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GrainGenes Probe Report: BE352603-5A

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BE352603-5A
Data at Wheat_SNP
BE352603-5A
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP INS;C>A;DEL;INS;C>G;DEL at 814, 1;820;824-850;857, 2;863;867-868
SNP DEL;G>A at 14;298
Reference sequence AGAACATAATTGAATAAGGTGTGTTACAGTTGTCCATGATTGTTTTGTTAACCCTTGATTATAGCACGTATTAGGCATTAATTCTCTAACTTGTATTATGTAGTGCTGCAATTCTCGATTCTTGTATATGACAGTTCCACATAGCATTTCTATTATTAAATTGCACGAATACTGTTTTCCTTTCTTTCTTTTTCAATACAAGTATTCCTCATTCCCTGTTTTCCTCCTGTTGCATGATGATTGTAACCCATGTTAAATTTGTTGTTTTTCCCCTCATGATAAGACGTTTGAGGAGGCGGACACAAA
Reference sequence GGTGAGTTGCTCGTGCCTCTCAGTGGTTTCACCCAAATGCTTCAGTTGAAGAGAAAATTGACTGTGAGTTCATTTATCTTGTAGCTAGAGAATTTGGTTCCCAAATATGCAATTATATCCAGACTCTAGATTGTATCATCATAATGGTGATACCTCTTCAAATATAAATGTATGCAAGGATTCTCACCAACCCTAGTTTAATCATCAATTTCTGGATACTGTACTTGTGTTTGTGGTTAAATAGAGGAATTTAAGGATCTTAATATTTTATGTTATGCTCCTGCCTTGTCACATCCTCTTTATGAGCTGGAAGATCTGAAGTTCATGTCATCTTTTACAGTTTCATTCCAGCTATATGATCTTAAGCAACAAGGCTTCATTGAGAGACAGGAGGTATTGATACTATTTCCAGTGTTGTAACCCGTCAGGTCTAGCATGTTGGCTAAATATATTAGCTTGTACAGCATTGTAAATAATTCAAAATGTTCCTGTATTGTCTCTGATACATGAAATTATGCTTTATTCAAGTTAATGTCTTTTGAACTTGATGGCCTTGTCAGTTATCTTGAGTAGTTATGGTATGGTGACCATGTATGCCCACACAACTGATGATAGGAAGGCCCAGGCTTTCTGATAATCACTGATTGAATGAGGGTTTACAAAGTTATGAAACAATTCTCTGAATGTAGAGGCAGTATCTGGGTAGTGCTGGTTAATGGTTATGCTAAAGTTAAGAGACCAGTAGTTCAATCAGGCTTGTTACTATTTAAAAAAAAGGTGAATTATCAGTCTTGTTCCCAACAGATTGAGGTTTAATTCCTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAAGATCATTTTTTAGACTATCATAGTGTCTAAAAAATGATCTTATATTTTGGGACGGAGGGAGTTAACATATTGCAGTTGGCCTTATTGTTGAGATTCAGGAATTATATCGTTTAGCTTTGAAGAACTGCTATTGTATTCTTGAGGCTAAGTTTGTGCAGTGTGTCAATCGTTTGGTTGAGCTTTCTCTGTTTGCTTCATCTTAACGCATATATTTGGTTATCAGGTTAAGCAGATGGTTGTTGCCACACTTGCGGAGTCAGGAATGAATCTGTCTGATGAAATTATAGAGAACATAATTGATAAGGTGTGTTACAGTTGTCCATGATTGTTTTGTTAACCCTTGATTATAGCACGTATTAGGCATTAATTCTCTAACTTGTATTATGTAGTGCTGCAATTCTCGATT
Type
EST
SNP
PCR primers
BE352603A_R1 GAAAGGAAAACAGTATTCGTGCA
BE352603_cpF3 GTTCGACACAAAGCACAATGG
Sequence
NSFT03P2_Contig16712
Linkage Group
5A
Source Species
Triticum aestivum