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GrainGenes Probe Report: BE499948-4D

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BE499948-4D
Data at Wheat_SNP
BE499948-4D
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP INS;G>A at 577, 15;582
SNP DEL;INS;G>A;C>T;A>C at 7;693, 15;698;774;775
Reference sequence CAGAGTTCCCACACACATTATATGGCGTTGCTGGAACTCAGGTTGCGTTCCGTCTTTACCCTTTTTAAAATTTACACAGAAAGGACTACTTCATGCTTTGTCTTGCAGCAAAACTGAGATTACAGTTCCTTTCTGTTCTGCCACATAGAGATGAGTTTGATCGTCTCAAATGTATTTGTAAGGGCATATTTGATTATCTTGTTTAACTGCTGGATTGCTGGTGCCTACTCATGTATACTTCTCCAGAATGTGCTAGGGTATTTACCGGTCTGCATCAGTTTCTTATTCTGCTATTTTAGATGGAACGTCGTACAATTGCTAATGTTTATTAGTACAGATGAACCATGTCAGAAATTTAGTGTGGATGCTTGCTCCCATTTATAACATGATTGTTGCTTTGGTGCGTGTTTCATTGTTATTGGTGTTATTACAGCTTCAATATGTAAGGCTCGGCCAAGCTATGATTGCTTGCAACCGAGCTCGGCTGGGTATTGTTAAGCTTTAAGAATGAGACTCAGCTAACGGGGATTTTTGTGCTCCAAGAAATAATGTTTATATTGGTGGAATCTCAAGTAATTAGTGCATGAAAAGAAAGTTTTCGTACTTGCTTACCATTTACTACCTAAACTGCCAAACGTTTCCCAAACGTCTTATATTTAGGAATGGAGGTAGCATGTTTCATTTACGTTTCCACACAGTTTATCTATCTAAATTAAGGGCTATGCTTCATCCTTTACAGGCTGAAAAGGCTCCATGGAATTATATTGGCGTATCAA
Reference sequence AGATTACAGTTCCTTTCTGTTCTGCCACATAGAGATGAGTTTGATCGTCTCAAATGTATTTGTAAGGGCATATTTGATTATCTTGTTTAACTGCTGGATTGCTGGTGCCTACTCATGTATACTTCTCCAGAATGTGCTAGGGTATTTACCGGTCTGCATCAGTTTCTTATTCTGCTATTTTAGATGGAACGTCGTACAATTGCTAATGTTTATTAGTACAGATGAACCATGTCAGAAATTTAGTGTGGATGCTTGCTCCCATTTATAACATGATTGTTGCTTTGGTGCGTGTTTCATTGTTATTGGTGTTATTACAGCTTCAATATGTAAGGCTCGGCCAAGCTATGATTGCTTGCAACCGAGCTCGGCTGGGTATTGTTAAGCTTTAAGAATGAGACTCAGCTAACGGGGATTTTTGTGCTCCAAGAAATAATGTTTATATTGGTGGAATCTCAAGTAATTAGTGCATGAAAAGAAAGTTTTCGTACTTGCTTACCATTTACTACCTAAACTGCCAAACGTTTCCCAAACGTCTTATATTTAGGAATGGAGGTAGCATGTTTCATTTACGTTTCCACACAGTTTATCTATCTAAATTAAGGGCTATGCTTCATCCTTTACAGGCTGAAAAGGCTCCATGGAATTATATTGGCGTATTCAAGCTTTCCAACATAAAC
Type
EST
SNP
PCR primers
BE499948_cpR1 TTCTCGCTTCTTCCCGTTTA
BE499948D_F1 CAGCAAAACTGAGATTACAGTTCC
Sequence
NSFT03P2_Contig16831
Linkage Group
4D
Source Species
Triticum aestivum