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QTL data can be found at https://wheat.pw.usda.gov/GG3/content/avena-sativa-sang-v11-dataset.
└── [10.4G] Asativa_sang_pseudomolecules.fasta
[406M] gene_annotation.zip
├── [ 63.0M] Asativa_sang.v1.1.aa.fa
├── [178M] Asativa_sang.v1.1.cds.fa
├── [294M] Asativa_sang.v1.1.gff3
├── [ 44.6M] Asativa_sang.v1.1.high.aa.fa
├── [127.8M] Asativa_sang.v1.1.high.cds.fa
├── [205.2M] Asativa_sang.v1.1.high.gff3
├── [ 18.4M] Asativa_sang.v1.1.low.aa.fa
├── [ 50.8M] Asativa_sang.v1.1.low.cds.fa
├── [ 89.2M] Asativa_sang.v1.1.low.gff3
├── [ 63.0M] Asativa_sang.v1.aa.fa
├── [178.6M] Asativa_sang.v1.cds.fa
├── [ 57.2M] Asativa_sang.v1.functional_annotation.tsv
├── [294.4M] Asativa_sang.v1.gff3
├── [ 44.6M] Asativa_sang.v1.high.aa.fa
├── [127.8M] Asativa_sang.v1.high.cds.fa
├── [205.2M] Asativa_sang.v1.high.gff3
├── [ 18.4M] Asativa_sang.v1.low.aa.fa
├── [ 50.8M] Asativa_sang.v1.low.cds.fa
└── [ 89.2M] Asativa_sang.v1.low.gff3
[9.8M] Asativa_sang.v1.1.functional_annotation_Feb2022.zip
└── [45.0M] Asativa_sang.v1.1.functional_annotation_Feb2022.csv
[92M] representative_transcripts_v1.1.zip
├── [237M] Asativa_sang.v1.1.representative_transcripts.gff3
├── [ 53M] Asativa_sang_v1.1.representative_transcripts.aa.fasta
└── [150M] Asativa_sang_v1.1.representative_transcripts.cds.fasta
[168M] PGSB_Transposon_annotation-v0.9__210323_Asativa_Sang_pseudomolecules+chrUn.gff.gz
└── [1.3G] PGSB_Transposon_annotation-v0.9__210323_Asativa_Sang_pseudomolecules+chrUn.gff
[4K] manual_annotations.zip
├── [2K] Asativa_sang.cluster_genes.gff
└── [5K] cluster.aa.fa
[58M] express_data.zip
└── [23M] expression_data.csv
[4.7K] tsv.zip
├── [6.0M] geneAssocTableSangOT3098.tsv
├── [ 3K] invSangOT3098.tsv
├── [ 2K] lowGeneDens.tsv
└── [22M] Orthogroups.tsv
[15.2M] DESeq2_Asativa.zip
├── [ 9.2M] DESeq2_Asativa_dev_seed_Late_vs_Early_LFC_1_padj_0.01.tsv
├── [ 8.6M] DESeq2_Asativa_dev_seed_Late_vs_Mid_LFC_1_padj_0.01.tsv
├── [ 8.6M] DESeq2_Asativa_dev_seed_Mid_vs_Early_LFC_1_padj_0.01.tsv
└── [12.8M] DESeq2_Asativa_glume_Glossy_vs_Glaucous_LFC_0_padj_0.01.tsv
[105M] ontologies.zip
├── [1.4G] Asativa_sang.PO.gaf
└── [1.7M] Asativa_sang.TO.gaf