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GrainGenes Probe Report: BE498662-7D

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BE498662-7D
Data at Wheat_SNP
BE498662-7D
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP T>G;C>T at 43;69
SNP T>G;C>T;A>G at 43;69;521
SNP T>G;C>T;A>G;DEL;DEL;A>C;A>C;A>C;G>C;T>G;G>C;A>C;G>C;A>G;T>G;A>G;A>G at 63;89;541;660;675;724;807;883;891;894;903;942;989;1117;1121;1122;1124
Reference sequence TGTTGCTTCGTTGATATCAACTTCTTGGCTACAAATCCGACTCCTAGCAGATTCATTAGATATCAACTTCTTAGCTACAAATCAGACTCCTGGCAGATTCATTTACTATTGGCAAGAGGTCGGTCTCTTTGCAGAGGTAGGATGGGCTATCAAATATCTGCTCCTGAAAAAAGGCCATGATTAATTTGCAAGTGGACACATACTACCCAATAGCTAAATTCCGTTGGTACTTGCAGACAGTAATTCGTGTGTAGAGCAGGTGCCAAACCAATTACTGACGGCACGGTTAAATGTTTCTGCCAGTTCTGTTGTCAGCCACCACAAGATTCATCTGATGTACATGACAGTGGCAGACTTCATTATCAATTGTTGAACCAAAAAAATAAAATAAAAATGGGAACAACTCACTTGAACTAGGCAGGCGGAGCTTTGCGAGGGCTGATCATTGGGAGGAAGTATCAAATGAAAAAAAAATCTAACTTCTGTTGTGTTCATGAACTGTTAACTGTTCGCAAGAAAAGTGTCCTAATTCTGATAGAGATATTTCAATCCCAATTGATAGCTTGCACCCAATTTTTTTTTCTGTTATTGTGAATATTAAGGAATTTGATGTGGCGTTTTGAACAGTAACAAGCAAACACGCAGCACCTTAGTCTAAAAGTTAACTCTCTCACTAAATTTCTTGGGCGCAATATGTACATAACACAATGTAAGAATGCATCTAGAAGACCACCTAATATGAACAGAGTAACATTGTGATACTATTTGAGTAATTGTTGACGCACATCATGTCAGCGCTTAACCCCAGAGAAGCAATCATGTACGTGCAATGCACTTTTTTTTAACAAAGCAATGCAAATGTTGACTGGTGTAAATTAAGCCACACATACGTGTAATATGTCGCAATGAAAGAATTGGACCTAAGACTAAAGCACCTTGACATATAAAAATAACAACATGGTTTGGAGTGATTTGCAGATCTATTTTCGCAGCCCAACATTATTTGGCAAATATCTGCCCATGAAACCCAATAATAAACAAGATAAATCATCATCTGAAAGTGAATCCCACGAATCATTTCTGGAATCGTACAGTTTTTGGTGCTTAGTAGCATACACGATACAATTGCTGTTAAGGCATCCCGTCTTGGACACTTAGGTGGCAAGGTGCCCTGGCAGCCCCTTGCAATTGTGCCTGCCTTAGCTGCTTAGGCATCAGGACGGTGGGTGCTCACCTTATCGCCTTAAGAACAATGCACAATA
Reference sequence CTTCTTGGCTACAAATCCGACTCCTAGCAGATTCATTAGATATCAACTTCTTAGCTACAAATCAGACTCCTGGCAGATTCATTTACTATTGGCAAGAGGTCGGTCTCTTTGCAGAGGTAGGATGGGCTATCAAATATCTGCTCCTGAAAAAAGGCCATGATTAATTTGCAAGTGGACACATACTACCCAATAGCTAAATTCCGTTGGTACTTGCAGACAGTAATTCGTGTGTAGAGCAGGTGCCAAACCAATTACTGACGGCACGGTTAAATGTTTCTGCCAGTTCTGTTGTCAGCCACCACAAGATTCATCTGATGTACATGACAGTGGCAGACTTCATTATCAATTGTTGAACCAAAAAAATAAAATAAAAATGGGAACAACTCACTTGAACTAGGCAGGCGGAGCTTTGCGAGGGCTGATCATTGGGAGGAAGTATCAAATGAAAAAAAAATCTAACTTCTGTTGTGTTCATGAACTGTTAACTGTTCGCAAGAAAAGTGTCCTAATTCTGATAGAGATATTTCAATCCCAATTGATAGCTTGCACCCAATTTTTTTTTCTGTTATTGTGAATATTAAGGAATTTGATGTGGCGTTTTGAACAGTAACAAGCAAACACGCAGCACCTTAGTCTAAAAGTTAACTCTCTCACTAAATTTCTTGGGCGTTAGAGCTTCAAAGCTCGGAAGGGCCGCCTTCGCTGGTATTATGATATGGGTGCCATGTGGAAGTAGCTGGCCAAGTTAGTTTATGTTTGTAATATTTATTAGATCAATTATCTTTGAGGTGAAAGCCACAAAGTTGAACAGCTGGATGTTACCACTTGGTGATTCGTATGCCTCACAGTTCTGCTTGTGCACATAAACCAATGCCATTTCACCTCAGAGTATTTTGGGATATTCTATTTTACGAAGAAAGGGTCAAAGAGCCTATATCTTTGACAATCACTTGATTGGAAGGTTTTGGTCATAAGAGTACGGATGTGAGAAGGATAATCTGCTAAGGCTAACTTGATATCAAGCAGGTGTAGGCACTCAGCTTTGGTTCATGAACTGGCAGTCTAAACTAGTGATAAATTTGACAGACTTGGTTTGCACTTAGTATTCCTGGATTTACGCCCACAAGCAACTTATTAGCAGTGCTAGCATTAACCTGTCGCAGTTTATCCACGCAGAATGATCTCAGTAACTAGCAATGTGAGGTAATGCTGAGACCTAGTTAATTCTAAGAATTACTTTACCTAATATTTGAAATGAAGCGTGAGATCA
Type
EST
SNP
PCR primers
BE498662_cpF1 CCGAGAAGTTTGCTCAGAGG
BE498662D_R1 CTTAAGAACAATGCACAATACAG
Sequence
NSFT03P2_Contig17748
Linkage Group
7D
Source Species
Triticum aestivum