dna.zip
└── The 2019-2021 rye (Secale cereale L. inbred line 'Lo7') genome assembly
├── [ 6735227173] Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020_pseudomolecules.fasta
├── [ 13566819] Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020_scaffold_coords_info.csv
├── [ 6671746538] Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020_scaffolds_v1.fasta
├── [ 6675136510] Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020_scaffolds_v2.fasta
└── [ 6725400479] Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020_scaffolds_v3.fasta
annotations.zip
└── Strutural gene prediction and annotation for Secale cereale Lo7
├── [ 21111722] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.all.aa.fasta
├── [ 60735859] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.all.cds.fasta
├── [ 59306951] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.all.gff3
├── [ 15713127] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.HC.aa.fasta
├── [ 45554085] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.HC.cds.fasta
├── [ 42566076] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.HC.gff3
├── [ 5398595] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.LC.aa.fasta
├── [ 15181774] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.LC.cds.fasta
└── [ 16741232] Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.LC.gff3
TE.zip
└── Repeat annotation for the genome assembly of Secale cereale Lo7 (Rye)
├── [ 28450218] PGSB_full-length-LTR-retrotransposons-v1__Rye__Lo7.gff
├── [ 880617967] PGSB_Transposon_annotation-v2__Rye__Lo7.gff
├── [ 5154] ReadMe__Rye_Lo7_repeat_annotation.txt
├── [ 10117] repeat_classification_PGSB_REcat-v4.tab.txt
└── [ 173713946] TandemRepeats-NonRedundant-v1__Rye__Lo7.gff