GrainGenes Marker Report: Xcdo504-5B
Locus
Xcdo504-5B
Type
RFLP
Chromosome
5B
Chromosome Arm
5BL
Map
[ Hide all but 1 of 6 ] Ta-Physical-Sarma-5B 0.69 Ta-Synthetic/Opata-5B 99.7 Ta-Synthetic/Opata-BARC-5B 84.7 Ta-Synthetic/Opata-GPW-5B 89 Ta-Synthetic/Opata-SSR-5B 106.5 Tturgidum-MxM-AFLP-5B 80.6
[ Show Nearby Loci ]
Breakpoint Interval
5BL11-0.59-0.79
Map Data
T. turgidum, Messapia x dicoccoides, AFLP
[ Show all 6 ]
Probe
CDO504
Homology
AAF71315.1 e-value: 4e-32 (AF241512) unknown [Agropyron cristatum]
Possible Orthologs
CDO504
[ Show all 7 ]
Probe for Locus
CDO504
Locus
CDO504
[ Show all 8 ]
Synonym
Synonym HAR35_17977
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
General Remarks
Uni-ZAP XR library OatUni-ZAPXR [c] OatUni-ZAPXR
Type
cDNA
Sequence
BE439141 CDO504_WHE2E0121 CDO504_WHE2E0122 CDO504-5
Polymorphism
CDO504 EcoRI CDO504 EcoRV CDO504 HindIII CDO504 DraI CDO504 XbaI
Linkage Group
[b 7L]
Insert Enzyme
EcoRI XhoI
Source Species
Avena sativa
Source Germplasm
Brooks (oat)
Source Tissue
etiolated leaf
Insert Size
0.8
PCR size
0.8
GrainGenes Marker Report: Xcdo504-5B
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
| |||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
| ||||||||||||||
|
|