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GrainGenes Probe Report: BF429272-3A

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BF429272-3A
Data at Wheat_SNP
BF429272-3A
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP G>A;T>C;G>T at 74;617;731
SNP G>A;C>T;A>G;T>C;G>T at 74;356;521;617;731
SNP G>C;A>C;G>C;G>T;G>C;DEL;G>T;A>C;C>A;C>G;DEL;G>C;A>G;A>G;G>T;A>T;C>G;G>C;G>T at 9;10;11;43;52;55;103;105;122;137;148;172;173;175;176;258;265;499;509
Reference sequence CCGACCCCGAGCTATCCTATTTAAAGTTCTTGCAGATGCTGTGGGCCTTGAGAGCTAAACTTGTTGTGGTATGTTGACATCCCTTTTCAATCTTTTGTATATGTAAGATATTTCTTTGCGCCTCAAATAATATTCCCTGTTCATGTTCATATTTAGGATAAAAATTAAGTTGAAAGGCTTAAAATTGTTTCCTTCATAGGGTCTACCTGATGACGGTGCAGTTGGATTTGTGGACTCCTACAAACATATGTCTGTGGAAGTTCCCCTGAATTCTATGGAGCTACTAGTTGACCTTATGCGATTTCCCGGCCAGTTGATTCCTTTTTCAGCCAAGGCCATCTTTATATCACATATCTCTGCTGCGGGTGAGAGTGATTCAGCTGAAAATGACTCGTGTGATTCTCCCCTGGAGCCCAACAGTCCTCTATATGGATTATCTGATAAAGTTGAAGCTGAAGGGTATGCTTATGCATTAAATATCTCTAGTTATGCAATTCAGGCCTTTATAGTTTTTCAATATCACTATGAGTATAATGATAGAGAGCTAATAGTTCACTCACTGGACAAAATGTTTGTTGGCATATTGAGTGGCTCACACCCTTTTATGGATGAACTTATACCGTGAACCTTTGAACAGAAAGCAT
Reference sequence GGGTCTGTATTTTAGGATAAAAATTAAGTTCAAATGCTTAAAATTGTTTCCTTCATAGGGTCTACCTGATGACGGTGCAGTTGGATTTGTGGACTCCTACAAACATATGTCTGTGGTAGTTCCGCTGAATTCTATGGAGCTACTAGTTGACCTTATGCGATTTCCCGGCCAGTTGATTCCTTTTTCAGCCAAGGCCATCTTTATATCACATATCTCTGCTGCGGGTGAGAGTGATTCAGCTGAAAATGACTCGTGTGATTCTCCCCTGGAGCCCAACAGTCCTCTATATGGATTATCTGATAAAGTTGAAGCTGAAGGGTATGCTTATGCATTAAATATCTCTAGTTATGCAATTCAGGCCTTTATATTTTTTCAATATCACTATGAGTATAATGATAGAGAGCTAATAGTTCACTCACTGGACAAAATGTTTGTTGGCATATTGAGTGGCTCACACCCTTTTATGGATGAACTTATACCGTGAACCTTTGAACAGAAAGCATGGCCTCCCACTGTCATTAAAGTTCAAAAATAAAATAAAATAAACAGATAGCATGGTCTGATTATAGAGAAAAAAAATCATTGTTTGTGTTGTGGGGCAGGCTATTAATGACTTTTAAATATAATCATGCAATAGAACTGTAAGATTGATAATTATTCTAGCATATATATGCTTGTTGAAACAAGTAATTTTGTAAGACATGGTGATGTATGCCCCTTGCTGGTTTAGGTTGGTTGGTTGGAACATTATTGATTGTATGGTGGAACAGTGAATCTTCACACTGGCCGCAATAGAAGCTGAGATAGGTTATTTGCATGAAGAGAAAATACAGAATATTTGAGAAATTTACGTCGGAAGTTATATCTGACAACATTAACCAAATAAATAAATTGTACAGAAGAAAATCAGTCATGGATATTTTAATTGTATAGTTGTTGTGGTATGGTTCTAAATAGCGTCTGTATCGGCTGATAAATTGCTGATATTGCGGTTTGGGCTGCCTGCTTATATCAAGTATGGTCTGATATTTTGGTCACATCAGCCCCAGTATTGGTCATATCGGCCGATATTTCGCTCATATCGCTCTTTCTACACCAAATCTACGAGCATGGTATCCGATATTTTGAACTTGAAATTACCATTAGAAAAGGTTACATGCTCAGGTTGTATTGGTTCTTTCATTATTCTTTTGTGCAATCCTTCTGTTAATTTTTCCTAACTTTCTAGAGTTTATATTTGAGCAAGATAAAAATATTCCATCTCTATCTCAGTACAGAATCGAAGCTTCATCAAATCTATCTGGGCGT
Type
EST
SNP
PCR primers
BF429272A_F1 CAGATATTTCTTTGCGCATCA
BF429272_cpR1 CCCCTCTGAGAATGTTTTCG
Linkage Group
3A
Source Species
Triticum aestivum