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GrainGenes Sequence Report: AA042263

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Sequence
AA042263
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042263
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
CMWG701-3
DNA
CGAAACCGGAGCAGGCAAAGAGGAGGAAAGAAAAGAGAGAAAAGAAAAAA
AATTAAATTGAAAAGAGAAAAATCTCGAAGCCTAAGCCGCCTCCCCCATC
CCACTCCGGCGCTCCATGCCTCCTGTCCCCCTCCCCGCCGCCGCCTCCCC
GAAGTCCGGACGCGTGTCCGCCTCTCGCCCCAGCATCCGGCGGCAGCGCC
GCTGCCTCACCCGCTAGCCGCAGCAGAGGTCCCCTTCCTGACCGCCGGTT
CTGGGCGGGCGTCAGGAGCGGCGTCGGCGATGGCGCCGACCCGGAAGAAG
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AGACAATTGGGAGATCCTTAGACGGTGCCACAATCTTGATCTGTTTTTGT
TATCTATGTTGAAGATTCTTATAGAGGGATTTAGCTCCTTAATTATCTGG
GCTTTAATGCCATAGGCGGTCCTTGTGGAGTAGCGAAGGCCAGATAGTTC
CACAATGGAAGTCTACACTGACTTGTGGAGCGTATATAATACTATAATGT
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TCATTATCTCTATCAATTTAAACACATCATGTGTATATATATTTGCGGTT
TGTGCACACTGGCATTGAGATTTTTTTTGCAATATGAATTTTTCTTGGTG
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GCTTGTCATTTGAAATTTTGAGAGGTTTCCTGCTGTCCGTTGCTAAATCT
AATATCCTTCTTGCCCTTTGCTCACTCTAATGTTTACCTGCTGTCCTAAT
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TCTTCTCGCTTCAGCTATTATAATCATTTCCCCATATTTCGCTGCCTTAG
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TTGGCGAATATCCCTTTGCTATTAGGCTGGTATATTACTTGGATGAAGCT
GCTTGGTCGTTACTTCTTAGGCCTTCCATTTTCCATTTGTACCTGTTATG
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TATAGATAAGTGAGCCGCAGCAATGGGGGCTTCCTTCAACTAAAAAGAAG
TTGCTGGTCTACTTTTATGGAACCAAAGAGATGTAAGTACTGTTTTTTAT
TTAAGACTGCCATTTTGAATTTACAGATTCTGGTTGATGCATACTTTTGC
TATATGCACCGTTTGCTTGTGTCAAACTATCAAATAGCTTTCTCATGTTA
GTTGTTTATTATTTTACAATAGTTTGACTGTTTGCCATATTGGTACATGA
GATGCGAGAAGATATGTTATATACTTTTACTTTGATAATCTATTGTATTT
TCTTTTGTGACGATGAACACATAGAACACGCCAGAGTTGCCTTCTATTTG
TATTTGCATGCAGGCCCTGCATCTTTTCTACATGACTCCATTATTTGTAC
AAGTGTCCATTAGATGGTTCTTGTTAGTTGTTACAATGACTGCACATTTT
TGTTTCGGCTTTTGGTGCACTCAAGGTGTTTGCTCTTGGATTATTTGATC
TTTACCCGACCAAAAGCTTATTCTAGCTGAGCACTATGAACATACTATTC
CGGATTCAGCAATATGCTGTCGAAACCGTAGGGTAAATCTAGTAAACCTA
TTTATGATAAGGACAACATACTATCATCGTTTATGATTCTTTTTAGTCTA
AATTGTTAGATTTCATTGGACGAGCCCTAATATTTACCTTGCAGCTCTGA
AGTTTAGTTGTAAGTTCAATTCTCTACCTATCTGTGTTATCTTAATAAAG
CCTCTTTTCAATAATCCTGCTTGGGTGGAAGTTAAGCATCCACGTTCTTT
TTTTGAATGTCCTCAAGGCGAGACACAATGCTTGTTGAGTTCTGTTGGGT
TTTCCCTATTTCAGAATGTGTTGCTGCTGGCATGGTTTGTCTCATAGCAT
GAATACACACTCATTATCAAAAGTTTGTTGCTTTTGGGGCAACCCAAAAA
GTTTGGAATGGCAATTTCTTATACTTCAGATTAATACAACTTCATCTGTT
GATGATAGCTCCCATTTTAGACTTTGTGTATTAGTCATTGTCATGAAACT
GTAATGGTGTAGAAGTAAACCTGCCATATTAGAAACATGTTTGTTGACAT
TGTTTGGGGCTCTGTTTTGCATATAAACACGTCAGATGTCCACACTTGCT
CCACCATGTAAATAAAAAATCATTTCTGTAGAGTACAAATTGGACAGACA
ACCCACACACGCTTCACTGAAGGGATATTTGGTCCTTCCTCCCATTCCTA
CGCATGGAACCACTGCCAAGAAGTCATACAAAAAAATTCAAAGATTGTTA
CAAGATGCATCTACCATGCCACAAATTTGTCAATGTTGTCTCATATTACA
AAACCTTATGGTTGTGTTTCTGCAAGTAGGTAGCACGGTACCACTGTAAG
GGGAGGAAGCATCATATATGTTTTCTATCGCACCACTCATAGAGACACAC
ATGCATGCACATCTCGTACACATGCTATGAATATATTAGAGGCTCTACGA
ACACACTATATATTAGAGGCTCTACATCCCACTTAACGCGGGAACACGCT
CTTACATAACACATGCACTGCGGCATGGAAATGAAGTCAGGTTGGTTTCA
TCAAACACCTTCTCTCCTGCCACTAGGCCAAAGGCCCATCCATAGCCATC
TTAAAATCTATTAGGAATTGTTAGTTGAACGGCCTCAGCCGGAGACATTT
GTTACTCACAGCAGTCGCCCCCTTGATGGCTATCATGTTTACACATTTAT
TCTTAATCCACTATTCTCGATTCCAGATTTTTGAATGTTTGTCTCTGACG
TTGGTTCTTAATTTGTAGTGGTTTCTGCAATTATTCTGACCTTGAGGCGT
TCACTGAAGAGAAAAAGAAATCTCTACTTGCTAAACGACACGGGAAAGGA
GCAGATTTTGTCCGTGCAGTTAAGGAAATAGTAGAAATTTTTGATTCTTT
GAAGAAAAAGGACATTGATAACAGCAGTTTGGCCCCTGCCAATAATAGCA
GCAGTTTGGACACTGGTGGTCCTGAAGAAGGTTCTGATTTGGCCAATGAC
AACAAGCTTGATGGCATTCCTGCCTCTTCCATGGATCACAGCATGGCCAG
TACTCCTGGGTCTAATATTGCTGCATTGGAGAGTGAACACTGTGTTGTGA
ACTCTGCACCTGACAAGCCCGCCAGTTCATTTTCAATGAATAGGCAAAAT
AATGGTCAGCAACTAGATTCGTTTACTCACGGTAATCTTGCATCGGCACG
GAGGCCAAGAAGTTCATTAGGTGTTGATCATAGGACTCGGGATTCTTGTG
GGCTGAATGGTCCCAATCTGCCTTCTGTTGACATGACCCCTGAGGATAAG
CAGGAAGGCTCTTCTTCTCGATATAACTGTATAGGCAATGACAAACTCAA
CTCGGATTTCCTTTCAGCTAAGAAGGATGTTATGCTGCCCAATTGCAGTC
AAGGCACCTCAAGTCAATCTGGAACCTCAGGGAATGGTAATGACGAGAAA
AACTCCAGTTCTGCTGCAAATGTAGAAAGTACCCTCAATGTTGAAGTATG
TCAGACTGTCAAGGATAGAGAAGATAATCTGAATGAAACGCAAGATCTTT
CCACAAGCACAACAGTTACTTTTAAAAGAAAGCGAAAGCCAGAGACAAAT
GATGTTAATAATTCTGTCATTAGTATGGTACCGAATATGGATGAAGTATT
GCAGCCTAAGTCAAGTGGAAACAAACCAGATTCTCCCATTTCAGGGAATG
AAGTCAATAAGTCAGACGGAGATGACCACTTGCCACTAGTGAAAAGGGCA
CGGGTTAGAATGGGAAGACCCCAGCTGGAGGACTCCATAGGTGACGAGCC
TGATGTTTCTGATAACAAAACAGAGTTGGCTATGCCTGTAGATCAATGTT
ATAAACATGACGTCTCTTCAGTAGCGGGAAATGATTATCCAGCTGACGAG
GTTCCCCCTGGCACAGTTCCTTCATCCGAAGTAGACCTATCTCTGGCATC
GGGAAAGGATCATTCAGCTGATGACGTTCCTCCTAGCATAGATCCTTCAC
CCAAAGTAGATCTGGCTCTGGCATCAGGAGAAGTTCAGACTGCTTGCAAT
AACAAAGAATGCCAATCAAAGGTTCTGGCGCTGGATGAAGAAGCTGCTTT
GCCTCCATCTAAACGCCTACATCGTGCCTTAGAGGCTATGTCTGCTAATG
CAGCTGATACTATTAGTAATCTGCCGGAAGTGAATAAGCCAAATGAGTTT
ATCCTGAAGCATAGCACAGCTTCAACAGCAAGCTCACCTTCTAATAACTC
TGCAGATGCACTTGTCAAAAGTCCAAAATTTGCACCAACTAATAGCCCGG
AAATTTGTGCAACTGCATATTCTTTAGACACCTCAACTGATCAAAAGTAT
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AAAGAGCCTGCTGTTGTATCTAAACTTGATCAATTGCCTTTGGTGAAAGC
AATTAGAAATGAGCTGCCAGATCCATTTGCCAACTATGGTCAAGATTTTA
GCAAAAAAAATGATGGATCTGCTTACCCACTTAGCCCAGCAAAGACGGTT
GTGTCAGGAGCTGATGACGATTGCAATTCCTTGCCACATGAGAAGACAGT
TTGGGCTGAACCAACAGTCTGTGTGGGTGACAGAACAAGTGTCTCTTCGT
TGGTTACTAAAGGTACATGCAGCCAATCTGTTGCAGACGCCCGGACATTT
GAAGCGTAAGCCTTTTATTTCCTGTCAAGAAAAATCGTCCATTTCTTAGA
TATACATAAGCACTATTTTTTACATAGGTAGACATATTGCACACCATCTT
AATTAACTAATTCTAGCAATCTTGGGTATCATATGTTTTCATTTTAACCA
TTGTTCCTGTCCCTGAATCTATGTGTTCTGCTGTAGCACATTTAATGTAG
TCTGCCATTATTCACTTTAAATAATCACTAAATTTTATTGTGCACTTGCA
TATATATGTCTTAAACTCTTAATGCAATAATATGTATTGGATGTATTTTT
TTTCTGCATATTTTTGGTATGCACAAACAAGATTGAAGGTCTTGTGCACT
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GCTTGTTCAGTCACCACCCTACCCAGGCATCCATTCAAACGAAGCAATGT
TGTTGGATGTGTGCAGGCAAACATCGTAATTTTACTAGATCGTATAAACA
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TCTAAAATTATTAAGTTGGAGCTGCTTCATTGGGTTAGAAAAATCATATG
CAAAACCCTGTTTAGGGGTATTTAGTCTGGCCTCTGTGGGTGATATTATT
GATTGATTGAGGGTGATCCTATCACAAATGGACATATTTGTCTATTATTA
ATATAATATATGTGTGCAATTCATTCGTCTGCAAGCTGTTTATAATTGGT
AGGGAACATGCTAACGAAGCTACTCTTAGCTGATATAAAACATTTTTGTT
TACCCTAGGTGACTTTTAATAGTACATGTGCATAATTTATTCTTCTGCAA
GCAGTTCAAAATTCCTAGGGTTACATGCTAAAGAAGCTATTCTTCGTTGA
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TTTATCTTCTGTTATTTCCAATCCTCGCTTTTCGGTATTTGTACCTTATA
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CTTGCAGGCATGGTTCTTTAGCAACGCCACTAAAAGAATCTGACCGGAGA
ATTAACCCAAAGGATACTAGTTTATCTCCGGACTCAATGCCAATGAAAGA
ACTTATTGCTGCTGCACATGCTCGGAGATTCTCTCAACCAACTTCTTTCA
TAGATAATTTTTTAGATTCCAATGTTATTTCACCTTTGGCGAATATACCT
TCAGCTAAGGAAGCATCAGGTAGCCGGTGTTCACCTTCAAATAATACAGC
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TTTTTGATGACACGCAACAGAAGAGCTTGAACAAATTACCAGGTCATGAT
GAAGCCAGGTCAGCACGTAGGGCCTTTGAAAACTTCCTTGGCACATTAAC
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CACTTCCATATACAAGCATATTTCTTGTTGGACTTTTGTATTTTCCTACT
GCCACACTGTTTCTATCGTTGCTAATGACCATGTACTTGCTTGAATGGTT
GTAGTTGTACAGTTGGTGGATTTTCTTTGCTCTATGAATGGAGTGGTCCA
TCTTTTAATTGGTTAACTTAGACTGATTCTGATGGCATTTTCTCATAGTT
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TACTGACATCTTTTCTGTGTCTGAGAGTATAGGTAATGGATGTCATCATC
GAACGCCTGGAAAAAGAATCAAATTTGTATAAAAGGGTGGACCTGTTCTT
CCTTGTTGATTCAATAATCCAATGCTGTCGCAATCAGAAAGGTACTCTCA
TCGTTTTCTCGTGTTCCTGAGCATTTCTTGGGCAGACATTTTCAAGCTAC
TGTCATACATCTTCTAGGTGGAGTTGGCGATGCCTATCCATCTCTTATCC
AAGCAGTCCTACCACGAATACTATATGCTTCAGCACCTCCTGGAAATTCT
GCATGGGAAAATCGAAGGCAATGTCTTAAGGCAAGTTTTTTCTTCAGTGC
TCTAATTATGATAATACTGTAGTGTGGTTTTACCTTTTTTCACATGCCTG
TGTCATGGTGATTAGGTTTTGAAACTCTGGCTTGAGAGGAAAACCCTTTC
AGAATACATAATTCGTCATCATATTAAAGAGCTTGAAACTCTTAATGAGG
CAGCATTTGGAACCTCTCGTCGTTCTTCAGGGACAGAGAGAGCTTTAAAT
GACCCTTTGCGGGATAACGAAGGAATGCTTGTAGATGAATATGGAAGGTA
TAACTCTCCTTTTGCATTGTGAGAAACTATTTCTATGGTTCCCTGAGTGT
ACAGCTGAGGTTTTTTGTGTTCTTGGTCAATTGATTCTGTTATTGCATAG
TTTTATAGCGCTAGCTTGTGGATACTTGGGATGTTTTTCATTTGTATTTC
TGTAAGTACCTGAAAGAAAAAAAAATCATCATTCACCAGTGCATGATTTC
ATGGTGCATATAGAGTTATAAGCTTGTAGCAAACACGCATCTTGTCTCAA
GTGTGGGTATTTGTAATTTATGTCGTTTTGGACTAGAATACTAGATAGTG
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GGTATCAGCAAAGGTCCCAAATCTGAATACATTGTTGTATGGATAGATGG
TCCACCCGACTGTTCGTGACTCAGAAAAAAAAGATTTCTAGAAAATTCAG
TAACCTTGGTGAATTTGAACTTCAGCTGAACTTGCAAGAACATGATATGA
CTACAAAGTACAAATAATATGTGATGGCAGATGGTTAGCACCAGGAGATG
GATAGTTGATGCTGTGCTTTTGTCAAGCATAACAAGTTAAAACTGTTAAG
GCACATATAGTTTAATGCTAGGGCATTGCTATGGTGTTTAGAATGCCAAA
TGCCAGTAGTATATGACTAGTATGGGATTTAAGGTGTTTAGAGGACTCCA
AACATACAAAAGTATTTAGTTTAGTCATAATTTGGATTTTTCTTAGGTAT
ATTACTGTAGTATGGGATTTAAGGTGTTTAGAGGACTCCAAACATACAAA
AATATTTATTTTAGTTATAATTTGCATTTTTCTCAGGTATGTTATTCTCC
GTATGGGTGACAACCGCTGCTGTGCACGCTGTGCTCTGCTATATTATCTT
TTTTATACTAAAGAGTATGTTTTTGTGTCATCCTCTTATGACTAGATTAT
TCTTTGCAGCAATACTGGTTTCCATCTTCCAAATTTAATCTGCACGAAAC
TACTTGATGAGGAAGGAAGCTCCTCTGAGGATAGAAGCTTTGAAGCTGTT
ACTCCTGAACATGAATCTGCTGGTGCTAATGAGCAAGAAGGGGCTTCTCA
AGTGGATGGGGCGAAACATCGACTTGTCTTTGAAGAAGTGAATGGTGATC
TCGAGATGGAAGATGTAGCCCCATCATCTGAAGCTGAAGCTAGCTCTGCA
GCTGATCTTACTGATGCTAGGTGTACGGTAACTAATCAAAATGCCGGTTC
TGTTCCTCCGCTACCTGATGACAAACCCCCAACTCCGCCCCCATTGCCTT
CATCTCCACCACCTCTACCACGTCCACATGTGGCAGCTGCTCGAGTTGAG
CCAGATAATTTAAGAGTATGCAGTTCTGTTGTTTGTGTAGTAAGATAATT
ATATTTTTTAATTATGGCGAATCTAATGTTTCCTTGATGATTCTTTGCAG
AATGTTCAAGATCAGCACCCTCGTTCTATTGCAAACAATCGAGGCAACAT
GGATCCTTGTGTGGTTCCATTTCAGCCTCCGGTGCCCTATCCTTCTGGAT
GTACAGGGCATACAAATCAAATACTTCCGCCACCACCGCTGCCTCCACCA
CCACCTCCACCACCCATCGCACAATTCCATCCTCCTGGACCCCATGGAAA
TTTTTCTGGCCCCCCAGTACCGCCCCATGGAAATAACTATCACCATCCAC
CATCGGCACCACTGCCTAATAATGCATACCATTTGCAGCCACCACCACCG
CATCCACCGGGTCCTCCGAATCAGTTCCCCTATATGCCACCCGAACCCCA
ACAAAGAACACAACCCTGGAATAATTCTCCCTACCCTGAGGGATATCAGT
ACAATGGACATGACAGAGGACACCATCCATACGACAGGAGACATCACTTT
GATGATAGATGGCATCACTTTGACGATAGGGGGCGGCGTTTCGATGATGG
AGGGCATCATTTTGATGCTGGAGGACATTACTTCGATGATGGACCATATC
ACTATGATGATAGAGGGCATCACTTCAATGATAGAGGACACATGCACCCT
GAAGCTATGGATAGAGGAAGGTTTCCTCCACATTTTGGACCAGGTATTTT
CCTTATTTAGCCATCAGCATTTTGAAGTTCTGCATTTCCTTGTCCCGATC
AGTATCCATGAGCTGATCGAGCTATTCTTACAATTGTTCAGATCCCCCGT
ATCCGGACCATTTTGACCATGGGCGACCCTCGGACCATCCACCAGGTCCA
TGCGCCGGGTGGCCGATGCCACCTAGGAGATCTAAGTATCCTCCTGGCTC
CAGACATTCAATGGAGCCCCCGATGTCCCATGAAGGAGGTATGTCCTCAT
GTTGCCCTTTGCTCTTGTACGAATCTTTTCTGTTTGCTTCAGCTATGCTT
TGCACACCTCCATGTTCTACAGACTGTCTTGTCAAGAGTAGATACTTTTA
CTTCTCAAAAGAGAAGAGAAAGCAAAATTAGGGATGCAAGCGGACGCCCG
CCACGCCATGATTTTCTGTCCGCCTATTTTTTTTCACATACAGCTAATAG
GAAACTAATTCGTTTCTAAGCTTACATATGCACTCCGGCGGATTGTCTGC
CTCGTCTGCCGGATGGTCCACTTGCATGCCTAAGCAAAATTATATTTGTC
ATGTGTTCAATCGTTTCAGTAATAACAACATTGTGAGCTGAATGTGTTAA
TCGTCATCGCATTCAGGTTGGAGGAGGCATGGAAGACACAATAATGATAG
ATTCCATAGATGACTCTGGGCAGAAGCGTGGTGTATTTCTTTACTCAAAC
CAGGCTAAGCCTCATCTTCGGTACTCCTAAACACTTCTAGGATATGGTGA
AATGATAGCAGCCTCTACTGCATTGGTTTTCTGTATCTTCCCGTTTTCAT
GCTCAGTTAAGCTGTTATCATGGCAGATTAGCAGTAATGGTTACCGGAAG
AGGGATAATTTCTGACTATTTAATGGTACAATATTTTGTTCCGCTGTGTT
TTCTTCTAAATTAACTGTTATTATTGCTTGAGGGCACCATTTACCTGACA
CATATATGCATTGTTTTCCAGGTTATAGATTTTAGCTTTCTTTATTTTCT
TCATTGGTGAGCCGTGACGGGATCTTCAGTATCTCCATTTGCGGATGGGC
TTAGCATGAAATCTCTTTGCAAAAGAAGAGATGGAACAGCCCCAGTTGTG
CATATGTATCTCACCATTCTTCTGCCAATGCAGAAACGGAATGTACTCTA
GAGCTGTTCTGTATCAGTTTAGTTAGCCTTACAGTCTACCGTGTTACTGA
GAAATTCTTCAATATTGATTCCCCATTCAGACATCCCTTTGTAACCCAAC
TGTCATTTCGACTACCTTACTGAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.