GrainGenes Marker Report: MWG798A
Locus
MWG798A
Type
RFLP
Synonym
Synonym MWG798
Chromosome
6H
Map
[ Hide all but 1 of 21 ] Barley-Consensus2-6H 139.6 Hordeum-Bins-6H 151.6 Hordeum-Consensus2005-SNP-6H 156.033 Hordeum-Consensus2006-DArT-6H 136.1 Hordeum-Graner2-6H 136.3 Hordeum-KxM-6H 176.5 Hordeum-NABGMP1-6H 139.7 Hordeum-OPA-2009-6H 199.22 Hordeum-OWB-2004-6H 156.7 Hordeum-OWB-2005-6H 162.7 Hordeum-OWB-OPA2008-6H 157.559 Hordeum-PilotOPA1-6H 136.026 Hordeum-QTLConsensus-Abiotic-6H 156.03 Hordeum-QTLConsensus-Agronomic-6H 156.03 Hordeum-StMo-SNP-6H 147.34 Hordeum-SxM-base-6H 156.6 Hordeum-SxM-FeedQTL-6H 139.7 Hordeum-SxM-SSAP-6H 157.5 Hordeum-SxM-SSR-6H 163.5 Hv-Consensus2006-Marcel-6H 141.49 Hv-Integrated2009-6H 133
[ Show Nearby Loci ]
Map Data
Barley consensus 2
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Species
Hordeum vulgare
Probe
MWG798
Reference
Close TJ et al. (2009) Development and implementation of high-throughput SNP genotyping in barley. BMC Genomics 10:582.
[ Show all 6 ]
Data Source
Blake, Tom 05.04.19 Close, Timothy J.
Remark
Number of populations contributing to the placement of MWG798A in the Barley, Consensus 2006 DArT maps = 2 Bin on the 'Barley, Integrated, Marcel 2009' Map Set : 'chromosome_kleinhofs & graner BIN nb.subBIN nb' Mapping population(s) used for locus placement on the 'Barley, Integrated, Marcel 2009' Map Set = Steptoe x Morex,Oregon Wolfe Barleys,Igri x Franka Loci in 'Barley, Consensus 2006, Marcel' mapped in population(s) : Steptoe x Morex; Igri x Franka
Possible Orthologs
MWG798
[ Show all 7 ]
Probe for Locus
MWG798
Locus
MWG798A
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Reference
Graner A et al. (1991) Construction of an RFLP map of barley Theoretical and Applied Genetics 83:250-256.
Type
Genomic STS
STS primers
5' GGCTGTCTACATCTTCTGCA
5' CAAGTGTTGAGAAGGAGAGT
STS size
365
Amplification Conditions
STS annealing temperature 55-58 oC
Sequence
AJ234554 AJ234553 MWG798-5 MWG798-3
Insert Enzyme
PstI
Source Species
Hordeum vulgare
GrainGenes Marker Report: MWG798A
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