Query (optional)   in Class  

GrainGenes Probe Report: BE445287-7A

[Submit comment/correction][What is a probe?]

Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BE445287-7A
Data at Wheat_SNP
BE445287-7A
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP INS;C>G;T>G;G>T at 34, 1;43;45;1000
SNP C>T at 329
SNP C>T;C>T at 329;461
Reference sequence TTTGCCGGTTGGTTGGATATTTTCTGATTCTACACTGTAACACGTTGTTACTTAAATTCTACGTTGTTCTTTAGATAGACTAATATTGGTATTTGATTTATCTAATAAATGTTCATGTTAAGGGTAGTATAGTGGCAGTGGTTGCCATCTTAAATAAACTGACCTACCATGTAAACTTAAGTTACTCCTTATAATAGTGTAAACTGCATTCTGTAAATATTAGACTTGCTGTGGAGCTGACACCATGAATAGTGACTGGCTAGCTTGTATCTGACCTAACATGGTAACAAAAGCATTGCTACTTATGCTCCATGGTGTAACTCTGAGTTGTGACTGCGAGAGCGTATGCTATTCTAGGGCTTGTGTCAAGGGTCCGAGGTCTTATGAAATAAAATTCCTCCAGTCGTTCAAAAAGTCTTCATGATGTGAAAAGGGGCATATGTCCTTATTGTCAATTACCGTGTGGTTTTTTCTTAAACCAGCCACTTCAGTTGCTTGGTCTTAAGGTTTCAATACATGTATAATTTAAGTTAGCCCTAGTTAAGTACCACCGGTAGTTGCCTAGTTATGTATGTTTCTCTCCTGAAACCAGAGAAAGCAGGATGCCCAGAACATTGCTCGGGTAAATGCTGAAATATCATTGATTAATTATCAACAAGTGCTAATGTCCTATGAAACATCGTGTAGGCCGCAAATGTATCGTTAGTTTGTCACTCCTGATAGTTGATTGGGAATCAGCCTATAAGCAGTCTGATGCCATTTTGGAACCTTGGCCATACATACTACTAGACACTATTATTAGCTTGGTCCCAGTTTGGGAATCAACAAGTGCGATCTTGTCAAATGCAGTGGCGGTCCCAGTTTGAGGTAAATCACCCGAGTGCATTATGATCTATGTAAACTTATCATTACCAAAAAAAAGAATCAAGAAATTGCCTCACACTGTACTTACTAATATTAGCTTTATGTAGTTCTGAACAAAGATTTCTTAAACTTGATGTGCGTTTTATACCAGATCTTCAATGAGTTCAATGCGC
Reference sequence CCATGAATAGTGACTGGCTAGCTTGCTATCTGACCTAACATGGTTAACAAAAGCATTGCTACTTATGCTCCATGGTGTAACTCTGAGTTGTGACTGCGAGAGCGTATGCTATTCTAGGGCTTGTGTCAAGGGTCCGAGGTCTTATGAAATAAAATTCCTCCAGTCGTTCAAAAAGTCTTCATGATGTGAAAAGGGGCATATGTCCTTATTGTCAATTACCGTGTGGTTTTTTCTTAAACCAGCCACTTCAGTTGCTTGGTCTTAAGGTTTCAATACATGTATAATTTAAGTTAGCCCTAGTTAAGTACCACCGGTAGTTGCCTAGTTACGTATGTTTCTCTCCTGAAACCAGAGAAAGCAGGATGCCCAGAACATTGCTCGGGTAAATGCTGAAATATCATTGATTAATTATCAACAAGTGCTAATGTCCTATGAAACATCGTGTAGGCCGCAAATGTATCGTTAGTTTGTCACTCCTGATAGTTGATTGGGAATCAGCCTATAAGCAGTCTGATGCCATTTTGGAACCTTGGCCATACATACTACTAGACACTATTATTAGCTTGGTCCCAGTTTGGGAATCAACAAGTGCGATCTTGTCAAATGCAGTGGCGGTCCCAGTTTGAGGTAAATCACCCGAGTGCATTATGATCTATGTAAACTTATCATTACCAAAAAAAAGAATCAAGAAATTGCCTCACACTGTACTTACTAATATTAGCTTTATGTAGTTCTGAACAAAGATTTCTTAAACTTGATTTGCGTTTTATACCAGATCTTCAATGAGTTCAATGCGCGAAGC
Type
EST
SNP
PCR primers
BE445287A_F2 GTTACTCCTTATAATAGTGTAAAC
BE445287_cpR1 TTCCCATGAAGAGGTGGTTC
Sequence
NSFT03P2_Contig6999
Linkage Group
7A
Source Species
Triticum aestivum