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GrainGenes Marker Report: Q

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Gene	q
Synonym	Correct name Q (Triticum)
Gene Product	Q protein
Comment	q is an allele in T.dicoccoides Sequences in this gene record are from EST sequence annotations only
Sequence	[ Hide all but 1 of 292 ] DQ290774 DQ290774_1.cds DQ290775 DQ290775_1.cds DQ290776 DQ290776_1.cds DQ290777 DQ290777_1.cds DQ290778 DQ290778_1.cds DQ290779 DQ290779_1.cds DQ290780 DQ290780_1.cds DQ290781 DQ290781_1.cds DQ290782 DQ290782_1.cds DQ290783 DQ290783_1.cds DQ290784 DQ290784_1.cds DQ290785 DQ290785_1.cds DQ290786 DQ290786_1.cds DQ290787 DQ290787_1.cds DQ290788 DQ290788_1.cds DQ290789 DQ290789_1.cds DQ290790 DQ290790_1.cds DQ290791 DQ290791_1.cds DQ290792 DQ290792_1.cds DQ290793 DQ290793_1.cds DQ290794 DQ290794_1.cds DQ290795 DQ290795_1.cds DQ290796 DQ290796_1.cds DQ290797 DQ290797_1.cds DQ290798 DQ290798_1.cds DQ290799 DQ290799_1.cds DQ290800 DQ290800_1.cds DQ290801 DQ290801_1.cds DQ290802 DQ290802_1.cds DQ290803 DQ290803_1.cds DQ290804 DQ290804_1.cds DQ290805 DQ290805_1.cds DQ290806 DQ290806_1.cds DQ290807 DQ290807_1.cds DQ290808 DQ290808_1.cds DQ290809 DQ290809_1.cds DQ290810 DQ290810_1.cds DQ290811 DQ290811_1.cds DQ290812 DQ290812_1.cds DQ290813 DQ290813_1.cds DQ290814 DQ290814_1.cds DQ290815 DQ290815_1.cds DQ290816 DQ290816_1.cds DQ290817 DQ290817_1.cds DQ290818 DQ290818_1.cds DQ290819 DQ290819_1.cds DQ290820 DQ290820_1.cds DQ290821 DQ290821_1.cds DQ290822 DQ290822_1.cds DQ290823 DQ290823_1.cds DQ290824 DQ290824_1.cds DQ290825 DQ290825_1.cds DQ290826 DQ290826_1.cds DQ290827 DQ290827_1.cds DQ290834 DQ290834_1.cds DQ290835 DQ290835_1.cds DQ290836 DQ290836_1.cds DQ290837 DQ290837_1.cds DQ290838 DQ290838_1.cds DQ290839 DQ290839_1.cds DQ290840 DQ290840_1.cds DQ290841 DQ290841_1.cds DQ290842 DQ290842_1.cds DQ290843 DQ290843_1.cds DQ290844 DQ290844_1.cds DQ290845 DQ290845_1.cds DQ290846 DQ290846_1.cds DQ290847 DQ290847_1.cds DQ290848 DQ290848_1.cds DQ290849 DQ290849_1.cds DQ290850 DQ290850_1.cds DQ290851 DQ290851_1.cds DQ290852 DQ290852_1.cds DQ290853 DQ290853_1.cds DQ290854 DQ290854_1.cds DQ290855 DQ290855_1.cds DQ290856 DQ290856_1.cds DQ290857 DQ290857_1.cds DQ290858 DQ290858_1.cds DQ290859 DQ290859_1.cds DQ290860 DQ290860_1.cds DQ290861 DQ290861_1.cds DQ290862 DQ290862_1.cds DQ290863 DQ290863_1.cds DQ290864 DQ290864_1.cds DQ290865 DQ290865_1.cds DQ290866 DQ290866_1.cds DQ290867 DQ290867_1.cds DQ290868 DQ290868_1.cds DQ290869 DQ290869_1.cds DQ290870 DQ290870_1.cds DQ290871 DQ290871_1.cds DQ290872 DQ290872_1.cds DQ290873 DQ290873_1.cds DQ290874 DQ290874_1.cds DQ290875 DQ290875_1.cds DQ290876 DQ290876_1.cds DQ290877 DQ290877_1.cds DQ290878 DQ290878_1.cds DQ290879 DQ290879_1.cds DQ290880 DQ290880_1.cds DQ290881 DQ290881_1.cds DQ290882 DQ290882_1.cds DQ290883 DQ290883_1.cds DQ290884 DQ290884_1.cds DQ290885 DQ290885_1.cds DQ290886 DQ290886_1.cds DQ290887 DQ290887_1.cds DQ290888 DQ290888_1.cds DQ290891 DQ290891_1.cds DQ290892 DQ290892_1.cds DQ290893 DQ290893_1.cds DQ290894 DQ290894_1.cds DQ290895 DQ290895_1.cds DQ290896 DQ290896_1.cds DQ290897 DQ290897_1.cds DQ290898 DQ290898_1.cds DQ290899 DQ290899_1.cds DQ290900 DQ290900_1.cds DQ290901 DQ290901_1.cds DQ290902 DQ290902_1.cds DQ290903 DQ290903_1.cds DQ290904 DQ290904_1.cds DQ364913 DQ364913_1.cds DQ364914 DQ364914_1.cds DQ364915 DQ364915_1.cds DQ364916 DQ364916_1.cds DQ364917 DQ364917_1.cds DQ364918 DQ364918_1.cds DQ364919 DQ364919_1.cds DQ364920 DQ364920_1.cds DQ364921 DQ364921_1.cds DQ364922 DQ364922_1.cds DQ364923 DQ364923_1.cds DQ364924 DQ364924_1.cds DQ364925 DQ364925_1.cds DQ364926 DQ364926_1.cds DQ364927 DQ364927_1.cds DQ364928 DQ364928_1.cds DQ364929 DQ364929_1.cds DQ364930 DQ364930_1.cds DQ364931 DQ364931_1.cds DQ364932 DQ364932_1.cds DQ364933 DQ364933_1.cds DQ364934 DQ364934_1.cds EF382967 EF382967_1.cds
Locus	Q
Type	Gene
Synonym	Other name fcp650(Q) fcp650(Q)-5A
Chromosome	5A
Chromosome Arm	5AL
Map	5A, DS 5AEurope 132.1 5AL, CS x CS-TDIC DS5A 18.7 5AL, q deletions 95 Ta-Kyoto-5A 170 Triticum-Genes-5A 18.3
	[ Show Nearby Loci ]
Breakpoint Interval	5AL7-0.87-0.87 5AL-q2/0
Map Data	5A, DS 5AEurope 5AL, CS q deletions, physical 5AL, CS x CS-TDIC DS5A Wheat genes Wheat, Kyoto
2 Point Data	Centromere/q#1 [ Show all 8 ]
Probe	FCP650 Faris JD et al. (2014) Analysis of agronomic and domestication traits in a durum x cultivated emmer wheat population using a high-density single nucleotide polymorphism-based linkage map. Theoretical and Applied Genetics 127:2333-2348.
Associated Gene	Q (Triticum)
Gene Class	APETALA2-like Spelt
Reference	Rao MVP (1983) Telocentric mapping of the squarehead (vulgare) gene Q on chromosome 5A of hexaploid wheat. Wheat Information Service 56:12-13.
Possible Orthologs	fcp650(Q) [ Show all 26 ]
Probe for Locus	FCP650
Locus	fcp650(Q) fcp650(Q)-5A Q
Reference	Faris JD et al. (2014) Analysis of agronomic and domestication traits in a durum x cultivated emmer wheat population using a high-density single nucleotide polymorphism-based linkage map. Theoretical and Applied Genetics 127:2333-2348.
General Remarks	Annealing temperature 65 C
Type	PCR
PCR primers	5' GCACTAGCTAATTCAGTGGTTAGATTTGCTCA 3' 5' ATTCAGTGGTAGCAACAGTTTCAGTAAGCTGG 3' 5 GCACTAGCTAATTCAGTGGTTAGATTTGCT CA 3 5 ATTCAGTGGTAGCAACAGTTTCAGTAAGCT GG 3
Source Gene	Q (Triticum)
Source Allele	q (Triticum) Q (Triticum)