GrainGenes Marker Report: ABG387a
Locus
ABG387a
Type
RFLP
Synonym
Synonym ABG387
Chromosome
1H
Map
[ Hide all but 1 of 24 ] Barley-Consensus2-1H 149.8 Barley-ConsensusFHB-1H 176.8 Hordeum-Bins-1H 159.6 Hordeum-Consensus2005-SNP-1H 148.555 Hordeum-Consensus2006-DArT-1H 146.4 Hordeum-Genes-1H -59.6 Hordeum-Graner2-1H 132.6 Hordeum-IxF-SSR-1H 131.1 Hordeum-NABGMP1-1H 150.8 Hordeum-OPA-2009-1H 210.4 Hordeum-OWB-1H 137.1 Hordeum-OWB-2004-1H 139.6 Hordeum-OWB-2005-1H 136 Hordeum-OWB-OPA2008-1H 156.299 Hordeum-OWB-SNP-1H 137.54 Hordeum-PilotOPA1-1H 142.05 Hordeum-QTLConsensus-Abiotic-1H 148.56 Hordeum-QTLConsensus-Agronomic-1H 148.56 Hordeum-StMo-SNP-1H 155.79 Hordeum-SxM-base-1H 151.2 Hordeum-SxM-FeedQTL-1H 150.8 Hordeum-SxM-SSAP-1H 143.2 Hv-Consensus2006-Marcel-1H 138.75 Hv-Integrated2009-1H 140.1
[ Show Nearby Loci ]
Map Data
Barley consensus 2
[ Show all 24 ]
Species
Hordeum vulgare
Probe
ABG387
Reference
Close TJ et al. (2009) Development and implementation of high-throughput SNP genotyping in barley. BMC Genomics 10:582.
[ Show all 6 ]
Data Source
Blake, Tom 05.04.19 Close, Timothy J.
Remark
Number of populations contributing to the placement of ABG387A in the Barley, Consensus 2006 DArT maps = 1 Bin on the 'Barley, Integrated, Marcel 2009' Map Set : 'chromosome_kleinhofs & graner BIN nb.subBIN nb' Mapping population(s) used for locus placement on the 'Barley, Integrated, Marcel 2009' Map Set = Steptoe x Morex,Oregon Wolfe Barleys,Igri x Franka Loci in 'Barley, Consensus 2006, Marcel' mapped in population(s) : Steptoe x Morex; Oregon Wolfe Dom x Rec; Igri x Franka
Possible Orthologs
ABG387
[ Show all 14 ]
Probe for Locus
ABG387
Locus
ABG387a
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Synonym
Synonym HAR35_1739
Type
Genomic STS
STS primers
5' GCACTGGCATAGTCTCACAA
5' CGATGCTGGTTCGGTCATAC
STS size
198
Amplification Conditions
STS annealing temperature 60-62 oC
Sequence
BH854352 ABG387-5
Source Species
Hordeum vulgare
GrainGenes Marker Report: ABG387a
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