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GrainGenes Probe Report: BE498849-7D

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BE498849-7D
Data at Wheat_SNP
BE498849-7D
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP DEL;C>T;INS;INS;G>A;A>G;A>G;G>T at 7;36;42, 1;62, 1;124;257;294;524
SNP C>T;A>G at 24;87
SNP T>A;A>T at 391;729
Reference sequence GTTTGTTATGGTTAGAATGACTTGCCCATTTCGTACTTTTGCAATCATCACAATATATTGCCTTTTTATTGTATTTCTAGTGTTACTCGTCATGTGTGAGAAGGTTGAATCCTATAATGCTAAGAGTGTTGCCCGCAAATTATATCATGAACATCCATCGCCTCGTGTATGTTTGCTTGAATCATGGTTTCCTGTATTGTTCACATAGTAGAAAACATGTACCACTACGACCAGATTTGATTTCTGGCTAGTTGTCATTTCGAGTCATGTAGGGTTTCAGCCTTAATTTCCCAAACCACTAACGCCAGAAGTTGGCATGAACTGGCCTTATGTCCATGTTAGCTTTAATCAGATGGATAAATAGTTAGCCAGAGAACAGCTGGGAAATAGTCATGCTTAAATGAAAACTATGGTTTGATTGGGGTACATTAGATTTCTGTAAGGATGTTTACATGTGGCTGTTCTCCTTTTGTCTAATACTCCCTCCGTTCCAAATTAGTTGTCGCTGATTTAGTACAAAACTGTACTCCCACCGATCCATATTACTTGTCTCAGATTTGTCTAGATATGGATGTGTGTAGACACGCTTTAGTGTTAGATACATCCGTATCTAGACAAATCTAAGATAAGTAGTAATATGGATCTCAGGGAGTATTAAATCAGCGACAACTAATTTGGAA
Reference sequence CACGCTTTAGTGTTAGATACATCCGTATCTAGACAAATCTAAGATAAGTAGTAATATGGATCTCAGGGAGTATTAAATCAGCGACAACTAATTTGGAAAGGAGGGAGTATATATTAGTCTTTCCTGAACATTACTTGCTTTATTAAACTCACAACTTTGGTTGGTTGGTACTCTATTATGTTATGAGTTATGATCTGATGTCCTGATGTATAGCATTGCATGTCAGTTTAGGTGGATGTCTGATGATCATTTCTTTGAACCTGAAGTGGTCCCAAGTACTCTCTCTATTGAGAAGTTATTAGTTAGCAAGATCTACTGTTGCTTGTTGTCCTCGTGCTTAGCGCATTAACTTGATCTTAGTCAGCATTGTTTGTTGTTCAGGATAATCTCTAATTGCTATACACGTGCTGTAAAAATGGCTCTGTTAGTTACATTTTCTTGGATTTTGGGGCCTTACGATGCAGGGTATTTTGGGAAATGAAGTTCATGTGTGTATGCAACTTCTTTCCTGTTGTAACAGCAATGTCCTTGGCTAGTCCTTTGTGTGGCATAGTAGTAGTGGTGGTATTTTTCATTTCACAACCAAGTTCAGCCTGGAGGTTCATTTGTTTCTTAATTTTCAGGCTGAAAGTGCTACAGCTGCTCTCAACTGCAGTGGTGTTATACTGGGTTCCCTGCCAATAAGGTAAAAAGCATGGTCTGGATTCAACTTTGTTGACCCAACTGTGAATAAAAGCCTATTTAGTTTTGGAAATAACGTGCTGCCTTGCTGATATTTCAGGGTGAGTCCATCTAAGACTCCC
Type
EST
SNP
PCR primers
BE498849_cpR1 CATTGGCACCTCCTGTACCT
BE498849D_F3 CTTGTCTCAGATTTGTCTAGATAT
Sequence
NSFT03P2_Contig8456
Linkage Group
7D
Source Species
Triticum aestivum