTATGAGATCGTCCTAAACCATGCTGAAAATTGCTTTTCACGAGA
AATAAAACTGAGGTGCCTACAATTTGCCCCTACTTATATAGGTTTTATCC
ATCAAAATTTGTGCATGAATCGATCTATCTGCAGTTTATAGCCACTTCTC
CCAACATTCTTCCTATTATATTTCTGTAACCGTCACTCTCATTAATAAAT
GGATTTCCCTAATCCTTCTCGATGCTCATAATTGAAGAGGTAACACGGGA
ATTGAGAAGATAGTTTTTTTTACGGGAATTGAGAAGATAGTTGAGTACCG
AGGAGCAAGAGAACATAGTCTTTTTAGACTATTCCTTATTTCTTTTGTCA
TTTTAGATTATTCCTTATTCCTTGTTTCATGATATAGCGCCATGAACTTG
TGGACAACGGAATTATTTGTTATGAACTCATAAGTAGTAGTAGCTTAATC
CTTCCATTGTCTAGAAAAAATGTTGTAGTAAACTAAGAAGATATTAATTA
TTTGATACTTTTAGTTGATGGAGGTTTTCTGTCCGATAAGAGTATTGCTA
CTCAATATTTTGCAGTAAAGTGGCATGTGGGAAGTAGTATCCTGGGAGGT
TTGTCTTGCTTTCATTATTTGTACCCCCTTTTGTAATAATAATGTAGTAT
GGAGAGAGTAAAAGTAGTAGCCTGTGAGGTTATTTTGTTTCCTTTGTTTG
TACCGTAGTTACCGGATTTGGTGAAATAGGCTTCGGGCCCCAACTGTGAT
TTATTGATCTACCTCAGGATTCGAGATTGCCGCACATCAGGAAAAGTTTG
CATCTCGAGCTGTTGACTCAAGCAAACCACAACAATGAAATTGCAGGCAG
CAGCTAACACTAAATAGTTTAACCGTGGCAGCTAATCTGGTGTAGCTACT
CGCCCATGGCGAAGACGCTGTTGCCGGCACTTTGACCTTGTGTAGTGGCG
GCTCCTTCATGGTCTGTTGTGATCGTCTGCTGCGTGGACTGCCGGGGAGA
GTGAAGCACATCAGCTGGCCCTGGAGCCTGGCCAGCCGTGACGTCAAAGC
AGGCGTTGACGGCATGAAAGCCATGACAGCCGCCACGGCACGGCTGCACA
CATGGAGGATAGGCTTCCCCATCCCTTTGCGAGCAAGCAAGCAATTTTGG
GATTAAGATGACGAGGGACAGTAGTGAGAATAAAACAGTAATAAAATCCA
GTACTAGTTTCTACACACTTCTACTATATTCTAGGTAATTTGGTCCTTTA
GTCATATGTGTTGTAGTAGTTTCTGGAGTGTTCTAGTGTGAGAACCATGT
TGTTTGTGTTTACTTCCTAGTTTTAAGTAGTATTCTCTAGAGCCTTCTAG
CTATAAGTAGAACTAAAAAGTGGAGGCTCATGAGGCCTATAAATAGAGGT
CCTCACCTCTATCTATGGAACTCGGATTATGTACCCACTACCTATCAAAT
AAATGGAACCTTGTGTTCTTGTTTTAGATCTTGGATTAGATCTAGTATGT
TGAGAATTTTGGATTGAACTCTTGACAGCCCCCGCCCCTAGAGCGATATC
TAGCCCACGCCTCTAGAGCGATATCTAGCCTAGCACGTTGGAGTGGTTCC
TTCAACACTTGTGCTGTCTTTATTATAGCAGCACGGTGGAGTTGTTCCTC
CACAACCCTTGTGCTGCATCAGGCCCCCGCCCCTAGAGCGATATCTAGCC
CACGCCCCTAGAGCGATATCTAGCCCAGAACGTTGGAGTGGTTCCTTCAA
CATTTGTGCTGTCTTTATTATAGCAGCAAGGTGGAGTTGTTCCTCCACAA
CCCTTGTGCTGCATCAGAAGATCATAGATTCACAAGTCAAGGTCACGAGT
GACTATTTGGGGCTTCTGGGAATTTCTTGAGAAGATCATGTGGCTTGAGT
GACTGGTGGGTCTGAGCAAGTCCGAATTTTAGCAGGATTTTACCTCCATC
CATTCTGCCATCAGTTTTGGAACTTGTGACCTGTAGCATTACACCATTCC
TACCAAAATGCCTTTTTGAACCACATGATCATTAAGATACACAATGACTA
CTTTTCCTTGGAAATAAAAGTTTGGATGTGCATCTGCTCGTTTAGCATTT
TACCTTCTATATATATCTGATCATGTGTCTGCGAACTGGAGTTATGTCTC
CCCCCACCCTCCCCTGCCCCTCTCTCCACACACCCACACACATATCACTC
CTTTTATGTGTGAACCGAGCAAAACAGTAAATCTCGTGACAATGGTTTGT
ATCTGTCAATTGTTAACTTGATCCTTGTATTTACATCTTCCTTAAGCAAA
TTAGCATTATCAATTATACTAAATTCACATAAGATTTTTTAATTCACTAA
CCATTGGCAGGAATGACCCTGTCCAACCATTTTCTGTTTCCTTAAGAGAA
CTTAGAGAATCTGTCATGCCATTTAACCTATTCTGCTATGTCCTGACTAA
CATGATATGCTACACATTTCTAGAAACTTGCTTTATTTTCTTATAGCTTT
GTCCCATAATTTGTATAACGCCCTTCTTCTTTTTCTCTGTTTATTTCCTA
TGTGGCACTGGTGGTAATTTTATTACCGATTTGTTACACTAGACTACAAC
CTTGAACTTTACACGTATAACGTATTAAATACAATGTCAATGTATTAAAT
AATCTATCCATTTCTCCAATTTGATCTCTTAATGCCTTCCTGTTTATGCA
TTGCTTGCAACTCTTCCTTGCCTTTTCAGATTATGCAACAGCGTCTCATA
AAAATGAAGGAATTGAAATAGCCTTAACTAACTTTAACAGTTAAATAGTT
AATAAAAGACATAGTTATCATTTAAGAAAAAATTAAATATTCTGAATTTT
ATGTACACAAGCATTCGCTTTAGGGTTGACAGAACCAGCAAGACTTACTT
TTAGCATGCTTCTAGGTTAGCTCAAGTTTGGTGAAATGCAGTAGTTATTT
GGAGCTTACCCTAGTAGCATCGACCCATCACTACGTAACTTTAGATGGAA
TGATAGCACATCCCGTCCCTGTAGATGCTTATGCTAGGATGGCCTAGCTT
TCAACTAAATAACCCTGAAAAGAGCTTCCATATTTCCTTCTAATGTTTGT
GATGCTTCCAAAACATGTATGTCCATGGCTTGTGGCCTACCAAGTTGTAA
GCTACTCTAGAAAGAAGCTATAGACCTGTGGTGGTTTAGGTGGTAGTAAT
GTAGTAACCTGGGAGGTTTTATATTGTTTTATATTTGTACCCCTTTTTAG
TAATAACGTAGCATAGGGAAGTAGAAGTGGTATCCTGTTTTCCTTGTTTC
TACCGTAGTTGGTAAAATAGGCTTCAGACCCTGACTGTCATCTACAGATC
TAGCTCAGTATTCAAGATTGCTGCAGATCTGAAGGAGTTTGTATCTCGAG
CCAACAATCTTAAGGGAACCATGACATAGCAGGCAGCAGCTAACATTAAA
CAGCTTAATAATCTGTTGCAGCAACTCACCCATGGCGCTTAGGGCCAGCC
GCGTGGCTATGGCAGTAGTGATGAAGATGCTGTGGCCGACACTTTGACGC
AGCGCAGCAGTGGCTTCTCCTGCGTTGTCTGTCGTGATCATCTGCTGTGT
GGACTGCTGGTGAAAGAACTGCAGAGCTAGCCCTGTAGTCTGGCCAACCA
CGCTATTCCAAAGCAGGCGCCAATGTCATGAAATATGTGGCGGCCGGACG
ACACGGATACAGACACAGAGAACAGACTCCTCCCCTCCTGAGCAAGCTTT
GTTGGGAGGAAGGTCACAAGTCATGACCATTAGTTACTATTTCGGACTTC
TTGGGATTTCGTGGGAAGACCATGGGACTAGATCATGTGGTTTGAGTGAC
TGGTGGGCTTGAACAAGTGAAATCTTCAGCAATTTAACATCCACCTGTTC
TCCATTAGTTTTTGGAACTTGTGACCTATAGCATTAACCATGCCTACTAA
AATGTCTTTTTGAGCCACGTGATCATTAAGGTGCACAATGGCCACTTTTT
GTAAACAAAAGATTGGATTTGTGTCTGCTGGTCTTCAACTTCTTTACCTT
CTCTGTGGATCGAGATTTCTGATCACGTTTAAGTGAACCGGAGTTGCTAG
ACCTGCGAACCAGTTACTGGATTTGCGAAATAGAGCAAATAGTAAATCTG
GTGACTGGTTTGTGAATTATACCTATTTTGTGTCTTTCAATTGTTAATTT
GATCCTTGTATTTACAACTTTCTCTAGCAACTTAGCATTATCATTTACAC
TAAAACGGAACTTCATACTAGTTTTTTGAACTCACTAGCCGTTGGCAGGC
ATGATTTTGTTCAACCAATGTCTTCGTACCTAAGAAAACTTCTATAACCT
GTCATGTCAGTTATTCTATTCTGCTATGTCCTCACTAACATTATATGCCA
CGAGCCCACGACTTTCTAGAAAATCACTTTATTTTATCATAGCATTGTCT
CATTATTTGTATAACATCCTTCTTCATTTTCTTCATTTATATCTGGTATT
TCGCTGGTGGTATTTTATAATTGATTTGTTGGAACACAACTTCGAACTTT
AACATGCATTAAATACAATGTTGATGATGTCTTAAATACTATTTTTGTTG
TACTACATTTTGATATCTCAATGCTTGTCTGTTTATACCATTGCTTGCCA
CTCTTGCCTTCCTCGGAATTATGCAACAACATTTCATAAAAAATGATGAA
ATTGAATATATAAGCATTAATGTTCACAAAAATAAAAGACCTAGTTATCA
TGTAACAAAAGTTCAAAAAGTAAATGTTTTAAATTTTGTAGGCAGACATT
CACTTTAGGGTTGGTAGAAACAGCTAGGCTTTTTTTAGCAAGCTTCTAGG
GTTGCTCAAGTTTGGTTGAAGTGCACTAGTGATATTAGGATAGCTTACCT
AGTAGCATCAACCCGCTTGTAGATGAGGGTGGCTAGAATCAATGCAGATC
CTGGGCCTGAAGATGCTTATGCAAGGATGACCCAACTTCCAACTAAATAG
CCATTAAAAGAACTTATATATTCTCTTTCTGTTGCTTGTGATGCCTCTGA
AACAAATGTCTTTGTTTTGTGGCCTACCAAGTTGGAAGCAATTCTACAAA
GCAGATATAGATCTGTGGTGTTATAGGTGGTGTTTGAGGTGCTTCTCTTC
CACAAAAAGATGCTTTTTTTGTGGTGATACATGACCTTTGGCTGACGTTT
TTATTCTTTTCAGTTGTACTGAATTTATATTTTTCGATCAACATCTTATG
AATTTTATCCACAGGTTTTCACACAGGTTGGCTAATCGTTTCCATCTGTA
TAAATCATTGACAGGAGGTTGCCACTGATACTTGCGTGTACAAAAGGGTT
CTCCGTAAATCTGCCGGTGAACCTACAGATGTCCTAAAAGATGCAGCAAC
TGATCCTACTCTGCCTCGCACCAGAAGTGTTAGATGCTACAACTGCGGCT
ACCCGGAAGCTGCTTATTTCCAGGTCTGTCAATGAGCATTGTACACCTAT
GTTTACCTCTGCAGCTGTTGGTAAAGGTTATACCTACCATCAGTGCAGAT
ATTTGTCAATACAAAACCTTAAGCATGTTGTTTTTCTGCATCCTTCATTC
ATATTTACTTTGATTCCTCCAACATGCAGGCTCCGACAAAGGGAGAGCAA
GGCCTGACGCTGTACTTCATCTGCTGCAGCCCTACCTGTGGTCACAGGTG
GAGGGACTGACCGTAGAAGGAAGTGCTAGTTCTTGGCACTGAGACTTGAC
TGGCCATGTGTTGTTGTTCACCTTAACTTTGTAGCGTATGGTATCTAGGT
TCCGAAGTTTCAGACGAGTTGGCTGCTGTGAGTGTGCTGTTTCTAGGCTC
GCGCTCTTCAATCTTTATGTATGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.