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GrainGenes Probe Report: BE404955-7D

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BE404955-7D
Data at Wheat_SNP
BE404955-7D
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP T>G;A>G at 256;504
SNP T>G;A>G;A>G at 222;470;859
Reference sequence ATTTTGACCAGCATGCGAAAGATGGTAAGAATTTCTTAAATCTCCGGTCTCCGCAACTTTGGGTAAGCAAGAACATGCCGTCACCCTTGTCTTTTCCTGGAATGGATGCAGAACATTTTTCACCGTTGTTCGAACAAATTGCTAAGTTGGATGAAGCACTTTACAACATTCAGTTTGAGCAGCACTGGCTAGAGGCCCAAACCGACCGGCAAGCAATATGTTAGTATCCTCTATTATTCATTTGTTTTGAGAATCCTGCTATTCAAATCTTACTACGTGTTCTTGTCCTTTGTACTACAAGAAATACACTGGTTATTTGGCTTAAAATACTAGCATTCACCAGCTTGTTCACTGGTAGTGATATCAGTTGTTAATTGTTTATTTATTTATAACCTAAATAAGGATGCCATGTATCTCACCCCTGCGTTCGAGAGGAGCATGATGCCAGTTTTGGCAGTTCTTGGTGCTCAATGCCCAGATAGACTTCACTCTAGCAGCCCTCAAATTGGACTTCTCGTAAATTTAACCTGCAGTCCACCAGAATAATAAGTAATGACCTAATCTTACCTAAATGAGGATGGCGTGTTCCTACCCCCTCCGTTGGAGAGGAGCATTATGCCAGTTTTTGGCAGTTCTTGGTGCTCGATGCCTAGGTAGTCTTTACTCGAGCAGCCTGCAAGTTTGACTTATCTAAATTTTAACCTGTAATCCAAGTCCACCAGAACAAGTTAGGATTCACCAGTGTTTACGGAAGGCTGTCTGCAATTTCTGAATTTGTTATAACTATGGTGGGTGCAACACAGGCTAGCCAAGTACTACCATGGTTTGTCAAGAAATCTTTCGATAACTATAACTCCAATGTATGAGCTTATGCCTGCTGTCCAAGCAGCCAGTGGATTGCACTCTTCTCAGAATCTTTATAATCTAATCGCTTAGTCATTTAACCACGTGTTTCCCGCTGTGGTGCAGTGAACGAGAATATGAGCAGGAGGGCCATCC
Reference sequence ATAGACTTTGATGTGCATGTTGGACATTATTCATATTTTGACCAGCATGCGAAAGATGGTAAGAATTTCTTAAATCTCCGGTCTCCGCAACTTTGGGTAAGCAAGAACATGCCGTCACCCTTGTCTTTTCCTGGAATGGATGCAGAACATTTTTCACCGTTGTTCGAACAAATTGCTAAGTTGGATGAAGCACTTTACAACATTCAGTTTGAGCAGCACTGGCTAGAGGCCCAAACCGACCGGCAAGCAATATGTTAGTATCCTCTATTATTCATTTGTTTTGAGAATCCTGCTATTCAAATCTTACTACGTGTTCTTGTCCTTTGTACTACAAGAAATACACTGGTTATTTGGCTTAAAATACTAGCATTCACCAGCTTGTTCACTGGTAGTGATATCAGTTGTTAATTGTTTATTTATTTATAACCTAAATAAGGATGCCATGTATCTCACCCCTGCGTTCGAGAGGAGCATGATGCCAGTTTTGGCAGTTCTTGGTGCTCAATGCCCAGATAGACTTCACTCTAGCAGCCCTCAAATTGGACTTCTCGTAAATTTAACCTGCAGTCCACCAGAATAATAAGTAATGACCTAATCTTACCTAAATGAGGATGGCGTGTTCCTACCCCCTCCGTTGGAGAGGAGCATTATGCCAGTTTTTGGCAGTTCTTGGTGCTCGATGCCTAGGTAGTCTTTACTCGAGCAGCCTGCAAGTTTGACTTATCTAAATTT
Type
EST
SNP
PCR primers
BE404955_cpF1 ATCCCCATATCACGAAACCA
BE404955D_R2 AGCCTTCCGTAAACACTGGT
Sequence
NSFT03P2_Contig17882
Linkage Group
7D
Source Species
Triticum aestivum